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transcript sequence >TCONS_00002742 ID=TCONS_00002742|Name=TCONS_00002742|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2035bp CTTTTCCCTTTTAGACCAAAAAGTCAATTggtaaaaaaaaactagaaaaa aaaacaagaacaacACTTTGCTGTCATTGACCATAAGCAAAACACTTTGC AGTTAAGTTTCAATGTATAAATAATGGTCTCTGAGAGATTGGTGTTTGGA GATAGAAGACTTGTAGTCCACTCAGAAAATGATTGCAGAAAAATATGTGA ACGAAATTCTGAAAGGCACATTTGGTATGGTTGAAACAGATGAGTGTTGT ATTATGCAATGGAAAAGAGGAGAACAAGAGGCGCTCATATGATAACAGAC TGGATGAATTGCTCGAAGTATTTTGCGGACGAGAGAATCAGTATAAATAT TGCTGGCTTTGGAGTACTTAGATGCAAACACAGTGCAGTGTCCAAAGAga ttcattgaaaaaaattttagaatattttattgAGTGGAACAAGCACTAAC CAACTAATCGAGATGGCATCAACGTTACTCATGAGCTGTATCTGTATGCT GGCCATCAATGTATTGTTAATAGAATCGCGACcacctttgaaaattttat cagaCTTTAATACTGATCCAGAACATCCAATCACTAGCCCACGGCAAGTA GATGAAACTAGTATAGGGGCTAGTGATGAATTTGTGAAAGAAGCAACACG AGATGAACTAGAGAAGTTGGAACCTGAAATGATACTTATTCACAAGAATG CAGGCGTTTCAGACTTTTATATGACGAAGTTTGCTAAAGTGAAAACTACC AGACTGGCAAAGAAAGTGAGCAGACATTGGAAAGGTAAATACTTCTTGGT CATTATCAGTGCATTCATCTCCAGTAAAGATCCAAAGCGATCATTACATC ATAACGATCACTCATTACATCTCGAGGGACGAGCTTTAGATATAACAATA GGAACCAAAGCCGATGGTAAAACTGTAACCATTATGGATGATAGAAAAGC TGGTAGAATTACCAGAGCAGAAGAGGTTGAATTACTTAAAATACTTGGCA CTTTAGCTAGAACTGGCTCTAAATCCTTTGAATTTGCTCAATTGTTTGAT AACCATGTACATATCTCTACAATGAGACGTGAAAAACTTCTAAGGCATTA AAACCGTTTTAGATTCGACTCACAGTTTTTATTATAAATTATTTAAAGAA ATAagagaaattttaataaatgatGTTTAGTTTTGTATGTTATTTGTATG CTGAATCAGCAACAATTTTAGATATttattgttatttatttttttgtgac gTCATGCTGCATATTATTGTAGttcaatttttgtaaaaaaaaattatttt tttacacctATTAGCAACGCCTATAGTTGCTAGAAACCAGTTCAATTACT ATATGCACCTTTGGACTTAATTAACTCAATCTATAAAGCTCTAAAGTATA AACTGACCTTTCGGCCTTTGACCTGCTTTTGTATTTTTACATTTACAAAG CCAGCTATGCATTATTGGCATTTCACATATATATAGTTCTTACATTCTAT TCAAACAcgttattgtttttatgataTAGAAGAAAGGCGCACcgtttatg ctgacaaagcagagcTTACTTAAAAGATACAGCATATAGAAATATCTGTC TATTTTGTATGTACTTATGTAGAATATCAACTATGAattgtgaattattt ttgattgtataaaacgtaaaattttgctaaCATGTTACAATTGTAATTTA GTAAATAATGTATATTATTAAAACAAGAGTCCCGAAAAAAAGAGCATTAT TTTCTGGACACGCTGTATTTAAATTTACTACCGAACggttttttgatatt tattttttgtgtgtaaataaaCAACAGTAGTGGATGTATATAAGGTTTTC TAACGAAGATGGGGAGCTATTACTTTCTATATATGgttaaaagatcaaaa caacACTCTCCAACACAATGTTGAAACTTATCTACACCCACTACTGATAG ATTTTGATTATTGTTCCAGGAAAGATctggataaaagaaaaacacgttga tataaacgtttttttataagagcaaactatagaac Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000021:955178..968684- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002742 ID=TCONS_00002742|Name=TCONS_00002742|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13507bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000021:955178..968684- (Clytia hemisphaerica) CTTTTCCCTTTTAGACCAAAAAGTCAATTGGTAAAAAAAAACTAGAAAAA
AAAACAAGAACAACACTTTGCTGTCATTGACCATAAGCAAAACACTTTGC
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GAGTATGGGGAGATATGCTGGACATTGAATGTGGTGTGGTGATGGTACTC
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GGATATTGTCATAAAGATAAAACTCAAAAAAAATCGGAAAATGAAGAAGA
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TTAGTTTGGAGTATCTAATTTCTTTGCGTCATAAGTCTGATTCACAGATC
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GCATTTGATATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCGATGACCCAA
CAGCTGATTGGTTGAAAGTGACGTATTGGCTGATTTACGTCACTTACAAC
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TGGTATTGGATTGTTAAACACTTGTATTGTGAGAATGATATTGAACCTTT
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TTGTCAGCATGAAGTATGCTTAAAAAAATGAAATACATATCTCGATTTTT
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TCATCAGATATACAAATGTAGAAACATCATTACTTTTCCAAAAGTTGTTT
TTTAATTTGATACATAAATAAGAACTTGGTCGTTGTGGTAGGTCCAATTA
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CCGTTTTGTTTTAATGGTTTTTATGTGGCTTGAAGTTGCGTTAGTTCTCT
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GTTTACGTGATGTTGGTGTATAAAAGATGCACTCGTGAGTACGCTATGTT
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TTCTGCTGGAAAGTATATATCTCTAGAAATATGATGAGGTATATTGCGGA
