|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00009021 ID=TCONS_00009021|Name=TCONS_00009021|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3809bp
gggaaatcaaaacaaagaatgTAAACAAAAGTTTGATTGTGGGGATTACA
ATGGACTTGAAACTTGATAAAAAATATGTCCGCTCATCATCTctactgaa
aatcaaaacacaggaaagaaaaataagagGTTGTTGCTGGCTGACAATCC
TCTAAATTAAGAAGAATACTCTAACTCATTCAAGAAGGTATTATAAAACA
TTATGTTGAAAACATGCTTCATATTAGTTGTTTTGTTTAGCGTTTGTTCT
CgtgtatttttggttgattcAAATGAACGAGAAGTTCGAAGTATAGAGAA
TGATCGAAATGCTGAAGTCAAGaaggaaataaaaaagcttgaaGACATTG
AAGCAAAGCTTGATAAATTAAGATCCCTTTTGAAAGATCCCCTTGACGAA
GAACATGATATTTTGGATAATGAGACTGATGATACTCATGCTCATGAATG
GACTGTCCAACTGAACTCTGATAAATACGATGACGCCAAAGATATTGCTA
AACAATATGGTTTTGACCATATTCATAAGCTCGATGTTGGGTATGGTGTT
TATAGATTTAGTCACTCTAAAAAGTCCTTAGAGGAAgcagaaaagaagaa
aaaggagATGATCAAAGAGAAACAAGAAGAAATAGAagttgaaaaaacaa
ttagtaAACGTGATCACATTGATTCTGCTAGACTTCTTGCAAATGATGAA
AAAGTTACTTGGATGAAACGTGAGAGAATTCTTCAAAGAGAAAAGCGTGT
TCCTGTTAAAGATGCTAAAAAGGAGGCAGAAGCAGCAAAGGATATGATTC
CAAATGATCCTTATTTCAGTGCACAATGGTATATTAGAAATGATGGTCAA
ACTACTGGCCCTGCCGGATTTGATAGCAAGATAGAGTCTGCATGGAAGAG
AGGATACACTGGTAAAGATGTTGTATTATCAGTGTTAGATGATGGTATGG
ATCATACTCATCCAGAGTTAAAAGATAATTATGACCCTAAAGCCAGTACT
GATTTAAATGGTCACAAAGCAGATCCATTCCCTAATGATTCAGATCCTTA
CAACGCACATGGAACTAAATGTTCTGGTACCATTGCAGCAAAAGGAAACA
ACAGCCTTTGTGGTATCGGTATTGCATATGACTCCAAAATTGGTGCCATT
AGGATGTTGGATGGTAAAGCCACAGATGCTTTGGAAGCCAATGCATTGTC
ATTCAAACGAGATCACATTGATATTTACAGTTGTTCATGGGGTCCTAAAG
ATAACGGTGCAACATTTGGAAGACCAGGTCGATTGGGAAAGATTGCTCTT
CATCAAGGAGCCAAATTTGGAAGAAATGGCAAAGGATCTCTCTTCATTTG
GGCTACTGGAAATGGAGGTATGCAGCGTGATGACTGCAATGCTGACGGAT
ATGTTAACAGTATCTACACCCTTGGTATCGGGGCTGTCAACGAGCATGGT
GTCTCTACATACTATGGTGAACGATGTGCCGCCATGTTTGCCGTTACTTA
CTGTAGTGGTAAACACAAAGCTGGATTAGGTGATCCAAAAGCCAATGTCA
TCACCACCTACCTCCATCATCAATGTACTGATCATTTTGTTGGTACTTCT
TCTGCTGCTCCGTTAGCTGCCGGTATCTTTGCTTTGGTTCTTGAAGCTAA
CAAAAATATCACCTGGAGAGATCTTCAACATTTGGTGTTCCAAACTGCTC
AGAAAGTCAGCCCTAACGATCTTGGTTGGTTTAAGAATGGTGttggaaaa
ttctacaaccaTAAATTTGGATTCGGTGTTTTGGATGCTGAAAAGCTTGT
TGATGCTGCATTGAATTGGACCACTGTTCCAAAACAAAAGAGCTGTCATT
TCATCTTGAGATTCAAGAATGGTAACATTCCATCCAAGGAGCATTTCAAA
CTTGCGTTCAACACTGATGGTTGTCAAGCTTGTAAGGTAAAGGAGAGTGA
CGGTACCTGCAAAAATGCCATCACTAAATTGGAACACGCCGTTGTTAACG
