TCONS_00009116 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00009116
Unique NameTCONS_00009116
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1486

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00009116 ID=TCONS_00009116|Name=TCONS_00009116|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1486bp
CTTGTGTGCTCTGGAAGGGAAAGCGTAATAGACAAACCTCCAGATTTTCA
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CATTAAACTTGATAAAGACAACCGTCGAAGTCAAAC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000090:610413..627976+

Legend: exon
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>TCONS_00009116 ID=TCONS_00009116|Name=TCONS_00009116|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17564bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090:610413..627976+ (Clytia hemisphaerica)
CTTGTGTGCTCTGGAAGGGAAAGCGTAATAGACAAACCTCCAGGTTGTTG
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GACgaattttcgacaaattttCCAATGTGTAGGTAATCCTAAGAGTTAGT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000090supercontigsc0000090:610413..627976 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00009116 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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