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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002318 ID=TCONS_00002318|Name=TCONS_00002318|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=251bp CTATGCTTGTTATGTCTTCTACAATTTATTTTCTCTTGTTTGGAACATTG TATTCTTATGGTGTTTGGTTGCCAAGAATCATGGAAGAATTCAATTGTAA TCAAGAACAAGCTGCTTGGGTTGTTTCAATGGCCAGTGGTTTATTGGTGT TACTTGCAATGCCTGCATCAGTATCGTGCAATTATCTTGGAGTTTTCACG ATGTCCATACTCGGTTCAATTATGTGCGGATCAGGACTCATAATATCGTC A Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:531575..542450- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002318 ID=TCONS_00002318|Name=TCONS_00002318|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:531575..542450- (Clytia hemisphaerica) CTATGCTTGTTATGTCTTCTACAATTTATTTTCTCTTGTTTGGAACATTG
TATTCTTATGGTGTTTGGTTGCCAAGAATCATGGAAGAATTCAATTGTAA
TCAAGAACAAGCTGGTAAGCGTCATGGTTTATTTTTTTGTTGGAAAGTTA
ATTTAGAATGGCCGATGAAAGTTAGGCTTTGAGCTAGACGATCCTATCGT
CTACACCATATCACTGAATAAGGGAATAATTCAGGAGGTGGGATAAATTT
GAAAACGGAGTTTAGCTCGGGACGGAGTAAACAGTGGCGGATGTGTTTAC
AGTGTTCTAAACTCTACTGCCACTATTTTCCCCGTAAATCACCATGATGG
TTGTAAACTTTTCCTGCACTATCCATCCAACATACGATAGCATCGTCTAG
CTTTAAGTGTGGAGTCAAGTTCTCCTTTTTAATCAGAGTAATGATACCAC
TAGGTGAAGACATCGGCGCTCGAATCCCCACTTTTTTCAATATCCCACGT
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GAAAATCCTGGATTACTGTTTACTGAAGGTCTTATTTTACGCCATCACCG
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GGGATATTAGGGCCCATGCTACTTTGACCTTAGAAAAGTATCACTACGTA
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GGTTCAATGGCCAGTGGTTTATTGGTGTTACTTGCAATGCCTGCATCTAT
ATCGTGTAATTATCTTGGAGTTTTCACGATGTCCATACTCGGTTCAATTA
TGTGCGGATCAGGACTCATAATATCGTCACATCTTCAAAATATCTATCAT
CTTTATTTATCGTTTGGAGTGTTGCTAGGCATTGGTTTAGCCCTTCTTTA
CACACCGACTTTGGTCATGGTTGGACGATGGTTTGACAAATACCAAACGC
AAGCTACTACTTTTATGATGATTGGAGCTCCAATAGGGTCGCTTATATTT
AACCCGCTGATGGAGAAAATCATGGAGAATTATAACCTAAGGTCTGCGAT
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GTTATCTTCCCTTCAGCCAAAAGCTTATCAAAAAAGATGTTGATATAGAA
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ATTGCTTAGGAACAACGCATTTTGGTTGTTCTGCGTGTGCAGATTCTTTG
CAATCCTGGCTTACTACGTCCCCCTGTTTCACTTGGTAAGTTATAAAGTT
CCTTAGTCTTACCAAAAATTGGCATAAAACTTAACTATGTATTAGACAAA
AGATTGCATTACAAACGATTTGTTGCTCAAACTTTTCTGAGAAATTTGAC
GCCTAGGTTATAACTCAAATCAAATAAGTGACCAGGTGAGCAATTTTTGC
AAGTTTGAATGATTTAGGAGTTAATTTAATCGGGTTGTACAAATGTATTA
GACTAGCAAGCAACTGTCTTTCTTTGGACACAGGAACGCGGGAATAGTGC