TCACCTTGAAACACCGACGACGTGGTGATTTAAGCATCAAGTTGGTATCA
CCGAGTGGTACGGTCAGTAATTTACTTCATCAACGTCCATTTGATGGATC
ATCTGCTGGATTGAAAGGTTGGACCTTCATGACCGTCTATAACTGGGGTG
AGAACCCTAAGGGTACCTGGAATCTGATTTTCACCGATAATAAAGGTATG
AATCCGTTCGACACTAAAGATCGTCGTGACGTTGAGGAGGAATACATGGA
GGAATTAGACAAGAAGAAGGAACGTGAACAACGTCAACAACGTCAACAAC
AACGAAATGTTGCCGCTGACACTCAACGTCAAGACGAAAACGTCGTCACT
GCCCAAGGAGATATCTATAAACGCGAAGACGAGGTTTCCAACGACGCTTA
CGCCAAATTGTACGACAAATACCGACGTGACGAATCCGCATACGAGCAGT
TGAAACGAGAATTATACGAGCGACAAAGTCAAGGATACGCTGATGATTAT
TACCGATCCGGTAGAAAACGAAGGTCGAACTTTGCTGATGATACGACGGA
CTACGTCAAGTATAAGAAAGACACTATTTCTGATTTGAAATATGAATACG
AAAATGATATCTTGAAACGAAGTGATCTTGCTGGTGAAGTTATAGATCTT
AGAATTACACTTTATGGGACTGGTGaataaattatcataatttttatttt
cggttagaaaattaaatattttctctctcaATGGGTTATTAttgttagaa
aaaaattaaaagcacTATTTATGTCAACCACAAGGAAGCTCAACCAGCGT
GACCGATCTGCACTAATTAAAACGTCTAATGTGGCTTATGTTGTTACATT
TCTTATTAATTGATGAGATTAATTATCAGAGTTTCCTTGTCAAAGCGGTA
TTCTTTGCAAAAGGACTTTCTAAGGATATTCTCTTTCATACTTCATACTT
CCTTATGCCCAAAATGAGCATCGAAGATGAAATTTAATTTCACACGATGC
AGAAGATTAATGGTGCCTGTGATTGACATAGATTGGTAGATTACCATCAT
CGGTAGATAAATCAAGGAGggattttagttttaaaatcACGGCTTGGTCA
CACGTCCAGGAAAAATGTTAAGGAAGTTTCTCCAGATTTATCTCGCGATG
TTTGGTACCATTTCTTAATTCAAAATGCATTGTCTAGCTAAGGAATAATA
ATTCTAGCGCCAACCACAGCGAACAAACGAACAAACGAATGCtattcctt
tgtttactttgcatGCTTGCGAATAATTCTGGGCAAGATTGAAAGCTTTG
GCTTGACAAACCACCTTCGGGCTTTAGCTGAACAttgcattttgaaattt
aaattatttattgCATTGTATCTTCATCTAACTAAAGTATTGTGTAGTCT
TTGGGGTTTCAAATTAgctaaattatttttcaatttaatcaTCTTATTTT
TCTACTAAATAGTTTCTAACCTAGAAAATAGCAAACCGCTAGTCTCACAA
ATGAAAGTCtcctttttattaaaaaaaaagtcaacaaatagTTCGTTGAT
GAATTGAAATAACCAATTATGCCTACGAGGTTGtaaattttagtaatttt
gaGCAATTAGGGAGCTTAAGATTGTGACTTAAATGTCAAACTTAGATATC
TTTAGAGATCATTGATATTAAGGTCCCTACAAAATAGCCTATTTTCCTAA
ctaatatatttattttttgactaatttttcattttggtataattattttt
tgtttgtagtGATGTTTTGTGTATATTTTgctttaaaatataaaaaactg
tTATTAGCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000089:87584..95635- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009021 ID=TCONS_00009021|Name=TCONS_00009021|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089:87584..95635- (Clytia hemisphaerica)
GGGAAATCAAAACAAAGAATGTAAACAAAAGTTTGATTGTGGGGATTACA
