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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2033bp GGCAATATGGctgctttgtttacattcgatttcacttttacattttttta aaaagacacttttttgctaaaaccGGCCACGAAGAACCGAAGAACAGCAA AAAAGTAAAGGGAAATTGACTTCATTACAATCTTCTACTACCACAGCGTA AATGAAATGAATAGTCATTTAGCTAAATGACCCTTGTATATTATTGGGAA TAGCTAAAAATCATATTGTGGCGTGAGGGTAGGGTAAATTCAATCATCAA TGaattctttctgtttatttctTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAG GAATCCTTCACCAGTAATCATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAA CATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATTC GAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAAT TTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATA TAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACC AAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAA GTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGA TCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATATTGAACAAGATG AACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACAAACA CAGTGTTCCAATGCATATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGT AGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACA TCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAGgACAATCAATAC TGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTCACACGA TTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGT TCACTTATAGCAATTTGCCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGA ATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGG TAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATC GTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAG CAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGATG TGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTA TGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTG TTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCT AAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAAC TACGACGTGTAgctaaatgttcttattttggtGTTTCATTTTGCATAATT ATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATT GGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGG TGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGATCGTAGATAAGATTTGGAAGTcag taaaagtttcaaaaataatttacaatACAACACTTTCATGGGAAATATAG TGTCAACGacatttatattttataaaaaacaagtaATACAATTACTGTAG AATTAGAATTGATTTTCTAAAGATCCGATATTTCAATTGTTATGTACGTA GAATAGACTTAAAAAAATTGCTATACTTCTCAAGGCGTTCAGAATTTCGC GAACAcgaacttttttgagattttccgATTGCCAAAATTTTGTGCCGAGG AATTTTAAATGTTCAAACTTGCTGTTGTATTGGTATTTTGCATGACAGCT GCTATGGTTCATTGTGAGGTCAAGAAAATTGGTGTAAAATGGGGATATCA CATGAATTAAGTAAAAAAGGGTACTATTTGACT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00008034-protein >TCONS_00008034-protein ID=TCONS_00008034-protein|Name=TCONS_00008034-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=458bp
MNSFCLFLALLLVSIIKESFTSNHVVVATYNLWNIMYHWDVRKFYIADMI RKVNADIVGFQDVRAHNLLDRTQIDELQFLLPQYKHKYYLPLENVDQKYY QDDGWQWRGVGFMSKFKVSSVASTNLSIPLYSNDQRQRAILYSQFYIEQD ELEINVIFVELSFDKQTQCSNAYEVVKYIYSVGVESLVVMGDFHVYEEFN IPLKAIANGYFDEDNQYCKNIGSIFNQQQYRSHDYKFTDAWVHRFSLYPG FTYSNLPSTGFLSRPDRILVSKVGIKIESAMVLGKGELYEHKRGSEIYWN RYWTVLNAAHNRDFGREQNSTCLTDCGPHTSCRCGICIKGAGRTCKPKEC MECTPSKLFLFHLIMAVFGLTSFYFFGIIIVVILSLVRPRWNRFFFNKLK LRRVAKCSYFGVSFCIIIFTIIYATIQFDDVKRLVDLQPMDELNPSSHLM VVAKLELV Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000081:244392..250309- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:244392..250309- (Clytia hemisphaerica) GGCAATATGGCTGCTTTGTTTACATTCGATTTCACTTTTACATTTTTTTA
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TAGCTAAAAATCATATTGTGGCGTGAGGGTAGGGTAAATTCAATCATCAA
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GTTTTCGCCTTTTTTAAACTTTTTTGAAAATTATTTTTTTAGCATTTAGA
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TCAGCTGAACTGCAGTACATAGAACTCGAGGAGGTAGTCGACCTTGGCTT
CTGTGCAGGCGGCCAGGGTTCGATTCCCACTCACGGCAGTTCACTTGGCA
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GCTTTACAATCTTTCTTCAACACTCTCAACATTACACCTTCATCTGTTTT
TTTTTGTCTTTATATAAATTGCACACCTACACTAAATTAGATTTTTTTGG
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GCATTGATTTGTACAATAACAAATGATTCCCTCTTTGAATTATAAAGTTT
TAAATTTGGTCCAACTACAGCACGCTTTCTGAGTTAAAAATTCACTAAGA
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ATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATT
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ACACAGGTAATAATTTTGTTACTTGTCAGATTTTAAATTATATTTTGTTG
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CTGTACTTTTTAAGGAAAATTAGTTTTTATTATGATATACACGTTAAATC
TTTCACTACTAGCCAAAGCGGGGTATTTCCATAGAAAACATTAAATCATG
GATATCATGAATTTGTAAGCTTATTTTCTATTTCTTAGTGTTCCAATGCA
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GATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAA
TTGCAAACGGATATTTTGACGAGGTAAGTATAACAATACAATGCAATAAA
AAAAGATAAAATGGGCTATTCCAGAAATAGGCTGTGCCCCTATGTTGAGG
AGGTTTGACGTCCAGAGTTATCTGGAAAACAAAAAATCTAGGGGTCTGGT
TTTTCAAATGTAAGAATCCAGTAAAATGAGGTTGAAAATAAAGGGTGGAC
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TTAATATAGCTATGATGTCTACAATATCTTTTAAGTCAAAGTCTCACTGG
GATTCGTGTAAGAATAGTCGGCAGAATAATAGATCATCAGATTCAGCTCT
CTTCTAGTCTTTCACTTAGATAATTCTACCAGGCGATCTAAAAAATATCT
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TAGACGGACCTTCCTGCTAGTAGCATGACAGCGTTTTTTACTGTGTACAC
GCATTTTTTATAAGAATAGTGTTTTTTCATTTCATAATGGATATTCTTAA
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GTTATTCTTAGTATATTCTTAATTTTTTGGCCGATTTTATATTGAGTTTT
CTTACAAAGTATATTCTTATAAAAAAGTGTGTAATTACAAAGGCTTCTCT
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CCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGT
TTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACC
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TGAGATTTTCCGATTGCCAAAATTTTGTGCCGAGGAATTTTAAATGTTCA
AACTTGCTGTTGTATTGGTATTTTGCATGACAGCTGCTATGGTTCATTGT
GAGGTCAAGAAAATTGGTGTAAAATGGGGATATCACATGAATTAAGTAAA
AAAGGGTACTATTTGACT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081:244392..250309- >TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8262bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:244392..250309- (Clytia hemisphaerica) ATGTGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAAT GTATGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCT GTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTAT TCTAAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAA AACTACGACGTGTAGCTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATA ATTATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCG ATTGGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGA TGGTGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCT CGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGC AATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAA TTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGAT TTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATAC CTCTTGCAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCA ACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACA GGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCA TATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGT GATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAA TTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTT GGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGATAGA TGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTACCTT TGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGG GGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAA CCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGT ATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTT GTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATT TCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATC ATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGAT GTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTATTAAAGGAG CTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTCCAAG CTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTA TTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCAAGAT GGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAAATGT TCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATAATTTATGC AACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCAATGG ATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGAATTG GTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTC CAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAAC TTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACC GTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCAC GTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGACAATCAATACTG TAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTCACACGATT ATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGTTC ACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCATATGAAGTTGTGAAGTATATTTA CAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATG AAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAG ATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCA TAATTTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCAC AATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATAT TACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTT CAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAA ATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATATTGAACAA GATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACA 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TAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAA GCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATAT TGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGA TAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTA CCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATG GAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCA CAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATT TTGTATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTAT TTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTT TATTTCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGT AATCATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTG GGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTATTAAA GGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTC CAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTT TTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCA AGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAA ATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATAATTT ATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCA ATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGA 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TAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTG CTGATATGATGTGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACC GAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAA TTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATC GTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAA CAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCAT TTTGCATAATTATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGAC GTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAG TCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGT TCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATC GAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGG AAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATA ATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGA CCCCATACCTCTTGCAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATT TTCAACCAACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATG GGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTT CCAATGCATATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGT TTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTT GAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTG ATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACA CAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTA TTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGC AATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCT TCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGC TATTTTGTATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATG TTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTC TGTTTATTTCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCAC CAGTAATCATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATC ATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTAT TAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACAC CTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACT AGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAG ACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAG CTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATA ATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACA ACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAAC TCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATT CTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAA AGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTT ATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAA AACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGACAAT CAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTC ACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACC CTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCATATGAAGTTGTGAAG TATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCA TGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATT TTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTC AGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTT GCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATC AAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATG AGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTT ATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATA TTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTT GATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATTTCTTGCTTTACTGCT GGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATCATGTTGTTGTGGCTA CATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTAT ATTGCTGATATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
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Position
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Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
Term | Definition |
IPR005135 | Endo/exonuclease/phosphatase |
Blast
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