TCONS_00010096 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00010096
Unique Name	TCONS_00010096
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1898

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000102:90344..114093-

transcript sequence

>TCONS_00010096 ID=TCONS_00010096|Name=TCONS_00010096|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1898bp
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ccgtacatcaactactggctttgttttgtatcgacttcacttaccgtacc
cctcgatatcctccgatacataaactcggtaaaaaGTTTGGAAGGGAAGA
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transcript from alignment at sc0000102:90344..114093-

Legend: exon

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>TCONS_00010096 ID=TCONS_00010096|Name=TCONS_00010096|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102:90344..114093- (Clytia hemisphaerica)
AAAACACCAAAATACCGTCGTCTGTTTGGGTGAGGAAAGGCAATATAGAG
CCGTACATCAACTACTGGCTTTGTTTTGTATCGACTTCACTTACCGTACC
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TTATATAGTTTGTTCTTATGTAAAAAACTTGTATAAGATTTAATCTATGT
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ATAATCTAACTAGTTTTCCTATTATTTTAAAGCATTTGGAATCATATTGT
ACACCTTTCGCTAAACGAATTAACCCAGGTTCAAATTCAGTTGACGATTT
AGAAGTATCTTCAGAATTTTTTATATTCAAATCCTTCCCAGCTTATTTCT
AATTGGAAAATAATATAATTTTAGAAGAATGGATTGTATACAAAATCTAA
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ATGTCAAATAAGAATGTTTTAAACTTTTTAATGACTTTTCGAAACATTTT
CGAATGTTTTGATGTTGATTTCACCACAATACAGGAAATGAAAAAAATAT
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TTCAAAATCCCCACAATCGTTAAATAAGATTTCAAAATCCCCACAATCGT
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GTAGCAGTAGTAGCAAGTAGTAGCATTAGCAGCAGTTCCTGAGTTCTGGC
AGGTGGTCAATGTGTATTTTATTATAGACTGGTCTGCAAAGTATCAAATA
CTCATGTGAACGAATTTCAAGGGTCAAAATTTCAAGGTCATAGGACTTGT
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GAATAGGAATATGCTTGAAGGGTTAAGGGTTAAGAACATCGTAAGAACAA
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CATTTACCAGTTCCTTATTAAAAAAAAGCGTGTTCCTGTTTTCTTGTATT
GTTTGTGATAAAGTACAATCAATTTCACTTTATACAGAGCTATGGGATCG
ATATTTGGATGTCACAAAAATGGGAGGACTATCGTCTCAAACATAATATT
TCAAAAGTCATTACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTAATTTGAT
CTGGGTTCCTGATACAGTTTTTATCAACGAGATCAATTCCAAACAGCATT
TGGTTACTGTTAGAAACAATAAAGTGGATATTAATAGCGATGGCACGGTG
CATTTGATCTCCAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGAATTTTCG
ATTCTATCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAGTTGTA
AGTCATGCTTTACGAATTTTTGATTTCATAAATTCAAAAACCCTTTTTTC
GGTACTAGATTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCAGGGGCTAGATT
TTGGCTGTGTTAGAGCCAAAAGTTTTCACCATTAAAGCTTGAGGCCTTTT
