TCONS_00004495 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00004495
Unique Name	TCONS_00004495
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4522

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000045:363507..382696+

transcript sequence

>TCONS_00004495 ID=TCONS_00004495|Name=TCONS_00004495|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4522bp
TTGATTCTCATATGTTTACAATGTTGGATAAAGATAAATCATTGACCATG
ATGAACAGTGATGAAGTTTCAGAGCAACACGAAGGCGAAGGAACTAGTCT
AACTTCAGATGAAGGAATCCAAGCTAGAGTACGCTTTCAAGATATGTCGA
ACGAAGAAACGAGCCAAGAAGATGAAGATCGAATGAACGATATGACTGGC
GATTCACAATCACTCGATGCGTTCAATATCGAAACTAAACCTCGTTCGGT
TATCGAAGgtgGAACGGAAGTGGGATGGACTCCCTTATCCTCAGTCATTT
TGTGGCGGCGTATGCTCGGCATCATGGGTAATATCAATCACATAAAGGAC
CCAGAAATCCACGCGACTGTCTTCAAACATTTGATCGACCTTTGGCAAAT
GTTAGCCAGTATTTGCAAGAATCAAGGAGTGTCATTGGACAACAAATCAA
GTCCCGATCCTCCTGGTCTGACTCCTGCTCTCTTCTTCCCTGTCTCCTGG
TGCTTTCAAGCTATGACACAAGAGTTTGGTGGCTCACATAAACCTGGACG
TGTTCTAGCTTTCAAGTTGATGTGTATGCTTACAACTAGAAGCCATCGCT
TGAAACCATCTACTGAGCATATCAAGCATTTTTACAGATTCTTACATGAG
GGACTCAAAGGGAGTGACCAGAATGTGATCAACGCGATCATAGGAGAATG
TTCTTCCTTCTTCACCTTGAACTTCCCTGGTGCGTCTTGTCTTATCAACG
ATTTCATTCATGGGACCAAAACCATCATCTCCACAATTTATATGCAATAC
CCACGCAAAGAAGCTGTGACGTTACTTGGTTCCTTATTATGTTTCCCTGC
TGCTTTCCCCtcaatgaaaatcttcaaactGAACGCAATGTCCAAACAAC
CTGATGACTTCATTCGATGCAAAGACCTCAGGGAAAAGATTTTGCTACCA
CTTCTAAAGGCCGCCAAAAACGACCCTTCTTGTCGAGCAAGATGTATTGC
ATTGAATGGTCTAGCGTTGTTCGTCATTGAAGTTATGCAACACGGCCAGA
ACCATAACAGGATACCCGAGTGTCTCTCCGTCATCCTTGCTTCTTTAGAT
TTCCACAGCCAGACAGTTTCGAACGTAGCATTAGACGTTCTATGGTCATT
ATCATACTACCACGATCAACTCCAAACTTATGATAAAGATATacctgtca
aaattatcgagTCAATGTGTTTGATCGCGTTGAGGTTGCACACAACCAAA
TCAAGTATTGAAGAAGGTATTCCGGAGGAGAAGCTTCCCGAGtACATCAG
CAGATTGTTGTTAGTGCTTCTTGATTGGGTGATGGTAACACCACGCGATG
TATTGCTAAGACAACGTGCTGGTAACCAGGACGAATTGAAATTGACATAC
CTCAGTTTGATTATGAGGACGTTTAAAGACTGCATCAAGACGTACGATTC
AAACAACAAGTTTGAGAGACGTCAATCACTAAACATCAATCAAATGTTTA
CCGGAGAACCACGCCCTATCCAATTGAAACGTGTCCATAATGATTTGGGG
ATGGATGACCCTCAAGGAATCACTGATGAGGAGGATACAGAAACCGatTT
CTTCATGAGTGCAAAGACTGAACAAGACAACAAGAAAACAATTTTGGTTC
TCACTGCACGCTATtgcaTCAACCAAGTATTGAATTACTATCTGCACTTC
CCAACCATTGGTGGTGCCACATGCCCCACAAGCAAAGTGCATGAAACAGA
CGATGCGGTACACAAACCTTCAGATGTCGGATCCACCCCGAACGCGCCGG
ACGAACAAACTCTACTAAAACTCTATGAAAAAACTACTATGTTGGACAGT
AATAATATGCAGTTCCTTCTTTTGAATGGTATAGCATTGTTAACTGTGGT
GGAATTACCGCAAGAGGAGGACTTCTTGACTCGATCGGGAACGGAAGGGC
AGAAGAGTGTTTGCCGGATGATTATTCGTGACACCACTGGCACACATTCA
TGGGAAGTCTCcaatcttttcaaaatggtgCAGATGAATGATATCCTTTC
CCAAGGAGAATCCACACCAAAGAGACCATCTTTTGAACGGAAACACAGTC
GTAATCTTTCCGTTTCTTCAGCCCGCTTGACGCGGACCGCAACCGCTGAT
CTTCCGAAATGGGATTCCGTTGATTCCAAAGTCGATCGAATTGACCAGCT
TCTTCGATACGTTGGTCAATCAAGTCCAGAATGTCTCATTTATCCTGACC
AACAATTGAACTTGCCAGCTCCAGTGCCAGTAGGTCTTGATGCTGGCATC
CAATCACTTGCTGTCACTTCTGTTTTGAAACAACATAACGAGGAAGAAAA
TTACATCCATGAAATCGCCAGTGATGCAAGAGTAACGGCAAGTGAGATTC
AGAAGCCAAGTTGTTTCGATCCTTCGAGTCCttttcatctttcgaaaatg
ttGCTTCATCAACTCGGTTATTTCACTTGGGAAAACAGgaAACACTTTGA
GCTGCTTGAACGCAACGAAAAACTTTTACGACAAATCAAAAATCTTGATA
AACAAGGAAGCCGTGAAAAGCACAAGATGGCGGTTTTCTACGTAGCGCCT
GGTCAAGAGGATAAACACTCGATATTATCCAATTCCAAAGGAAGCACTAA
ATTTGAACATTTCGTTTCACAACTCGGATGGGAGGTTGATCTTTCCACGC
ATGCTGGTTTCATGGGAGGTTTGGAACGGAATCTATCAACAGGTGTTTCT
GCACCTTATTATGCTACACATTCTTTGGAGTTGATTTTCCACGTGTCAAC
GCGCATGCCCGGGTCTGAAGAAGAATCACTCAAAACGAAGCTACGTCACC
TTGGTAACGATGAGGTTCACATTGTTTGGTCAGAGCACTCACGTGACTTT
CGTCGAGGGATTGTCAACACTGAATTTGGTGATGTTTTGATAGTCATCTA
TCCCATGAAAAATGACCTCTATCGAATACAAATTGACCGTCATCCAAAGA
TCCAGCCATTTGGACCATTGTTTGATGGTGCCATCATCAATGGCGATATG
TTAGCCAACCTTGTACGGTGTACTGCAGTCAATGCAGGCCGTGCCAACCG
GGCCACCCTATCAATGTATTATCAACACTACGAAGAAAGAGCACGTTGTA
TCGGAGAAATCTCACGGAATTGTGCCCGCCCAACTACTTTCGAAGACTTT
