TCONS_00004411 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00004411
Unique NameTCONS_00004411
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2267

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00004411 ID=TCONS_00004411|Name=TCONS_00004411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2267bp
CATCTGATCAATGTACGAAAAcgaccccttctcacagacccgGGACCAAT
CAACTTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAATTACAAATAAACTAGAAag
AATGGAACCTCGTGGATAGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTtacaaaga
aaatattgatattgACTGTCAATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAAT
AATGGAACGAAACAGCAAACAAACAAATTAAAGTAAAGTGGTTGTTACAT
ATTTATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGCTGACTCGACAAAATGTGT
TGCAGTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGgttgtttttcattgt
tttcttcGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTA
TCAAAGTTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTGTC
CAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAGAT
GGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTATA
GTGGAAGAATAGTATATAAAGtgacattcaatttcttatccAATACATTT
AGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCTGT
TGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATGGT
ATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATTCT
AACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGCAT
TATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACACC
AAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGATAACGATAGTGGT
AATTTCAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACCAAAAGAT
TTTCGTTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACaggtgtttttattattttca
ttgctGTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGCAGCCAAG
AAGCGAGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGAATTGGAA
AATCGATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAATCGTAAAA
TTGCGAAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCGTAGTCTC
AAAGAATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACTTTGTACG
AACCTCCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACGATTTTG
CatacgaaaatatttttgatcccgATGAGATATCGCTATCAACTCGTTTT
ACGACGTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGCTACCAT
AGCAACACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCGATGTAA
ACAGATATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACGCTGACG
AGTAGCGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCGTTTTTA
CGTCCGAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGTCGCCAG
GCACTCGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAACGAAAAAC
GAAAATGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGATTATTA
TCGTCATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACGGGAAAG
ATTTCACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACGTCGTCG
AATTCCGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGACCCAAG
AGAATTGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGCTGAAAC
GAAACTCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCaacaaaagtttaaaatcga
aaaaaataaaaatgagtttGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGGCGAGAAG
AAGCcactattgaaaaattgaaaaattgaaataaagacGCTTGCCTAATT
ACAATAGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAGACTGAAA
ACTCCTTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCAAGTGAGT
TACATCACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCAGTCAAAA
GATTTATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTTGTGAGCG
TACATAACCTTTTAGTT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000044:453823..466884-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00004411 ID=TCONS_00004411|Name=TCONS_00004411|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13062bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044:453823..466884- (Clytia hemisphaerica)
CATCTGATCAATGTACGAAAACGACCCCTTCTCACAGACCCGGTAGGATA TTTTCATCCAGTGGGGTTAAAAATAACGGACTGAAACTCTGGAAAGGGGT GTATGAAAGGGAGCGCACCGATTAATACTTCCAAACCGACACCTACACAC AGTTGGTTAATATCCTAGGAATTGCTTTAAAATTTCGCATCTTTCTATGT TATGATGTAATCAATATGCGGAATTACATTTATTCTTCCGGGGGAGTCGC CTTTAATTTCGCGAAAAAGCCACATCATCATTAGCTGAAATTTATGCTGA TCTGTTTTAAATATTTTTCAATATACGATTTGATGTTGATTGATAATAAA TACTTTCACTTTCCTTTACTTTTAATTTCTCTTGTTAGGGACCAATCAAC TTGAGTTGATGACAATAAAAGCAACAATTACAAATAAACTAGAAAGGTAT TTTTCTGAAATCCCATATTGAAAATTAATTCTTCCATCTTTAAGATTTTT GTTAATGTTTCTTCACATGCTAAGTAATTAATTCAGTTCTATCCAGTTTA TAGTCATTTTTTCTTATATACAGCAGATAGTACAGATTCCTTTGGCGAAA CTATTTTATGCAGCAACGACTTTTAGTATATAGATTTCATATGCCATAGA CGGAAATTTCTCGTGCAATATGGAAATATTTTACTCGTCCTATATTCTTT ATCCGTATATTAAACGGAAAAATTTCGGAAGTCATAAAATATTTCTCATA TTGCAATCGAAGTTGTCTGATATGTTGTTCTAGACAAATTTCTCCTCAAG ACTCTCGGATGACTTTGAATTGACGTCAATAATTTTTTGACGACATTGAA GATTACCTGTTTAGTCCATTGACGATTGCGTTGAGTATGAAACTAACTTA ACTCGTTTTCTTAACTCAAAACTAATATTTCATCGTGAAACGTCTCTCTA CAATAATAATTTTGGGTGTGTTCATTTCTACAGAATGGAACCTCGTGGAT AGTACTACGCAATAAACCGAGAGGTTACAAAGAAAATATTGATATTGACT GTCAATATAATAATGAAAAATGATATCAAAAATAATGGAACGAAACAGCA AACAAACAAATTAAAGGTATTTCCGTTCATTTGAATCATTTTTCTTCCTG TATTAAACCATTATGAGGTGTAATGACTTTCTCACATATTAGCCCCGCTA TGGGCTAAAGGTATTTCCGGTACCCTTAATTACATAAGCATAATCTTTCC