TTATCTATAAAGAGTTCTTTAAAAAAATAGAAATTGCCGCGGGAGAGTGG
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GCTTAAGCTGCAGCGAAATACAACGATACAACAATGGTTTATTAATCTAT
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TCAACAGCTAGTCTTATGTTAGCTGTATGGTCTGGAAGTAATTTGTTTGG
TCGGATCTGTTATGGCTGCTTTATTGCAAATCACCGAGAAAAATTATTGG
CAACATATCAAATCTCGATGTTTTTAAGCGGAGTGGTCAGCATTGCAGCT
TATTTTGCCGACAATACATGGAGTTTGTTTCTCTATTGTTGTGTTTATGG
AATTTTTGATAGTTCGAATATTGGACTAGCCAGTCTGGTGACGATTGATT
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AATGGGATTCCAAGCATTGCTGGTCCTGTACTGATCGGTATGGTTAATTT
TCGCCTTTTTATTTGCTATTTGAAAACTCAGTAGGTATTAGGTTTGCGAA
AAGATGGGGTGTGCAACTTGTGACCTTTGGACCCTTAGTGGGACTAAAGA
GGAGAAAAAATTGGAAGTATTTGTTAATTTCACGACCCTTATTGTACTGG
GACAAATGACCAAATTTCAATGCATTTAGGGGCAGAAATTGAAAATTTTC
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ATACCAGTACCGTTACTCGCCAAATAACCCNGTCCAAAAAGGTATCCTTA
AGGGCGGCACATACCAGTACCGTTACTCGCCAAATAACCCCTGGGTTACA
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CAAAATATTCTTGCCAGTGGAAAAGTTATTCACTCAAATTTTTGTCGCTG
GTTAAAATAATAAAAGAAACAAATCTTCTTTGCAAAATATAGTGCTTTTT
CTCACTTTTGAGTTTCCGTCCGTTCTTTTTATCGCCACTGGTTAATAGAT
CCCCCCGGATTAGTGACTACTTTTTATAAACATTCTTAGAATTGAGTGGA
ATTCGTCAATAATATCTGACACGAAAAAATCTTGCAAAATTTTAGAAAAT
TTCTCGAGTCTTCAAAATCTTTCCGACATCTTCATTTTCTAGGTAGATTT
TGTTTCTTTTTGAGAATCTCTACCATTCATTTTCAATATATTTTTCTCAA
CAGGTGCGATGAACGATGCGAAATTATTGAGTGCAAATTACATGTTTGTT
TTTACTGGTGGTACATTCATCCTTGGAAGTATTTTCATGAACTTTGCACG
GATCACACATAATCGAACTCGTCAATCAGAGATTCCAAACACAGAGCTCA
AGGATGTCTACAATACTGACCAGAACGAGAGCTTGGACGAATCACACTTA
CAAAAGGATGTGTATATTACTAACCAGAAAATTTCTAAAGAGAACGTAAA
GTCTTCGGAATTGCCAAAACAAACCTCAGTGGAAAATTTTTCATTTGATA
ATAAAACTTTCGATGTTGATATTATCCGGAATGAAAAGGAGTCATTGTCC
TCAGTTGATTTTTCTAAAGATACACAAAATGGGAAAATTGTCTGATGAAT
TTGTTTTAATAACAAAGCTTTTGTCTATGCCAATGAAAACTGAAAAGAGC
GATAAGAAATCTACCAAATGATCAAAAGAAAATAAAGAACACAGCATTGA
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ATACTTAGGCGAATTGGGCGCCGGGTAAGTACGAGCCATATTGGGTATAA
TCATTTAAAAGCAATCGAGTCTCTGTAAGTGTTCCAAAATCACGAAAAAA
AAAATCGGCTCCCTCAAAAGATCATGAATTTTTTTTTAATTTGGACTAGA
ATTGAATTTGAAAATTTTGCTTGAAATCTTAGGGAAGCTGTCTCTTTAAG
TGTGACAAAAACGTCAAGAATTTAGTGTCTCGCAGGTTCTATTTTCGTAC
TTTGGCTCGTCTCGCAAACCTGGTACACCCCCTGCATAACCAGTAGCAAA
CCCTTGTCAGACATCCCATTTGGAAAAGTTTGACCAAAATATCGTCCCAC
TGGTAAAATTTCTCACTGAGAAATTGACTTTGATTTTATTTTCATTTAGC