TGCTCAAAGATTTTCGCGCCCAACCTTCCGCCCTCTGGTCACACACACAA
AGATGATGATGGTGGTTTACATAGAACTTTTAGTGCGCCATCTCAATCAA
GGTcaaactcactaaaagattCTGCAGGTGTTCTAAGGTTTATGGAGATG
CACGAAACACAGACGTTTAGAAGTCGTACGCAAAGTGCGCTTCCAAAAAA
CTCCAAACCTGTAGACCACAAACAAGTCTagaaaaacaacaaatttcgaG
CCCATAAAACAACAGATCGTACAGCTTCGAACACGTCACTCCAAAACATC
AATGAAGATTCAAACTTGTTGTTATCACCTGATTTTTGTGACGCGAGCGG
CAGCGGTGACAATAAAGACAGTATGTCAGCCAAGGAGCGAAGAAAATCTT
TGAGTAAACGGTTCAGAAAGAAGGCGGCTTCTATTGACGTTTCTGGTTTC
TTGATGGATAAAACGATCGGTGAATGATGATTGGTTCATTTTTGATCACG
TGACTTTCATGGATGAAGTTGATTGGAGGAAAAGGATTTTCTTGTCAAAT
TGTCATGTTAAATTGTTGAGTACTCAATGGCACGAGAAAAGAAGGTACAT
AGTGCATATGAGTAATTTTATCCGACGGATTTATAGTGATATCGGCGACG
GATTTTGATGGATATCAAAGGTACCATTGACATATGCGTTATAGCAGCTA
TAGCAACCTTGTTTTACTATTAAGTCTATTAAATTTAGTTGGTTTAAATT
TGGGCTATTTAGCAGGTACGcgattgaaaaatgttttctagaaacatttt
gcttttttattcaaaagatatAGGAAATTATCTGGGAATTTTTATAGTAC
ACCATTATTTACCCTATCTTATTACCCCTTGTATTATTATCATATTATCG
TAAAATTGTGTAATAttaaagaaatttatatttttcataataCTTAGTAG
TAATAAATATTGTCAAATTGATTGTTCAGTTGTTTTATAGAATGTGGTGA
AAAACGTAGTATAGGCtcccaaaaaaatgaaaaggagGCTCTTATTCCGT
CCATTCAACCTAAAAAAGTCACAACTGTCAGCTTCAATAAGCTTTTCTGT
CCAAACTTTCGGATTAGACTGTCAAACATCTGTAAAGCTAAGTGcaagca
tggaggtataaagaaacaggagaactatgctattgtaaccaagctcgccc
tacgattaaaaaagttacgatgtgtgcatgctcataatctcatatatcgt
gcatttttaatgagctcttttatccataggtgaaatcctattggctcatt
taagctttagaaattagatgag

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000045:363507..382696+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00004495 ID=TCONS_00004495|Name=TCONS_00004495|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045:363507..382696+ (Clytia hemisphaerica)
TTGATTCTCATATGTTTACAATGTTGGATAAAGATAAATCATTGACCATG
ATGAACAGTGATGAAGTTTCAGAGCAACACGAAGGCGAAGGAACTAGTCT
AACTTCAGATGAAGGAATCCAAGCTAGAGTACGCTTTCAAGGTATGGCTT
TTCTCTAATCACTGCAatgttctttgtttgtttgtttgtcaatGTACAAT
TTTGGCTTTGATACAATTCTAAACTAAAATGTTCTAATTCCTTATGGCAT
TGAAAataattcaagaaatttaagattttttacGCACCATTTCATCGCTT
AGCTTACCAAGAAGTGATGCTTAGTTTCCtttagatagagtcgatatttt
acgttgATAGACCATTCATCTGGGACTTTTAGGCATgctttcgatttttt
tcatggggtccacggccagctgGCTTAGCTATTTATGAACTGAACATTGG
AAGGTGTGGGAATTCGAACCGGCAACCCCTGGTATTAGGCGCCAGCGCTC
TGTCATTACTCGGTCATTACTCCTTAGGTTCAAAACTCAAACATATAAAC
TCATAAGTTTCCAATGGCTTTCTCTAGATATGTCGAACGAAGAAACGAGC
CAAGAAGATGAAGATCGAATGAACGATATGACTGGCGATTCACAATCACT
CGATGCGTTCAATATCGAAACTAAACCTCGTTCGGTTATCGAAGGTATGG
CAGAAGATCTTGTTTAAAAATCGGTAGTTTACTTTCTTAGTGCATCCGTT
GGTCTCTCAGCGAACAGTTGGGATTTTACTCATTTAACACTACTTCTTGG
AACTGTCAATCAGACCCTATCATTTTTCAAGGAGAAAACCTGATGAAATG
tattctataattcgaatctctctccTACCGTTTTCTCTTACCAAAGAATT
ACaagtaatagacgatatcggcttaacgaaattctccccgaatgattacc
catgatgcattgcgtaaaaaaattcagtaagtcaatattgtccgtcATTT
GGGGAGAATTCGgcaagccgatatcgtctattacttgtagttctttgttc
ttatatattgAATTTCCCGTTTGAGTTTGGATTTGTGAGACTTCTAACTA
ATATATTTTTCTGATTGGTAGAAAAAGATATTACAAAGGTCACATACATT
CTTcatcaatttgatttttcaaggtgGAACGGAAGTGGGATGGACTCCCT
TATCCTCAGTCATTTTGTGGCGGCGTATGCTCGGCATCATGGGTAATATC
AATCACATAAAGGACCCAGAAATCCACGCGACTGTCTTCAAACATTTGAT
CGACCTTTGGCAAATGTTAGCCAGTGTAAGTTCCACTTTTTATTAAAGCT
TGATATTTTCCTCGTTTCCATTTGCTTAGTTGCACCTATCCCATGAATAG
AAATATTAAAATCTATATAGACGATGTACCGTTCGAttcttgtttgcttt
tattgaaattgCGGATATTAGTATATACGGTGGGATTTCTTTAACTctaa
cctctataactcgaatgtcccTTAAAACTCGAATAAggtttatggtccct
tcagtatATCCTTACTTCATAACTAAATTTCCTTCGAACAAGTTTGTGTT
TCCCGGTGCTAATCTCTATCATTTCCAATCACACttcaataacatttttt
aacttttgtagATTTGCAAGAATCAAGGAGTGTCATTGGACAACAAATCA
AGTCCCGATCCTCCTGGTCTGACTCCTGCTCTCTTCTTCCCTGTCTCCTG
GTGCTTTCAAGTATGCCTTATGTgttcaaattattttgtttgtttttcta
atCANGTCTCCTGGTGCTTTCAAGTATGTCTTATGTgttcaaattatttt
gtttgtttttctaatCACAACCTTTCTAGTTGAAAGTTCACTGTTTGTTT
CAAAAGGTTAATGAAAATCTTTCGCACTTTTAAACCTCCCACACGTGAGA
AATTTATAATAGAAAAGACTGTTAAGTTGGGGAGTTTTTACTTAATATTT
