XLOC_005907 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005907
Unique NameXLOC_005907
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000107:540298..582657+

Legend: gene
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>XLOC_005907 ID=XLOC_005907|Name=XLOC_005907|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107:540298..582657+ (Clytia hemisphaerica)
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ATTTTTCCCACGAGTAACTTGAAAGCTTGAATCTCAttctaaataaagaa aattgacGCGCGAGTTTTTGACATGGTGGACATTTCCTTTGCTCTTTTTT AAGGGGaaattcaaataatttaaaCCAATTTCCATAGGATAACACTGTAT TGAACAGTGGTGTCGAAGTTTGTTTTGACAGAATTTCTTGCTATAAAAAG GGGTTGTATTTTCTATTCAAAACGGATAGGCGAACTGTCTGGTGGATTTA TGATGTGCtaaatgattatgtcaaaaggCGGTCACTAAAACCTTTAGCAT CAAATTTGCCTTCTGAAGCTTGTTTGATATCTTCGGTATTCATTTAGTTT GACGGTAAACTTTCTCTTATCAACGATTTTTGGCGCTATGTAAAGAGGAG AACTTCCAAATAGACCGATTTCATTTCGCTCCAAACAGCTTTTTGCTTCG TTTCTTGTCCAAATTTCTCATAAAATCTTTGTTTTAAGACTAAATGTTCC CCAAAAGAACTATGGTAAAGTTATTTCAAAGTTTAGAAATTTGggtgttt tttgttgttttgtatcCTAGCATTTTTGTCATATTTCATTGTCAAATGGA AGCACCCCAACCTAGTTTGATGTCAAGAATTTGTATTTCATCTGTTTTTA ACTGTGACAGTGTTTTCTCATTTTacccttcttttttttcttgctACCTT TTTCTCAGTGCCACTCTAAATCTTTGAAATCTCCTTCATTAAAACTATTC AGATACCGATAACTTTCCCATCTCATTcacttttgaaggaaaaattccTG GTATAGAAGCTCAGCAGTTGGTCCTTCTCTAGTCTGTattgcagacctct atagatttGTTTCCTAAAGAAAAAAACTCTAGTCCTTCTCCTAGAAGTTA TTCCAATATActtcatttttgaccaaaaaagttttttcacctTGACACTT CAGTTGAATAGAAATTTGACTTAAATGGGTTTCACGCTCTAGGGGATACA TCCGAGTATATGTTTATTGTATCAGATTGATTGGTGCatctttcaaaata tcagacTTCCTGcattttttgattgaaactCTTCAATCTTGAAACGTGAC CCAAATATGTAAACAATATGATTTTATGCAAATTAGGGGCAATCCGTAAC CGTAGGattgtctttcttttttaagTTAGGCTCAAAGAGtcctcttttca aaaaaattaaaataggaGTTTTATTACGGCTACGGTTTAGGTTTTCCGCG CGTACAAGTGTTAATTTTACGGCGGTTCCGTGTTAAAAGCCATTACGTCA TGCCAATCACGAATAACGTGTGAATATGCTGCACAGAAAAATCACTTCCC CCTTTTAATATCACTGTTGGAAATTCATAATACCTTCAATAAAAATGCTA TGTTTTAAACAGAGTAAGACCACGGTGGTTCTTCCTCTTCACGGTATTAT GTCAAAACGACCTTAATTTCCGacaatgaaatatttcaaacattcaaatt aattccttttcttttttctcttctctATTTTTAGTACGGCAAAAGTTTCA CGTGCGGATGTCAGAGAGGACTTTCATGCGCTTTAGTTGAAGTCAACGAA GCTACAAACAGCCAAAAACATCGTTGTGTTAAAGTTCTACCGGACCTGAA AGAGAAACGGAAGTCTAACGGGTCGACGTCTTTGGAAAAGGAAAAAGCAA CGTTTACCGCACAGCTTATCCGGGAATTATTGAGCCCGGATTTTTTATCG GACACTTTGGATGAGGACGAAGAGAAGAAAGCTACatgaatgttttttta aagttaaagaaaatgtgTTGTCgtttatttttaaatgaaagaaTTAAAAG AAAGAACGTGGTACGACATGATTAAAGGACGTAGCACgacagaaaaagtt tttttgacagGAAAGGAGATACGCGTAATCAACCTGCATAATACAATTGT TAGCCTTCTTTTGATTGGATAATAAGTCGATAATGATGCATTGGTACGgt atttgataaaatattttcctttggcaaaaatattttatgcGAGATATTAT GAAATCACCCGAGAAATCTTTTAGCACTGAAGTATTTTGCTCTCAAAGTC TGGAATACGAACAAAAATGAACCCTGTCTGACCATCATTGAAGGGATGAA TTATGGTCTTCTGTTGAACCATATACAAATGAAATATTCAGTGAGAgcgg aaatttttgaaaaaattttcaatcattttattttattaaaattttatttg tttttgtttttatatattgAAGTATTCTTACACTGCGATCCCTTTCCAGa gttttagtacacatggtcaAATTCGGAATAATATCTTGTTATCTTAAGCT GTAGTAACTTTATGGATTTTTTAGTTGATTCAAATATCATGGACATTAGA AAGATGTCAAAAAAGATGTCGACAAAAGGCTAAGATTTAATATTTAACCT CTGTTGTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010534TCONS_00010534Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010536TCONS_00010536Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010537TCONS_00010537Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010536-proteinTCONS_00010536-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107supercontigsc0000107:540298..582657 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
19.35 18.13 153.69 185.41 0.89 0.45 0.86 1.51 1.81 2.41 1.01 1.99 14.69 12.34 5.85 5.85 12.72 12.86 27.85 36.91 19.8 16.52 26.42 27.56 10.88 15.8 2.67 2.2 9.9 10.72