TTTCGTAAGAAATTTATATTCCCATTGGGGCTGCGAACAGGGATGTCAGC
AGATGCGATAATACAGTATTATAATATTATAGATAATTTGTACAATTTTT
ACATACATATATAAGAACCTTTATAACTTCAAACGATAGTGTACTTTAAT
TGGAAGGTCTAGTAGAGACCATTAGTTTTTAAAATGATAATTAGTCGACG
GAAGGTTAGACAAACAATGAACGGTATAATTCGATGTAATAATTTATTGC
TTATTTTGATAATGTCTGGTTATTTTTATCTATTTGCCAAAGATAACTCA
TGCCATGAAGAAATAGAGTCTCATTTGCTCGTTAGTCAGGAGTTGCTCAG
CTATCGTGGTTAGCCATTTTAAATGGACATTCGAAGGTGGACGACCTTCG
AGGGTGGACATTCGAGGGTGACCTTGAAAGACTTTGAAAGGCTTTGAACG
AAATTTGATATTTGGAAAAGGAAAAAAGAATGAGTAATCAAATTTCAAAG
CGCTCTTGAAAATGTTCAAATAAGAAGATTAGAAAAAGAAAAAAAATACA
CACTTTCACAGTTATCATTTTGAGGCTGAAAATTGACCAATTGAAAGATC
AATACAGAAAAGGCGCCAGAAATAATTCCTAGATGCTTAAAAATCGCTAG
CGAAAAGCTTCATGCCAGAATGAGAGAGTTCCGATTTAAATGTCTTACTA
GCCATAATTTTCATTAAAGTGCCACCGCAGAAGAATGGTCAAATAAATTT
TTGAATTTGGAAAGAAATGTTACTGATAGCCGTTACTTCAGTTTGAATGG
CATCTCATCTGAAGCAAAATTTAGTCTACAAATATTAGGAGGGGGCGTAC
GGGGGTCACAGACACCGAAATACCTACGCATATTTCTTGGACTACCGTCA
ACACCGACAGCAAAATTTGGTAAAATCCTTAATTTTGTCACCGTATGGCA
TGTTTGACACCGAAATACCGTCACTTTTTTCTTCAAACACCGAATATTAC
CAAAATAATGGTATATTATGGTTTGTTTATATCATACTAAACGCTACTGT
ACTAAACTGCCATTTTACTGTAATATGCAAACGACAAGTTTTTGAAAGGA
TGAAAATTTCTAATTTGCGTTGCTCAGAGCGGTTAATAAATAGGGAATTT
CCCAACAAAAAAGGAATTTCCCTTAATTCGACTCCCTGAGGTAATAAAAA
AAGACATATAGAGCTTTGAAAATGGGTAATCAGATCAAAAAAAATCCGGA
AAAGTACAATACAGTCAAGCTAAGAATGTTACCGGTACACAATTTAACCG
GAACTAAAATACTGAAAAACGTGCGCAAAATCCCGCGATGGCAATAGTAT
AGATGTATATCATCTTTATTGGAAAACCGCATCAATGTTAACCCGAATGC
CTTCTCGGGTAACTTAATGCGAGACTTAATGCATGTCGGGTAACTGCATG
TCCCAAAATTGCATTAATTTTTCGCCCCCAGTTCCAGTTCATAAACAATA
AAAAATTATATATTTTTGTGAGCGTAATTGGATGTAGAATATCGGATTTG
GTGTTACTTAAATTTTTTCTCAGTATAATTAGAGATATCTTAAGAAAACC
TGCTTATGACGTCATAATATTGATGACGTCATAAATACAAAATGTTGAAT
ATCTCAAGAAATATAAATCAAAACTTTATGAAATTTGGACCAGTGATAGA
GCACATTGAGATAATTCTAGACTAGTCATAGCTTTCACTATCCTAAATGC
CCCCACTGAAAGGTCATGTCATGCACTTNAAAGTACAAAGTATTTCCAAA
AATTGATGACGTCAGCAGCAACTGCAGAAATTCGAATTTTTGCAATAAAA
TGCTGACATCAGCTAATTTTCAATTTTTTTGAAAACATTTCTCCTACTCT
TGATGAGTTCTATCATTGGTGCAAATTTCATTAGCATTAGTTCTTGAGAT
ATTCAACTTTTTAAATTATGACGTCATGAATAATGACGTCATAATTAGGT
TTTCTTACAAAAACTCTAATTATGCTGAGAAAAAAATTAGGTATCACCAA
ATCCAACATTCTATATCCAAATACGCTTCCAAAAATGTATACCTAATTTG
TTATGGTTTAAGGGCTGGAATTCGGGGCGAAGACGAAAAGCAGATTTTGA
ATAATTTGGGACATGCATTAAGTTACCCGAGTTGGTTTACCCATAAAAGC
CCACGATTGTATCTACGAAACACAAGGTGAGAATTTTAGCTGTCAGCAAT
AATAAGAATAAGTCTCTATAGAAGAATCTGAGATGAACAGCTTGTATTTC