TCGATTATTCGAATGAAAAAGTCGACAAGATGAATCGTAACATTGAGCAT
ATTTTACCATTGTTTCAGGCTATGACACAAGAGTTTGGTGGCTCACATAA
ACCTGGACGTGTTCTAGCTTTCAAGTTGATGTGTATGCTTACAACTAGAA
GCCATCGCTTGAAACCATCTACTGAGCATATCAAGCATTTTTACAGATTC
TTACATGAGGGACTCAAAGGGAGTGACCAGGTACATCAAAATCTTCCTTT
CCATTTCTATATTTCTTTATATTACTGTATGTGAAATTTGAGAGCTTTAG
GAGAATGAATTTGAAGATATTTCAGCATTAATTACTTAgattttttgatg
aatttgtAAATTATTGTTCAGTGGTTATATGCAATGACAATTCTTccatc
tacacgttttttttttaagaaacacacttttaagaaacataaggctcaga
atgcctaaaaactaagaaacatctaagaaacatgctgaggctgagaaNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNgaaaataacattttttaattcgttttttttaagaacct
tccaatccagccttccatgaggctgattatgtcaaaaagtttagaaacat
ttaagaaacattgaggctgcttggtaaaacttgtttctttaaaaaaaaca
aaaaacgtgtaagtcAAGTTCAAGAAATGCAAGTCCGAAACTTCAATGAA
AAAGAACTTTGTCATCTGAAATTAAAATTCTACTAGTTTAACtaataatt
tttataataattgataatttttgtgacatcttattttcattttttcatct
gTCAGAATGTGATCAACGCGATCATAGGAGAATGTTCTTCCTTCTTCACC
TTGAACTTCCCTGGTGCGTCTTGTCTTATCAACGATTTCATTCATGGGAC
CAAAACCATCATCTCCACAATTTATATGCAAGTAAGAGAACCAAATCTGC
GTTGACAAGTTTGTCCTCCATAATTAAAGGgataaagcaaaataaaagtc
agaaaatttacaTGTGTACTTTTGTCGAATGAATTTTCGCGAGAATTGTT
ATTTACCGTATTCGCAGAAAAAAAACCTCGCGAAATTACCCGAGAAAATT
AAATTCatgcgaatttttttttatggctCGTGAAACTTAATCTTACGAAA
ATCAAGCCGATTAAAATATTCGGATTCCATACTTAGAGTTTATGGTTTTC
AGACtcaaaaaggttttaaaagGAGCAAGGGGAGGGATTATTATTTGCAA
CCTACGTCGATCAAAAAGGGTATTCGGAGCTCACACTGATTTTCGTGCTT
AACAAAGCTTCTAAAGAAGAAGTATTATTCTCAAGTTTCTTTAGAGAGTC
TTATTTGAAATGATAAGTAAAGGGAGTCTGGTAAAACCTGCTGATTTCGA
CACCTCTTTCCCTATTTCACCTCGTAGAAAAGATACTTTTTTGGTTGTGA
AATTAGACTGGAGTCATTTATAAtgtgtgtaatacagtagtataggcgtt
atatgatcataccattattgttacgggatttagtttgtatgaACTAAAAT
ttttccctccattactttttgctttatttctactatgtctgaattagttg
tctagcttgctagactattgTGAAATTGGAAATATTTCTGATGATGATCT
GCTTACCTTTCCCATAGTACCCACGCAAAGAAGCTGTGACGTTACTTGGT
TCCTTATTATGTTTCCCTGCTGCTTTCCCCtcaatgaaaatcttcaaact
GAACGCAATGTCCAAACAACCTGATGACTTCATTCGATGCAAAGACCTCA
GGGTAAAGAAACTTTGAAACCTATATATGTATCAGATTTCAATCCCCCTT
TTTTCAGCTTTCAATCTGTTACATATTTCTAAGTTTCTGATGAAGCAGtt
tatgattttcaaaaatgttagaaTGGGAAGGGTACAAAATCTGGGTATAA
ATACTttctcaaaattattttctttacttGAGTATATCTTCGTCCCTCAA
GACTTCGTTTTAAACAAACTATCTAAATCTGATCTTTTCAGGAAAAGATT
TTGCTACCACTTCTAAAGGCCGCCAAAAACGACCCTTCTTGTCGAGCAAG
GTGAGATTTTATTTTTCTGTATTTTACGTAAACAACGCTTTTGTGATTGG
AAGATTCTTTTGGAAAGTTTATTGATGAAGAGAACTAatttcatattgga
agtttatcgctGATCatgagatttacgtttggctacgttttgAAAGATTT
CCATCATCGGGCAAATTGGCTACTTGAATTAACTACGTAAtaattttgtt
tacttttttgtcTCCTAGATGTATTGCATTGAATGGTCTAGCGTTGTTCG
TCATTGAAGTTATGCAACACGGCCAGAACCATAACAGGATACCCGAGTGT
CTCTCCGTCATCCTTGCTTCTTTAGATGTAAGATTGATATTTAAAGGGAT
AAACAGATGCTTTGAGCTATTTGGAATCGGGGTTCCTTTTATtgtcttca
aatatttttgcatatcTATTTTCCTAATCGAGATATTTCAAGTTACAATT
GAAATGATTTCTACGCATGTGTAGAATACATGGGGGCTATTTGTATAAAG
CCCAATCAAGCGTGGAAAGTTTTTGGTCTTAAAATTCTCTATTTCCCAAA
AGGGTTTCCTTTTAATAATAGGGTATGATGATATGGCCAGAAACTATGCT
TTGCAGGAAACAACCCATTTCTGGGTAAACTGCAATGCCGTCCATTGCAA
TTAtacaactttttgttttttcttttcaaaattaccAGTTCCACAGCCAG
ACAGTTTCGAACGTAGCATTAGACGTTCTATGGTCATTATCATACTACCA
CGATCAACTCCAAACTTATGATAAAGATATacctgtcaaaattatcgagg
TATTATAGATTTATAGCCCGAATATTTATCCCAAATTTATATGTTTGTGA
CGAGATCTTACGCTTCTATATACGGCTAAAAAATTCGGATTTATCTTCAT
AAAACACCTATTTATTAGCTTTCCTATtggattttcattaatttttctat
TTGCATTTTTCTTTCCAGTCAATGTGTTTGATCGCGTTGAGGTTGCACAC
AACCAAATCAAGTATTGAAGAAGGTATTCCGGAGGAGAAGCTTCCCGAGG
TAATTTCAGTAAAGTCGGAAGGAGGGAGGACATTATTTTGAAACTGCATC
ATTCCAGAGGGTAGACAAATGATCAACTCAAATTGAGTGATTTATAAGCT
AGGCTAGTTATAAGTTGTACAATTAGACTGCcctagcatgaaggtagagc
atccagctacggtgcgcaaggttgtttGTTCGATCCCTTGCTAGGTCATA
CCAGATGCCTCTCTGATTGATGCTTCTAAAGAGAAATTTTAGGAGTAAGT
GGAGATATCAAGGGACAGTTTGTAGCGCcgtcccctaccttcgggtagac
agttATCAGTCAaggacaccttcaaattagcctatcataggctatttaga
