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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002334 ID=TCONS_00002334|Name=TCONS_00002334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3791bp
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AATGATTATCAAATATTGTCTAACATTGTATGCCAAGTCACCTTCAGCct
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GAACACAAAAGGAATATCAAACCTGATCAGAAGCCTTTTGAATCATTAAC
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ATTGGCTCAAGTGGATAAACACCGCACACCCGGNGAAACCTTTTGAATCA
TTAACAGATGCACGTTTTGACTGgctggaaaataaatttttgaaatactt
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ATTTCCACCATGTCTCTTATCCATTGTACCAAGTATCTTTTGAAGAATGG
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TGGATCaattttgttattattataatattGAATGTATCACATTAGAAACT
GTTTTGAAGATTATGAATGCACTTGTAATTAtatgaattta Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:924410..928484- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002334 ID=TCONS_00002334|Name=TCONS_00002334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4075bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:924410..928484- (Clytia hemisphaerica)
GTATAATTTTATAAACATGAAAAGTAAATACAAAATGAAGGAAGAAAACG
TATATTTAGGTTGATAGTATCTATATGGTTTGTTATTTTCCCTTTCAGTG
AATTTTACATCTAACAAAATTTAGGCTCATGCCTGGAGAAAATTGTGCCA
TCGTTGGTTGTGGGATCTGTCGGAATCAAAATAAGTATGGATTATTCAAA
ATCCCACCACTTACAAAGCCTGAATGGCGTCAAAACTTTTTGGCTTAAAT
TTTGAAAGGCCGAATTGTCGATGAGAAATTCAGTAAGAAGATTGAATCAA
GCAAAGTTTGGGTTTGTGAGAAACACTACGAACCTGATGCTCTTTATCAC
TGTAAGTATATAAAGCATGATTTATTTTTTAATTTTTTGTTTAATTAGCT
ACTTTTGATGCATGCTCACCTGAAGTCTTATTTTTGTAAAAGATGGAAAT
TAATTTTAAAGAAATTAGATTAGATTTTAAAATGCATGTTTTACTTCAGG
TCTAATTTTTGTAAGAGATAGAAATAAATTTTCAACATTATTAGGTTAGA
TATTATATCATAGTGATTGAGGAGCTACTAATATAAGAGGGCATGTATTT
TTTAATTTGAAAATTTTTTGATTTTAAATTTTAAGATGCAACACGAAAAG
TACCAAAGGAGGATGCAATTCCAACATTGAACCTCCCTGGCATGTCAAAC
AAAACTTACGTTCCCCGCCCAATTAATTCCATTGTCAAAAGAGAACAAAA
CCACCAACCTGCAAATATCCCATCCACATCTATCAAAACTTTTTCCATTT
ACACATATCGTCAATTCTTGCAGAATGCATCAATGAGCATCAACAATAAT
TGGCAATATTCATTATTAGATCAGTTCTCAACTTTTCGTCTTTTTGATTC
ACGCTTTCAAGTTCCAAAATTTGATTTAGTCGTTGACTGTCATTTAAAGG
TGAGTTTGTAGGTATTCAGTATTCAGTTAAAATGTACATTATATATAGAG
GCTTTTTAGAGTATTGTACAACTATGAACTATATTGAAGATATATGAAGA
TATATTGCACGCTTCTACAGTTAAATTCATGCATGCTCAAAATATATTTT
TTTAAATTTTTCCTATTCATCAATCATATTATACGCTAACGTACATGATC
AATCCATGCATGACCAATCATTCGTAAATTATATTTTTAACTTTAGGTAA
CATTAAGAGTTTTTGGATGGTTCAGCACCTGCCCTTTTTCTATAATGTCT
ATGCCAATCAACACAATCTTAACAAAGCTTGAAACCATGAATTTATGTGT
GGGAATCAGTAATTTGGAATTGGTTAACAACGATGCAATCAGGCATCACA
CAATTTCAAAGCTACAAACAGTGAAACAATCAGACCTTCCTGATGCTTTT
GAAAATCTTGTTGAAAGACACTTTTACAGAAGCCCATTTTGCTCATTATT
AGTTGGACACCAACTTAAGATTTGTACGCATTGTACTTCTTTGGAGAAGA
AGGAAATGAATGCCTTGAAAATGAAGCAAAATATGCAAGCAAAACCCATT
CCACTTAAAGCTCCTATAACCGCAACATCAGTAGCTAGGTTGAAAGCGAC
AATCCTGGAACAAAGGGCCCTAAATAAAGATCTAACAAACCAGATCAGCT
ATTTACAAAATGAACTTGATCGAAAATCTGTGATTGTTAACAAAGAATTA
CATCAAGATCTAAAATCTATATTCGATCAAACTGACCAACGCAGGATTTC
TCCATTTATGAAATTGTTTTGGGAAGAACAAATGAAGTATTTAAAGCAAC
ACCCAACTCAAGTAAGTTATGTTATTTTTGCAATAATTGCTATTATATTT
CAGATAAAAGTATCCTTTTGGATTATTTATTATAGCTATATTCTATCTAG
ACCTGCATGTTCAAGTTTTTATCAAACAAGATTAGAATTTTGTCATTTGC
ATTGCATACATGAATTTTGCTTAAAAATTTTTTTTATGAAATTAAGCTCC
AAAACATTTAACTTTTAAAGGTGAGGTACCATCCAATGATTATCAAATAT