TAGTCGGTCCTAATAGAGCACCGGTGCTTATTACGTCAAAGCTCGATAGT
TTCCATTNACTATATGAATTTTTGATTTCAATAAATTCAAAAATTGTTTT
CCGGTACTAGATTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCATGGGCTAGA
TTTTGGCTGTGTTAGAGCCAAAAGTTTTCACTATTAGAGCTTGAGGCCTT
TTTAGTCGGACCTAATAGAGCACCGGTGTTTAATACGTCAAAGCTCGATA
GTTTCCATTTTTAGCCCGGCCCTAATTTGATTTTTATCACTTATACCAGC
CTTTATAATGTCAACCAGGGCTGATAAGGTACACCGTTTTTTCATCCAGT
CAACATTGACATATTAAACGTTTACATTTTTTGTCTCTAAACTGATATTT
TGATTATAGTATTTCAGCCTCAACCAAAAAGCAAACCTCTCATAAACTTT
TCCTTTTAGTCGCTTACCCTGACACTTACGTGGATTACAATTGGCGTGTT
GGCGTAATCGTTGAAAAGTATGATCTATCTCAGTATACGTTGGAAAAAGT
CGAGACATTCAAAAATATATCAAAATATGAATCAGGTAGTAAATATTCTC
TAAATTTCAATATTTCCACTCAATTCGTAGGGACATTTTGATTTAATATT
CGAATAGTTGCAAACAAAGTTCAGTGCCTTAGCTACCGGCGGTCAGGGGG
GCTTAGCACCCCCTATAATATTTTTAAGAGTGATTTTTTTCATAAAATGG
AGTATTTTACCTTTAAATTTTGCCTTTAATTGAATTATTTTAGTTTTTTG
AGTGTTTTTAGCCAACTTAGAGCTCTAGATTTCCAAATCCCTCCCTCGAG
CCAAACCTTGGTTGGCCCTCATGGTGTCACTGAACTTATGCCCCTCCAAT
ATTAATCCTATAGCTACTTTTTCCTATTGTCTAGGGAATTATACAATTCT
TCAGGTCGTGTTTCGTTTCATATTAATAATATTTGAATAGTTGCAAAAAA
AGTTTTAAAATATGCTATCTTTGCTGAACACTTTTTGGACTTATCCTGAC
TAATCCTATAGCTACCTTTTCCTATTTTCTAGGGAATTATACAATTCTTC
AGGTCATGTTTCGTTTTAAGCGAGGCGTTGAAGTTTCGGTCATCCAAGTA
TTCTTTCCGATTGTGTCTGTTGTTTGTGTTTCAATGATCTCCTTATGGTT
AAACAAATATTCTACATCTTCACGTGTAGGTGAGTAATCATAGAGACAAA
AAGTTGGTTAGGGTACTGTCGTTTTCACTTAAATTCATTGAAATCCTTCC
GTTATTGACAAGGCTGAATAGTTTGGCTCCCTCTATTTCTTAGTCCAAAT
CGAAAAGAGCAAGAGAGAATTTTAAAATCCTGTTCCGAAGATAATATAAC
TGAAGGGACGATAAAACTTCTTCCAGTTAAGGAGACATTCGAGTTCTAAA
GGTTCCAGTTATGAGACTTCGCTATGTATTTATTCATCTTTTTTTTCAAC
ATTATGTGTTACTACTTTTTCAACATTGTGTACATTGTGGACCAGACCGA
ATTTCTCTTTGTCATTATAACTCTACGGGCTTTTTAGGGCTTGACTATGC
GTTATAAGATTATTTATTTTTCTTTCCTTTTTTCAGCATTATGCGTTACT
ACCCTCTTAACATTGTGTACTTTGTGGACCAGAGTGAATTTCTCCTTACC
ATTGGTCAGTTATTTCAAAGCATTGGATTGGTATTTCCTGGTTAGTTTCG
TTTTCATTCTGCTGGTGTTGGTTGAATACACCATTGTGGTTAACGTGGAT
ACTTCAAGAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATGCAAAGAAAGAAGAAAAGGT
TAGTGCAGCAATTTTTTCCAGTAACCTTTTAAAAGTGTATTTTGATTTTC
ACTTTATGAAGCTACAGTGAAACCTCTAATTAACGGACACTCTAAAAGGC
AGACACCTCTGATTAGCGGACAATTTCATTTTCCCCGGCCGTTTCCTAGT
CAAATCATCATAAAAAAGTTTCTAAAAGGCGGACACTCAATTATCGGACC
CTCTGATTAGCGGACAATTTTTTTCGCATGAAATGGCCAAAACCCCTATT
TTAGCTCTCCAATTAGCGGACATTGAATATCAAACGGGTCACAGACGTCC
AAAATTGAAAAAAAAATTTTAGATATTTTTATTTCGAGCACTTATTAGTC
TTATTATTCAAATTATTTATACAAATTTCCAGTTTTCCCTTGACCCATTC
AACGAATTTAGGTGGGCCAAAGAAATCATAAATCACTGGTACTTCAAGTC
CGTACTCACCACCTCGATTTAACCTCTTGCCAGTCACTCGAGCTCTTCTA
TGGCCTAGTGTCTGCAGATAAGTACTTTAGACCCCAATTTTATATTTTCG
ACACCCTGGGATGGCCTAATTTAAAAATTGGAGCTCCGAGATCAAAAGTT
TCTAAAAGGCGGACACTTCTAATTAGCGGACACTAACCCCTTTCCCCGAT