ctattttatataggctatttagccgaaaatcgataaaaacctcgatttct
gacgaaatataaatagtcgcgtcttctctaaggaatacatggtttctcat
tgtcagagaaatgctcatgacaaattttgactgaaaatagtctaaatagc
ctatgataggctaatcagcctatgataggctaatttgaaggtgtcctTGA
CTGGTCatagaaaagggagccttcgtgTTGCCCTTTATTGCGGTCGCAAA
TTTACTTACTAGACTTTAAAATGTGACAGGAATAAATACTCTTttgaatt
ttgttattttcagtACATCAGCAGATTGTTGTTAGTGCTTCTTGATTGGG
TGATGGTAACACCACGCGATGTATTGCTAAGACAACGTGCTGGTAACCAG
GACGAATTGAAATTGACATACCTCAGTTTGATTATGAGGGTAAACGAAAT
TTGTGTTCACATAATTTTGTGAATGACAAACAAAATAACCAgaagcattt
tttgttttttattatttattattttttattaaaatgctTCTGGTTATTTT
GTCTGTCATTAAGCTGTTAGCCCAACGAAACATTTTATAATTTTGTGAAT
ATGTATTTGTCGagttttttgtcactttttctatACAATGGATTTGTAAG
AAACCCTGTAATTCATTTCTATTACTTTTGTCACTCCTTACTCAGAGTAT
CCTAAAGTAAAACTGACTCAACACTTTCTTCAGTATAACGCCATTGAgaa
ttgaaaaacttgaaaacggTTCTGCAGGTCTGCATGGATTGGCAGCACAC
TAACGAGTGGTTTGGTTTCGGATCATTAACTGATAGCCTGCAGAATCTAA
TTTTATGAGTTTTTACTAAAGACACGAATAAGAATCCTGTCAGATGTCTG
GAGAGTCGTCTTTTTTGAGTTGTAACTCGATCAGCGGTGCTGCCATTAGA
AGACCGtttaaaatatcaattttatgaCTTTACTTGGCCCGGACCGAAAC
AGTGTTCAGGGTATATAAATCATAAAGGTCAGTGTTGTCGCTCTATCATA
CTTTTACGTATACAAAATTCCTCATTTTTTTATAGACGTTTAAAGACTGC
ATCAAGACGTACGATTCAAACAACAAGTTTGAGAGACGTCAATCACTAAA
CATCAATCAAATGTTTACCGGAGAACCACGCCCTATCCAATTGAAACGTG
TCCATAATGATTTGGGGATGGATGACCCTCAAGGAATCACTGATGAGGAG
GATACAGAAACCGGTATGTGTTTGGTTACCTGGTTTCTATTATCACTGAT
TTAATGTCTACCAAGATACAATAATTCACAATACAGTTCacgttctctaa
ttcgacgttctactatttgatacactccattattcgatgatattgaaagt
catcatcaacaagaaactcttaaaCGATACGCTCCTTTATTTGATGCAAa
ttcaattccccttgaaaatcaaattagagagcgtcaacctTGTATCTATG
AgctgttttgaaaaatattgattttttcgCAATTTCATCGatattggctt
aaaaattttaaagtaaaACAACACTCTTTTTTTCGATTTGAAGTCCACGT
TACCTTTCTTAAACTtgtaatgattttcttttagatTTCTTCATGAGTGC
AAAGACTGAACAAGACAACAAGAAAACAATTTTGGTTCTCACTGCACGCT
ATGTAAGATCTTTTGCCAATCCTTTCAAAAAGCCACTGCTTTGTCTCATC
ATATATTATAATGGTAAAACTTTAAAGTTCTCAGATAATATGTCCAATTA
TACCAAAGACTTTGATAGATTCTGCAACAGACGATTTTATGATTAAGTCA
ATGTAATTAAAAAGATaccatctttttttttaaaagtgcaTCAACCAAGT
ATTGAATTACTATCTGCACTTCCCAACCATTGGTGGTGCCACATGCCCCA
CAAGCAAAGTGCATGAAACAGACGATGCGGTACACAAACCTTCAGATGTC
GGATCCACCCCGAACGCGCCGGACGAACAAACTCTACTAAAACTCTATGA
AAAAACTACTATGTTGGACAGTAATAATATGCAGGTAataatatcttttt
aattttcgttTTCTATGCTTTTCTCATGTCTCAtactaaccttttttttg
attgGCGATAAGATAGATAAAAAAACTCTAATGCTAAACAGTTTCATTca
aattgtttctttttttatcgtttcAGTTCCTTCTTTTGAATGGTATAGCA
TTGTTAACTGTGGTGGAATTACCGCAAGAGGTCAGTATCCTAAAATTATC
GATGACTTTGGAAAATGAAGTCGAACCAAATCAATAGCCAACGACTAAAT
GAATTAATTTCTGGAACGTCTTGAAATATCTACTTTTGAAAGCACGGAAA
TGACCGAGAACCAACTTTGATAAAGAATGATCTTGATAGCATTTTCGCCT
CAAGTTGTTTTATTTCAAATGTATTTTAAATTCtgcaatattttcattta
taaaactTCACTTTCTTCCCGATAGGAGGACTTCTTGACTCGATCGGGAA
CGGAAGGGCAGAAGAGTGTTTGCCGGATGATTATTCGTGACACCACTGGC
ACACATTCATGGGAAGTCTCcaatcttttcaaaatggtgCAGATGAATGA
TATCCTTTCCCAAGGTATGTTACTAGAGAATTAGAAGGATCTGTTAAAGg
ttttgcttactcatcaattttaatttacaagctttttcacatcgAATTGA
CACGGGtgtgaagcaagattggtcaaaaagacgaaaagaaaaacaatttt
ttctttattcagcataatataacaaaatggagacaccgtcctgataagaa
atatgtgtctgatatgaaacgggaacacttatgtcaaaataaaacctttg
agttctataaaagtttttaataattaaaatggaaaaagaGACATGGTGTA
CAATAGCtcaaaataataagtgtttttgATTTCCTGAGGTATATCCATTG
TTAACCTCAAAGCTCTTCAAGTTTAGATGAAAAGCTTCCTTCTCTATTAC
TACAGTAGATAATATTTGGTATTCTTTTAACACTGATCTATAACTAATTG
ACTGGATTGGGCTTTCTGTGTAGAAAGAAGCGTGTCCAGGTCTTAAAGCT
AACTAGTCCGCCATTTGATCTGTTTggtttcaataaaataaaaagcaaac
ttCAAAACTAAACAACTTTCACGGGAAATTTGTGAGCAATTAGCCTATCT
AATGTgtaaaaaaatatgatatctGTGATTGTAAACCCTTTCCATCTTTT
TCGCAACAGGAGAATCCACACCAAAGAGACCATCTTTTGAACGGAAACAC
AGTCGTAATCTTTCCGTTTCTTCAGCCCGCTTGACGCGGACCGCAACCGC
TGATCTTCCGAAATGGGATTCCGTTGATTCCAAAGTCGATCGAATTGACC
AGGTAAATATTTATGATTATATTTCTTTAACGCCGTCAATTACAATTAAA
AGTAGCTAATTTTACTAAACAATTGCGTAAGCGTGAAAAGTCTCTAAAAG
ATATTTCAAATCTTCTATGAAAGAAATTTTGTGGTTCGGCTCAATACATC