ATGGACTTGAAACTTGATAAAAAATATGTCCGCTCATCATCTCTACTGAA
AATCAAAACACAGGAAAGAAAAATAAGAGGTTGTTGCTGGCTGACAATCC
TCTAAATTAAGAAGAATACTCTAACTCATTCAAGAAGGTATTATAAAACA
TTATGTTGAAAACATGCTTCATATTAGTTGTTTTGTTTAGCGTTTGTTCT
CGTGTATTTTTGGTTGATTCAAATGAACGAGAAGTTCGAAGTATAGAGAA
TGATCGAAATGCTGAAGTCAAGAAGGAAATAAAAAAGCTTGAAGACATTG
AAGCAAAGCTTGATAAATTAAGATCCCTTTTGAAAGATCCCCTTGACGAA
GAACATGATATTTTGGATAATGAGACTGATGATACTCATGCTCATGAATG
GACTGTCCAACTGAACTCTGATAAATACGATGACGCCAAAGATATTGCTA
AACAATATGGTTTTGACCATATTCATAAGCTCGATGTTGGGTATGGTGTT
TATAGATTTAGTCACTCTAAAAAGTCCTTAGAGGAAGCAGAAAAGAAGAA
AAAGGAGATGATCAAAGAGAAACAAGAAGAAATAGAAGTTGAAAAAACAA
TTAGTAAACGTGATCACATTGATTCTGCTAGACTTCTTGCAAATGATGAA
AAAGTTACTTGGATGAAACGTGAGAGAATTCTTCAAAGAGAAAAGCGTGT
TCCTGTTAAAGATGCTAAAAAGGAGGCAGAAGCAGCAAAGGATATGATTC
CAAATGATCCTTATTTCAGTGCACAATGGTATATTAGAAATGATGGTCAA
ACTACTGGCCCTGCCGGATTTGATAGCAAGATAGAGTCTGCATGGAAGAG
AGGATACACTGGTAAAGATGTTGTATTATCAGTGTTAGATGATGGTATGG
ATCATACTCATCCAGAGTTAAAAGATAATTATGACCCTAAAGCCAGTACT
GATTTAAATGGTCACAAAGCAGATCCATTCCCTAATGATTCAGATCCTTA
CAACGCACATGGAACTAAATGTTCTGGTACCATTGCAGCAAAAGGAAACA
ACAGCCTTTGTGGTATCGGTATTGCATATGACTCCAAAATTGGTGCCATT
AGGATGTTGGATGGTAAAGCCACAGATGCTTTGGAAGCCAATGCATTGTC
ATTCAAACGAGATCACATTGATATTTACAGTTGTTCATGGGGTCCTAAAG
ATAACGGTGCAACATTTGGAAGACCAGGTCGATTGGGAAAGATTGCTCTT
CATCAAGGAGCCAAATTTGGAAGAAATGGTATGTATATTTTGTGAATTCT
TAGATAGATTTTTTTGAACCTAGGTAACAGCTGTGTCGTAAAAGATAAAT
CAATCATATGATGTTATGATAAACGTAATTTATGCTGGAGTAATTCAGAC
CTGCCAAATTGAGATATTGAGAGAAATCAGAAATTTTTTCCCGAAAATCA
GGGAAACACTTTTCCAAAAATTGGAACATAAGGCGAAAATAAAAAATTGT
ATTGTTTCCGGAATACAGGTGAAGGAAAAAAGCTCTCATGCTGCACCCTG
GGAAAAATCTTTTTTTGCTATTTTTGATAACTTAAGATCATTGAAATAGA
ACTTTAAAGATAACTTTTATGTACAAACAGTATGAAGTAAGCCCTAAATA
TTAATGTATCAACTACTAACAAACAAAACTTGATTTACAAGCGGGAATAT
CTAACCAAACAACGTTTCTCAGGTAAGTTATGGCATGTCTTAAAATTACC
ATAATTTTTAGATCTCATTAGCCGACAGAAAACGACCAAACAAATGACTG
AACATGAAAGGTACTATGATGTAGTTTCTAACCTGATGTGTAACCTAATT
GTTTTTTCACCGATTTTCACGAAAAACCGCAAAAACTGACGATGACGTCA
TAGAAATTAAAAATTGAATTTCTCAAGGACTGTTTATCCAATCGTCTTCA
AACTTTAACCAAAGATGTATCTCACTAAAGTCGATCATTTGAAAAAAAAC
ATTTTTTTCGAAATTCCGATTATGTCAGCAAAAAATAGGATTTTTCCTTT
TTTCCTGATTTCTGATGACCTCATCAAAATTTCGAAAAATTAATATTTTC
AAATGATCAACTTTAGTAGGATACATCTTTGGTGAAAGTTTGAAGTTAAT
