TCONS_00004412 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00004412
Unique Name	TCONS_00004412
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2284

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000044:453823..466884-
coding sequence from alignment at sc0000044:453823..466884-

transcript sequence

>TCONS_00004412 ID=TCONS_00004412|Name=TCONS_00004412|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2284bp
CATCTGATCAATGTACGAAAAcgaccccttctcacagacccgGGACCAAT
CAACTTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAATTACAAATAAACTAGAAag
AATGGAACCTCGTGGATAGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTtacaaaga
aaatattgatattgACTGTCAATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAAT
AATGGAACGAAACAGCAAACAAACAAATTAAAGTGACTTTCACTTTAAAG
TAAAGTGGTTGTTACATATTTATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGCT
GACTCGACAAAATGTGTTGCAGTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGT
TGgttgtttttcattgttttcttcGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGG
AAGATGCAACGCCCTTATCAAAGTTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAAT
GCGATTCCAAGTGTGTCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATC
AAAATTGCAGACCAGATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCAT
TGTTTTTGATTACTATAGTGGAAGAATAGTATATAAAGtgacattcaatt
tcttatccAATACATTTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCC
TTACCAATGAATGCTGTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGC
AAAGATCGACCAATGGTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTT
TATTGAATATCGATTCTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGA
CAATGTAAACGGGGCATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTA
TAAAAGTGACGCACACCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTT
TAGATAACGATAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACG
ACTGATGACCAAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACagg
tgtttttattattttcattgctGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAA
GGAAAATGGCAGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGA
AAACGATTGAATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGA
AGGGATAAATCGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAA
CTTTAACTCGTAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCAC
CAAGGCGACTTTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTT
TCGGAATCACGATTTTGCatacgaaaatatttttgatcccgATGAGATAT
CGCTATCAACTCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATA
AGTAATATTGCTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTT
GTCGCCTTTCGATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATC
AATTTTCAACGCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAAT
ACAATCGATCGTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCT
TCAATGGTTGTCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCG
ACACAGAAACGAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAAT
CGTTTTTCTGATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAAC
GCCAATGAACGGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATT
CCCGGAAGACGTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGT
AATTATTCGGACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAA
AGATGAATTGCTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCaa
caaaagtttaaaatcgaaaaaaataaaaatgagtttGGGCATTGGAGAAA
TGCTGGAAGGCGAGAAGAAGCcactattgaaaaattgaaaaattgaaata
aagacGCTTGCCTAATTACAATAGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAA
CTTGATGAAGACTGAAAACTCCTTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACAT
TCATTCACCAAGTGAGTTACATCACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTC
CTTGACGGCAGTCAAAAGATTTATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAAT
TCATGCTCTTGTGAGCGTACATAACCTTTTAGTT

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00004412-protein

>TCONS_00004412-protein ID=TCONS_00004412-protein|Name=TCONS_00004412-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=549bp
MCCSNGITTAKNCWLFFIVFFVAFCLGNHGRCNALIKVDVSLKLYQCDSK
CVQEDGQPCPSSIKIADQMENLTEPGVQFIVFDYYSGRIVYKVTFNFLSN
TFRRDRLKQFFNALPMNAVVLITVNKKCEAKIDQWYDFLLQHSNLVLLNI
DSNEPEVLITCQGQCKRGIISTSHAPIYRYKSDAHQGAIQEDYQLVLDND
SGNFKTHKQEGGTTDDQKIFVIVLVVSITGVFIIFIAVISLVYCCKRKMA
AKKREEDERLSNRKRLNWKIDNWFRQREIEGINRKIAKVNSLSGDTTLTR
SLKESVRDRNPYHQGDFVRTSISTPSVVDFRNHDFAYENIFDPDEISLST
RFTTLSRVYPDNISNIATIATPYDAQDRWLSPFDVNRYSARRESSDQFST
LTSSDFSSVSQHNTIDRFYVREHQTLPRGLQWLSPGTRRQIFFSAADTET
KNENGRLSVNEDNRFSDYYRHDVDGHLHKTPMNGKDFTPPAYVARNSRKT
SSNSDDGELSDSGNYSDPRELDSSTLSLFKDELLKRNSNASFYEIATKV

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000044:453823..466884-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00004412 ID=TCONS_00004412|Name=TCONS_00004412|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13062bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:453823..466884- (Clytia hemisphaerica)
CATCTGATCAATGTACGAAAACGACCCCTTCTCACAGACCCGGTAGGATA
TTTTCATCCAGTGGGGTTAAAAATAACGGACTGAAACTCTGGAAAGGGGT
GTATGAAAGGGAGCGCACCGATTAATACTTCCAAACCGACACCTACACAC
AGTTGGTTAATATCCTAGGAATTGCTTTAAAATTTCGCATCTTTCTATGT
TATGATGTAATCAATATGCGGAATTACATTTATTCTTCCGGGGGAGTCGC
CTTTAATTTCGCGAAAAAGCCACATCATCATTAGCTGAAATTTATGCTGA
TCTGTTTTAAATATTTTTCAATATACGATTTGATGTTGATTGATAATAAA
TACTTTCACTTTCCTTTACTTTTAATTTCTCTTGTTAGGGACCAATCAAC
TTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAATTACAAATAAACTAGAAAGGTAT
TTTTCTGAAATCCCATATTGAAAATTAATTCTTCCATCTTTAAGATTTTT
GTTAATGTTTCTTCACATGCTAAGTAATTAATTCAGTTCTATCCAGTTTA
TAGTCATTTTTTCTTATATACAGCAGATAGTACAGATTCCTTTGGCGAAA
CTATTTTATGCAGCAACGACTTTTAGTATATAGATTTCATATGCCATAGA
CGGAAATTTCTCGTGCAATATGGAAATATTTTACTCGTCCTATATTCTTT
ATCCGTATATTAAACGGAAAAATTTCGGAAGTCATAAAATATTTCTCATA
TTGCAATCGAAGTTGTCTGATATGTTGTTCTAGACAAATTTCTCCTCAAG
ACTCTCGGATGACTTTGAATTGACGTCAATAATTTTTTGACGACATTGAA
GATTACCTGTTTAGTCCATTGACGATTGCGTTGAGTATGAAACTAACTTA
ACTCGTTTTCTTAACTCAAAACTAATATTTCATCGTGAAACGTCTCTCTA
CAATAATAATTTTGGGTGTGTTCATTTCTACAGAATGGAACCTCGTGGAT
AGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTTACAAAGAAAATATTGATATTGACT
GTCAATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAATAATGGAACGAAACAGCA
AACAAACAAATTAAAGGTATTTCCGTTCATTTGAATCATTTTTCTTCCTG
TATTAAACCATTATGAGGTGTAATGACTTTCTCACATATTAGCCCCGCTA
TGGGCTAAAGGTATTTCCGGTACCCTTAATTACATAAGCATAATCTTTCC
TCGCTCACAGACTTGTATATCCCTGTTATCGGCCTTTATCATCACGTCAC
GCAATCACGCCTCAAATGTTTGCCAAAGTCAGTCGTTCATGGTGTTTCAA
TAAAAATGGCTCGCTAAAAAAAATGATTGCTTTGGGAAATAGATATTATT
ATCTAGAGATATCGAAATCGAGATTGTCCTTGGGTTATGGCGCTCTAAAT
TAGCGATGTCGAGAGGCTATTTTATGTCAAACATGGCCCCAATAAAATTG
ACATAGGCTCACGTTTGAAAGATCTTCAAATTTAGAACGACATAGTGTCA
AGAGTTAATTTGATCCAGTCCCGGAATGATAATTTTTTTTCTGGAAGAGC
CTTATCTAGCTACTAACTTACGTATTGCCTATTTCCACCTATTCAACTAT
TACACTGAAACTCGGGAATCATTGAGACAATCCCGATCAGGTCATCGGGC
TAACCGCTGAGAGTAACTATATTTTATAAATTGAAAAAGGCTAAAACAAA
ACCAAATTTCTAGTTTAAGTAACTGTTGTAAGGTTGGACAGATATTTTGA