TGGTATTGAGTATTCCCCAGTCATAGAATTCTATGCTCCAATACAATATT
CatctcaaaaaaaatcaaggaaGATTTACCTTTAGTTGTCAAGCCTTCAC
AAAAACGACATTCAAAAATCCACCATCTCACCAGTTATGGTGGTAGTTTA
GTTTTAACGATGTTACCAATCACATCACTTACATACTTACTCGTTTCAGC
TTCTTCGATACGTTGGTCAATCAAGTCCAGAATGTCTCATTTATCCTGAC
CAACAATTGAACTTGCCAGCTCCAGTGCCAGTAGGTCTTGATGCTGGCAT
CCAATCACTTGCTGTCACTTCTGTTTTGAAACAACATAACGAGGAAGAAA
ATTACATCCATGAAATCGCCAGTGATGCAAGGTATAACAGTGTATGAATT
CGCCGTTTAAATTGCAGTTTAAAGGACAACGTTTGCTTTActcagcattt
ttaaacaaaagaaaatgcaaCTTTCTCCCTCCTGCGCCGCGAGAGTGACG
TGTTATTGTTAGATCCAGGGCATTATATCAAATCGTAATACCGGTAACTC
GTAATTGCCATGATCATTTTATCataagaaattatattttttatataata
acaCATCATCCAGTATCCAACCAGGATTACTCCCGGTAGGATAAAGTTAG
TGTGATATCCATTTGCTTTTGTTATGCATATTTTTTTGCATGAGACTTTT
TTGATGTTTACCCTACCCTCTTGCATGGTGttgattttatttgaatttaC
TCGAACACCTGTGACATTTTCTTATATCCTCTTTATTTTCAGAGTAACGG
CAAGTGAGATTCAGAAGCCAAGTTGTTTCGATCCTTCGAGTCCttttcat
ctttcgaaaatgttGCTTCATCAACTCGGTTATTTCACTTGGGAAAACAG
GTAAAGAAATCTACTATCTATTACCGAGTCTGGTTTAGAATTCTAGATAT
TATTTTGGCTAgttaaaaagagaaagatttAGGCGAAATGAAACGCTTTT
TCATATTATTGCATTGGTGTTAGTGCTTTAAGATTGTGCAGTATAACATA
AACTATCGACAATTAATTATCATAagttgttttaaagttttttcatcaaa
tttgaaatgatagatcaattttacatcaaaattacatttatttttctttc
aggaAACACTTTGAGCTGCTTGAACGCAACGAAAAACTTTTACGACAAAT
CAAAAATCTTGATAAACAAGGAAGGTAGGTTTATGATAAATATTGAatca
ttttttcttaaattctaTTAGAAACAGTTTGAGATTCCTCATGCTCAAGT
GTAATGAAGATTAGCCTTACAACTAGCCcaggcatcgaaataagggatGG
AAAgtgcattgcaattttttgataagcacGATTTTGtatcctaaaatgga
tcaattttcaatttttagcttgtaagtaattcaaaaacgcatcgcgaatt
gcgaaatgcgatacgctaattcgatccctgTAGCCTTCGATAAAGAGATA
GAGTTAATGTTCTACGATTGTTTTTTCGATagttcgattgttttcacggg
gtttAAAGCCGGATCGGCTGGACTAACTCTGAACTAAACAGATCTTGGAA
GAGGCAGAGGATAGAACCGGGAACTCCTGCCCCGGTTTGAAGTGATGATA
CCTTAAACCTCCTctatcttttgttattttgattatCGTTAGAATTTGAT
ATGATTCATACCTTTCAAACAACTTTTTATTCCCATTTAATTCCCATGAG
ACGTGCTAGATTATTCAATTGTGAAGTTAAGTATCGTAGATAATTCGCCA
ACGCGAACGGAAAAATAcgataggctagtgaaaatactaAACGTGATACA
CAAATTTCTTATTAGCAGATTTATGTAAAACATTTACGAAAAAAACTTag
agtactttaatgggataaactttcgcggggattaaatttcgcggattagG
TGGATTTGGGTCTTCCGcgcaaatccgcgaaattaagtcccaatggaaat
ttggaaggacctcgtccgcaaaaatttctaaacaaaactgtaaatatgtc
aaataaatactatttgaatagttacttgcatcaaagaggtaAAAGTCACA
GAATTGTGAAAATATGAGTGGGGCGACGATTTGCACACTTACTTCGGCGC
TGCGCGTGGCTTACGCAGTTAGCGCACATATTTTACGTGTGCAAGCTTTT
CGCGTGTGATTGGGGGCTATTTTATGTCTGGAACAGCCTTCGCAACTTCG
GCACAGCGACGAAACATATTGCGCAGCGCGAGTCTTTCGCATatggtata
agttattttatgtctggaacagccttcgcgacttcggcgcagcgacgaaa
catattgcgcagcgcgagtctttcgcatatggtataagttatcttatgtc
tggaacagccttcgcgacttcggcgcagcGACGAAACATATCGCGCAGCG
CGAGTCTTTCACATATGGTATGagttattttatgtctggaACAGCCTTCG
CGGCTTCGGCGCAGCGGCGAAACATATTGCCCAGCGCAAGTCTTTCGCAt
atgttatgatttattttataTCCAGTTCAAATGTTGTCACAGGAAGTGTA
ATCATGCAAAAACTTGCGCTGCACAATATATTTCGCAgctgcgccgaagt
cgcgaagcAGTATTATCCATGCTAAGATATCATTTTATATGATTAGTTTT
ACCTCAGAAATGACCTTCACAGCTTCGGCGCTGCGGCGAAAGATATTGCG
CAGCGCAAGTCTTTCGCGTTTATAAAGAGTTATTTTGTGTCCTGAAATGA
CCTTCGCGGATTCGGCGCAGCGGCGAAACATATCGCGCAGCGCCAATCTT
TGTTAACAGCAACTGAAGCTCATACAGAGTTTCTGAGGTAAAACTAATCA
TATAAAATGATATCTTAGCATGGATAATACTgcttcgcgacttcggcgca
gcGACGAAACATATCGCGCAGCGCCAATCTTTGTTAACAGCAACTGAAGC
TCATACAGAGTTTCTGAGGTAAAACTAATCATATAAAATGATATCTTAGC
ATGGATAATACTgcttcgcgacttcggcgcagcGACGAAACATATCGCGC
AGCGCCAATCTTTGTTAACAGCAACTGAAGCTCATACAGAGTTTCTGAGA
ATGAAAGTGACGTCAGATCAAATGTCGTCAGAAAAGAAAGTGTAATCAAG
CGAAAGGTTGCGCTGCGTAATATGTTTCGCCGTTGCGCCGAAGTCGcgaa
agtaaaaattttgaataagaaaaaactatatctTGCGAAAGGCTGCGCAG
CGGCGAAGTAATTGTGCAAATCGCCGGCCCTTTGGAAAATATTGCCAACC
AACAGTGCCATTTGATTGGCTGAGAATTGCATATGTAAACATTCACTTGC
CTTTTATATTTCCGTTTGCGTTCGTGATTATACCGGTGCATTTAACCTCG
CTAATACATTCGCTGCAAAAATATTCACTTACTCCTGTCGACTTTTTTTT
CAGCCGTGAAAAGCACAAGATGGCGGTTTTCTACGTAGCGCCTGGTCAAG