TCGCTCACAGACTTGTATATCCCTGTTATCGGCCTTTATCATCACGTCAC GCAATCACGCCTCAAATGTTTGCCAAAGTCAGTCGTTCATGGTGTTTCAA TAAAAATGGCTCGCTAAAAAAAATGATTGCTTTGGGAAATAGATATTATT ATCTAGAGATATCGAAATCGAGATTGTCCTTGGGTTATGGCGCTCTAAAT TAGCGATGTCGAGAGGCTATTTTATGTCAAACATGGCCCCAATAAAATTG ACATAGGCTCACGTTTGAAAGATCTTCAAATTTAGAACGACATAGTGTCA AGAGTTAATTTGATCCAGTCCCGGAATGATAATTTTTTTTCTGGAAGAGC CTTATCTAGCTACTAACTTACGTATTGCCTATTTCCACCTATTCAACTAT TACACTGAAACTCGGGAATCATTGAGACAATCCCGATCAGGTCATCGGGC TAACCGCTGAGAGTAACTATATTTTATAAATTGAAAAAGGCTAAAACAAA ACCAAATTTCTAGTTTAAGTAACTGTTGTAAGGTTGGACAGATATTTTGA TAAAATCGCGAGGACAGGCTGTCATCAGCATCAATTTGGCAAATTTTCAA ACATCAAAAATATGCAAGTTATTTTAAAGCAATCCATCATCATTCCAAGA AAATGATTAACCATACTTCTTCAATTAAGTGATTGAATCAAAATAGTTTA GAGAACATTAAAAAACACACCACATTTTTACTATACTAATGCAGTTGCAA TTTGTCATGTATTTATTTCGGTGTTGACGAGATGAGCTGTGGTGTGGGAG TGATTGTGAAAGTTTTATGTAAGATCTGTGGTAACAAACTTAAGCTGAAA GTTCACCTTTCTAAAGTGACATTCTGACTATTATGCGTTGTGAACGAGAT GAAATGATCACAGGTGTCAGGTGTTGTGCAATGTTTACCTCATAACCTTC TATGATAGTATACCGTCGTTATTTCCGGTAAGATCCCACTTCCCGGACTG AACTTCCTCTGTCACTTTCCAGTGGAAAAAAAAAACCAAAACTCTGGCTA GTTGAAAAATGAACTTGGGAAAGTTAGCCAGTCTTCTAATTCAACACAAG GTTTATCATGTACATTTTAAAAACCCTTTAAAAAGTTTTTCAGCCGATTA TCCTGGGGAAAACAGTAGAAATATTTTGGGAAAGTTGTGGAACTTTTTGT CCGGGAGGTAGGTTCTTTGTCCTGAAAGTGGAATCTTAACCGGAACGACG GTACAAACTTTATCGATCAATATTTGTATCTAACGTTGTCTTTTAAATGG GAAAAAAGGACAAAAAGACGCAAAAATCAATAAAAAAAGTTTCGGGTAAA TGAAATTTACGATTTGAACATCTTTTTGTTAAATGCAACACACGAAGAAC ACATTTAGCCCTCTCATTTAAAAAAAGAAATTGGGGTCTTTTCTTATTTC TGATAAAACATCAAGGTGTCTCGCGATATTTTGAAACGATGACTGAATTA TATGAAATCCTTTACATTGCGCTTATAGAGTTTCGTTTTCGCTAAAACAA AACTGACATATTCTTGAATGTTTCAACATTTGTAAATTAAAAACATAAGA ATGAGCCACTTGATCTTTTGTGATTGTTCCTATAATAAAATACTAATGGA TACTTCAAATATCAAATTTTCTAAAGAAATGTGATTTGGGTATTGCTTTG TTTTTGCCAGGTAGTCGATGTGTTAGGGGATTCCGTTTCTTGGTTACTAT AAATGTGTCTTTGTGGCGAATCTTGACTTTTTCTTGTCTTGTCTTTGAGT TCTTATAAAATAGTGTTCTTATAAAAAATCATTCCACTAAAAATCGAAAA CTAACATGTCATCTTATTTTCAAAAGACAAATGACGTAAAAAACAACACA TGAATTCGTTTTTGTAAGGGTGAGTCTAAACTTTTTCTTCTCTTTCAGTT CCTATAGAGTAGTATTCTTATTAAAAACACATTTAAGACATTCTTTTTAT ACCGAGAGGAGGTGCGCCACTTATGCTGACAAAGCAGAATAAAGAAAAGA ATTTTTCAAAGTTTGTGCTCGCGCGGAGAAAGGGTTCCAAATTTCATCAC CCAACCGTCACCGGTTGCCGGGGAACGGGCCGTGCAAGGTACGGCGCGGG ACATTCCCGCACGGACAATTGCCGGTCCGTACGGTGTTTTCGGCGCGAGA GGGATATAAAGTTGGCCTTTCTTTAGTTTAGAAACATGCTTAGTAAGTAA ATGTTTGGAGATACGTTAAATGTTGTCCTTGAACAAAAAAATTGAAAAAT AATATGTCATTTCATTTTCAAAAGACGGATCACGTAAAAAAAACAACACA AAAACAAAAATTGTTGAACACAAAGAGTAGCTAGGCAGTAAGGTAGTAAA GCGACTTTGTCTGTTGTCTATCTATCATTGTTCGAAACTACCTCAATGAT