CATATTAATGATATGTGTAACCAATATAATATTTAAAAGTTCATTTTGTT
CAGCTGCTATGGTAGCAAAAATCCTTATTCAATTATAGAATTCCAAAAGA
CAAAAAGAGTATAAGGCATTAAAAATTCCACCAAAGATTTATCAGCTTCA
AGCTGTGTTCATTCTTACATAATTGAAAATTATGGCAATTAAGATTTTAC
ATTGATAATTGGAGGCTATGGAGACACGAATTTATTTAATGACTTTTCTT
CCTCTCCATACATGTGGTTTACCGTCTCAATGTAGAAATATCATAAGTCA
GACAAAAAATTATACTAGTCAAAGATTGATTAAATGATTCAGTGAGGGTA
CTCATTAATCACCCCGAAGTCGACCTCATACCTAGNTTACATTTACCGTT
TCAATGTAGAAATATATCATAAGTTAGATAAGAAAAATATACTAGAGTCA
AAGATTGATTAAATGATACATATTCAGTGAGGGCACTCATTAATCACCCT
GAAGTCGACCTCATACCTAGAGCAATTTAACCTTAACAAGAAACTCTTTG
ATTTTACTGTTCTTCGTAGATTTTCGAAAAGAGGATATTTTCAATATGTT
AAGTTTCAGAGCACCAACGGTAGATAAAAGCCTATGTTGGCCTATGTTTA
TTTCTTCAATGATAATCTATTTTCTCCTGTTTGGAACGTTGTATTCTTAC
GGTGTTTGGTTGCCAAGAATCATGGAAGAATTTAATTGTAATCAAGAACA
AGCTGGTAAGCGTCATAGTTTATTTTTTTGCAGACAGAAATTCTCCCGAT
GAAAATTTTCTGATCGGTGAGCCAAAAGCTAGAGACGAATCTCCTACGTA
GGGTTTGAAACGACTTTTTTCATACATAAGTCTCATGGTCAAAGTGGTTT
TCATACAAATGTAGTCTGCTATACTAGATTACTAATTCAGACATAGTAGA
CACTAAGCGAATAAGCAAAAATAAGTAAGTAAGTCTGCGACCGCTGTCGG
AAGCGACCCGAAGGCTCCTCTTTCGATACACCTATATCTACCCGAAGGTA
GAGGAGTTTGTCACTCTTTCTCACTGGATTTCTTCACTTACCTTTGGTCC
TTTTCTTAAATGTTGGGCATCAAGCAGAGCAGAAAGGCATCAAGTACCAT
TTTGAGGATCTTTGGTATGACCTGAACCGTAGTCGGATGCTCTACCACTG
CACCACGGTTCGCAAAAATAATGGAAGGGAGGAATTGTAAAAATCATCAT
ATTATCATATAACGTACTCGTGCATAGGCGTATCGAGAATTTTTGAGGGA
GTGCAGACGTTTATGACATATTCATTATCTTTTGATAAAACAAAGACAAT
AATTACAGTGCCGTAAAAACCGCTCTCATACATAAATTTTGCAGGGTATC
TCGCTACGACTATAACACCCCCTGATACGGATAGAGTTGAGGTAGCAAAA
ATATTTTTAAAAGCATGCCACCCTATGGTTAAATATCTTTTTAGATCTAC
AGCTTTGGGGTCAGCCTAGTTTCTAATATTTCGAAAACGTTCTTGAAGAC
GGAACTGATGAACTACATGTTAGTTTGGTCTAACTAAAACTTTTCACACC
TGACCACTTAACTTATTCTCAAATATTGCATGGCATGTTCACTTTGACAT
TTTGACAAATGTTCTTGTGTAAGGAGAGATAGATATTACAAAGTACTCAT
AAAAAAAAAACACATGTTTGAAACTTCAATTCAGCTGAGTGGATTTTATT
TTGAGATTCGACAAGAGGATAAGAATTCATGGCTCAGGCAGAGCTCAAAT
ACTCTCCTTTACATCTATTTTACAATATAATCTTGCACTGAGGCCCCCTT
TTGGTTTGGATTAAGGTCATTAAGAGGTTAAACTATNATGGAAGGGAGGA
ATTGTAAAAATCATCATATTATCATATAACGTACTCGTGCATAGGCGTAT
CGAGAATTTTTGAGGGAGTGCAGACGTTTATGACATATTCATTATCTTTT
GATAAAACAAAGACAATAATTACAGTGCCGTAAAAACCGCTCTCATACAT
AAATTTTGCAGGGTATCTCGCTACGACTATAACACCCCCTGATACGGATA
GAGTTGAGGTAGCAAAAATATTTTTAAAAGCATGCCACCCTATGGTTAAA
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CTTCTTCAGAAGAGGCTGGTTTAAATGTACAGAAGGCGAGTCAAGGCAGA
AGATTGACAAAAGCCAATACAACTCAAGTAGAATAATATATGGTAAACCA