TAAAATCGCGAGGACAGGCTGTCATCAGCATCAATTTGGCAAATTTTCAA
ACATCAAAAATATGCAAGTTATTTTAAAGCAATCCATCATCATTCCAAGA
AAATGATTAACCATACTTCTTCAATTAAGTGATTGAATCAAAATAGTTTA
GAGAACATTAAAAAACACACCACATTTTTACTATACTAATGCAGTTGCAA
TTTGTCATGTATTTATTTCGGTGTTGACGAGATGAGCTGTGGTGTGGGAG
TGATTGTGAAAGTTTTATGTAAGATCTGTGGTAACAAACTTAAGCTGAAA
GTTCACCTTTCTAAAGTGACATTCTGACTATTATGCGTTGTGAACGAGAT
GAAATGATCACAGGTGTCAGGTGTTGTGCAATGTTTACCTCATAACCTTC
TATGATAGTATACCGTCGTTATTTCCGGTAAGATCCCACTTCCCGGACTG
AACTTCCTCTGTCACTTTCCAGTGGAAAAAAAAAACCAAAACTCTGGCTA
GTTGAAAAATGAACTTGGGAAAGTTAGCCAGTCTTCTAATTCAACACAAG
GTTTATCATGTACATTTTAAAAACCCTTTAAAAAGTTTTTCAGCCGATTA
TCCTGGGGAAAACAGTAGAAATATTTTGGGAAAGTTGTGGAACTTTTTGT
CCGGGAGGTAGGTTCTTTGTCCTGAAAGTGGAATCTTAACCGGAACGACG
GTACAAACTTTATCGATCAATATTTGTATCTAACGTTGTCTTTTAAATGG
GAAAAAAGGACAAAAAGACGCAAAAATCAATAAAAAAAGTTTCGGGTAAA
TGAAATTTACGATTTGAACATCTTTTTGTTAAATGCAACACACGAAGAAC
ACATTTAGCCCTCTCATTTAAAAAAAGAAATTGGGGTCTTTTCTTATTTC
TGATAAAACATCAAGGTGTCTCGCGATATTTTGAAACGATGACTGAATTA
TATGAAATCCTTTACATTGCGCTTATAGAGTTTCGTTTTCGCTAAAACAA
AACTGACATATTCTTGAATGTTTCAACATTTGTAAATTAAAAACATAAGA
ATGAGCCACTTGATCTTTTGTGATTGTTCCTATAATAAAATACTAATGGA
TACTTCAAATATCAAATTTTCTAAAGAAATGTGATTTGGGTATTGCTTTG
TTTTTGCCAGGTAGTCGATGTGTTAGGGGATTCCGTTTCTTGGTTACTAT
AAATGTGTCTTTGTGGCGAATCTTGACTTTTTCTTGTCTTGTCTTTGAGT
TCTTATAAAATAGTGTTCTTATAAAAAATCATTCCACTAAAAATCGAAAA
CTAACATGTCATCTTATTTTCAAAAGACAAATGACGTAAAAAACAACACA
TGAATTCGTTTTTGTAAGGGTGAGTCTAAACTTTTTCTTCTCTTTCAGTT
CCTATAGAGTAGTATTCTTATTAAAAACACATTTAAGACATTCTTTTTAT
ACCGAGAGGAGGTGCGCCACTTATGCTGACAAAGCAGAATAAAGAAAAGA
ATTTTTCAAAGTTTGTGCTCGCGCGGAGAAAGGGTTCCAAATTTCATCAC
CCAACCGTCACCGGTTGCCGGGGAACGGGCCGTGCAAGGTACGGCGCGGG
ACATTCCCGCACGGACAATTGCCGGTCCGTACGGTGTTTTCGGCGCGAGA
GGGATATAAAGTTGGCCTTTCTTTAGTTTAGAAACATGCTTAGTAAGTAA
ATGTTTGGAGATACGTTAAATGTTGTCCTTGAACAAAAAAATTGAAAAAT
AATATGTCATTTCATTTTCAAAAGACGGATCACGTAAAAAAAACAACACA
AAAACAAAAATTGTTGAACACAAAGAGTAGCTAGGCAGTAAGGTAGTAAA
GCGACTTTGTCTGTTGTCTATCTATCATTGTTCGAAACTACCTCAATGAT
TTCCTGTGACTAATTACCTTACTAATTGCCTCTTTAACGATTCCCGCTTT
CTACTCGACTATCCACTTCTTTTTATTATTATTTTTCACTTAATACACAT
AAGAACAATAACAACAACTATAAAATAGACTACATCTCCATCATATACAA
TTTAACTATTTGCTATTTGAAAGATTTACCACTGGCTATCACCAATACTT
GATCTTTCCAATTTCGATGCACCTTCAATAAATTTGTTACTTTTATTTTT
ATGGATATTTAGTGACTTTCACTTTAAAGTAAAGTGGTTGTTACATATTT
ATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGCTGACTCGACAAAATGTGTTGCA
GTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGGTTGTTTTTCATTGTTTTC
TTCGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTATCAA
AGGTATGAAATGGTTTTATTTTAGAAGCTGCTAGAATTGTTTATGTGGAG
GCGCTGTTACTGTATTTTCAGTTAAGATCCTATTATCAAATCCAAACCTC
GAAATCAATAGCTTCTATCTGCACGTTCTTTGGATGTATAAATATCTGCA
TCGTTGAGGGGGCCATTGTATTATTTTTCGTCCCGTATATGATTACCGAA
GAAAGAGTCAATGAAATGAATTCATTTTTCACAACCTTACTAAACTTTAT
AGGTCACGATTTTGAAGCAGTCCCTTACTCGTAATAAGTTAACTTAAACT
TAATAGGTTATAATGTGACAATTCTTAGACTTTTCATGGAGCCTGGTAGC
GAGAGGTGGAGACTTTCCGTGTTGTTTACTGATTTTATTTCATTTTATTG
GATTGATGAAAAAAAGCTGAAAATTTCAATTCCACTGTGTAAAACAATAA
GGAACTTATTTGCTGTACGCAGGTTTTATTGATTCCCACTGGTATCTCAG
CCAGTGGTTAATTAATGACCGCTAATAAATCAACACCGTCACTTTGGAAT
CTTATTAGGTCGATGTCTTGTTTACAAGATAAGTCTTGTATTCATTAAGA
TGACAAGTCTCCTTAAATATTCTTTATTTGAAAGTATTACTGGGTTAACG
ATAGTTTACAAATTTAATTTCAAATGTTAATACTTTTAGATACACATGGG
TAGTGTATTTTAGAAGCCTTTTTTTGCAAGGTTATTAGGAATGAAAATCT
TAAAATAAAACCTAATTAAAATTGATTCTGAAGTTTTGGATATACTTTTA