GGTGTCCGCTAATTAGAGGTTCCACTGTATATAAAGATGATTTGTTACGA
CCCATCATGGAACTTGATCTTATACGGGTACAAATTTCTAACCGTGCCAC
TATTTCAAGAAAGTTTGGCGGAACTCTGGCATTTAACCATGCTAATAAAC
TAGTATGTTAATTAATCATGTAAAAGGGTGGGAACTTAAGGGCGGCGGGT
GTTTGCTAAAATGGGAGCTCCGTAGGAGAACGAGCAAAAGTTGGTGAGAG
GTCAGCCCCTCCTTCCCCGCCCTCTTCCTACGCTCACTTTTCCCGCGTGA
TATCGTTCCAGCCCGAATGGTGTGCTGGTCTATAGTCTAGGATTTAGTTG
ATGGATTCTAAAAAAACTCCGATATAAAGCCGATGAGGACTCATTTTTGT
GGTCGATAAATTGATACCCCTTTCTAGACGTGTTTATGGACTTTTTCAAA
AGCAAATTTTGACTTCAAAAGCGTATAGCTTGAGAATCACTAAGCCAATT
TTCATAAGTTATATACCAAATTTTAAGTTTGCTTTTCCTCTTTACAATGA
CAAAATAATTTATCAAAAGTTTGCATTATTTCGGACACAGTTAGCAATCA
AACCTTTACACTTCTTTCTGGGTCACCCGGTGTAAATTAAAAGTAAAGAT
TTATCATATATACACCCCCTTCTCACAGACCCGGTCGGATCTTTTCAGCC
AGTGGAGAAAAGAATAACGGACTGAAATTCGATGAGGATCGATATTCCCA
CATTTTTATGGCTGGAGATTTCAATTCTTTTGTTTTAAGGTCAGAAAATT
CAGTGGGAATGAGAAAAATAGCATAATACTTTGCAATGAGGATTGGTTTA
ATTGATTATTTTCAGTGGGGAAAAAATTAGACGATCATTTTCCGCCGGGG
ACGATATTTCGGCGAATTTTTCCAGTGTGAAGGGATTCCAGTGGTTCTGT
GAAAAGGAGGTGTATATATTGAAAACAAGTACAAAATAAACGTATGACCA
TACATACATAAACCATATTCTTCATTTTCAAGCGAAATTCTTTGAAAAAT
GCATCACTAAAGGAAACTGCTTTGGATTCCGCACGTAGTCGTAAAGCCTC
AGAAGCACCAGGAGCACCAGTCAATGTTAAAGAAGTCTTGAAACGTAAAA
GGAAAGTCAAATTTGATGATTATGAAACGGGGACTTCGAGAATTGACAGG
GTGGCACGATTTTTGATTCCATGCTCGTATTTCCTCTACAATATTTATTT
TTGGTTTGTTTTTATGGATGAACGACATGCATACGCAGCAGAACACAGCA
GACCCATTCATAAATGAATGCACGGTTTGTGAGAAAGGTTTAACGTTTTA
AATCGTTAGTATGGTACGTTTGAAACTGTTTTGATTTGATTAACAACATG
AATAAGTTGTTGGCTTATTTTCATATTTACTCTGACCATTTTCATGAAGA
AAAGACATGGTTACGCTTTGGCATTGCGGTTAAATTTGTATGCTTTCATG
TGCTAATTGGAAACCTGTTCTAAGCCGTTAACCCAGTCATGTTTTTGGTA
AAATATTAACACTCCGGAGCGCAGTTGTATATTCAAAAATCTTGTTTAAA
TATATAGTTCAACGTTTTTGTTTCTTATAGATAGAACTAAAGCATTATAT
CAGACAAAAGAGTCCAATGTCAATGGTAAGACGAATGTACGAAATATTAC
TGAGTATTTGAGATAACAACATGTTTATTATTAATGTAAACTGTAGCCTA
CAATTCTTATATTTTTGATAGGTCTTATGTATTATCGACATGGTTTTTCT
CTTGATTCTCTTGATTTTTTTTTGATTATATAAACATAATATAACAATAG
AAAGACACTGTCCTGATATCAGATATGTGTCTGATATGAAACTGGAACAC
TAATGTAAAAACAAAACCTTTGCGAATGAAAGAAAATTATCTTTCGTAAA
TTACTAAGAAAAGCAGGATGAGCTAACCTTGGCTAATTTAGGATGCGTTT
TTAGAGATTCAAAAGAGTAAAATACACTCTCTTTTTTGAGAACAATTATT
CTCAGAAATGCCAGAAAATAAGAACAAATTAAAGGTCAAAACGGTTAAAA
TAACTGGCTTGATATCCAGCCGCAGGAATAACCCAATTTTGCCCTAAAAA
TTAGGATAGGATAAAAGTGATTTGAAGCTAAAATTGATAAGAACAAAGAG
ATAAGAACAGCCGAGCCTCTATACAAATTTGCTGCCTCTTATAAAAAAAG
AGTGTACAGGGCGTGTACAGAAGATCTTAAATTTTTAAGCCTCTGAATGT
TCCTAATTTTTTTACTATCAAGCTTGAAGATGTTCTTAACATGTTTTAAT
TTTTGCCATTTTGTGATTTGTTGTCCCTTTTTTTAAATCGGGTCAGAAGG
ACAAAGACTTAAAATTTTAACTGATTTTCATATTTGAAGAGATAATATTA
GTCTAAAGGTTTTTTATCAAAGATTTGGGAACAACCCATAGTGATACATG
