TCONS_00002849 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00002849
Unique Name	TCONS_00002849
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2190

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000023:138251..147744-

transcript sequence

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gatgaaaaataaatcttATGCTCGCCACAATGACGTGTCAAAAGTTGTTA
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TCTCTTTTCATTATTCGTTATTATatgtaaaaaaacaaca

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000023:138251..147744-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00002849 ID=TCONS_00002849|Name=TCONS_00002849|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023:138251..147744- (Clytia hemisphaerica)
ATAAAAACAATGTAGATACTTTGAGCATTGGGTTTGCAAAAGTAAGTTTG
TATGTAAGGTAAGGTAAGGTAAGGCGATCTTCGAATTAAGAAAAGCGAAA
CTTTACATTGGAATACTTTAATGGGATAAATTCTCGCGGATAACTATATT
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TCATTTTTTTTCCACCACACAGTTCTGTTCTGTCTATGCCAAGCACGTGA
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TCCATTTTGAGCAGTACAACTCGACCATTGTTAAGATCACAATCAAACTA
AGCTATGATGGTGTGGATAATAAATTGTATCGCATTCATCAACATCCTTC
CAACTACCAACAAAAATGTAAACATCTTGGCGAAAGAATTTTCGATATGG
ACTCCATAAAAGGGCATCTGGGTAAAGAAGAAACATTGTATGTTGATGCA
AACAAAATATCTCTACATGGTAAAAACTCAATCCAGGGACGATCGATTAG
CGTTGCCTTATCATCGAACACAAGCAAGATTTTAGCCTGTGGTACTTTAG
TTTCCAAAGGTATTGAGAACAGCTATGCAGTGGCATCGATTTCTAACTCG
AAGATTGCTGGTAAATTTGAATTTGTCCAACAAGGTTTGAATGGAGATAC
CATGATCACCGGAGAAATTTCACATTCAGACAGGTCCACTGTGGCAACTG
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CGGAACAGTAATAAGTAATACTTAATAAAAGAGTAATAAGTCGCAAAAAA
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TTAGCTGAACTACTAATAGTAGGGTACAAACCCTAAAGACACGTGACATC
TTTTGTGCAACGCAACCAAACCTGGTTCATCTCAAAGAATTTTACGAGTT
TTTGGCGAGGGAAGGGGTTTCTGCTAAGGCCTTTAAAAAACTGACGTTAC
AGCCAAAACCCCCCATTGACCCCAAACCTTGACGAAATTTCAAAGTCAAT
AAAACCCAAAACCACTTATTATAAGTTAAATACTTGATTCTTTGAAATGA
ACCAGGTTTTGTTGCGTCGATGTCACGGGTCCTTAGGATTTGTACCCAAA
TATAAGCCTTCCAGACAAGTGTTTTTATAATGACTATGCTATAATAAACT
TTTCTTTCTGATGTTTTTGATGTCGCTAAGTCCATTGAAGTAGACTAGAG
GATCTTTTTAGATCATTTGAGAACATTTTCATTGTCATTTTCAAAAAATT
ATATTAATTAAATGATTTCGATTTGTTTATCTTTAAACACAAACTGGATC
TGTAATGGAGTGAGTCGGTATAACACCGAGCCATTTATCAGCGCCATCCA
GTCTATCAAAAACCCCGGGCTAAGGGTGACAATACTAATTTTTGAAAATA
ATATCTTTCTCCTATTTAAAAGGTATATTTTGGGTTCAACAGAACCAGAA
GAATGGGTTGCAAATTGTCAAACTCATATGAACTGGACACAAGTCTTCGA
