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transcript sequence >TCONS_00003019 ID=TCONS_00003019|Name=TCONS_00003019|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=925bp GTCGGATTTTTCATCGTGAAACGTTCAGAAATGATACTTTGAATTTTATC AATGACTTAATCAATCAAAAAGATTTCAGTTGTAACCATGCCATAGTTGT TACATATGAGAATATGCCTGAGTTTGGTGTTTACACATCAAGGAATAGCT TCCAAATCGTGCTAGCGTCAGATGGGAAAGTTACCTACGGTCTAGCTCTC TATTACCGCGTAGACTCTTATGATCGCGCTATGGTTGGCTATGGAGAAGC AACATGTAACACAGGCATTAAGGTTGCACCTCCATCTCAACAACAATTGG ACGAGTTTGGACATCGAGTGAACACAAAGATATTCTTATTGACAAATTCA GTATGTAAAGCCAAAATTGACAGCTATTTATATTCATATGGCGAATCAGT TGGTGATCAACTTCTGCCGTATGATAGCTTGAACCCAGTTCGTGAATTAG TTGTGGAAGATCCTTTCCAATATTTTGATAAGGATGTGCACAAAATATAT ATCAGCAAGTATGGTTTTATATCATTACACGAACCCGCTCAACATTCACT CGTGTGGTTCCCGTATAAATACACTTCAATTATATACGGATATCTTACGC TTCTACCCGGTAATGTTTACTACCGGCAAACAAATGATACAGCGGAAATC AATGTGTTGTTGGAGAATCTGATTGAAATGAACTTGCGAACAACTTTTGA CAGTGTTATTATTATAACATATCGTCGTTTGGACTATATATTTGGAATAT CAGGATTCAGCGTTCCAGGTTGTTACCAAGGTCAGATTGTGGACCCGAGA GCTTCTCATTActtgacagttacatcaaatggtgaaagacattatttcgG ATGGTCAAACTGTAATACTAAACATACAGcATTTTTACCAAACGGAGCTG TTTGTGGGGACTTGTTTAATTCAAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000024:822941..831497- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003019 ID=TCONS_00003019|Name=TCONS_00003019|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8557bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000024:822941..831497- (Clytia hemisphaerica) GTCGGATTTTTCATCGTGAAACGTTCAGAAATGATACTTTGAATTTTATC
AATGACTTAATCAATCAAAAAGGTTAGTTTCGTGAGTTTCCTAATAATTT
GTGTAAAGTCTCTTTCAATATAATCTGCAGCGGGACAATAAAATCTGTAA
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TTAGGCAATACATACCCTGAGTATCAGAGGTTAAGTTTTCAAAGAATATA
TTAACCTCTGAAGACCAATAATATAAATTTCATCGCGCATGTGTCAATCT
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TTGTATCAGTATACATGTTTACAATTGACGAATTCCCCAGAAACTTCCAA
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CTACGGTCTAGCTCTCTATTACCGCGTAGACTCTTATGATCGCGCTATGG
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GTGGTTGTTACTCCCATCCCGGTAGAAGCTTTACATTTCTTAACGTCAGT
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AGACTTTATGGCCGTGTTCAGACCTAGGTTTAAAGTAATTATGTCCGCAT
GCCTCTTTTATATTCCTTTTGTNTATCGTAACATAGGCCGTGTTCAGACC
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TTAACTGCACGCTCCTCATTAGTTAAACCAAAGTTTAAAAAGGAATCACC
CTCTGGTTTAAAAAAAAAGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAATAT
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TTATTTTGAATCATCCGAATGCATCATTCTCGCCTAGCCGCAGCTTAATT
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TAGAGGGTCCACAAAGTTCGAGTTAAGGAAATATTCAAGTTATAGAGGTC
ATGATATGAGCCCTTCCCATAGAGGAATAGGTCCTACTCCTTGCGAAGTA
GGAATTCCTCCTTTTTCAAGGCGGAGTGCATAGCGCTGTTCAGACACCAA
TGGTGTAGTTCGTCGCAAGCGCAGGTCGGAAGGTCTGAGTCAAAGAAACT
CCACTCCAATAAACTTAACGCTTATAAAAAGCAAACTTTTAATTTATTTT
CCAGGCTATTTATATTCATATGGCGAATCAGTTGGTGATCAACTTCTGCC