GCTTTCTTCTCAATCTAATAAAATCTTACTANAAATTGATTCTGAAGTTT
TGGATATACTTTTAGCTTTCCTCTCAATCTAATAAAATCTTACTAAAAAA
AGTTTGTATCAAAAGTATTAATTTAAATGAGTTTATAATTTGATGAGTTT
TTACAATCTTTTAAAATCCTTTAAAAAGTAACCGTTGGCAATGATTTGTA
GGTCTACTATAAAATATGTTTTTTTCTATAATGAGTATATAATCTTTATA
AGGAAGTTGGGAACGGTAATTCGGTTACATGCAGACTCCATTGAAAAGCA
ATTTTCAATAATGTTCTTTAGTGATTGAACGTGCGCTGATTTTCTTTAGA
AAAACCGGGAAATGTATTACTTAATTCGGATTAAATTAGATTAATTCTAC
AATCAAGTTCCGTCATTTTTTAAAGTGACCTTATTATTGTTTTTCATTTT
GTTCTAAATTCAGCGAAATTCGCATTAATTTGATAAAGCCAAATGAACGA
AAATTTACTTGAAATACCATAAGAATGTTCACAACGTTCATATAACGTTA
GATGAATGTTGAAGCAACACTGTGTACCCGGTGGGTTGCCTTGCAAATTT
TATTTCCGTCAGCGGACGTAGACCTGAATTACTGGCCGAAGACTAGCGGG
CACCTCACTATAAACTGGGGTTTTTTTATCTTGTTTCTCAATGAGTTCCA
TACTTTATGACGACTTTTGGAGTGACGTCAAAAAATCGAATGCTTGGAGC
CCTAAAACCTGGGCTCAAAACATTCGAAAAAGTAACAAAGTGGAATTTTT
GATGTCGAAAATTCTCCTTTTTTCGAATAATAAAACAAAAGTAATGGAAA
GTAGTCGTCAATATTACATGAAAAAGTTACAAATGTTAATCAATATAATT
TTCAAATTTATGTATAAGGGATGTTTTATGCTACCCACGCGCTAAATGGA
CATAGCACGTATTTTTCGTTCTGTTTGTCAATTACATTTGATATTATATA
ATTATTATTGGGGAGAATGGAGTATAAAGTTTCCTTCCTCTGAAGTAAAA
GTTTTCAACATTATTGTAACATTGTCAGGAAATTTGAAAAGCCCTTTTTT
TGGGTCGATTATGTCTTATTAAAACTTTGTTTTATGGGTTTTAAACTATG
TCTTCTAGTGCAAATAGCATTGATTTTAAATTGACGAAGGACCAAAATCG
ACTATTTTTGTATGATTTTCTAAAGCATATAATTCAAATTATCTATATGT
TCTTTTTTCCATGAAACAACCACGTGGTCATATACCTTGGTCGTCTTTTT
GCGGAAAGCACTTAAGAGTTTTCAATTTGTAAAAAATCATTTGGTAGGCC
TACGGTATATCCGTATAAATCTTAACTTGCTTGACCGAAAACTCTAGCCT
CGTTTTTGCTTGTTAGTAACCCTTAATTAGCTAGGAGCCAGCGAATTTCA
AAAGTATTGCTTTTTTAACATACTGGTATTAAATATTGCAATTGGCATTT
TTTCGCTAATTGCCATCATTTTCCGACAATTAGACTTATTAATTCAGAAC
TTCATTTCGCTTGCAGTTAACGAATGAAAAACTTTCTTCGTTTTAAATTG
ATTAGAGGTTAGATGTCATTTTGGCCACCCCATACCCTCCCAGTAATCTT
CAAAAAAGGCGTTTTATTTTCGCTGCAATAATGCTTGTCTCAAGAGAATA
CAGTAACTTAGTAATGATAAAATAGCTTCATTAATGACGTGTATATGTAC
GACTCCAAGCTCAATTTCTCTTTTCTGAAAATGAAAATATCTCAAGATTT
CATAATTTTTCTTATGCTAGGCCTTCTAGAAGTTCAATTCATTCCAGAAA
AAAAAATTGGAGGTTTTCATCTGTGTTTTTCAGGACTTTATCACTACTTT
TTACTTTAAGAAGTCCAGCCAGCGCCTTATATAACAAGAACGCTTTAAAA
AAGGCTTGAAAAATGATCTGGCAAAGTTAAATACAAAGTGCTCAAGACGA
TGTTTGCTTATGAAGTAATACGCAATCTAGCACGTTCAAATACTATTTCC
TTCAATTAGTGGGCGCTCTTAAAACCGCAGTATGTACAGTTCAAAAAGGG
CTGGCCGTCTAAGTCTTTGATTGTCATTCTCTTTGACCTCATTTTTACTT
TTTCTTTGGAAGCAGAGCAGTGACTTTGCATTGATAACGGAACTTCAGAA
ATTTGGCAAAAGAACTAACGAGACCGTCATACAAAAAAAGTGTTAAAAAG
ATGACGGTTATGCGAAAACCGTATGCCGGATCTTTAAATGACTTATTAAT
GACGGCAACAAGTGAAAAAGACGATAACGACGACGTCATTTTTCATTCGT
CATTAAGTGTGCACTGATATATTGTGTCGGTATTTATATAATGTTTTTTT
GTTATTGTTTTTCTTAAAATTCTTTCTTTTTATAAGAAATAGAAGAATAT
GTTCTTCGCCTACTCAGGGACTCTATCTATCTACGTAATACATTTTCCAT
TCGTCTCATTAAGCTAAGGATTTTTGACCTTGCATATGAAATATGTAAGG
TCGACTATTTAGTTGAAAAAGGGACAATCTCAAAGTTTAAGGTTAGCAAA
TATGTTAGTTTTTCAGACATTATTTTTGACATTTGGCCTTTTGATGTTAG
TAGGTTGATATTTTATTGTTTTCATTTCCCGACATGCATACCTCGGGAAG
ACTTATATTGCATAATAAAGCTATCATTCTTCATTCCNATTTCCCGACAT
GCATACTTCGGGAAGACTTATATTGCATAAGAAAGCTATCATTCTTCATT
CTATTATTTTGAGAAATCTTAGAAAATAATTTTTATATAGACTTAAGGAA
GGATCGTGTAGGAATGATATATTTTCCAATGTGCATCCTGGATTCCATTG
AATACAAGTTTCTATTTTTGATATCGGATCGTTAACTTGTGTCCACCTAA
ACCTGATAATTACTGACACTCAAACAATAGCTAGGGCTGAATAAGAAAAA
AATTAATCTCCGTCCAGATTCTGATTACTCTGCGTTGGCACGTATGCATC
CTAAAGGCAATGGCTCCGTAAGAGCCATTTAAAATTTTTTAAAGTTTCTG
CCCCCAAAGTAAGAACGTTTTTTTATCCGATAATTTTGTAAGAATCCATT
GAATGACTGGATTTTAAAAACAAACATAAAAATCGTCAATTTATTTTTTG
ATGTCATGCACAATATCCGCAATTATTTAAGATATGCACCATTTTTGTCT
