TCONS_00008034 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00008034
Unique NameTCONS_00008034
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2033

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2033bp
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GTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAG
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TGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTA
TGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTG
TTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCT
AAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAAC
TACGACGTGTAgctaaatgttcttattttggtGTTTCATTTTGCATAATT
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GGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGG
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taaaagtttcaaaaataatttacaatACAACACTTTCATGGGAAATATAG
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GAATAGACTTAAAAAAATTGCTATACTTCTCAAGGCGTTCAGAATTTCGC
GAACAcgaacttttttgagattttccgATTGCCAAAATTTTGTGCCGAGG
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00008034-protein

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VVAKLELV
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000081:244392..250309-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:244392..250309- (Clytia hemisphaerica)
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TTGCAAACGGATATTTTGACGAGGTAAGTATAACAATACAATGCAATAAA AAAAGATAAAATGGGCTATTCCAGAAATAGGCTGTGCCCCTATGTTGAGG AGGTTTGACGTCCAGAGTTATCTGGAAAACAAAAAATCTAGGGGTCTGGT TTTTCAAATGTAAGAATCCAGTAAAATGAGGTTGAAAATAAAGGGTGGAC AGTAAAACGAGATCGAAAATCCAGGGTGGGCCAATGAGAAAAAAATCAAG GGGGTCATGAAATTGAAAGAAAAAACCAGCGGTCATCTTTCCCAAAGAAA ACCTCCTCAATATAGAGGTTAAATACACATTTTTATTATAAAAACATCCA AAACTTTTGAAGCCTTAGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCATCG TGTGCATTTTTCTCCATGTTCCAAAGAAATTAGTTTTTTTGGAGTCCAAA AAAACCTTAAAAATGTTATTAAATTGGCCACTGAAGCCTTATGTTCTAAT AGTTTGTTCTTAAAGAAGAAAAGTGTATTTCAAATATTGTCATTGACAAA CAAGACAAAACAGTGTCTAGAGAGGATTCTTTATATATTTTTAAATGTTA TTTTTGTAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCA ACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACA GGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGGTAAGTTTTTTA TCATCGCATAAGGCTATATTCGCACGCCCCCCCCCCAAGAATTGACGTAA AACTTGAATTAAAAACAAAAAGAATGGCTTCGGAGCGAAACGAAACCGTC ACGTGCGAACGTGATCTAAATTGAACATCCTCTGGTAAGCATAAGAAATA TGACTACAATATCTTTCAAGTGAAACATTCTAGTGCCAAAGCCCAACTGG GACCCATGTAAGAATGGTCGGCAAAATTATCAATCGAAAGAAATCATCTG ATACACTTCTCTTTTAATGTGTTTGTTATATTGAAGATTGAAGTTCCTGA TTAATATAGCTATGATGTCTACAATATCTTTTAAGTCAAAGTCTCACTGG GATTCGTGTAAGAATAGTCGGCAGAATAATAGATCATCAGATTCAGCTCT CTTCTAGTCTTTCACTTAGATAATTCTACCAGGCGATCTAAAAAATATCT AACAGGCTTAGGGGGGGGGGTCTCTAGCAGTATAGATACCCCTTTGATGG AATCAATCTTGAATTTTAACTTGTCTTTGTTTATAATTACTATATGTTTC AGCCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAA GTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTA CGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGT TAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGT TTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGTATGTACGGGATACTTC AAATTCATTGTTTTCGGTAGTGGAGAGTTAAGGGTTCCATATTCTTTCAT TATTATCAAGCAAACTATAAATGTTGTTGAACAAATAGACGGACCTTCCC NCCATATTCTTTCATTACTATCAAGCAAACTATAAATGTTGTTGACCAAA TAGACGGACCTTCCTGCTAGTAGCATGACAGCGTTTTTTACTGTGTACAC GCATTTTTTATAAGAATAGTGTTTTTTCATTTCATAATGGATATTCTTAA CTTTTTGGGAAAAATCATTTTAAGACATTCTTCGACATTCTTATGTTAGG TTCCAACCTAGCCTAATTCTAGCAAGTAATAAATACCTCGAGCAAAGATA TGGCATTTTTATGAAAGTTTTTAGCATTGCAGGAAAACAATTGGCAATTT ACAGGTAAAATAAGGCATTCTAAGGTTCAGTTGCCATATTCCATGATGGT GTTATTCTTAGTATATTCTTAATTTTTTGGCCGATTTTATATTGAGTTTT CTTACAAAGTATATTCTTATAAAAAAGTGTGTAATTACAAAGGCTTCTCT AAACTATATAATAAAAAATGAGGGTTGCATGTACCATGTGAATTTTGGTA GTCCTTGAAAAAATATTTCGTTTTTTCACGTTATTTTTAACAGATTTTAA CTTGTTTTGTTTGTAATTGTTTATGGAAATATGCGGGCTGTTAGAATTCA CTAATTCCTTAAATCTTCATTCCTTATCATAGATGTGGAATATGTATTAA AGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTT CCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGT TTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACC AAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTA AATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATAATT TATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACC AATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCG AATTGGTGTGATCGTAGATAAGATTTGGAAGTCAGTAAAAGTTTCAAAAA TAATTTACAATACAACACTTTCATGGGAAATATAGTGTCAACGACATTTA TATTTTATAAAAAACAAGTAATACAATTACTGTAGAATTAGAATTGATTT TCTAAAGATCCGATATTTCAATTGTTATGTACGTAGAATAGACTTAAAAA AATTGCTATACTTCTCAAGGCGTTCAGAATTTCGCGAACACGAACTTTTT TGAGATTTTCCGATTGCCAAAATTTTGTGCCGAGGAATTTTAAATGTTCA AACTTGCTGTTGTATTGGTATTTTGCATGACAGCTGCTATGGTTCATTGT GAGGTCAAGAAAATTGGTGTAAAATGGGGATATCACATGAATTAAGTAAA AAAGGGTACTATTTGACT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000081:244392..250309-

>TCONS_00008034 ID=TCONS_00008034|Name=TCONS_00008034|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8262bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:244392..250309- (Clytia hemisphaerica)
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GTATGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCT
GTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTAT
TCTAAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAA
AACTACGACGTGTAGCTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATA
ATTATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCG
ATTGGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGA
TGGTGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCT
CGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGC
AATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAA
TTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGAT
TTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATAC
CTCTTGCAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCA
ACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACA
GGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCA
TATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGT
GATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAA
TTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTT
GGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGATAGA
TGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTACCTT
TGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGG
GGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAA
CCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGT
ATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTT
GTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATT
TCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATC
ATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGAT
GTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTATTAAAGGAG
CTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTCCAAG
CTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTA
TTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCAAGAT
GGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAAATGT
TCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATAATTTATGC
AACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCAATGG
ATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGAATTG
GTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTC
CAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAAC
TTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACC
GTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCAC
GTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGACAATCAATACTG
TAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTCACACGATT
ATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGTTC
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CAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATG
AAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAG
ATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCA
TAATTTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCAC
AATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATAT
TACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTT
CAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAA
ATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATATTGAACAA
GATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACA
AACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATTTCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCA
TCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATCATGTTGTTGTGGCTACATATAAT
CTTTGGAACATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGA
TATGATGTGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAA
GAATGTATGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTAT
GGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGG
TTATTCTAAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAA
CTAAAACTACGACGTGTAGCTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTG
CATAATTATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGA
AGCGATTGGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCAT
TTGATGGTGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCT
TTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAAT
CAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGT
GAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCG
TGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCC
ATACCTCTTGCAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCA
ACCAACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTG
CACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAA
TGCATATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGG
TAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAA
GCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATAT
TGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGA
TAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTA
CCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATG
GAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCA
CAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATT
TTGTATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTAT
TTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTT
TATTTCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGT
AATCATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTG
GGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTATTAAA
GGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTC
CAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTT
TTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCA
AGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAA
ATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATAATTT
ATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCA
ATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGA
ATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGG
TCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGT
GAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTG
GACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACA
GCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGACAATCAAT
ACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTCACAC
GATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGG
GTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCATATGAAGTTGTGAAGTATA
TTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTT
TATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGA
CGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAG
CTCATAATTTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTA
CCACAATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAA
ATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCA
AGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATAT
TCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATATTGA
ACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATA
AACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATTTCTTGCTTTACTGCTGGTT
TCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATCATGTTGTTGTGGCTACATA
TAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTG
CTGATATGATGTGGAATATGTATTAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACC
GAAAGAATGTATGGAGTGTACACCTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAA
TTATGGCTGTGTTTGGTCTAACTAGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATC
GTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAGACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAA
CAAACTAAAACTACGACGTGTAGCTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCAT
TTTGCATAATTATATTCACGATAATTTATGCAACAATACAGTTTGATGAC
GTGAAGCGATTGGTTGATTTACAACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAG
TCATTTGATGGTGGTGGCTAAACTCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGT
TCCTTTCTCGTCCAGATCGAATTCTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATC
GAATCAGCAATGGTACTTGGTAAAGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGG
AAGTGAAATTTATTGGAATCGTTATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATA
ATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAAAACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGA
CCCCATACCTCTTGCAGGACAATCAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATT
TTCAACCAACAACAATACCGTTCACACGATTATAAGTTCACTGATGCATG
GGTGCACAGGTTCTCACTCTACCCTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTT
CCAATGCATATGAAGTTGTGAAGTATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGT
TTGGTAGTGATGGGTGATTTTCATGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTT
GAAAGCAATTGCAAACGGATATTTTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTG
ATATTGTTGGATTCCAAGATGTCAGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACA
CAGATAGATGAACTTCAGTTTTTGCTACCACAATATAAACATAAGTACTA
TTTACCTTTGGAAAATGTTGATCAAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGC
AATGGAGGGGTGTAGGCTTTATGAGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCT
TCCACAAACCTTTCAATTCCTTTATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGC
TATTTTGTATTCACAATTTTATATTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATG
TTATTTTTGTAGAACTATCATTTGATAAACAAACACAGATGAATTCTTTC
TGTTTATTTCTTGCTTTACTGCTGGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCAC
CAGTAATCATGTTGTTGTGGCTACATATAATCTTTGGAACATTATGTATC
ATTGGGATGTCAGAAAATTTTATATTGCTGATATGATGTGGAATATGTAT
TAAAGGAGCTGGTCGAACGTGTAAACCGAAAGAATGTATGGAGTGTACAC
CTTCCAAGCTATTTTTGTTCCATTTAATTATGGCTGTGTTTGGTCTAACT
AGTTTTTATTTCTTCGGTATTATCATCGTGGTTATTCTAAGTCTGGTAAG
ACCAAGATGGAATCGCTTCTTCTTTAACAAACTAAAACTACGACGTGTAG
CTAAATGTTCTTATTTTGGTGTTTCATTTTGCATAATTATATTCACGATA
ATTTATGCAACAATACAGTTTGATGACGTGAAGCGATTGGTTGATTTACA
ACCAATGGATGAGCTGAATCCTTCTAGTCATTTGATGGTGGTGGCTAAAC
TCGAATTGGTGTGACCTTCAACTGGGTTCCTTTCTCGTCCAGATCGAATT
CTGGTCTCCAAAGTTGGAATAAAAATCGAATCAGCAATGGTACTTGGTAA
AGGTGAACTTTACGAACATAAACGTGGAAGTGAAATTTATTGGAATCGTT
ATTGGACCGTGTTAAATGCCGCCCATAATCGTGATTTCGGTAGAGAGCAA
AACAGCACGTGTTTAACTGATTGTGGACCCCATACCTCTTGCAGGACAAT
CAATACTGTAAAAACATAGGGAGTATTTTCAACCAACAACAATACCGTTC
ACACGATTATAAGTTCACTGATGCATGGGTGCACAGGTTCTCACTCTACC
CTGGGTTCACTTATAGCAATTTGTGTTCCAATGCATATGAAGTTGTGAAG
TATATTTACAGTGTTGGTGTAGAAAGTTTGGTAGTGATGGGTGATTTTCA
TGTTTATGAAGAATTCAACATCCCTTTGAAAGCAATTGCAAACGGATATT
TTGACGAGATTCGAAAAGTGAACGCTGATATTGTTGGATTCCAAGATGTC
AGAGCTCATAATTTATTAGACCGTACACAGATAGATGAACTTCAGTTTTT
GCTACCACAATATAAACATAAGTACTATTTACCTTTGGAAAATGTTGATC
AAAAATATTACCAAGATGATGGCTGGCAATGGAGGGGTGTAGGCTTTATG
AGCAAGTTCAAAGTATCATCTGTTGCTTCCACAAACCTTTCAATTCCTTT
ATATTCAAATGATCAGAGGCAGAGAGCTATTTTGTATTCACAATTTTATA
TTGAACAAGATGAACTTGAGATCAATGTTATTTTTGTAGAACTATCATTT
GATAAACAAACACAGATGAATTCTTTCTGTTTATTTCTTGCTTTACTGCT
GGTTTCCATCATTAAGGAATCCTTCACCAGTAATCATGTTGTTGTGGCTA
CATATAATCTTTGGAACATTATGTATCATTGGGATGTCAGAAAATTTTAT
ATTGCTGATATG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_004524XLOC_004524Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008034-proteinTCONS_00008034-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000081supercontigsc0000081:244392..250309 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.08205 1.4525 0.919 0.959992 4.03806 3.04901 3.42395 3.31282 1.334 1.31492 2.84736 1.68663 2.49203 1.94766 1.95697 2.86941 1.96905 1.69239 0.372174 0.172712 2.34751 1.9833 0.989815 1.55036 2.36815 3.06375 1.6212 0.918199 0.481626 0.497411
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR005135Endo/exonuclease/phosphatase
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00008034 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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