AGGATAAACACTCGATATTATCCAATTCCAAAGGAAGCACTAAATTTGAA
CATTTCGTTTCACAACTCGGATGGGAGGTAACTTCTTGTCAGTTATAAGG
CTCATAGTAAAATCTAAATCAGGTATTCTTTTCTTCAGCCAGCCTTCTGT
TTGCTTTATTGGATAAGAAACCAATCACTCGACCATCTATCATAGATTTA
GCTAGGCATAAAAATGATGTACgtaaaaattagattttctcTTAAAGGAC
ACTCACTTTCTTAGAAGGAATAATTAAAATTAACCTAACTTTACTCCCTT
GCTGATAAGATAAAACTAAAAACTTCAACCGCTTATATTTTAGGTTGATC
TTTCCACGCATGCTGGTTTCATGGGAGGTTTGGAACGGAATCTATCAACA
GGTGTTTCTGCACCTTATTATGCTACACATTCTTTGGAGTTGATTTTCCA
CGTGTCAACGCGCATGCCCGGGTCTGAAGAAGAATCACTCAAAACGAAGG
TGAGACACTTTGTAATTATCTTGTCTATTTTTTACTCTCAGTATTTATTA
AGAGAGCAACCGATAAACGAAAACAAATAAATCCACCATGTCACATTTTA
CAATAATCCTTATGTAGTATGACAATAATTCTTCACAACGCACCCCCTTC
CTCTTAAACCAAAATGGTCCAATTGTCTTCGAAATGAACCGTTAAAAGAC
ATCAACCTTATTTGTAAACATGAAACTACTTGTTATCACCAACCATAGCT
ACGTCACCTTGGTAACGATGAGGTTCACATTGTTTGGTCAGAGCACTCAC
GTGACTTTCGTCGAGGGATTGTCAACACTGAATTTGGTGATGTTTTGATA
GTCATCTATCCCATGAAAAATGACCTCTATCGAATACAAATTGACCGTCA
TCCAAAGGTTTGTTAAGATAAAATAGCCGACCATCTCAACTTAACCCTAC
ATTAGCAATTTCACTTTGGGAATATTATTGGACCAGTGCATTTTTCTGAG
AAAGGGAATTTAATCATGTTTTTCTCATTCTTCCGACTAACTAACTACTC
AGCTAATAGTGGCTCAATATGTTACCTCAATTTCGTGCATTTCAggcttt
tgatttttcttaatcGCTAATCTTCGTTCTTTTAGATCCAGCCATTTGGA
CCATTGTTTGATGGTGCCATCATCAATGGCGATATGTTAGCCAACCTTGT
ACGGTGTACTGCAGTCAATGCAGGCCGTGCCAACCGGGCCACCCTATCAA
TGTATTATCAACAGTATCCTTTTCATGTTCTTTCGCACAAAGGGTTTGTC
TCGTTGCATAATCAAGACCTCAATAATGCTTTTAAATGCTATATTTGTTT
GGTCTAATGAAATGAGAGTTGGTTGATATCACCTTTTTCTAGTGCTTTAT
CAGTAAAGCTGTATGACCAAATAATAGAATAAGTAAGCGTGTAGAGGGTT
AGGTAGGGCTGTGAAGAAGAGAAAGATGCTTCCTATTTCTGGGAAGGTCG
CCGCCGAAAAGACGGTAAAAATCAGTTGACAAATTTACTTAGTAACACTT
ATTGTAAGTCATGATGCCCAAAAGTCATATTCTTTCTTTCTCCATATTTG
AAGATGTAAGTTTCATTAAACTAAGGGATGGCAGCTGTTTGTGTTCGAAT
TGTTAACGATTAGAATAtagtcagaaagtatctacctTGACGCTACTTAA
CCAATAACAACACAGCTACGAAGAAAGAGCACGTTGTATCGGAGAAATCT
CACGGAATTGTGCCCGCCCAACTACTTTCGAAGACTTTTGCTCAAAGATT
TTCGCGCCCAACCTTCCGCCCTCTGGTCACACACACAAAGATGATGATGG
TGGTTTACATAGAACTTTTAGTGCGCCATCTCAATCAAGGTcaaactcac
taaaagattCTGCAGGTGTTCTAAGGTTTATGGAGATGCACGAAACACAG
ACGTTTAGAAGTCGTACGCAAAGTGCGCTTCCAAAAAACTCCAAACCTGT
AGACCACAAACAAGTCTGTAAGTGATAACAAGTCATTTAAAAGTACATTC
TTTATTGAACTCCTGACATTCTCCTTTCTTAACCTGAAGATTACATCAAA
GTAGTAATGCATGCGTACAGTTGAACTCAGACAGCCAAGTTATTAATGAT
GAGAGATGTTACATCATTCGCATAAGACTTCCATTGTATGTAAACCTGCA
ACCATTCTATGCAATTCTATGATAATGTCCGTTTTCCCGTTTTTCTGCGA
CTAACTATGAACCAAAACGTTGTTACGGTATAAATGCATGTAgtctagaa
atctaagctagtttgatctTAAAATCCttaaatatttgtaaaaaaatctt
tGTCACAAGCCGtatgtcctagccttgtgataTACGGGTTTAGTAAACTA
GGCTAAAATGCACCTTGCTAGagaaatcatatttcttttgttgtgtTAAG
TAACTGTAATCCAAATATGATAACATGAGATATTTGAAACGTTTTTCCAT
acgaaaacatttaaaaggatGTCTGTTTGTACAAGTAATCGCATTTCCTT
GTCAACCGTCTCTTGTTAACAACTATGACGCTTACCTTTCTAGctagtgg
aggctaacatgcatagccctcaaataaatgacctggctggtccttaaaat
acaaagttaaattaaaaaaaaatggtagagtagagatGTGAGCGGaactg
cgtagttcatttgttttgaaattttgctgctttgattggtgagtcatttg
agggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttacccgacttcacggt
acacCTTTTCGGTCGTAgtcgcggcaattggcggctacgggcGGAAAAGT
GTACTGTATACTACTTCTCGGACTTCTTTACAGGAATATTTTTAAGGGCA
TTTTttactgccccccccccccNaagttacccgacttcacggtacacCTT
TTCGGTCGTAGtagcggcaattggcggctacggtcgaaaaggtgtatact
aCTTCTCGGACTTCTTTACAGGAATATTTTTAAAGGCACCTCTCCCCTCT
CTCTTCCTCTTGAACAGACCACCGAAGTTAAAATTATCAGTTTGGATGAC
AATGAGAtcattttttctattcttttacagagaaaaacaacaaatttcga
GCCCATAAAACAACAGGTTTTTAgtgtataaatttttttattaatttgta
TATCATTAGTGTTACTGTTTAGTTTTAAAGAGACAGAGGTGTGATCAAAG
GCCCCCTTCTCAAATTATTGATATTCTTTGATAGAAGATAGTGGGtactt
tctaaattttgaaaacctttttcaaaataaagcagccatatgtatttttt
tactaGACTAAGGACTAAGGTctcgaaaatcttaaaaataagaCCAAGCA
GTCGAGCCTGGAATGGCtgagttttagaaaaatatagggTAAAATGCCTT
GAAATACCGAAAGGGGACgaaggatttttttttgtttcgtcagctcttaa
gattttaattttttttactacaaAGAACATTCTCTTCAATTAGGTTTCAA