TGGATAAACCATTCTTGAGAAATTCAATTTTTAGTTTTTATGACGTCATC
GATTATGACGTCGTAATCAGTTTTTACGGTTTTTGCAAAAATTAACGAAA
AAACAATTAGGTTACACATCAGGTTAGAAACTTAATCATAGTACCCTTCA
TGTTCAGTCATTTGTTTGGTCATTTTCTGTCGACTAATGCGATCTAAAAA
TTATGTTAATTTTCAGTTTTTGAGACATGCCATAACTTACCCGAGTTGAT
AGCTTGAGTGGTCAACTTAGCTTTTTTTATGATGAACTATATGGATAAAA
AAAAGATTTTCACCTGGCAGGTTTTAGGAAACACTACATTTTTTTATTTT
CGCCTAAGGAAAACTTTTTTTCTGAATATCAGAAAATTGGTAGTCTAGTA
AGCCAGACGACTAATTCAGACATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATGGA
GGGAACAATTTTAGTCGTTTAGAAACCTTTGTGCACAAACTCCAAACAAA
AGAAAAGTGTTAATATTGCAATTATAATTTTATCCTGCTCAAAAATTTTC
TTCAAAAAAAAATGTGTATATATTTATTTGTGTGTTATAAAATTTTTTAA
TTTGAGTTGATTTTGGTTTGAGAGTTTGTTGTTGCTTGATGAATTGTTTC
TCGTCTTGCTACGCAAGTTTCTGCGTAGCTAGCCGGGGATTCTATAAGGC
CGGAACACTGGATTCTTCCAGTTGTTTATACAAACTAAATCCCGTAACAA
TAATCATATCATTATATAACGCCTATACTTACTACGCACTATAAACAACT
CCAGTCTAGAAAATTGGGGAAACTTTTTTGCAAAAATTGGAATAATGAGG
ATATTTTTCTCAAAAATCCAAAATGCATAAGAATTACTTGAGACAAAGTG
GAAATGTGTGAGTTTCACGCCCAATGCGTGAGAGTTGACACCTCTGGTAA
TAAGTTATTCAAAAGGCTGTTGCGTTCTCCCAAAGGTCTATTACCAAATT
TAACAAAAGGATTATAAATTGCGCAGTTACATGTTTGCAGATTTGATATG
TTGTGATTTGTGAACTGTGTTAAGCTTATCAAGAATTTGAAGTGTGTGAA
AGGGCTGATTCAATGAAAACAAGAGTGTCAATTGTACATGAAAAGTTAAC
TCATTTTAGTATATATGTACTTTATATAGTTAGTTTTGTGCACTTTAGTG
TCTTTAAAAAATTCTGCCAAAAGATTGGGACTTTTAAAATAGTATTAAAT
GCTGGCTCTGGAATTGTTTGTTTATCCTGGTTTATCAGTTGGATTTTATT
GCAATGATTTGCTTCTTTGCTTATTATATCTCAGCAACCAAAAAAATGTA
GATTCAAGGTTATTATTATAACACTAGGGAAAAGAGTGGTCCACTTAACT
ACCAACTAAATCAAAAAGCATTTGGGTTAGCCTTCGACTGCAGTCACAAT
ACTTTACCAGGATCTTTTGTTTCCTTGCCAGTTCTCAGTTAATGGTGCTT
GGGCCCATTAGCTAATAGGGGCTAAATTTTAGAAGATAGGACCATACATA
GCCTTTCACAGCTGAGCCACATTGGTAATATTAGTTTTAATTATGGAATG
ATTGTTTTTTTTAGTGTTTGTAGTTTTTTTTGGGTAGGACTTTTCCCTTT
GTGTTTTGTTGGAGTATTTTTAATACTCTTAAGTTCTGACAATATTCAAA
AAGTAGATAGGTATTGAATTGTTTTAGAATCTTAAAAATATTAGCTTGAT
ATGTGTCAAAAGGATTAATACATTCTGAGAATGAGTATCTATTTGAAAAA
AAAGAATACACTGTCCTCCTTTCTTAATTTAAATATATATTTTTGACTTT
CTACATGGGAAATGAGTTTTAAGCTTTTCAGATTAATTCTGATGAAGAAA
AATTTTTATGATGAAATTTAATCAGAATTGTAAAGGGGAAAGGAAGAAGT
TTTCCTTTGATGTAATAATATCAAGAGATGAATACTTTGTCTGTTGTATT
TATGGAAATTTACAATTCTTCCCCTGTTTTGTCTTCATTTTTGCTTCATA
AATTATAAATGACACAGGTTTCTTATGTGTTGTTGTTTGCTCTGCTTATT
