TCONS_00009079 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00009079
Unique NameTCONS_00009079
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length512

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00009079 ID=TCONS_00009079|Name=TCONS_00009079|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=512bp
CCTGCTTCATGACCATGGAACTTGGCTGCTGAAAAGTAAAGgttgTTAAT
GTTGATGGAATAGAACAATGTCAAACATAGTTAAATATGCAAAGTTTGCA
GACGAGAAATGACGCTAGTTTCTGTGGAGATGAACCTTTACTTTGATACT
AGATGGTTTCTAGCAACTCAAAATTAGCAATATCGTGATCTTCCAGAGAA
GAACAAcatttcctatctataaaagttattgatgttgatggaaTGGAATA
ACGCCAAACATAGTTAAATATGCAAAGTTTGAAGACGAGAAATGACGATA
GTTTATATGGAGATGAACCTTTCCTTTGATACTAGAGAGCGTTCAGAGGG
TGAAGCCCTCAAATAAGCGTCGGTCAGTGTCCAACTTGAAAATTCATTTG
ACTGACTAAGAATCTTTTTGTGTCAGTCATGTGATGATAagttcaaaata
attattttacaCCCTTTTTTTTACTGAACActtcctttgtagctttcaag
agtgttttgaaa
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000090:901..11701+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00009079 ID=TCONS_00009079|Name=TCONS_00009079|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10801bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090:901..11701+ (Clytia hemisphaerica)
CCTGCTTCATGACCATGGAACTTGGCTGCTGAAAAGTAAAGGTAATTAAT
TCGTCTTTTGTGCTTTTACTGTGAGTGGTCATAAATGATAAATCCGACAG
CCTTGCCGCTGCCTAAGCTAAATCCGATGGagtctttcaaagtcaaaaTA
GCCAGACTACTTTCAAAGAtgcaaacaaaaataaaaacgaatCTTTCGCT
GTGATACAATGAAGataaggaccctgccgacgcaacGGACTGTCCAGTgc
atttgtccggtggcaaaagtatcctttcgccaCACCGGACGCAATTCCGG
TGTCAGTCcagtgttgcatacagggaattctggacaccggacatttatga
aacaaaaaattaagaaacatcggacgcaccggactggtcatgtcttGTGT
TTTCATTGTCCGGTGGAGAAAAATATCCTTCCCCGACACCGGACATcgga
cttccttaagtccggtgtagagattgtccggtggtaaaaaaattctcatt
ttacaccagaCATTTGCGTGTTCGATGtttgttaagtccggtgcgtcggc
agggtccttgaagataccaaagtgtcaactaaactgagagatttgataca
ctgaaccaaataacaataattcctttttttttacacaaaacataattttt
tgttacaaaattgttaatgttttaaaactagcaacagattcagaataatc
AGTTTGTCAAACTAGTGTCCTGCCGAAATgggtatcaaagattaatgctg
taAAAGCGCTATCGTGGTGCTTTCCGTAAATCTGAGAACCATTTTTAAGT
TAGAAAGCCAccccttttacaaatctgtatgagaaaggcaactgcataca
ctttatCTGAAAGTACCAACAAAAATTCTAAAGCAAGCATCATTCTTTAa
cgaaaaaactaaactttTAAAACGACagatatggtatgttgttgatgaaa
gggtgctaattttggtagattgtttcatatttcccatgttcaaagtatgA
ACCGTGGAAACTtactctttcttactcaaataagaaaatgatctgttata
aacctagattgtttcatatttcccatATTCAAAGTATGAACCGTGGAAAC
TTACTCTTTCTtgctcaaataagaaaatgatctgttataaacctagattg
tttcatatttcccatATTCAAAGTATGAACCGTGGAAACTTACTCTTTCt
tattcaaataagaaaatgatctgttataaaccttaaacaatcttccaaaa
gcaatatgttTCATATTCAAAAAGCAACGCAGCGAACGTCGTGTGATTGA
GGCCCTGGAGTTTACGACATATCATAATTCAATTATATTGGCATTTAACA
TTCTAATGAAAAGTTTCcaatatttgagttaaaatttttgaagtccaATG
CTTCTTTTTCCTATCTTTGTAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNTGATCTTCCAGAGAAGAACAAcatttcctatctata
aaagtaggttttcatatctttaacagttttgtttcattttgaacagtctc
tttttctccatttttaatttagaaagccaccccttttacaaatctgtatg
agaaaggcaactgcgTACACTTTATCTGAAAGTACCAACAAAAATTCTAA
AGCAAGCATCATTCTTTAACGAAAAaactataaacttttaaaacgaCAGA
TATGGTATTTTTTTGATGAAAGGGTGCCaattttggtagattgtttCGTA
TTTCCCATGCTCAaagtacgaaccgtggaaacttactctttcttattcaa
ataagaaaatgatctgttataaaccttaaacaatcttccaaaagcaatat
gNCCCGACTTAAAATGAtattaaaaagtgaactttCCAGTAAACATCTAA
TCAACGCCATCAACATGTGGGCAGTACCGGCACTGTCATACGGATTTCCA
ATACTAGATTGGTCCATAACCGAACTTGAAATCATCGACCGAGAGACACG
CAAGATGCTGCAATCGTTCCACGCAATGCACAGCCAAAGCGACATAACGA
GATTATACATCCCAAGAAAGGAGGGTGGTAGAGGTCTGATAAACTTAACT
GAACACTTCAAAAACTCGATCATCAACTTCAGTACCTATTTGCTATCAAC
CAATGAAGCCCTCCTCAACTTGGTTTCTGATTGGCAGACCTCTAGAAACG
CAAAATCGATACATGAAAGGGCGCAAATCTATTGCCAGGAGCTCGAGTTT
GAAATTGAACAAATGTCTACCCTCAACAAGCAACAAcggaaaaacaaaat
taaaaataaacgaACTGATATGAAAGTTGAAtttctaaaatcgaaaaatc
tccACGGGCAGTACGCTAAGCTTCTTGACGAACCACACATAGACAAACAA
GCCTCGATGCATTGGCTAACTGCAGCTTCACTTAAATGTGCGACCGAATC
AGCCATATGTGCAATACAAGAACAAGCGATAACGACAAATTANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTATATTTCAAtctccaa
aatttacatttggctcttcggctgaaaatattatatagcaTATGTGTgca