TTCCTGTGACTAATTACCTTACTAATTGCCTCTTTAACGATTCCCGCTTT CTACTCGACTATCCACTTCTTTTTATTATTATTTTTCACTTAATACACAT AAGAACAATAACAACAACTATAAAATAGACTACATCTCCATCATATACAA TTTAACTATTTGCTATTTGAAAGATTTACCACTGGCTATCACCAATACTT GATCTTTCCAATTTCGATGCACCTTCAATAAATTTGTTACTTTTATTTTT ATGGATATTTAGTGACTTTCACTTTAAAGTAAAGTGGTTGTTACATATTT ATTAAATGGACTGTTAAAGACAATTTGCTGACTCGACAAAATGTGTTGCA GTAATGGAATAACTACAGCGAAGAATTGTTGGTTGTTTTTCATTGTTTTC TTCGTGGCGTTTTGTCTTGGAAATCATGGAAGATGCAACGCCCTTATCAA AGGTATGAAATGGTTTTATTTTAGAAGCTGCTAGAATTGTTTATGTGGAG GCGCTGTTACTGTATTTTCAGTTAAGATCCTATTATCAAATCCAAACCTC GAAATCAATAGCTTCTATCTGCACGTTCTTTGGATGTATAAATATCTGCA TCGTTGAGGGGGCCATTGTATTATTTTTCGTCCCGTATATGATTACCGAA GAAAGAGTCAATGAAATGAATTCATTTTTCACAACCTTACTAAACTTTAT AGGTCACGATTTTGAAGCAGTCCCTTACTCGTAATAAGTTAACTTAAACT TAATAGGTTATAATGTGACAATTCTTAGACTTTTCATGGAGCCTGGTAGC GAGAGGTGGAGACTTTCCGTGTTGTTTACTGATTTTATTTCATTTTATTG GATTGATGAAAAAAAGCTGAAAATTTCAATTCCACTGTGTAAAACAATAA GGAACTTATTTGCTGTACGCAGGTTTTATTGATTCCCACTGGTATCTCAG CCAGTGGTTAATTAATGACCGCTAATAAATCAACACCGTCACTTTGGAAT CTTATTAGGTCGATGTCTTGTTTACAAGATAAGTCTTGTATTCATTAAGA TGACAAGTCTCCTTAAATATTCTTTATTTGAAAGTATTACTGGGTTAACG ATAGTTTACAAATTTAATTTCAAATGTTAATACTTTTAGATACACATGGG TAGTGTATTTTAGAAGCCTTTTTTTGCAAGGTTATTAGGAATGAAAATCT TAAAATAAAACCTAATTAAAATTGATTCTGAAGTTTTGGATATACTTTTA GCTTTCTTCTCAATCTAATAAAATCTTACTANAAATTGATTCTGAAGTTT TGGATATACTTTTAGCTTTCCTCTCAATCTAATAAAATCTTACTAAAAAA AGTTTGTATCAAAAGTATTAATTTAAATGAGTTTATAATTTGATGAGTTT TTACAATCTTTTAAAATCCTTTAAAAAGTAACCGTTGGCAATGATTTGTA GGTCTACTATAAAATATGTTTTTTTCTATAATGAGTATATAATCTTTATA AGGAAGTTGGGAACGGTAATTCGGTTACATGCAGACTCCATTGAAAAGCA ATTTTCAATAATGTTCTTTAGTGATTGAACGTGCGCTGATTTTCTTTAGA AAAACCGGGAAATGTATTACTTAATTCGGATTAAATTAGATTAATTCTAC AATCAAGTTCCGTCATTTTTTAAAGTGACCTTATTATTGTTTTTCATTTT GTTCTAAATTCAGCGAAATTCGCATTAATTTGATAAAGCCAAATGAACGA AAATTTACTTGAAATACCATAAGAATGTTCACAACGTTCATATAACGTTA GATGAATGTTGAAGCAACACTGTGTACCCGGTGGGTTGCCTTGCAAATTT TATTTCCGTCAGCGGACGTAGACCTGAATTACTGGCCGAAGACTAGCGGG CACCTCACTATAAACTGGGGTTTTTTTATCTTGTTTCTCAATGAGTTCCA TACTTTATGACGACTTTTGGAGTGACGTCAAAAAATCGAATGCTTGGAGC CCTAAAACCTGGGCTCAAAACATTCGAAAAAGTAACAAAGTGGAATTTTT GATGTCGAAAATTCTCCTTTTTTCGAATAATAAAACAAAAGTAATGGAAA GTAGTCGTCAATATTACATGAAAAAGTTACAAATGTTAATCAATATAATT TTCAAATTTATGTATAAGGGATGTTTTATGCTACCCACGCGCTAAATGGA CATAGCACGTATTTTTCGTTCTGTTTGTCAATTACATTTGATATTATATA ATTATTATTGGGGAGAATGGAGTATAAAGTTTCCTTCCTCTGAAGTAAAA GTTTTCAACATTATTGTAACATTGTCAGGAAATTTGAAAAGCCCTTTTTT TGGGTCGATTATGTCTTATTAAAACTTTGTTTTATGGGTTTTAAACTATG TCTTCTAGTGCAAATAGCATTGATTTTAAATTGACGAAGGACCAAAATCG