CTCTGATCGAATGAGCCAATCAGGATGCAATTCGACGGACGCGAAAACGT
GCGCAATTGGAGATTTAACCGGAAAACATGGTACCTTGGATGTGGGTGTA
GCTGGCGATAAAAAATTGACCGTTATTGATTCGAATCTTCCACTTTTCGG
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GTTCGAATGATAAAGTTCTTGGTTGTGGCATCATTAAACCAAAAGGTAAG
TGAGACTTTCCCCAATCACCCTATCAGGGGGGGGTCAGGGTCAGATTTTC
GCCGGAAATTTTGGCGTCGAAATAGTTCCTCTGTCGGCGGAAATACCGAG
TTTATGTTTCGGAGGATATCGAGGGCGACGGTAAGTGAAATCGATACAAA
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CAGACGACGGCATTTCTGTGTTTTACCGTCGTCGAGCAAAGTGGACGGTG
ATTTTGGAGACATGTCAACTTTGCTTTATACCGTCCCCCTCGATTTATCT
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TCATCGGGTCTGCAGAAAAGTGGCCTACAAATTTAAGCGGAAATGATTAC
ATTAAAGGTTTTATTTTTAGTGTTCCCGTTCATGACCGCGCCTGTCTATT
GTCATTTTGTGCTGAATAAACAAAAAATTGTTTTTCTTTTCCTATTTCTG
ACCAATCTTGCTCCACATTCGTGTCAATTCAATATCAAAACGCTTGTAAG
TTAGAATTGATGAGTAAGCTAATGATATCACTTTGAAGATACAACCTTTA
ATGTTGATTAGCAGACAGACAAGACAAAATCACTTTGATGGTGTGATATA
CTCTGCATGACTCACGGAATCTTTGTTAATATCATGCAGGGGGGTTTACT
GAAACGTCATGGTTAAACCATGGTTGAACTTGTTAATCTTCAGAAATTAA
TAACTTAGTCTGGAAATAATCATGATTTTGAACTCTTGTTTTTATAGGTC
CATTCAAAGCTGTATCAACGTTCGTAGCTGATAAAAATAGTGGAGTTTCA
GGGACAGTCGAGTTCGAACAAATTTCACCATATCATCGAACTTACTTTGT
CGTTAATTTAAAAGGTATACCCATCTGTTTAATCATTGATAATTATCTGG
TTACACCTTTTACGATCGCCAGTAATTTTTTTATTGGGGCTCAGCAGTTC
TCATTTTTTGGCTAAATTTATTCTCATCTTATTCGTATTTCTACAATCAG
TGCCATAACATTTTGGCACGTTTGGCTAATTTACCATTTTTCGAAAATTG
AATTTCGAGCGAGAATGTCAATTTCAGGCCTTCAACTTAATTTCATCGAT
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TACTGGACCATTTTTAAACTTTTGGATCCTCAGATCCTAAGGTACTAAGT
TTTAAGTCTAGCGGTAAAACTTCAATAATCTGCTTACATAAAAACAAAAA
GGAAGAACCATCCCCCTGGTTTTGATTTTGGAAAACATTTTTAGCCGTTA
TAGGAAAATTCTTTAATTTCGTAACTTAATATAACTTAAATTTATGATTT
CATGATATTGATATTCGGTTTTGACCAGGACTTGACGAGAGAGCCAAAGG
ATATCATGTCCATAAATTTCCAATCTCCGATTCATCCAATCCCTGCTCTG
GTGCCAGTGTTGGTGGACATCTCAATCCATGGGGAATCAATCCTAGCAAC
TCACCAAAACCTGGCACAGGTAAAATAGAAACTAAGAAAAAATACAAAAT
CTTCTTCTCTGTTAAATCTTGTCCCCTTCTTCTTCTGCTTCTTTTTACAG
CGTCGGTGACTCGGTGACACGACACAAGCAAATGTTATTGCTTTGCTCTC
GGGCGGTCTCTAATAGTAAAATCCCATAGTATTAAAAGAAGACAGATGTT
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AAGCATAATTTGTACCCTATCATGACAGGTCCTATGGATAAATACGAAGC
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AGCTCAAAATATATGACGAGAATTTGCCGATGTTTGGCCACCATGCATTG
GTTGGACGTTCTATTGTTATCCACAATAATGATGCTTCAAATTCACGAAT