TTTTTATTAATAAGAATATCACCAAAATCTTTGAAGCCTTTTGATATTCT
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AACAACGGTCCCGATCATTGACGTAATTTTTATAGGAATTCTGTATTTTT
TCCATTATCTTTAATACAGAATTTGTCGTTTTATTTTCAAAATTCAATTT
TCCAATATCATCCTTTCTTCAGTGATGGACAGATAAGAAAAGAATGGAAT
TCACTTTTGAAAGGTTACAACCGACACATTCGACCAAATTATACCGGTAA
ATAAAATATTTCCATTTTAAGTCAAAATCTTCAAATTAGCCAAAACCATC
AAATCCACAAGCAGATACACCAAAACCATCAAATCCACCAGTATATTCAC
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GCAGATTCATCAGAACCATCAACTCCACCTGCAAGTTCACCAACTTCATC
AAATCCACAAGCAGATTCGCCAAAACCATCAACTCCGGCAGCATATTCAC
CAGAACCATCAATTCCACCAGCGGATTCACCAAAACCATCAAATCCACTA
GTATATTCACCAAAACCTATAATTTCCCAGTTATTTTTTCTGGTCACATC
TTGGGGCAAGTGGGTCACATCTTAGGGCTGCTTTTTGGGGTCACATCTTG
GGGCAAGTGGGGTCACATCTTAGGGCAGCTTTTCGGGTCACATCTTGGGG
CAGGTTTCACATGGCAGGGGTCGTATCTTGGGGCTGTACAGCGGGGTCTG
CTAATTAATAAAAACTACCAAAATAATCTTCATATCACCACAATATGTCG
TTTTTTATGAAATTTGTCGTTCTTTTTGTCTATTTTTAGTTATGCAGGAT
TCTTTAGATAAGCCTCTACGCCGTCGTTTTTGAATCAAAAAAATCTATGA
AATTTCAATTGTGGTGATATGAAGATTATTTGGGTAGTTTTTATTAATTA
GCAGCCCCAAATCTGAGTAAATTTGGGTGAAATTCGGCCTTTATGGTGTA
TTTTCTGGAATATTTTTATCCATTTTAAGGCAAAAAACTTCTAGATCTTT
CAAAATTTTAGTCCTAACAACTTTCACTCATCTTTGCTCATCTCAGAACA
TTTTTTTGATTTTGAAAAACATTGCCTTAATAGGGCTGGACGTATGTTAG
GTTGTTTACTTTGAGTGCTCCCCCTCTCGAGATATATATCTGTTTTTATA
TTTTAGTGTGTTTTGATCATCCAATGCAATTTCCATCTATATTTCCATCT
AGGTTCGGCAACAAATGTTCATCTTAAAAGCAAAGTGCTTTCTTTTCGAG
AAATCAATGAACAAAAGATGGTAAGATTCTTCCCTATTTTTATTTCCAGT
TGCGATAATCTAATCTACAAAATGTATTGAGAATTTTGGTTAATTCCTCG
TTTTTAGCAGTTTAGAAGTTCGGGCGAGAAAGTCTCTTTTGGTCTAATTG
ATAAATTTAATCGAATATTTTAATTCAGGAGGGGTTTATAAGCGTCCAGG
CTATATTCTATAAGATTTCGTGGGCATTTCCCTCTTTTCTCAATTTTTTT
TATATCTATTGACTCTTTAGAAATATTCATTTGGAAGAGGTTCAAAATTT
TTTCTTTTTTTATTGATATTCAAAATACCCTAGATTTATTTTCCATCCTG
CCATTAGGCCCCTTTTTCAGGGTCTTCAACGCGGTTTTGTAACAGTATGA
TATTAAAAATATTTTTTTGATTAAGATCATATTTTTATGTGGAGAAAATA
AATTTTTTCAACTAAACAACACTCCAGACAAGAGTCGATACAGTAATGGT
GTTAAAAGTATTGATATTTTTTATTATTGAAAGTATTTCAATACAAAATA
CTATTGCACAAGAATATATCATTGGTATTTATTCCAAATGTGATGATGGA
ACGATTAAAACGCATTCGAATAGAACAGATGTACAAAAACAAGCTTTGCT
TTACGACAAAATCATCAACTACACCTTCTATTCAGAAAGACAGTATGGCA
AATTTCTTCAAAGTATGGAGTATATCAGCTTTGATGTTTGCACCAGTCAA
GAACATCTCTCGAACCTTACTCAAACACTTATCCTAGACTATCAGTTTCA
ATCAGATGTCAACCATACTGAATCTGGAGAAAACGACGGCAAAATAATTC
TTCTATTCGTCTATTTAGAAAAAGATCTTCACAAATTATTATTAGAATTA
TTATTTGCTCATGGACGTATACCAACATTACTATTGAATTCTCATCCATT
GCCAGGTATTATGAATCCATATTACACGGTGATGGATCCTTTAGACGTTG
AGGTTTACATTCTGTTGATACATGCTAAGATATTCGATTGGCAACGTATA
GGACTGATCTTCATTTCTGGACATGATAAATTATACGTAGATTATTACCG
TGATTTAAATGAAAGAGTTATTAACAAACTTAGAACCGAACATCCAAACT
TATGTTATTTCAAAGAAACAGTCGATATACGAAATGAAACTGATTTGGAA