ACTATTTTTGTATGATTTTCTAAAGCATATAATTCAAATTATCTATATGT TCTTTTTTCCATGAAACAACCACGTGGTCATATACCTTGGTCGTCTTTTT GCGGAAAGCACTTAAGAGTTTTCAATTTGTAAAAAATCATTTGGTAGGCC TACGGTATATCCGTATAAATCTTAACTTGCTTGACCGAAAACTCTAGCCT CGTTTTTGCTTGTTAGTAACCCTTAATTAGCTAGGAGCCAGCGAATTTCA AAAGTATTGCTTTTTTAACATACTGGTATTAAATATTGCAATTGGCATTT TTTCGCTAATTGCCATCATTTTCCGACAATTAGACTTATTAATTCAGAAC TTCATTTCGCTTGCAGTTAACGAATGAAAAACTTTCTTCGTTTTAAATTG ATTAGAGGTTAGATGTCATTTTGGCCACCCCATACCCTCCCAGTAATCTT CAAAAAAGGCGTTTTATTTTCGCTGCAATAATGCTTGTCTCAAGAGAATA CAGTAACTTAGTAATGATAAAATAGCTTCATTAATGACGTGTATATGTAC GACTCCAAGCTCAATTTCTCTTTTCTGAAAATGAAAATATCTCAAGATTT CATAATTTTTCTTATGCTAGGCCTTCTAGAAGTTCAATTCATTCCAGAAA AAAAAATTGGAGGTTTTCATCTGTGTTTTTCAGGACTTTATCACTACTTT TTACTTTAAGAAGTCCAGCCAGCGCCTTATATAACAAGAACGCTTTAAAA AAGGCTTGAAAAATGATCTGGCAAAGTTAAATACAAAGTGCTCAAGACGA TGTTTGCTTATGAAGTAATACGCAATCTAGCACGTTCAAATACTATTTCC TTCAATTAGTGGGCGCTCTTAAAACCGCAGTATGTACAGTTCAAAAAGGG CTGGCCGTCTAAGTCTTTGATTGTCATTCTCTTTGACCTCATTTTTACTT TTTCTTTGGAAGCAGAGCAGTGACTTTGCATTGATAACGGAACTTCAGAA ATTTGGCAAAAGAACTAACGAGACCGTCATACAAAAAAAGTGTTAAAAAG ATGACGGTTATGCGAAAACCGTATGCCGGATCTTTAAATGACTTATTAAT GACGGCAACAAGTGAAAAAGACGATAACGACGACGTCATTTTTCATTCGT CATTAAGTGTGCACTGATATATTGTGTCGGTATTTATATAATGTTTTTTT GTTATTGTTTTTCTTAAAATTCTTTCTTTTTATAAGAAATAGAAGAATAT GTTCTTCGCCTACTCAGGGACTCTATCTATCTACGTAATACATTTTCCAT TCGTCTCATTAAGCTAAGGATTTTTGACCTTGCATATGAAATATGTAAGG TCGACTATTTAGTTGAAAAAGGGACAATCTCAAAGTTTAAGGTTAGCAAA TATGTTAGTTTTTCAGACATTATTTTTGACATTTGGCCTTTTGATGTTAG TAGGTTGATATTTTATTGTTTTCATTTCCCGACATGCATACCTCGGGAAG ACTTATATTGCATAATAAAGCTATCATTCTTCATTCCNATTTCCCGACAT GCATACTTCGGGAAGACTTATATTGCATAAGAAAGCTATCATTCTTCATT CTATTATTTTGAGAAATCTTAGAAAATAATTTTTATATAGACTTAAGGAA GGATCGTGTAGGAATGATATATTTTCCAATGTGCATCCTGGATTCCATTG AATACAAGTTTCTATTTTTGATATCGGATCGTTAACTTGTGTCCACCTAA ACCTGATAATTACTGACACTCAAACAATAGCTAGGGCTGAATAAGAAAAA AATTAATCTCCGTCCAGATTCTGATTACTCTGCGTTGGCACGTATGCATC CTAAAGGCAATGGCTCCGTAAGAGCCATTTAAAATTTTTTAAAGTTTCTG CCCCCAAAGTAAGAACGTTTTTTTATCCGATAATTTTGTAAGAATCCATT GAATGACTGGATTTTAAAAACAAACATAAAAATCGTCAATTTATTTTTTG ATGTCATGCACAATATCCGCAATTATTTAAGATATGCACCATTTTTGTCT CACAAGGGCCAAAAGTGACCAAAATTTGAACTTGTCATACATCTGAGATG AGAAACGGATGTAAAATCGTACTTTTCTTAGATTTCATTTTAGTCTTTCA GCATTCTTTTTAAGGAGATCAAATTAACATGAATTCGAATCACCATTATG GAGTAAAATTAATTGGCGTTGCTAGATTTGCGGTCTACTAAGCTGAAAGC TTTTCGCCACCGTTTGCCAAACACGTGTTTTCTTTCAGTAAAAATTTGAT TTATTATTTTGAAATTACGCACCACGAAATTATTTTCTGCCAATGACGTT ATTGGGGTGAAAACGTTTTAATTGAAAATTCTTACGTGGGATATTATTTC GAAATTTAGCTTTCATCGCAAAAAATATGGAAAGGGACGTTTTTAAAGCA