TGTCTAACATTGTATGCCAAGTCACCTTCAGCCTACAAATATTTTCGTTA
TGATGAGAAAAATGGAACTGGGGCACTCATCCTTCCTTCAGAGAGGACAT
TGAGAGACTATCGCAATTACATCCGTCCGAAGACCGGTTTTAATCAGCAA
ACTATCGAGAGATTGACTAAGTTAACAGAAAAATTCAGTAATCAAGAGCG
TTTTGTTGTTCTATCGTTTGACGAAATGAAAATCCAGGAAGATTTGGTAT
GGAATAAGCATACTGGGGAACTTGTTGGTTATGTTGACCTTGGTGATGAA
TCTCTCAATGAAGCTACTTTTAAAAACTGTGATGATCTTGCCACACATGT
TTTGGTTTTTCTTGTGAAAAGTGTGATCAACCCACTATCATTTTCTTTTG
CAACATTTGCAACAAAAGGAGTAACTTCATTCCAAATCTTTCCTTTATTT
TGGAAGGCTGTATGTTTGCTTGAGATGTCCTGTAACTTACGTGTTGTTGC
AGCAACTTCTGATGGGGCCTCACCAAACAGAACCTTTTTCAAAATGCACA
AAGGCTTTGTTTCTGGAGACATAGTGGTTTATAGGACACCAAACATTTAT
GCTGAAGATGAGAACACCTTTATTTATTTTTTCTCCGATATACCTCATCT
TTTGAAAACTCTTAGGAATAATTTATTACACTCAGGATCTGAAGGACACA
CTAGATTTATGTTTAAAGATGGTGGACACATTTTATGGAAACACATAAAA
GATTACTACATGGAGGATTCTTTATCTTGCTACCGACACCTCAATAAAAT
CACTCCAGACCATATTTTTCTGACAAGCTATTCAAAAATGAATGTTAAAT
TGGCCGCACAATTGTTGAGTTCTAAGGTAGCCACGACACTCAAAGAATAT
GGTGATGATGAAACCCAAGAAACAGCGGTTTTTTGTGAGTTGGTTGACAA
ATGGTTTGATTGTGGTAATGTTAGACACCCTGATGAACACAAAAGGAATA
TCAAACCTGATCAGAAGCCTTTTGAATCATTAACAGATGCACGTTTTGAC
TGGCTGGAAAATAAATTTTTGAAATACTTTCAAGATTGGCTCAAGTGGAT
AAACACCGCACACCCGGNGAAACCTTTTGAATCATTAACAGATGCACGTT
TTGACTGGCTGGAAAATAAATTTTTGAAATACTTTCAAGATTGGCTCAAG
TGGATAAACACCGCACACCCGAGCATGAAACCTGAAATTAAGGGTAGAAT
GTTTATTAGCTGGCAAACTTACGAAGGACTTCAGATTTCCACCATGTCTC
TTATCCATTGTACCAAGTATCTTTTGAAGAATGGAATCAAATATGTTCTG
ACCAACAAATTCAATCAAGATGATTTGGAAAATTACTTTGGTTGGCAACG
ATCGATTGGAAGAAGGAAAGACAATCCAAGCCACCAACAAGTAAGAATCA
ATGACAACATTATAAAATCGTCACTACATGTTGCACCTAATGGAACAAAT
TGTGAGAACAGCACAACAACACGATGGTCAATCAGCGATGAGCCTGTCCC
CAAGAAACCCCGTACTTAGTTTAGAACGTTTTTTACTTTTATATTTTGAA
TTTTTATATTTTGTCATACTTTTATATTTTTTACATTTTTAATTGTTTTA
CACATTTTGGTTGCCGTTATTGTTAATAGCACTGTCAATTAAAGGTTGAT
AATTTGTTATATTAAAATTTTATGAGAATATTTATTATCCATCTTTTAAA
ATATACTTTTTTTGAAGCTAGTAAATTTGTTGGTTTTGTTTGTGTAATAT
TCTTTTGGTTAGTTTTTGTTTAAAATGCATGTTTTTTAGTGCATGATGCA
TTACCACGCATGTTCAGTTAAGTCTTCACATATATCAGAGATTTAGAGTT
TTTGTTCGATTCGCATTACTTGCATTTTAAATTATGGATCAATTTTGTTA
TTATTATAATATTGAATGTATCACATTAGAAACTGTTTTGAAGATTATGA
ATGCACTTGTAATTATATGAATTTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1575043694:928134..928484 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1575043694:928134..928484 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1575043694:924410..927849 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1575043694:924410..927849 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1510915933:928134..928484 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1510915933:928134..928484 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1510915933:924410..927849 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1510915933:924410..927849 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1491911889:928134..928484 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1491911889:928134..928484 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002334-exon-sc0000019-1491911889:924410..927849 | TCONS_00002334-exon-sc0000019-1491911889:924410..927849 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:924410..928484 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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