TCTATGATATTTAAGCTGCACGATGAACAAGATTCGAATGTTTTGATTCT
CTTTGGCGAACCTGATGATCAGATAACTTTAGTCAGGAAAACAAATACGG
ATTTCCATACAAGACATATATGGTTCACTCACGATATTGGGCATGATCTT
AGAGCACTTTTTCCAGATCCTTACGAAAATATTTATTTATTCTCATTTAC
AACTAAACTGAGAGAGCAAATCGTCCTAAATCAACTCAAATATGCTTTCG
ATATCAAACCACGTTTCAAAGAACTTTTTGTTGCTAATGGGAAAACAGCT
GAGTTGGCATTTACTTTGGCTAAAGAGATTTTGGTACAAATCAACAAAGT
GTATGGTAGATTCACTAATTTTACACCTTATTTTCTTGTGAAAAGAGCTA
TTTTACTAACTCTAAAAGTAGTTCAGTCAGTGTTACTTCAGAAAAACATT
TTTTCGCACGAATTTGTACACTCTACGGTGCAAATGGTTTACGATATAGA
TAAATATGACAAATACAAGGACACTGGTATTCAAGGCATATTATGTCATA
AGCATGCATGCGATCCAGGTTGGGAACAAACTAGAGGTCAACTTTTAAAG
AGTCTTACAAAATGGAGTTACGAATATGGCTTCACATGCCAGCGTTGTGC
TCCCAACTACATTAAACCTAAATACGGGTTCCATTTATGCCAGAGCTGTG
CAAAATATCATCAATCCAATGTTGACCATACTCGATGTGTTGACCCATAT
ACTGATATATTTTTAACCCAAGATCTTCTGTTCTATGCATCAATATCCTT
ATCTTGTTTCGGCGTTAGTATCAATGCAATCACACTGATGACTTTCATAT
TGCACCGAAAAACANCCTTGTTTCGGCGCTAGTATCAATGCAATCACACT
GATGACTTTCATATTGCACCGAAAAACACCAGTTGTTAAAAGCTCAGATT
TCGTGTTAACCGTTCTACATTTGGTAACATCTTTACTTATTAATGTAGGA
ATTATATGTCTTCGGTTTATGAAGCCGGCAAAAATATCATGTTCTTTAGA
TGCTATTTCACCAGGATTCTTGTATACTTTCTTTATTACCATTGTTTTAA
CTAAATCGCATAAAATTTTAAAAGCATTTGGCTCAATGAGGAAGTTAACA
ACGAAAAATAAACGGAACACAATAGTTCAACAATATACCATAATTGTTGG
TTTAATGGTGATTGTTATTGTTTTGACATTAATTGCACTAAGCAGCCAAT
TACCAGAAGTATTATCTCAAAGAGATACCCAAAAACTAATCATCTATATA
TCCTGCAATAACCTATTGCCAAAAATCTTCCAATTTGGATTTTCAGGAAT
TTTACAAATAGCTACATTCGTTATTGCGTACCGTGGTCGAAATTTACCGG
ATATTTTCAACGAATCAATGTCTTTACTGTACGCTTCGTTTTCGTCAACA
ATGTCACTCATTGTGATGTTTATTGTTTTAAAATTCGGAGGGAAAAACGA
TCTGTTTTTACCAGCATCCATCATCTGGGTAGCGGTATCATTGAATTTGA
ATATCTATGTACTATTATGTTATGGTAAAAAGATTTATATTATTTTGTTC
ATGAAAGAACGGAATACTAGAAGTTATATACAAAGGAAGACGTTCGAATC
GAACCAATCGGCTTCACTCTAGACGATCCAATCAGAATAACTTAATTTTT
AAGAGAATTTCTAAGCATAGTCCATTCACTTATGATATGATATACTTTAA
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AACGCCCCAAGCATTATGCATTATTCAACCTCTCTGGCTGAAATTTTTTA
TAAAAAATCTGTTTTTTTCTTGAATGGGGATCTTTTTCTTATTCAAACTA
AACGACCCCCTCCCCCCTCAACTTTAAAATACACTGTATCACATACCCAG
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CATCAACATGAAAAATATAAGCAATCTGAGTGGCGAAAAATGTGTACATA
AATGCTGTATTTCATATTGTACCGTACAAATCCGGGGGGGGGGGTACTTA
GGCAAAAATAGGTGCTGGGTATGTGCGGACGGTAAGGGCCAGGTTTTTCA
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AAGTCTCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGA
AAAAGTCTCTCTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCT
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TCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAG
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GTTGGGAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACT
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CTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGG
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GGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGGAAAA
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GTTTTCGGAGGTCCAGTCCGCACATACCCCTCATCCACCAACCCTAGTAC
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CGAAATTTATCATCCCCAGAAATGTTTTCGTTTTCCTCTCAAATCACGAA
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TTCAAATGTTTTGATGTTGATTTCACCAAAATACAGGGGAAAAAATAAAA
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TTTCACCTTTCAAAGTCTCTCTAAGGGTCGGAAAAATCAGAAAGTTTTAA
ATTAGTCTCTCTAAGGGTTGGAAAATTCAGGATTTTTAGGAAATTGTTTG
ATTTCCACAGAAGAAATTGTAATAAAGTCTCTCTAAGGGTAAGACTTTTT
ACAAAAATCGAAAAAAGAAAATTCAAAAAGTCTCTCTAAGGATCTCCTTT
TCAGCAAACGTCAGTCTCTCTAAAAGGGTTGGTTTTCGGAGGTCCCGTCC
GCATATACCCCTCATTCGCCCCTCATTCGCCAACCCCCAGGCTCCCATAT
TATACTCTGTAGCTATTTATTACGTATTTTTGGTAGCTTTTTGATACTAA
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CTGATTCTTATAATAAAAAAACGTGTATTTCACTTTATACAGAGTTACGG
GATCGATATTTGGATGTCACAAAAATGGGAAGACTATCGTCTCAAACATA
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TTTCGATTCTATCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005660	XLOC_005660	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000102	supercontig	sc0000102:90344..114093 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00010096 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GBRB1 (Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1 OS=Homo sapiens GN=GABRB1 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 103.605 bits (257), Expect = 2.124e-23
Identity = 54/146 (36.99%), Postives = 85/146 (58.22%), Query Frame = 1

Query: 1459 IRKEWNSLLKGYNRHIRPNYTGSATNVHLKSKVLSFREINEQKMSYGIDIWMSQKWEDYRLKHNISKVITPLLGLGRPSNLIWVPDTVFINEINSK*HLVTVRNNKVDINSDGTVHLISRVTVVASCRMNFRFYPLDTQFCYLFIE 1896
            +++  + LLKGY+  +RP++ G   +V ++  V S   ++E  M Y + ++  Q W+D RL +  S +   L    R ++ +WVPDT F+N+  S  H VTV+N  + ++ DGTV    R+T  A+C M+ R YPLD Q C L IE
Sbjct:   37 VKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPPVDVGMRIDVASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQSWKDKRLSY--SGIPLNLTLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE 180

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00010096 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00010096 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
GBRB1	2.124e-23	36.99	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1 OS...	[more]

You are here

TCONS_00010096 (transcript) - C. hemisphaerica