GTATGATAGCTTGAACCCAGTTCGTGAATTAGTTGTGGAAGATCCTTTCC
AATATTTTGATAAGGATGTGCACAAAATATATGCAAGTATTTTCATCATT
TTAATACACCTTTTCGACCGTAGCCACCAATTGCCACGCGGGCGTTTTTT
GTCCACTTTACCACCCTAAGAACCGTCCCAGTCTTTTTTTCGCACCTAAA
GACAATAGAAAAAAGTGTAAGAAAAGGATTGGATCGGGTTTATAAGGTGG
TAAATTAAATAGTAAAGTAGCACGCGCTTGACCGTGCGACTACGGTCGAA
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CATTTGCTTAAACAGCATTTATACTTTTTCCCCTTTCAGTGGCGCGCAAG
CATAAATTTTGTGAAATTCTTTTGTTGGTTCTGCTTTGTAAACATATCAT
TGAATGATCCGGAGCTTCTTCTACCAGAGCAACGAGTTTCTATCAGAGGC
TTCCATTTCCCGTTCGGTTCATAGATAACTGTGGGTCCCGTTAACAATCC
AAGAAACCCTAAAGTATCTAAATACACCCCTGTCTCACAGACCCGCTGGG
ACCCTAGTCGCACTAGAAAATTTGGCAAAATTTTTGTCCCCGGTGAGAAA
ATACCCTGGAATTTCAACTGAGAAATTGACTTTGATTTCATCTCCAATCG
AAATTTAATGTTAAAAAATTGCACTCCAAAACCACGCCACTGGATTTTTG
AACCTTGGGACAATAAAATTGCTTTCCCATTGGGATTTCAATAGGAACTT
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TGTTTAAATTACTGATCTATCCATATAAAAAATATTACTCCCTCTTGTCC
GTGTCTGTGTATTTGCATTGGTATTTATATCAATTATGCCTTCTGAAAAA
ACAACGTTATAAATGGAAATTTCATTGTAATGCAAGGTCAAAACTCAATC
ATGCAGGTCACCTTCTTTAAAAAATTACAGAAAAATGCTTACGCAGCTAA
AAAACATATCTCATCATCCTTGAAGTTCAATATCTCGACAAGCAGACAAT
TGGCACATAGCAAGCAATACCATTTTCTGATAGAATTCTTTCAGAGCTAT
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CTTAAAAAGGGCCATATCGTTGGTCCAGATGGTCCAACCAAACAAACAAC
CCCGCATTATTTCATCGGCTCAACAAACTGAATCTTGTAAAGAGACCCTT
AACGACGTAATTTTGCCCATTGTGACCCATCATTCCATATGATTGGAGTT
TGCTAACACCAAAAATTCAATTCTCACATAACATTCGGAAACATTTTGCG
TACAATTTTTCCGGTAAGCTAATTTTGACCCTCGATATATAAAACGTTCT
TGATTGGTTTGGCTGTAAGGAAGGTTTTGTCGGGGGACGGCAGCGTAGAA
AAGTGGCTTCATAAAATCTGTCGCTTAGAAAGGTCCATTTCATTAAGTTT
AAAGCCCGAAGGGCTGGAGTAGAAACTCTAATCTTTCCCATGCAAGAAAA
CATGAAGCCACTTATTTCCCATCCAGATCGCGCCTAGAATGCGCCGCAAT
CACGACGACGAATTGTATCTAGGAGTTCCTTTGTTTTTGAGGATTGTTTT
AATCTAATGATAGATTTTACTTTCAATCCGGCGTTTGTGTAAAAACCACG
CAGAGGCGTTCTGGATGAGAAATAAGTGGCTGGTGTCGAGTCTAGCCCTT
CGAACTTGGAAGTCAATGGTCCATTCCTGACAATTTATTTAACTGTTTAA
ATAATTATAGATCAGCAAGTATGGTTTTATATCATTACACGAACCCGCTC
AACATTCACTCGTGTGGTTCCCGTATAAATACACTTCAATTATATACGGA
TATCTTACGCTTCTACCCGGTAATGTTTACTACCGGCAAACAAATGATAC
AGCGGAAATCAATGTGTTGTTGGAGAATCTGATTGAAATGAACTTGCGAA
CAACTTTTGACAGTGTTATTATTATAACGTAAGTGTTTGTCAAACAGATT
ACGATTTAACTTAAGAGAAGAAATTTTGGTACTACAGTTTTTTATCATGG
CATATTTCTATCGAAACAAAAGTCTCAATTTTCAACTATCCGGAAAAGTG
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TTTCTTTCCATTTTACAGATTGATATTTAAATTCTTCTAGATATCATACA
GAATCTCGAAATGATCCTGAAGATTCTCACTTGCGTACCAACAACTTTCA
AATTATTTTGGCAAATCGTCCAGGAAGTCCTGTCTATATTCGATTCATGT
ATGAACATTTTCATGACTTTTTTTCATTTTTCAAATTTTCCAATTAACCC
GGTCAAAAAAAGAATATTAACAAAAGAAAATCTGTCCTCCATTAATTTTA
AGTTTCTTTTGTAACCGCTGCTGGCGTCGGTATTTCGTTCTTTGCTACCC
CGCATGTCCCCATTAAATTTCGCAATCGCCTATACAAGATTAGCCTATAC
TAGACGTCACCGCTTTTCCGTACGCAGTAAGATATTTTCTACTTTTACGA
CTTTTTCGAATGTTTCGGGCCAAGTTTTTTGGGTTCTAAACATTCGATAT
TTTGACGTCATTTTAAAGTTTTGAAGCTATTTTAACGTCTTCTAACATTA