TACAATCTTCACATTTACTTTTAATTTAAATCCATGCCTTTGGTTTATAA GTAAGAAAATAAACCAGTCAAGGGCTTAGCGAATGTTCTCTTTTCGATTT CTGTCAGCCTACATGTAGGAGAGGGTTTTACAGCCAACTTTCTACCCACT TTTAATTCACAATGAGAATAGACAGGGCCAGAGCTTTAGATGGCGGCCCT TTTGCTTGGTTAATGAGAATTAATCAGCCAACTTTTTTGAGTTTCTCGCT TAAAAGGTTCCATCAACAACCTTGCTCATGACAACCTGGATACTCTACGC TTATGCTACGGACGCTAATATTGACAAAAACAAAGTTATAAATCAAAAAC TTAATTGCGGAGAGTTCTTGGTTTAAAGTCGAAGCCACAAGTTTGTACCT CAAAGAGACATGATTTAATTGCGTTAAATTGCTTCTAATTAAGCTGCGGC TTTTGATAATTCATTTTTCGTATTGCGATTTTTCATTAAAAGGTCATTTA CTTTATGGGTCGCTTTTCTCTCATGTTCTGTCACTTCAAAAGATCTTCTG TAGCCGACCTCTGACTTGATTTATTGCCCAAAAGAAAACACAATCGACCC AGTTGACACACACAACGTTTTGCTAATGTTCATCTAACGTTCGTGCAATG TAAGCTGGAAGAATTCTTATGACTGTTTAGGTCATATTTATTTTGACTTT TAAGCCTAAAAAAGCTCTTAAAATTTTCTTAATTCCACAATTTTGTGGGA GTTTTTATGCAATTACCTTGAGAAATTGGGTTTTTTAGAGCCCATAGAAC CTTGAAATGTTCTTAACTTATCGAAGTTTCATATTCTTATCAAAAATGTT TAGTAGCCAAGCCTAACTTTCTAGTTCTTGAAAAAGAAAGAGTGGAATTT AGGTAAAAAATGACGGCACAAACACACACTTTTGAGGAAGTTACCCTGAC TTCTGGCAGCTCCTGGATCGGGTAATAAATTACTTTGTAGGAAGGCTCCT ACCTTTTAAATGCATATGTCATTTTCGGGTTTGATTTATAAATATCCTGT CTGTTTTTAGTTAATGACAAAGGCTCAATTATTAACAGGGTCCCTTCATC ACCGCTCATTAAGTTGTTGCCATATTGAAATAACTCGACATTGATTGATA TGGAAATATTTCCCGAATTTTTGAATATTTGATTTATAATGACTTCAATC GCTTTCCAATTAAGAATATCAGAGTATCTGGTTAACGCTTCTCTGCGACT GATACATTTGTAAACCTAAACGACATCTTTTTTTAATAATATTTAGGCTG TTGTTTTTCTGCAAAGACCTCTGTCAGCTAATTCTTGAAAAGGCCTGAAA ATACGATTCTAATATACAATATAATTGATCGGGCTTAGATCCAACATGAG AATTCCATTTTTGTTATCCTTAAAAAGGTTGTTTTTCTGCAGAGAGCTGG ATCAGGCTTTTAATGAAAGATACTCAACCAATATATATCATCCATTTAAG ACATTTAAGATAACATTTCAAAACAAACTTGAATAGTTGAATTTGAAATC TGAAAATAGCATATGAAGTGCGTATACATTAATTAAACCTATTTTGAACT TATGAGCATTTTTACAGAATCTTTTTTTCAAAGCAGACGTTTTGTTTGTA TTAGGGAGATTTAAAGCTCAATTTCCCGTCTATTGTAGGCTTAAAAACTT ATTTAAGCCTCTACTCTGCCTTTTACAAATTACTTTAAAGGCACTTTACT GTCTGTTATTAACTAACTATTTTTTTGAAGATATTCTGGATGATAATCCT ATTTTAACCCGATTGTGTATCTCCGTTCCCTTCTCAATAGTCAAACAGTT AACTCTCGCTAATTCGAAATCGAACGGGTTTCCAAATCTGTTCGAATAAC AGAGGTATTCGAATTATAGAGGGTATTTTACAAGGGTTTCTCATTTGACA GGAACTAAGAATTAGTTCGAATTATTGAGAGATTTGACAAATAGAATTTC GAATTAGCGAGAGCATGTCTCGTGTGTCGTCTTTGTAATTTCAAGCTGAT GTAGGTTTCTCGTTGAGAATTATAAAAGATTGAGAATTTTAAAAGATTTC TATCATCATGCTATAAAAACTTTTAGATTAATTATACACTATTCGTTAAC CTAACCTCCTCCCTGAACTTTCTTGACTCTGATATGACCCAATATAATAA TTCAACGTAGAATTCAAATTTTCGTTTTCAATATTAATTTCTGTTTCATT TTTTCTAGTTGATGTCTCCTTGAAACTTTACCAATGCGATTCCAAGTGTG TCCAAGAAGATGGTCAACCATGTCCATCAAGCATCAAAATTGCAGACCAG ATGGAAAACTTAACCGAACCGGGTGTTCAATTCATTGTTTTTGATTACTA TAGTGGAAGAATAGTATATAAAGTGACATTCAATTTCTTATCCAATACAT