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transcript sequence >TCONS_00010534 ID=TCONS_00010534|Name=TCONS_00010534|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1203bp aaggtaaaatcaaattgaaatatcaatattaaaatatacaaaaacaatgT AATGAGGAAATGGATATGATAAAAGAGATGGTTACTGGCTACTGCGGGTG ATTCTCAAATTGAATTGATAATTGAGGgcACGAGTGGCTTTTGGCAATAT GCTTTGCAAGAAACAATCTGATTGTCAGGATAATCAATGTTGTGCTATGG TCGCTGTCGGCAAATCACGGACTGGATTTTGCATGCCTGCTAAACAACTC GGAGACAGATGCGCGCCGACATTTATATACGGCAAAAGTTTCACGTGCGG ATGTCAGAGAGGACTTTCATGCGCTTTAGTTGAAGTCAACGAAGCTACAA ACAGCCAAAAACATCGTTGTGTTAAAGTTCTACCGGACCTGAAAGAGAAA CGGAAGTCTAACGGGTCGACGTCTTTGGAAAAGGAAAAAGCAACGTTTAC CGCACAGCTTATCCGGGAATTATTGAGCCCGGATTTTTTATCGGACACTT TGGATGAGGACGAAGAGAAGAAAGCTACatgaatgtttttttaaagttaa agaaaatgtgTTGTCgtttatttttaaatgaaagaaTTAAAAGAAAGAAC GTGGTACGACATGATTAAAGGACGTAGCACgacagaaaaagtttttttga cagGAAAGGAGATACGCGTAATCAACCTGCATAATACAATTGTTAGCCTT CTTTTGATTGGATAATAAGTCGATAATGATGCATTGGTACGgtatttgat aaaatattttcctttggcaaaaatattttatgcGAGATATTATGAAATCA CCCGAGAAATCTTTTAGCACTGAAGTATTTTGCTCTCAAAGTCTGGAATA CGAACAAAAATGAACCCTGTCTGACCATCATTGAAGGGATGAATTATGGT CTTCTGTTGAACCATATACAAATGAAATATTCAGTGAGAgcggaaatttt tgaaaaaattttcaatcattttattttattaaaattttatttgtttttgt ttttatatattgAAGTATTCTTACACTGCGATCCCTTTCCAGagttttag tacacatggtcaAATTCGGAATAATATCTTGTTATCTTAAGCTGTAGTAA CTTTATGGATTTTTTAGTTGATTCAAATATCATGGACATTAGAAAGATGT CAAAAAAGATGTCGACAAAAGGCTAAGATTTAATATTTAACCTCTGTTGT AAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000107:540298..582657+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00010534 ID=TCONS_00010534|Name=TCONS_00010534|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=42360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107:540298..582657+ (Clytia hemisphaerica) aaggtaaaatcaaattgaaatatcaatattaaaatatacaaaaacaatgT
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GCAATATGCTTTGCAAGAAACAATCTGATTGTCAGGATAATCAATGTTGT
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tttgttgttttgtatcCTAGCATTTTTGTCATATTTCATTGTCAAATGGA
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atagatttGTTTCCTAAAGAAAAAAACTCTAGTCCTTCTCCTAGAAGTTA
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CAGTTGAATAGAAATTTGACTTAAATGGGTTTCACGCTCTAGGGGATACA
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CCAAATATGTAAACAATATGATTTTATGCAAATTAGGGGCAATCCGTAAC
CGTAGGattgtctttcttttttaagTTAGGCTCAAAGAGtcctcttttca
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CGTGCGGATGTCAGAGAGGACTTTCATGCGCTTTAGTTGAAGTCAACGAA
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GACACTTTGGATGAGGACGAAGAGAAGAAAGCTACatgaatgttttttta
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00010534-exon-sc0000107-1491911889:579982..580131 | TCONS_00010534-exon-sc0000107-1491911889:579982..580131 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010534-exon-sc0000107-1510915933:579982..580131 | TCONS_00010534-exon-sc0000107-1510915933:579982..580131 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00010534-exon-sc0000107-1575043694:579982..580131 | TCONS_00010534-exon-sc0000107-1575043694:579982..580131 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000107 | supercontig | sc0000107:540298..582657 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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