GACATGCGCAAACATTATCCCTCATCAAGGTGTCAAAATTGAATCATGGA
CCAATTTCACGAAACAAAGTGATCTGTTTGACGGTTATGTTCAATTGGTA
ACTTTCAATTATTTTATTTTAGCTCTGCTGCCTCTAGTCTGGTTCGTATA
AAAATCTTACTAGACCTGTTAACAAACTATTTCAAAACGTATGTTTTAAA
GAAACTTTGAAATAAAGTCAAGATCGCTGCAGAGGAGGAGGGGAGTACAT
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TAATTCAAGGTGGCTAAATAATCTCTCGGCTTTTCTTTAGGTACAATACG
TCTTACCAAATGGAATTGTCACTCCCACTATGTATATTATCGACGTTGTA
TATCAAGATAACCCGACCTCTCGAAAGGTGAGGAAAACTGACATTTTTTT
TAATACGAAAACTAATAAATATATAAGTACATATAAGGCTTCGATGGCCG
AAATGTTAAGAACAAGTTAAAAACATTTTCACTCTATAACGCTAAATTTT
TTTTCCGAAATCACACAAAAATACTCACAAAATGGTGAAAACAAAAACAT
TATAAGAACATTTTTAGGGTTAAAATTTTAAAAATGTAGAAGAACCGAAG
GATGGATGCTCCTATAAAAAAAACATAGTTCTATGCATTAGAACAGTTGA
CTTGATCGTTAATTCCAACCCTCAACTTCCTCCTCGAATCAAAACTACCG
CCATTGACCAAGAACATAGGTTAGCGTTTCGAATGAGTTTTTATTAATGT
TATATAACTTAAACCATTCCATCATTATTATCTTATGTTAGACTTTGAAA
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TGGTACTTGCATGAGTGTTGGTGGTCATTACAATCCAAACTCCGTCGATG
TTGGGGTAAGAATCTATAATCTATCTTAGGATCTATAATCTTGTATGTCT
GGAAGTTGAAATTTTCACAAAATTAAGTCTCTCGTTTTTGAGTGGAGTTT
TTCTTGGTTACGACCCGTATGTGTTGAACATTATACAACTAGTAAGGCCA
GTATATGGTTGTTGTGAAGGTTTCTGTTCATCCTTTAACTAAACATTTTC
TTACAGAAATCAAGACATATCGCCTTGATTTCTATCAAGAAATGTTTAGT
TAAAGGTTAACAAACAAATCAGACAACACACTACTAACAAAAAAAATAGT
CTCCCCCCCCCCCCCCAGAGGTACATGGCTATATAAAAGAAAAGCATGTC
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AGGACTTAGCGTAGCGACCGTAAGTGGTAGAGCATCCGGCTACGTTTTGC
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GGTACTTGATGCCTCTCTGCTTGATGCTCAGCAATTAAGAGAAGGATCAA
GGGTAAGTGGAGCAATCCAGGGAGAAAGAGTGGCACCCTCCCCACCTTTG
GTTAGATAGTTATCGAAAAAGGAGCCTTCTGGTCGCCTCCGACTGCGGTC
GTAGACTTACTTACTACTAAGGACTTTGAAAGTGCTACTTGATGCCTAGC
TCCTAATGAGAAATACTATTTGTTTCTTTGACGAACTCACAATTTTCCCC
GTTCGTTTTAGAACGATGTTTACAAGGAGCAATGCGATCAAGACCATCCC
TACAGATGTGAAGTTGGAGATACCAGTGCTAAAGTTGGCACGTATGATGT
CGGTTATGGAAAGCGGTTCTACTGTGATGAGGACTCCCCTCTTTATGGAC
CCCACACTGGTTAGTTTTTTAAAACCACTATTTACTGCTTAAATGGATAC
TGAATAGAGATTTTTAAGTTATTTAATTTCCGCTATCATGGAAGCAAACG
CTGAAATCTGTAGTGACGATGCAGTTTTTTTTCCGTCAGCGGACGCAGAC
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AACCGAAAACTTGATGCAGCGGTCGAATACCTTTTTTAACGGCCGAAGAC
CTGGAGAAAATGAATTGTGGAAATTTGTTATAAATCACATTGGCACATTG
CTATACATTGTATATTGGCTCACTGCTTTTGTAGTTTGAGCACTCTTGGA
TTGGGTGGAGAGTCTTCATTTAAGACGCTCACTATTTGCATTATGCATTG
CTCGCTGCTCGCAGTTTGAGCACTCTTGTGACTCCACAATGCAATCCACA