TTAGGCGTGATCGTTTAAAACAGTTCTTTAACGCCTTACCAATGAATGCT GTTGTTTTAATAACCGTCAATAAGAAATGCGAAGCAAAGATCGACCAATG GTATGATTTCTTATTACAACATTCGAATCTGGTTTTATTGAATATCGATT CTAACGAACCAGAAGTGTTGATCACGTGTCAGGGACAATGTAAACGGGGC ATTATTTCGACATCGCATGCACCGATTTATCGTTATAAAAGTGACGCACA CCAAGGCGCGATACAAGAAGACTATCAACTAGTTTTAGGTAAGCCGACTC CTTATTTCCCTAATTTTATGGCTGACTACATTCAACTTGGAGATATAAAA GGCAAGCAGGGGGATTAATCCCTTAATAGCCCTGTTTTTCTTTAATCACC CTAGTAAAAAAGTTTTTTGACCGGAAAAATATCGTTCAAAAACAACATTG AAACTAAGAAAAAGACATTATGAAAAAAAGAAAACTTTAGCTTTTAAGGC TGTTTAAGGCCTTAATAATAAATCGAGGGATAATATTTTTTCGGGTGATT TTGAGATAAATAGTCCCTCATTTCATTGGATTTATTTTTTGGTTGTAGAT TTTATCAAAATTCTTCTTTCATTTTCTCTAGATAACGATAGTGGTAATTT CAAGACACACAAACAAGAAGGGGGTACGACTGATGACCAAAAGATTTTCG TTATTGTTCTCGTAGTTTCAATCACAGGTGTTTTTATTATTTTCATTGCT GTCATCTCATTGGTCTATTGTTGTAAAAGGAAAATGGCAGCCAAGAAGCG AGAAGAAGATGAAAGATTATCAAACCGAAAACGATTGAATTGGAAAATCG ATAATTGGTTTCGACAACGCGAGATTGAAGGGATAAATCGTAAAATTGCG AAAGTGAACTCGTTAAGTGGAGATACAACTTTAACTCGTAGTCTCAAAGA ATCGGTGCGGGATCGGAATCCATATCACCAAGGCGACTTTGTACGAACCT CCATTTCAACACCATCCGTCGTTGATTTTCGGAATCACGATTTTGCATAC GAAAATATTTTTGATCCCGATGAGATATCGCTATCAACTCGTTTTACGAC GTTATCACGAGTTTATCCAGATAATATAAGTAATATTGCTACCATAGCAA CACCATATGATGCACAGGACCGATGGTTGTCGCCTTTCGATGTAAACAGA TATTCGGCGAGACGAGAATCGTCGGATCAATTTTCAACGCTGACGAGTAG CGACTTTTCGAGCGTCTCGCAACACAATACAATCGATCGTTTTTACGTCC GAGAGCACCAAACCTTACCACGTGGGCTTCAATGGTTGTCGCCAGGCACT CGCCGACAAATATTTTTCTCGGCAGCCGACACAGAAACGAAAAACGAAAA TGGAAGATTGTCGGTAAACGAGGATAATCGTTTTTCTGATTATTATCGTC ATGATGTCGATGGTCATTTACATAAAACGCCAATGAACGGGAAAGATTTC ACGCCGCCGGCTTACGTAGCTCGAAATTCCCGGAAGACGTCGTCGAATTC CGACGACGGTGAATTGTCGGACTCTGGTAATTATTCGGACCCAAGAGAAT TGGATTCTAGCACGCTTTCGTTGTTCAAAGATGAATTGCTGAAACGAAAC TCGAACGCCTCTTTTTATGAGATCGCAACAAAAGTTTAAAATCGAAAAAA ATAAAAATGAGTTTGGGCATTGGAGAAATGCTGGAAGGCGAGAAGAAGCC ACTATTGAAAAATTGAAAAATTGAAATAAAGACGCTTGCCTAATTACAAT AGAGCAAATAACCCTCAACTTGATCAAACTTGATGAAGACTGAAAACTCC TTTACAAAGGATCGGGACGGAGGCACATTCATTCACCAAGTGAGTTACAT CACCCAGTGGAAATCGAACCCCAACCTCCTTGACGGCAGTCAAAAGATTT ATAAAGACTACACTACTGTGTTCAAAATTCATGCTCTTGTGAGCGTACAT AACCTTTTAGTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_002468XLOC_002468Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466843..466884TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466843..466884Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466439..466496TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:466439..466496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:465769..465901TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:465769..465901Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:462733..462905TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:462733..462905Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:455547..456026TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:455547..456026Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:453823..455203TCONS_00004411-exon-sc0000044-1575043694:453823..455203Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466843..466884TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466843..466884Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466439..466496TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:466439..466496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:465769..465901TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:465769..465901Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:462733..462905TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:462733..462905Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:455547..456026TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:455547..456026Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:453823..455203TCONS_00004411-exon-sc0000044-1510915933:453823..455203Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:466843..466884TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:466843..466884Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:466439..466496TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:466439..466496Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:465769..465901TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:465769..465901Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:462733..462905TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:462733..462905Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:455547..456026TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:455547..456026Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:453823..455203TCONS_00004411-exon-sc0000044-1491911889:453823..455203Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000044supercontigsc0000044:453823..466884 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.000588836 0 0.710397 0 1.4913e-08 0 4.54739e-05 1.21723 0.000305374 1.18331 0.180083 2.75319e-09 7.32565e-05 2.1979 0.00719918 0 0 0 0.861258 0.939618 0 0 0.887257 0.405257 0.340535 0 0.00473131 0 0.859013 3.74241e-06
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00004411 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top