ATGTATTCTAGCTTTGTTTCTCTTTCTTCGATTTTAAAATTTTGAGAAAG
AGTTGAGGCAGGTGATAACTATGATGAAAGATCTTTCTATGGTCTGATTG
CCTATTTCCTTTCCCATCAGATGGATGTGATTTCTTTATTCAAAACATTT
TCTTTGTTCCTAACTGTTAAATATCCGTACCCTTCCTCTTCTAGAAATTT
TGATTGATACTTATGAATATCTTCCCCATGGAAACTAAACAGAATTGATT
TTGTAAGATTTCACAGCTATGAAAACACAACTTATTCTTTTGAGTGAGTG
GGCTGTTAGCAATTCTACTATCCATGATTTTTTATTAAAACTTGAAATCA
TGAGCAAACATAGACACGAAGTATATTTCCAATCTGTTAAGATTTCTAGT
TTTACAAAAATTAACAATTTATCACAGAAAATTCTCCATCGGTTCTTTTT
GTTTATGAATGAAATTAATATCATTGATAGCATAATTGAAAAGTAGAATC
ATAGATTATAAAAAAATTGAAAAAACGTCCATGTTGTATAATGTCCTTGA
TTTATTTATATCCTTAGGGAATACCACGACTTCTTTAATCCTAATGGTTG
TTTGCCTTCCATCTAATAAGATTAATTATGTATTAAAAGTCACTGTCACT
TTTATTCATGTCACTAATGATGTGGAGGTTGATATCTCATAGTGAATAAC
TCAAACTTTAAGAAAAAGAACAACCTCTGTATTGATGATATTCTGAGTCA
CTGTCAGACAACTATTTTTTCAATTTGCAATGAGTTCTATAGAATCGTAC
CAGCTGTTTTTAAGATTGTTCCATCCCACTGTTTTCCTGAATTTTGTAAA
TTTGAATTTTCCTTGATGATTAGCTATAGATCTACGGTATATATAAAGCT
TAATAAACGATATCTATTCGACCAATAACATTCAAATTTTAATTTGTAGC
CCATATAGAAACTCCTTCGATCCTCTATGATTATGCAAAAGTTAAAAAGA
CTTTGCAAAATTTCTCAGTTTGACCTATTTTTATCAGATTTTTCTCAAGG
TCTTTGAAATCTGCTCGAGAAAATATTTAATTTTTTTAAGCCTAAATATT
TAATAGAGCCAACCATTAGAGTCAAAGAACCACGAAATTATAAGTTGGGT
TATGTACTACACTAAGAAGTTTGTGGTTCAAAATTACAAAAGCTGATAAT
AGGAGCCTAAAAAAACAGATATTGTCAGTTCTCTTTCGATCACTAATCTA
GAAATTCCATTGACTTTTTAGGCAAAGGATCTCTCTTCATTTGGGCTACT
GGAAATGGAGGTATGCAGCGTGATGACTGCAATGCTGACGGATATGTTAA
CAGTATCTACACCCTTGGTATCGGGGCTGTCAACGAGCATGGTGTCTCTA
CATACTATGGTGAACGATGTGCCGCCATGTTTGCCGTTACTTACTGTAGT
GGTAAACACAAAGCTGGATTAGGTGATCCAAAAGCCAATGTCATCACCAC
CTACCTCCATCATCAATGTACTGATCATTTTGTTGGTACTTCTTCTGCTG
CTCCGTTAGCTGCCGGTATCTTTGCTTTGGTTCTTGAAGCTAACAAAAAT
ATCACCTGGAGAGATCTTCAACATTTGGTGTTCCAAACTGCTCAGAAAGT
CAGCCCTAACGATCTTGGTTGGTTTAAGAATGGTGTTGGAAAATTCTACA
ACCATAAATTTGGATTCGGTGTTTTGGATGCTGAAAAGCTTGTTGATGCT
GCATTGAATTGGACCACTGTTCCAAAACAAAAGAGCTGTCATTTCATCTT
GAGATTCAAGAATGGTAACATTCCATCCAAGGAGCATTTCAAACTTGCGT
TCAACACTGATGGTTGTCAAGCTTGTAAGGTAAAGGAGAGTGACGGTACC
TGCAAAAATGCCATCACTAAATTGGAACACGCCGTTGTTAACGTCACCTT
GAAACACCGACGACGTGGTGATTTAAGCATCAAGTTGGTATCACCGAGTG
GTACGGTCAGTAATTTACTTCATCAACGTCCATTTGATGGATCATCTGCT
GGATTGAAAGGTTGGACCTTCATGACCGTCTATAACTGGGGTGAGAACCC