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CGTAAATTACCCGAGAGTTAAACCTGGAGTTATGATACAACGCGCATTTG
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TCTCAGCAACTCTCGTGACGATGACTTCCGTTCGAAGTATGTTGTCTGAG
TCGGCCACATTTGCTTTGAAAAGACCATTCCTATTTGAAGAGACTAGGTT
CTATCAGAACTGCTTCAAAAAAGACCTCCCCGAAAATATAATCAACAGAC
TATTTACCATATTATGAAATAACCGCCGTGATGAGACATTGCCAATTATG
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GTCCTTGTGACAGCGCATGACCGCGCTTTCAAGTCTCACGTCCAAGCTCA
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ATTTGGCAATCGGCAGGACGCAAGAGGATCCATCAGATCAAAATCAAGCC
ACACGACGTGTTGTACGGAGATATCAATCTCGTGGATTAAAAAAGAAACG
TTTTTAACGAATAGAACAATAGCCCTAATAGAGTATAAAATAAAAAAACA
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TGAAAATTTTATCAGACTTTAATACTGATCCAGAACATCCAATCACTAGC
CCACGGCAAGTAGATGAAACTAGTATAGGGGCTAGTGATGAATTTGTGAA
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TTCACAAGAATGCAGGCGTTTCAGACTTTTATATGACGAAGGTATGAAAT
TTCGTAATTCATTCTTATTTAACAACTTCTCGGATACCTAATCTTTGTCT
CTCCCGCTCATTAATTTTTTTAAATTTTCCTTGCCCTAATTCTTCTATAT
TATCCTACTTTCCGAAGATATTTTTCCCGGCATATTTCAATTCTATCCTT
CGGTCATTCATCCCAGCCTGGATATTCCAGACCCTTTTGTGATTTTCCTT
ACTTTTAATTTTCCTGTTTACGCGTTCTTAATAAAACGGGAAAATAATAT
ACAGCTGAGAATGAACGCGTCACTCTACAAGATTTTTCATTAATTATCCC
CTTATCATAGAGGAAATATACTGATAATTGCTCTCATAATCTATTTTATA
GTTTGCTAAAGTGAAAACTACCAGACTGGCAAAGAAAGTGAGCAGACATT
GGAAAGGTAAATACTTCTTGGTCATTATCAGTGCATTCATCTCCAGTAAA
GATCCAAAGCGATCATTACATCATAACGATCACTCATTACATCTCGAGGG
ACGAGCTTTAGATATAACAATAGGAACCAAAGCCGATGGTAAAACTGTAA
CCATTATGGATGATAGAAAAGCTGGTAGAATTACCAGAGCAGAAGAGGTT
GAATTACTTAAAATACTTGGCACTTTAGCTAGAACTGGCTCTAAATCCTT
TGAATTTGCTCAATTGTTTGATAACCATGTACATATCTCTACAATGAGAC
GTGAAAAACTTCTAAGGCATTAAAACCGTTTTAGATTCGACTCACAGTTT
TTATTATAAATTATTTAAAGAAATAAGAGAAATTTTAATAAATGATGTTT
AGTTTTGTATGTTATTTGTATGCTGAATCAGCAACAATTTTAGATATTTA
TTGTTATTTATTTTTTTGTGACGTCATGCTGCATATTATTGTAGTTCAAT
TTTTGTAAAAAAAAATTATTTTTTTACACCTATTAGCAACGCCTATAGTT
GCTAGAAACCAGTTCAATTACTATATGCACCTTTGGACTTAATTAACTCA
ATCTATAAAGCTCTAAAGTATAAACTGACCTTTCGGCCTTTGACCTGCTT
TTGTATTTTTACATTTACAAAGCCAGCTATGCATTATTGGCATTTCACAT
ATATATAGTTCTTACATTCTATTCAAACACGTTATTGTTTTTATGATATA
GAAGAAAGGCGCACCGTTTATGCTGACAAAGCAGAGCTTACTTAAAAGAT
ACAGCATATAGAAATATCTGTCTATTTTGTATGTACTTATGTAGAATATC
AACTATGAATTGTGAATTATTTTTGATTGTATAAAACGTAAAATTTTGCT
AACATGTTACAATTGTAATTTAGTAAATAATGTATATTATTAAAACAAGA
GTCCCGAAAAAAAGAGCATTATTTTCTGGACACGCTGTATTTAAATTTAC
TACCGAACGGTTTTTTGATATTTATTTTTTGTGTGTAAATAAACAACAGT
AGTGGATGTATATAAGGTTTTCTAACGAAGATGGGGAGCTATTACTTTCT
ATATATGGTTAAAAGATCAAAACAACACTCTCCAACACAATGTTGAAACT
TATCTACACCCACTACTGATAGATTTTGATTATTGTTCCAGGAAAGATCT
GGATAAAAGAAAAACACGTTGATATAAACGTTTTTTTATAAGAGCAAACT
ATAGAAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:968482..968684 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:968482..968684 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:967402..967526 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:967402..967526 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:956844..957244 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:956844..957244 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:955178..956483 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1575043694:955178..956483 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:968482..968684 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:968482..968684 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:967402..967526 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:967402..967526 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:956844..957244 | TCONS_00002742-exon-sc0000021-1510915933:956844..957244 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000021 | supercontig | sc0000021:955178..968684 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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