TTATTTGCAATTAACAATTtaatattattatattttaattaATTCGATAA
TAATTTcgtaatattttaataaaaatgcttaaataataataaaaactgAT
ATTTCTCctcattaaaataattttttcatttctgaaagttttgatttttg
tttttctttgcacGATTTTTGTTCCTATCTTTCTCTTCAAACTTACTTGG
GCTTTTGAACGTTGATTTTTCAAGATAGTATAATTTTACTCTACTCTTGC
CAAAGTAAAAACCACCAGATTAAACAATCAGGACTCTGAGCAAATCCAAT
TTTCTGCTCAAACAAAAGATAGATTTTGAAGTTAATTGCCTCTCATGTAA
TGACTTGTCATTAATTCAGTCAAGAAATAAGTTGAATCATTCAATTATAA
TTAAAAGTGGTTTtgctatcaaaacaaaaaatgttacTTTGAGTGCAAAA
GATATTCGATACTAATATGTCCCTTTTTTCTGCTGACAAGAGATAAAAAG
ATTGACTTCAATGTCAACAAAATAATtcgaaaaatgttattttatttaAG
ATCTACCAGTAAGCCAACATAAACCCCTCAATTTTCCGTCTTACTTTTTT
CACTCTCTCTAAGACTCCTCTTTCatttttcagtggtttcaaaGTATAGC
TTTTAGTCAGGCATAGTCAAATTAGATATTCTCTCACGCCCTCGAATGAA
ATTATTTTATACATTGTGTTATTTTTATAGCAAAGTAGCAGCAGTTTTTT
TAAGTGAGGGGAGAGAAAGAGAAATTTCCTTTGTTAGCAAGCTTTGTTAT
GGTTTTTGAAgagattttcatctttttcatacaTTCCAACCGtataaaaa
gtctttttgatcAAAAGCCATATTTTTTATATCATTAAGTTCTCAGCAGG
CGTTCCTTCTTAACTTGCAAGCCAAGTGAATCATCTCTTTCTAACGATTC
CTATCAAACTTTCTTTGCTTAGCTGCtagttttgttttctcttttcatTT
CATAACTTTTAACCTTATGCTAACAAATCATAACAATAAATTTTAATATG
AAACTGATAGCTAACTTACTAATAAGACGTATCATCCCAAACTTTATAAC
CCTTTTAAAACCCaggacattttttgtgttggcAGATAAGAACATTTGAC
TTACAGCTCATTCATAAAAAAAGTAGCGTTTTTTACATCTTACATTTGCG
ATTGAATTGATCATAAAATATGAATTCTTATTTTGtattaaaacaaaatt
aattttgttcgagttaaatCCTCGACTTATTTGAGTACGCGAGCACTCGA
AAAGACAACGAGAATACCTTATAACAAAATTCATTGGGAAAAAAAGCATG
TTTCAGTTAAGAATTCTCATTCATTTATAGATTTTTCCGTCACTTTTTGT
CGACGATTTTTTACCGATTTCATGATTAACAAAGTTTAACGATCACGTGA
CTAAATTTTAAACCAAATTAACCAATCAGTATCGCTGAAGAAGGAATCAC
AACTAATAACAACTAACTGTGAGGTAATGTTGATGATTTACCTAAATAAC
CTTTATTCTaaccattttaaattttattcggTTTATTAGAAGGAAGCTTG
CTTTAAAGTTTGAAGAGTATTTTAAAACAGAGTATTGATAGCTGCATGTT
TTCGTCAGTCTTTCTTAATGGACAAAAGTGGGTTCCTCGATTTTCGGAAT
TCTTACCAATCTTGAGAGTTGATGCActaatttacagaaaaaaatattgt
atttaAGGAATTTTCGGTCCTTATTTACATCACTATGTTCTTCTACTAAA
TTCCTGAAATATTCTGATTTTTCTACATTTCAGATCGTACAGCTTCGAAC
ACGTCACTCCAAAACATCAATGAAGATTCAAACTTGTTGTTATCACCTGA
TTTTTGTGACGCGAGCGGCAGCGGTGACAATAAAGACAGTATGTCAGCCA
AGGAGCGAAGAAAATCTTTGAGTAAACGGTTCAGAAAGAAGGCGGCTTCT
ATTGACGTTTCTGGTTTCTTGATGGATAAAACGATCGGTGAATGATGATT
GGTTCATTTTTGATCACGTGACTTTCATGGATGAAGTTGATTGGAGGAAA
AGGATTTTCTTGTCAAATTGTCATGTTAAATTGTTGAGTACTCAATGGCA
CGAGAAAAGAAGGTACATAGTGCATATGAGTAATTTTATCCGACGGATTT
ATAGTGATATCGGCGACGGATTTTGATGGATATCAAAGGTACCATTGACA
TATGCGTTATAGCAGCTATAGCAACCTTGTTTTACTATTAAGTCTATTAA
ATTTAGTTGGTTTAAATTTGGGCTATTTAGCAGGTACGcgattgaaaaat
gttttctagaaacattttgcttttttattcaaaagatatAGGAAATTATC
TGGGAATTTTTATAGTACACCATTATTTACCCTATCTTATTACCCCTTGT
ATTATTATCATATTATCGTAAAATTGTGTAATAttaaagaaatttatatt
tttcataataCTTAGTAGTAATAAATATTGTCAAATTGATTGTTCAGTTG
TTTTATAGAATGTGGTGAAAAACGTAGTATAGGCtcccaaaaaaatgaaa
aggagGCTCTTATTCCGTCCATTCAACCTAAAAAAGTCACAACTGTCAGC
TTCAATAAGCTTTTCTGTCCAAACTTTCGGATTAGACTGTCAAACATCTG
TAAAGCTAAGTGcaagcatggaggtataaagaaacaggagaactatgcta
ttgtaaccaagctcgccctacgattaaaaaagttacgatgtgtgcatgct
cataatctcatatatcgtgcatttttaatgagctcttttatccataggtg
aaatcctattggctcatttaagctttagaaattagatgag

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002531	XLOC_002531	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000045	supercontig	sc0000045:363507..382696 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.46828e-10	6.02888e-05	0.823931	1.07537	0.957591	0.0313026	0.0885815	0.571232	0.507336	5.10756e-09	0.215674	1.42613	0.147181	0.108312	0.748317	0.632029	0.924699	1.33736	0	0.131886	1.03625	1.7286	0.0270848	1.04228e-09	0.000581831	1.22201	0.680266	0.411944	0.718425	0.877609

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00004495 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: RGPA1 (Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 OS=Homo sapiens GN=RALGAPA1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 696.427 bits (1796), Expect = 0.000e+0