TAAGGGTACCTGGAATCTGATTTTCACCGATAATAAAGGTATGAATCCGT
TCGACACTAAAGATCGTCGTGACGTTGAGGAGGAATACATGGAGGAATTA
GACAAGAAGAAGGAACGTGAACAACGTCAACAACGTCAACAACAACGAAA
TGTTGCCGCTGACACTCAACGTCAAGACGAAAACGTCGTCACTGCCCAAG
GAGATATCTATAAACGCGAAGACGAGGTTTCCAACGACGCTTACGCCAAA
TTGTACGACAAATACCGACGTGACGAATCCGCATACGAGCAGTTGAAACG
AGAATTATACGAGCGACAAAGTCAAGGATACGCTGATGATTATTACCGAT
CCGGTAGAAAACGAAGGTCGAACTTTGCTGATGATACGACGGACTACGTC
AAGTATAAGAAAGACACTATTTCTGATTTGAAATATGAATACGAAAATGA
TATCTTGAAACGAAGTGATCTTGCTGGTGAAGTTATAGATCTTAGAATTA
CACTTTATGGGACTGGTGAATAAATTATCATAATTTTTATTTTCGGTTAG
AAAATTAAATATTTTCTCTCTCAATGGGTTATTATTGTTAGAAAAAAATT
AAAAGCACTATTTATGTCAACCACAAGGAAGCTCAACCAGCGTGACCGAT
CTGCACTAATTAAAACGTCTAATGTGGCTTATGTTGTTACATTTCTTATT
AATTGATGAGATTAATTATCAGAGTTTCCTTGTCAAAGCGGTATTCTTTG
CAAAAGGACTTTCTAAGGATATTCTCTTTCATACTTCATACTTCCTTATG
CCCAAAATGAGCATCGAAGATGAAATTTAATTTCACACGATGCAGAAGAT
TAATGGTGCCTGTGATTGACATAGATTGGTAGATTACCATCATCGGTAGA
TAAATCAAGGAGGGATTTTAGTTTTAAAATCACGGCTTGGTCACACGTCC
AGGAAAAATGTTAAGGAAGTTTCTCCAGATTTATCTCGCGATGTTTGGTA
CCATTTCTTAATTCAAAATGCATTGTCTAGCTAAGGAATAATAATTCTAG
CGCCAACCACAGCGAACAAACGAACAAACGAATGCTATTCCTTTGTTTAC
TTTGCATGCTTGCGAATAATTCTGGGCAAGATTGAAAGCTTTGGCTTGAC
AAACCACCTTCGGGCTTTAGCTGAACATTGCATTTTGAAATTTAAATTAT
TTATTGCATTGTATCTTCATCTAACTAAAGTATTGTGTAGTCTTTGGGGT
TTCAAATTAGCTAAATTATTTTTCAATTTAATCATCTTATTTTTCTACTA
AATAGTTTCTAACCTAGAAAATAGCAAACCGCTAGTCTCACAAATGAAAG
TCTCCTTTTTATTAAAAAAAAAGTCAACAAATAGTTCGTTGATGAATTGA
AATAACCAATTATGCCTACGAGGTTGTAAATTTTAGTAATTTTGAGCAAT
TAGGGAGCTTAAGATTGTGACTTAAATGTCAAACTTAGATATCTTTAGAG
ATCATTGATATTAAGGTCCCTACAAAATAGCCTATTTTCCTAACTAATAT
ATTTATTTTTTGACTAATTTTTCATTTTGGTATAATTATTTTTTGTTTGT
AGTGATGTTTTGTGTATATTTTGCTTTAAAATATAAAAAACTGTTATTAG
CA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1575043694:94308..95635 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1575043694:94308..95635 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1575043694:87584..90064 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1575043694:87584..90064 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1510915933:94308..95635 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1510915933:94308..95635 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1510915933:87584..90064 