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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00004411 ID=TCONS_00004411|Name=TCONS_00004411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2267bp CATCTGATCAATGTACGAAAAcgaccccttctcacagacccgGGACCAAT CAACTTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAATTACAAATAAACTAGAAag AATGGAACCTCGTGGATAGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTtacaaaga aaatattgatattgACTGTCAATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAAT AATGGAACGAAACAGCAAACAAACAAATTAAAGTAAAGTGGTTGTTACAT ATTTATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGCTGACTCGACAAAATGTGT TGCAGTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGgttgtttttcattgt tttcttcGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTA TCAAAGTTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTGTC CAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAGAT GGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTATA GTGGAAGAATAGTATATAAAGtgacattcaatttcttatccAATACATTT AGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCTGT TGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATGGT ATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATTCT AACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGCAT TATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACACC AAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATAACGATAGTGGT AATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACCAAAAGAT TTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACaggtgtttttattattttca ttgctGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGCAGCCAAG AAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGAATTGGAA AATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAATCGTAAAA TTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCGTAGTCTC AAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACTTTGTACG AACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACGATTTTG CatacgaaaatatttttgatcccgATGAGATATCGCTATCAACTCGTTTT ACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGCTACCAT AGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCGATGTAA ACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACGCTGACG AGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCGTTTTTA CGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGTCGCCAG GCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAACGAAAAAC GAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGATTATTA TCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACGGGAAAG ATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACGTCGTCG AATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGACCCAAG AGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGCTGAAAC GAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCaacaaaagtttaaaatcga aaaaaataaaaatgagtttGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGGCGAGAAG AAGCcactattgaaaaattgaaaaattgaaataaagacGCTTGCCTAATT ACAATAGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAGACTGAAA ACTCCTTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCAAGTGAGT TACATCACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCAGTCAAAA GATTTATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTTGTGAGCG TACATAACCTTTTAGTT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000044:453823..466884- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004411 ID=TCONS_00004411|Name=TCONS_00004411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13062bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:453823..466884- (Clytia hemisphaerica) CATCTGATCAATGTACGAAAACGACCCCTTCTCACAGACCCGGTAGGATA
TTTTCATCCAGTGGGGTTAAAAATAACGGACTGAAACTCTGGAAAGGGGT
GTATGAAAGGGAGCGCACCGATTAATACTTCCAAACCGACACCTACACAC
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GCGCTGTTACTGTATTTTCAGTTAAGATCCTATTATCAAATCCAAACCTC
GAAATCAATAGCTTCTATCTGCACGTTCTTTGGATGTATAAATATCTGCA
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GCATACTTCGGGAAGACTTATATTGCATAAGAAAGCTATCATTCTTCATT
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TATGAGCATTTTTACAGAATCTTTTTTTCAAAGCAGACGTTTTGTTTGTA
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GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT
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ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA
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CTTATTTCCCTAATTTTATGGCTGACTACATTCAACTTGGAGATATAAAA
GGCAAGCAGGGGGATTAATCCCTTAATAGCCCTGTTTTTCTTTAATCACC
CTAGTAAAAAAGTTTTTTGACCGGAAAAATATCGTTCAAAAACAACATTG
AAACTAAGAAAAAGACATTATGAAAAAAAGAAAACTTTAGCTTTTAAGGC
TGTTTAAGGCCTTAATAATAAATCGAGGGATAATATTTTTTCGGGTGATT
TTGAGATAAATAGTCCCTCATTTCATTGGATTTATTTTTTGGTTGTAGAT
TTTATCAAAATTCTTCTTTCATTTTCTCTAGATAACGATAGTGGTAATTT
CAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACCAAAAGATTTTCG
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GTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGCAGCCAAGAAGCG
AGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGAATTGGAAAATCG
ATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAATCGTAAAATTGCG
AAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCGTAGTCTCAAAGA
ATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACTTTGTACGAACCT
CCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACGATTTTGCATAC
GAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGCTATCAACTCGTTTTACGAC
GTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGCTACCATAGCAA
CACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCGATGTAAACAGA
TATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACGCTGACGAGTAG
CGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCGTTTTTACGTCC
GAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGTCGCCAGGCACT
CGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAACGAAAAACGAAAA
TGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGATTATTATCGTC
ATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACGGGAAAGATTTC
ACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACGTCGTCGAATTC
CGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGACCCAAGAGAAT
TGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGCTGAAACGAAAC
TCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAAAAGTTTAAAATCGAAAAAA
ATAAAAATGAGTTTGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGGCGAGAAGAAGCC
ACTATTGAAAAATTGAAAAATTGAAATAAAGACGCTTGCCTAATTACAAT
AGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAGACTGAAAACTCC
TTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCAAGTGAGTTACAT
CACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCAGTCAAAAGATTT
ATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTTGTGAGCGTACAT
AACCTTTTAGTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466843..466884 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466843..466884 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466439..466496 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466439..466496 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:465769..465901 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:465769..465901 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:462733..462905 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:462733..462905 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:455547..456026 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:455547..456026 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:453823..455203 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:453823..455203 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466843..466884 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466843..466884 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466439..466496 | TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466439..466496 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000044 | supercontig | sc0000044:453823..466884 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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