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CATTATGGTAATAACCGGGAGGGCACATTATTGTAAATCTTTTTTATAAA
TTCAATCAAGAATTTTTTATATTTCAATGGGAAATAGTATTGAAAACAAA
TTAAGTTAAAAGATTCCAAACTGAAAAGAATGAATAATAATGCGAATAGT
TCGTCTCAAACTACCCATCTTTCGTTTTCGATACCACTGCACTAACCACT
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ATTCAGGTCTTCGGCCGTTAATTCAGGTCTTCGGGCGCTAAATCAGCTCT
TCGTCCGCTGACGGAAAAAAAGTTTGCAGTGGCGATCCCTTACGCAAATT
CGCACGTTTGCTTCGGAAATTACGTAACTTAACAAAACATACAAAACTTC
TATAGATGACATCCCATTAACGCATGTTTTGTTTAACGACCGATGACACA
ACATGTACCATAAAGGGATTCGAATGTGGCTACGACTAATGGTTATGTTA
ATAGTTATGAAAACCCTTATCTTTACATGGGTTCACAAAAAAAGTTTTAT
ATCATAGCTTTTTCTACAGAGCAGATGTTTTGATGCATATAGACATTCGT
AGTAATAGTTCATCATCAAATAACTGAGATACTTTTTTTTCTGGGTAAAT
AGAAAGGGTCCATTTTACATATATTTTCTAATCTAGTCAACGTTTCCTTT
ACTTTACCTAGTTTTGGGCCGTTCCATTGTTTTCCACGCCAAAGAAATGG
GTGCGCCACGGCTCGCTTGCGCCGACGTCGTTCCTGTTGAAGGGTCCATG
GTCAAGAAACACACTGTTGAAGGTTCAAAGAAAATAGTTGATTCTAATAG
GTAAATGCACTCTTGTATTTTTCAACAATTTCGAAAACCAGTTCTTGTTC
GAAACTTTGTGCTACTCAAACCCGAACTCACGATTTGGCAATGGATTTAG
AAGTTTTGCTTCAGACGGATCTTTGTAAAAATTCACGTTGATGTGTTCGA
GTTAAGAAGACTCGACTGGATTGAATATAATTGACAAACCTTTACAAACC
CGGGGCTAAGCTTTAAGATTTTTTTTGAAAGTGGCACCCGCAAAGTAGCG
CCACAGTGTTAAAAGGTAACGTCAAACGTTGCTACATCATCACAAGTATT
AAAGGAAAAGTAGAGCCTCCCCCTAGCGCCCTCGATGCATTTACAACGAT
GCTGAGTAATGTTACCATTAGAAAGAAAACTCCAATCAAAGATTATGGTT
GGCTGGCATTGAGAAACTCCAGTCTCTTGATGTTTTAAATGATGTCCCGT
GACATTCGCCTGCGAATTTTCAAGGTTTTTTTCTAAATAAATCATTGGTC
TTGGTTTCATTTCAGCAGTAACTAATTTTCATTATTTCCTTTCCCCTTAT
CCCAGAGGTGCATCAATGGTAGACATTTTGTTAGAAAAATTCGGTTTACC
TCAAAGTGAAGATTGGAGATTCGGTTACCCACGATTGGAAGATGGTTCAA
ATAATAAAGAATGCTACTCCTTCTCATTCTACATGCTTGATAGTAAGTTT
TGATTCTCTTTTCATTATTCGTTATTATATGTAAAAAAACAACA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_001554	XLOC_001554	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000023	supercontig	sc0000023:138251..147744 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
15.0376	9.69836	26.381	24.7846	0.461058	0.000892186	0.010232	5.00089	12.4958	10.1691	0.00228458	10.3688	32.5421	23.8976	25.4979	25.3551	28.7393	34.9895	111.44	134.381	27.5316	23.1754	25.8524	12.6292	16.8284	11.9829	7.75585	4.75232	49.747	37.3078

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00002849 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00002849 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00002849 (transcript) - C. hemisphaerica