aagtctagaaaaaaatatttatatttataaaattatttataCACTTCATC
TGAAAgtaccaaaaaaaattctaaagcaagcatcattctttaacgaaaaa
actataaacttttaataggacagatatggtatgttgttgatgaaaaggtg
ctaattttggtagattgtttcatatttcccatgttcaaagtacgaaccgt
ggaaacttactctttcttactcaaataagaaaatgatctgttataaacCT
TAAACAATCTCGCAAGAGCAATATGTTTCATATTCAAAAAGCAACTCAGC
GAACGTCGTGTTATTGAGGCCCTAGAGTTTACGACATACCATAATTCAAT
TATATTGGCAATTAACATTCTAATGAAAAGTTTGCAATATTTGAGTTAAA
GTTTTTGAAGTGCGATGCTTCTTTTTCCTATCTTTGTAAAAAAGTTCACT
TGAAAAAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGATTTAATATTT
TCTATGCTTATCGAGAATCATTCTGCTTTCTggcctttgtttttattttc
atttaaggttgTTAATGTTGATGGAATAGAACAATGTCAAACATAGTTAA
ATATGCAAAGTTTGCAGACGAGAAATGACGCTAGTTTCTGTGGAGATGAA
CCTTTACTTTGATACTAGATGGTTTCTAGCAACTCAAAATTAGCAATATC
GTGATCTTCCAGAGAAGAACAAcatttcctatctataaaagtaggttttc
atatctttaacagttttgtttcattttgaacagtctctttttctccattt
ttaagtTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNttccatttgtaaaaatgatacTCTGATA
TTATCAACCTTGTGTGTGAAAGGATAGATGAACTGAAAAACAgtggaatt
tttttattcaaaaaaagattaaatattttctaTGCTTATCGAGAATCATT
CTGCTTTCTggcctttgtttttattttcatttaaggttgTTGATGTTGAT
GGAATGGAACAACGTCAAACATAGTTAAATATGCAAAGTTTGCAGACGAG
AAATGACGATAGTTTATATGGAGATGAACCTTTACTTTGATACTAGATGG
ATTCTAGTAACTCAAAATTAGCAATATCGTGATCTTCCAGAGAAGAACAa
cattcctatctataaaagtaggttttcatatctttaacagttttgattca
ttttgaacagtctctttttctccattttaagttagaaagccacccctttt
acaaatctgtatgagaaaggcaactgcatacactttatCTGAAAGTACCA
ACACAAATTCTAAAGCAAGTATCATTCTTTAACGAAAAaactataaactt
ttaaaacgacagatatggtatgttgttgatgaaagggtgctaattttggt
agattgtttcatatttcccatgttcaaagtacgaaccgtggaaacttact
ctttcttactcaaataagaaacTGATCTTATTAAAccttaaacaatcttc
caaaagcaatatgttTCATATTCAAAAAGCAACTCAGCGGACGTCGTGTT
ATTGACGCCTTGCAGTTTACGACATACCATAATTCAATTATTTTGGCATT
TAACACTCTAATGAAAAGTTTTcaatatttgagttaaaatttttgaagtg
cGATGTTTCTTTTTCCTGTCTTTGTAAAAAAAGTTCACTCGAAAAAGACt
tccatttgtaaaaatgatacTCTGATATTATCAACCTTGTGTGGGAAAgg
ataaataaactgaaaaaacagttgaatttttttattcaaaaaaagattta
atattTTCTATGCTTATCCAAAATCATTCTGCTTTCTggcctttgttttt
attttcattcaaggttattgatgttgatggaaTGGAATAACGCCAAACAT
AGTTAAATATGCAAAGTTTGAAGACGAGAAATGACGATAGTTTATATGGA
GATGAACCTTTCCTTTGATACTAGAGAGCGTTCAGAGGGTGAAGCCCTCA
AATAAGCGTCGGTCAGTGTCCAACTTGAAAATTCATTTGACTGACTAAGA
ATCTTTTTGTGTCAGTCATGTGATGATAagttcaaaataattattttaca
CCCTTTTTTTTACTGAACActtcctttgtagctttcaagagtgttttgaa
a
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005089XLOC_005089Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:901..941TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:901..941Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:901..941TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:901..941Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:901..941TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:901..941Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:8908..9090TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:8908..9090Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:8908..9090TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:8908..9090Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:8908..9090TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:8908..9090Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:11414..11701TCONS_00009079-exon-sc0000090-1491911889:11414..11701Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:11414..11701TCONS_00009079-exon-sc0000090-1510915933:11414..11701Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:11414..11701TCONS_00009079-exon-sc0000090-1575043694:11414..11701Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000090supercontigsc0000090:901..11701 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.13694	2.64314	0.856715	0.390993	0	0.558466	0	0	0	0	1.02939	0	0.663103	1.59367	0.750403	0	0	0	0	0	0.370488	0.393943	1.40877	0.215577	0.377137	1.99274	0.802756	0.342689	0.217549	0.264815
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00009079 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top