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1510915933:87584..90064 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1491911889:94308..95635 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1491911889:94308..95635 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009021-exon-sc0000089-1491911889:87584..90064 | TCONS_00009021-exon-sc0000089-1491911889:87584..90064 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000089 | supercontig | sc0000089:87584..95635 - |
Blast
BLAST of TCONS_00009021 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NEC1 (Neuroendocrine convertase 1 OS=Homo sapiens GN=PCSK1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 436.032 bits (1120), Expect = 1.677e-135 Identity = 222/522 (42.53%), Postives = 319/522 (61.11%), Query Frame = 2
Query: 653 SKRDHIDSARLLANDEKVTWMKRERILQREKRVPVXXXXXXXXXXXXMIPNDPYFSAQWYIRNDGQTTGPAGFDSKIESAWKRGYTGKDVVLSVLDDGMDHTHPELKDNYDPKASTDLNGHKADPFPN-DSDPYNAHGTKCSGTIAAKGNNSLCGIGIAYDSKIGAIRMLDGKATDALEANALSFKRDHIDIYSCSWGPKDNGATFGRPGRLGKIALHQGAKFGRNGKGSLFIWATGNGGMQRDDCNADGYVNSIYTLGIGAVNEHGVSTYYGERCAAMFAVTYCSGKHKAGLGDPKANVITTYLHHQCTDHFVGTSSAAPLAAGIFALVLEANKNITWRDLQHLVFQTAQ-KVSPNDLGWFKNGVGKFYNHKFGFGVLDAEKLVDAA--LNWTTVPKQKSCHFILR---FKNGNIPSKEHFKLAFNTDGCQACKVKESDGTCKNAITKLEHAVVNVTLKHRRRGDLSIKLVSPSGTVSNLLHQRPFDGSSAGLKGWTFMTVYNWGENPKGTWNLIFTDNKG 2197
S+R + L++D++V W +++ +R KR ++D+ + NDP ++ QWY+++ T D + W++G TGK VV++VLDDG++ H ++ NYDP+AS D N + DPFP D N HGT+C+G IA + NN CG+G+AY+SK+G IRMLDG TDA+EA+++ F H+DIYS SWGP D+G T PGRL + A G K GR GKGS+F+WA+GNGG Q D+C+ DGY +SIYT+ I + ++ G+S +Y E+C++ A +Y SG + + + LH+ CT+ GTS++APLAAGIFAL LEAN N+TWRD+QHLV T++ N+ GW KNG G N +FGFG+L+A+ LVD A W +VP++K C +++ F+ + + + T C+ +NAI LEH T+++ RRGDL + L S +GT + LL +R D S G K W FM+V+ WGENP GTW L TD G
Sbjct: 79 SRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALN-------LFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDYT------DQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKEC--VVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEG---------QENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSG 576
The following BLAST results are available for this feature:
|