Identity = 401/1026 (39.08%), Postives = 598/1026 (58.28%), Query Frame = 3

Query:  246 SVIEGGTEVGWTPLSSVILWRRMLGIMGNINHIKDPEIHATVFKHLIDLWQMLASICKNQGVSLDNKSSPDPPGLTPALFFPVSWCFQAMTQEFGGSHKPGRVLAFKLMCMLTTRSHRLKPSTEHIKHFYRFLHEGLKGSDQNVINAIIGECS-SFFTLNFPGASCLINDFIHGTKTIISTIYMQYPRKEAVTLLGSLLCFPAAFPSMKIFKLNAMSKQPDDFI-RCKDLREKILLPLLKAAKNDPSCRARCIALNGLALFVIEVMQHGQNHNRIPECLSVILASLDFHSQTVSNVALDVLWSLSYYHDQLQTYDKDIPVKIIESMCLIALRLHTTKSSIEEGIPEEKLPEYISRLLLVLLDWVMVTPRDVLLR---QRAGNQDELKLTYLSLIMRTFKDCIKTYDSNNKFERRQSLNINQMFTGEPRP-IQLKRVHNDLGMDDPQGITDEEDTETDFFMSAKTEQDNKKTILVLTARYCINQVLNYYLHFPTIGGATCPTSKVHETDDAVHKPSDVGSTPNAPDEQTLLKLYEKTTMLDSNNMQFLLLNGIALLTVVELPQEEDFL---TRSGTEGQKSVCRMIIRDTTGTHSWE---------VSNLFKMVQMNDILSQGESTPKRPSFERKHSRNLSVS---SARLTRTATADLPKWDSVDSKVDRIDQLLRYVGQSSPECLIYPDQQLNLPAPVPVGLDAGIQSLAVTSVLKQHNEEENYIHEIASDARVTASEIQKPSCFDPSSPFHLSKMLLHQLGYFTWENRKHFELLERNEKLLRQIKNLDKQGSREKHKMAVFYVAPGQEDKHSILSNSKGSTKFEHFVSQLGWEVDLSTHAGFMGGLERNLSTGVSAPYYATHSLELIFHVSTRMPGSEEESLKTKLRHLGNDEVHIVWSEHSRDFRRGIVNTEFGDVLIVIYPMKNDLYRIQIDRHPKIQPFGPLFDGAIINGDMLANLVRCTAVNAGRANRATLSMYYQHYEERARCIGEISRNCARPTTFEDFCSKIFAPNLPPSGHTHKDDD 3260
            SV+ GGT  GW    + ++WRRMLGI+G++N I DPEIHA VF +L +LWQ LA I  N G+S DN +SP PP L P L     W F+A        +K G++ A+KL+C    R   + P+ + + HFY  +H GL   DQ+++N II  CS  FF+L  PGA+ LI DFI     + S+ ++  PR EA  LLGSL+CFP  +  +     N     PD  + +  D++E I+  +L +A+++PS  ARC+AL  L +++ E + H  +H +I E L+VI  SL F ++TV++VA ++L  L +Y  +LQ Y  D P+KII+   LIA   H   S+  E    E     +  LLL LLDW+M  P   LL+         D+ + + L+ I +    C+      +   R   ++++ + + +  P + L+ +     +  P     E  ++       KT+   +  ++ + AR  I  ++N+  H+P  GG    TS+V E  D  +      ST  +P+            + +S N+QF +LN   L++ +++  EE+       +G     S  R+I+RD +G +SW+         VS L +       LS  E  P+ P    +   +++V    S +  R     +P WD++  + D +D+LL+Y+G +SPECL      LN+PAP PV +    ++  + ++LKQH EE+ ++ +  +D  + A E  +P    P S F+  ++LL  LG  +W+ R+ F LL++NEKLLR+++NLD +  RE HK+AVFYVA GQEDKHSIL+N+ GS  +E FV+ LGWEV+L+ H GFMGGL++N STG++ PY+AT ++E+IFHVSTRMP   ++SL  KLRHLGNDEVHIVWSEH+RD+RRGI+ TEFGDVLIVIYPMKN ++ IQI + P++  FGPLFDGAI+NG +L  +VR TA+NA RA ++ + +Y   YEERAR +  I ++   PTTFEDF +++F+P   P  H   D D
Sbjct: 1046 SVMAGGTLTGWHADVATVMWRRMLGILGDVNSIMDPEIHAQVFDYLCELWQNLAKIRDNLGISTDNLTSPSPPVLIPPLRILTPWLFKATM--LTDKYKQGKLHAYKLICNTMKRRQDVSPNRDFLTHFYNIMHCGLLHIDQDIVNTIIKHCSPQFFSLGLPGATMLIMDFIVAAGRVASSAFLNAPRVEAQVLLGSLVCFPNLYCELPSLHPNI----PDVAVSQFTDVKELIIKTVLSSARDEPSGPARCVALCSLGIWICEELVHESHHPQIKEALNVICVSLKFTNKTVAHVACNMLHMLVHYVPRLQIYQPDSPLKIIQ--ILIATITHLLPST--EASSYEMDKRLVVSLLLCLLDWIMALPLKTLLQPFHATGAESDKTEKSVLNCIYKVLHGCVYGAQCFSN-PRYFPMSLSDLASVDYDPFMHLESLKEPEPLHSPDS---ERSSKLQPVTEVKTQM--QHGLISIAARTVITHLVNHLGHYPMSGGPAMLTSQVCENHDNHYS----ESTELSPE------------LFESPNIQFFVLNNTTLVSCIQIRSEENMPGGGLSAGLASANSNVRIIVRDLSGKYSWDSAILYGPPPVSGLSEPTSFMLSLSHQEK-PEEPPTSNECLEDITVKDGLSLQFKRFRET-VPTWDTIRDEEDVLDELLQYLGVTSPECLQRTGISLNIPAPQPVCISEKQENDVINAILKQHTEEKEFVEKHFNDLNMKAVEQDEPIPQKPQSAFYYCRLLLSILGMNSWDKRRSFHLLKKNEKLLRELRNLDSRQCRETHKIAVFYVAEGQEDKHSILTNTGGSQAYEDFVAGLGWEVNLTNHCGFMGGLQKNKSTGLTTPYFATSTVEVIFHVSTRMPSDSDDSLTKKLRHLGNDEVHIVWSEHTRDYRRGIIPTEFGDVLIVIYPMKNHMFSIQIMKKPEVPFFGPLFDGAIVNGKVLPIMVRATAINASRALKSLIPLYQNFYEERARYLQTIVQHHLEPTTFEDFAAQVFSP--APYHHLPSDAD 2035

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00004495 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00004495 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
RGPA1	0.000e+0	39.08	Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 OS=H...	[more]

You are here

TCONS_00004495 (transcript) - C. hemisphaerica