CATCACGGAGACAACAGCTGATTGGTTGCAAGTGACGTATTAACTGACTT
TACGTCACTTTACAACAAAACTTGCTGTTGGGTCTATGGTGTGATGTCAA
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CAGATTTCATTGCTATGAAATTATAAAGTACTTGAAATTCAAAATGTCTG
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ATGAAATCTGTTTGAAAACGAGGACAACAATAAATTTATGCATCTCGAGA
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GTCTTGATAATGTTATAATTTTGCACTCCTATTCTTTATGTGAGATTGGC
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TTGAAACTCTCCCGCCGATTATTTTCCCGTCTACCACCATAGCGGCTGTG
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AAAAATAACAGACCAAAAGTAGATGGGGATTGATATTCCCATGTTTTTTA
TGACTGTGGATTTGGATTCAATTGTTTTAGAGCCAGAAAATTCAGTGGGG
ATGACAAAATAGCACAATATTTTGCAGTGAGGATTTACTTTTTGATTATT
TTCAGTGGGGAAGAATTTAGAGAATAATTTTCCACTGGGGACGATATCTT
GGCTAATCTTTCCTGTGGGAAAGGGTGGTATATAAAAGCAAACTATTTAA
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CGAAAAAAGATTCTTAGAAACGTGTGCACACCCTGTGGAAAAAAACAAAA
TTCGCAAAAGAACCCTTGGAAGAATTGTTTTCATAACTTAAAGTAAGGGT
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AAAATTAAAAAAGGGGTGAACGAACTAAAACCAGTTTTTTTCCCCCCCCC
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ATTCAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:831426..831497 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:831426..831497 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:827516..827643 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:827516..827643 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:825520..825737 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:825520..825737 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:824455..824615 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:824455..824615 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:822941..822986 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1575043694:822941..822986 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:831426..831497 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:831426..831497 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:829910..830109 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:829910..830109 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:829323..829422 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1510915933:829323..829422 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:825520..825737 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:825520..825737 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:824455..824615 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:824455..824615 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:822941..822986 | TCONS_00003019-exon-sc0000024-1491911889:822941..822986 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000024 | supercontig | sc0000024:822941..831497 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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