CACAAGGGCCAAAAGTGACCAAAATTTGAACTTGTCATACATCTGAGATG
AGAAACGGATGTAAAATCGTACTTTTCTTAGATTTCATTTTAGTCTTTCA
GCATTCTTTTTAAGGAGATCAAATTAACATGAATTCGAATCACCATTATG
GAGTAAAATTAATTGGCGTTGCTAGATTTGCGGTCTACTAAGCTGAAAGC
TTTTCGCCACCGTTTGCCAAACACGTGTTTTCTTTCAGTAAAAATTTGAT
TTATTATTTTGAAATTACGCACCACGAAATTATTTTCTGCCAATGACGTT
ATTGGGGTGAAAACGTTTTAATTGAAAATTCTTACGTGGGATATTATTTC
GAAATTTAGCTTTCATCGCAAAAAATATGGAAAGGGACGTTTTTAAAGCA
TACAATCTTCACATTTACTTTTAATTTAAATCCATGCCTTTGGTTTATAA
GTAAGAAAATAAACCAGTCAAGGGCTTAGCGAATGTTCTCTTTTCGATTT
CTGTCAGCCTACATGTAGGAGAGGGTTTTACAGCCAACTTTCTACCCACT
TTTAATTCACAATGAGAATAGACAGGGCCAGAGCTTTAGATGGCGGCCCT
TTTGCTTGGTTAATGAGAATTAATCAGCCAACTTTTTTGAGTTTCTCGCT
TAAAAGGTTCCATCAACAACCTTGCTCATGACAACCTGGATACTCTACGC
TTATGCTACGGACGCTAATATTGACAAAAACAAAGTTATAAATCAAAAAC
TTAATTGCGGAGAGTTCTTGGTTTAAAGTCGAAGCCACAAGTTTGTACCT
CAAAGAGACATGATTTAATTGCGTTAAATTGCTTCTAATTAAGCTGCGGC
TTTTGATAATTCATTTTTCGTATTGCGATTTTTCATTAAAAGGTCATTTA
CTTTATGGGTCGCTTTTCTCTCATGTTCTGTCACTTCAAAAGATCTTCTG
TAGCCGACCTCTGACTTGATTTATTGCCCAAAAGAAAACACAATCGACCC
AGTTGACACACACAACGTTTTGCTAATGTTCATCTAACGTTCGTGCAATG
TAAGCTGGAAGAATTCTTATGACTGTTTAGGTCATATTTATTTTGACTTT
TAAGCCTAAAAAAGCTCTTAAAATTTTCTTAATTCCACAATTTTGTGGGA
GTTTTTATGCAATTACCTTGAGAAATTGGGTTTTTTAGAGCCCATAGAAC
CTTGAAATGTTCTTAACTTATCGAAGTTTCATATTCTTATCAAAAATGTT
TAGTAGCCAAGCCTAACTTTCTAGTTCTTGAAAAAGAAAGAGTGGAATTT
AGGTAAAAAATGACGGCACAAACACACACTTTTGAGGAAGTTACCCTGAC
TTCTGGCAGCTCCTGGATCGGGTAATAAATTACTTTGTAGGAAGGCTCCT
ACCTTTTAAATGCATATGTCATTTTCGGGTTTGATTTATAAATATCCTGT
CTGTTTTTAGTTAATGACAAAGGCTCAATTATTAACAGGGTCCCTTCATC
ACCGCTCATTAAGTTGTTGCCATATTGAAATAACTCGACATTGATTGATA
TGGAAATATTTCCCGAATTTTTGAATATTTGATTTATAATGACTTCAATC
GCTTTCCAATTAAGAATATCAGAGTATCTGGTTAACGCTTCTCTGCGACT
GATACATTTGTAAACCTAAACGACATCTTTTTTTAATAATATTTAGGCTG
TTGTTTTTCTGCAAAGACCTCTGTCAGCTAATTCTTGAAAAGGCCTGAAA
ATACGATTCTAATATACAATATAATTGATCGGGCTTAGATCCAACATGAG
AATTCCATTTTTGTTATCCTTAAAAAGGTTGTTTTTCTGCAGAGAGCTGG
ATCAGGCTTTTAATGAAAGATACTCAACCAATATATATCATCCATTTAAG
ACATTTAAGATAACATTTCAAAACAAACTTGAATAGTTGAATTTGAAATC
TGAAAATAGCATATGAAGTGCGTATACATTAATTAAACCTATTTTGAACT
TATGAGCATTTTTACAGAATCTTTTTTTCAAAGCAGACGTTTTGTTTGTA
TTAGGGAGATTTAAAGCTCAATTTCCCGTCTATTGTAGGCTTAAAAACTT
ATTTAAGCCTCTACTCTGCCTTTTACAAATTACTTTAAAGGCACTTTACT
GTCTGTTATTAACTAACTATTTTTTTGAAGATATTCTGGATGATAATCCT
ATTTTAACCCGATTGTGTATCTCCGTTCCCTTCTCAATAGTCAAACAGTT
AACTCTCGCTAATTCGAAATCGAACGGGTTTCCAAATCTGTTCGAATAAC
AGAGGTATTCGAATTATAGAGGGTATTTTACAAGGGTTTCTCATTTGACA
GGAACTAAGAATTAGTTCGAATTATTGAGAGATTTGACAAATAGAATTTC
GAATTAGCGAGAGCATGTCTCGTGTGTCGTCTTTGTAATTTCAAGCTGAT
GTAGGTTTCTCGTTGAGAATTATAAAAGATTGAGAATTTTAAAAGATTTC
TATCATCATGCTATAAAAACTTTTAGATTAATTATACACTATTCGTTAAC
CTAACCTCCTCCCTGAACTTTCTTGACTCTGATATGACCCAATATAATAA
TTCAACGTAGAATTCAAATTTTCGTTTTCAATATTAATTTCTGTTTCATT
TTTTCTAGTTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTG
TCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAG
ATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTA
TAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACATTCAATTTCTTATCCAATACAT
TTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCT
GTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATG
GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT
CTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGC
ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA
CCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGGTAAGCCGACTC
CTTATTTCCCTAATTTTATGGCTGACTACATTCAACTTGGAGATATAAAA
GGCAAGCAGGGGGATTAATCCCTTAATAGCCCTGTTTTTCTTTAATCACC
CTAGTAAAAAAGTTTTTTGACCGGAAAAATATCGTTCAAAAACAACATTG
AAACTAAGAAAAAGACATTATGAAAAAAAGAAAACTTTAGCTTTTAAGGC
TGTTTAAGGCCTTAATAATAAATCGAGGGATAATATTTTTTCGGGTGATT
TTGAGATAAATAGTCCCTCATTTCATTGGATTTATTTTTTGGTTGTAGAT
TTTATCAAAATTCTTCTTTCATTTTCTCTAGATAACGATAGTGGTAATTT
CAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACCAAAAGATTTTCG
TTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGGTGTTTTTATTATTTTCATTGCT
GTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGCAGCCAAGAAGCG
AGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGAATTGGAAAATCG
ATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAATCGTAAAATTGCG
AAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCGTAGTCTCAAAGA
ATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACTTTGTACGAACCT
CCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACGATTTTGCATAC
GAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGCTATCAACTCGTTTTACGAC
GTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGCTACCATAGCAA
CACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCGATGTAAACAGA
TATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACGCTGACGAGTAG
CGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCGTTTTTACGTCC
GAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGTCGCCAGGCACT
CGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAACGAAAAACGAAAA
TGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGATTATTATCGTC
ATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACGGGAAAGATTTC
ACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACGTCGTCGAATTC
CGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGACCCAAGAGAAT
TGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGCTGAAACGAAAC
TCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAAAAGTTTAAAATCGAAAAAA
ATAAAAATGAGTTTGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGGCGAGAAGAAGCC
ACTATTGAAAAATTGAAAAATTGAAATAAAGACGCTTGCCTAATTACAAT
AGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAGACTGAAAACTCC
TTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCAAGTGAGTTACAT
CACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCAGTCAAAAGATTT
ATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTTGTGAGCGTACAT
AACCTTTTAGTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044:453823..466884-

>TCONS_00004412 ID=TCONS_00004412|Name=TCONS_00004412|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=4950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:453823..466884- (Clytia hemisphaerica)
ATAACGATAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACT
GATGACCAAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGGTGT
TTTTATTATTTTCATTGCTGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGA
AAATGGCAGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAA
CGATTGAATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGG
GATAAATCGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTT
TAACTCGTAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAA
GGCGACTTTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCG
GAATCACGATTTTGCATACGAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGC
TATCAACTCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGT
AATATTGCTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTC
GCCTTTCGATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAAT
TTTCAACGCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACA
ATCGATCGTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCA
ATGGTTGTCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACA
CAGAAACGAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGT
TTTTCTGATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCC
AATGAACGGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCC
GGAAGACGTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAAT
TATTCGGACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGA
TGAATTGCTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAA
AAGTTTAATTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTG
TCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAG
ATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTA
TAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACATTCAATTTCTTATCCAATACAT
TTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCT
GTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATG
GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT
CTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGC
ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA
CCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATGTGTTGCAGT
AATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGGTTGTTTTTCATTGTTTTCTT
CGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTATCAAAG
ATAACGATAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACT
GATGACCAAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGGTGT
TTTTATTATTTTCATTGCTGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGA
AAATGGCAGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAA
CGATTGAATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGG
GATAAATCGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTT
TAACTCGTAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAA
GGCGACTTTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCG
GAATCACGATTTTGCATACGAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGC
TATCAACTCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGT
AATATTGCTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTC
GCCTTTCGATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAAT
TTTCAACGCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACA
ATCGATCGTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCA
ATGGTTGTCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACA
CAGAAACGAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGT
TTTTCTGATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCC
AATGAACGGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCC
GGAAGACGTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAAT
TATTCGGACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGA
TGAATTGCTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAA
AAGTTTAATTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTG
TCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAG
ATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTA
TAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACATTCAATTTCTTATCCAATACAT
TTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCT
GTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATG
GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT
CTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGC
ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA
CCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATGTGTTGCAGT
AATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGGTTGTTTTTCATTGTTTTCTT
CGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTATCAAAG
ATAACGATAGTGGTAATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACT
GATGACCAAAAGATTTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGGTGT
TTTTATTATTTTCATTGCTGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGA
AAATGGCAGCCAAGAAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAA
CGATTGAATTGGAAAATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGG
GATAAATCGTAAAATTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTT
TAACTCGTAGTCTCAAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAA
GGCGACTTTGTACGAACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCG
GAATCACGATTTTGCATACGAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGC
TATCAACTCGTTTTACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGT
AATATTGCTACCATAGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTC
GCCTTTCGATGTAAACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAAT
TTTCAACGCTGACGAGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACA
ATCGATCGTTTTTACGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCA
ATGGTTGTCGCCAGGCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACA
CAGAAACGAAAAACGAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGT
TTTTCTGATTATTATCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCC
AATGAACGGGAAAGATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCC
GGAAGACGTCGTCGAATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAAT
TATTCGGACCCAAGAGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGA
TGAATTGCTGAAACGAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAA
AAGTTTAATTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTG
TCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAG
ATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTA
TAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACATTCAATTTCTTATCCAATACAT
TTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCT
GTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATG
GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT
CTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGC
ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA
CCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATGTGTTGCAGT
AATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGGTTGTTTTTCATTGTTTTCTT
CGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTATCAAAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002468	XLOC_002468	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00004412-protein	TCONS_00004412-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000044	supercontig	sc0000044:453823..466884 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.29929	1.2209	8.90665e-06	0.361548	2.01135	1.58537	1.35463	1.95965	2.1763	2.16358	1.07772e-05	0.987749	3.06796	4.36445e-06	9.11438	10.3624	1.55754	1.38855	3.41609e-05	1.52027e-05	0	0.195899	1.50818e-05	2.50432e-06	7.34811e-06	0.323909	2.00873	1.56258	1.62499e-05	1.0655

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00004412 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00004412 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00004412 (transcript) - C. hemisphaerica