GGAAATCAGTGTTTTTGTTTTAAAGGGTGACAATTTAGTTGAATAAAGCT
TGGGCATAGAAGATGAGCTAACAATTTTCTGGAAATATTCCAGACCAAAG
TATACACAGAACATCGACCAACATTAACAGGCATAAAATGAAAGTTTAAG
GGAAAATTCCGTTTATTTACGCATACTGCAAAATCAGTCTTCTTTCTGCA
GTAAAATTGAATCTTGGAAAATCATGAAATTAGTTCTTGGTTAATTCAAA
GGCTAGGCCAGTGGCACTCCAGATGTTACAATAAATACGAGAGCTTTGTG
AGTGTGTTATGTGTGTTTATTTCCCAGGTCGGGTCCTAGTTAAGGGGAGT
CACTTCTTTGAGAGAATTTCGAACGGCGGTACGGTTCTCTCAGAAACTTC
GACAGCCGTCTGGTAACCTCGACAGTGGTCTGGTTACCTCGGCGGCGGCT
TGGTTTCAACCATAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTATTAAGGGGAGTCA
CTTCTTGAGGGAATTTCGTAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTCGA
CAGCCGTCTGGTAACCTTGACGGCGGTCTGGTTACCTCGACGGCGGCTTG
GTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTACTCAAGGGAGTCACT
TCTTTGAGGGAATTTCGAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAACCTTGACG
GCGGTCTGGTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGTCGGGTCCTACTCAAGG
GAGTCACTTCTTTGAGGGAATTTCGAACGGCGGTTCGGTTCTCTCAGAAA
CCTTGACGGCGGTCTGGTTTCAACCCTAAAAGTGTCTCAGGTCCGGTCCT
ACTCAAAGGGAGTCACTTCTTTGAGGGAATTTCGAATGGCGGTTCGGTTC
TCTCAGAAACCTTGACGGCGGTCTGGTCTGCAACCATTGTCTTGTTTTGG
GGATACCTTCGGTTGGGACTAAATTTTCCCCAAAACTGATTATGGGTTAG
CCAAATATGTGAACGCCAAACTTAATTGAAAAATGTCTCAATCTATTCTA
CTCCCCTCCAAACACATGAACGAATTTGGAAATTAAACACAGATCTAATA
TGAAAACAAAAAGAAAGATTTAATAATGCAAAGATCTAGCCCGGGGTCCA
CTCAAAGCCTTTTTTATAGACTGATGACACGATTAAAGTGGCCCAGTAGT
ATGTGGTAATACACAAAGACGGACAGAGATAGTTATTTTTGAATACCGCA
GATGGGTAGGCTATCGCCATTATTAGCTGTAAACCCTATGTAGGGTTATT
TTCTCCCTGTTTGATATTCTTATAAACGGGAAATATATATCGTTTTAATT
TCTAGAAACATCAATTAAAAAACTATTTATCGTCATGTTAAGATTCAAAT
CACCGACCGTTGACGCAGGTTTTTGCTGGCCTATGCTTGTTATGTCTTCT
ACTATATATTTCTTGTTATTTGGAACGTTGTTTTCTTACGGTGTTTGGCT
GCCAAGAATCATGGAAGAATTTAATTGCAATCAAGAACAAGCTGGTAAGT
GTCATCGTTTATTTTTTTGTTTGAAAATGTTAATTCAGAATGGCCAATGA
AAATTAGGCGTTGAGCTAGACGATCCTATCGTCTACACCATGTCACTGAA
AAAGAAAATAAATCGGGAGGCGGGATAGATTTGAAAATTGAGTTTAGCAT
GGGATGGAGTAAACAGAGGCGGAGGTGTTTACAGTGTTCTAAACTCTACT
GCTTCTATTTTCTCGTAAACCACCGTCATGGCTGTAAACTTTTCCCGCGC
TATCCCTCTAACGGACGATAGCATCGTCTAGCTTTGAGCGCGGAGTCAAG
ATCTCCTTTTTAATCAGAGTAGTGACCACTAGGTCAAGGCATTGGTGCTC
AAATCCCCACTTTTTCCAATATCCCACGTTCAGTTCTAGGTAGCTGAGGC
GGCCTGTAAAAACAATCGAAAGAATGTCTGAAAATCCTGGATTACTGTTT
ACTGAAGGTCTTATTTTACGCCATCACCCATCTCTAGAATGCTGATGCTG
CGGAGTTATTGTGTAAAATATCGTTATTAGGGATATTAGGGCCCATGCTA
CTTTGACCTTAATTTTTTTACTTACTTTTTTTCATGTAGCTTGGGTTGTT
TCAATGGCCAGTGGTTTATTGGTGTTACTTGCAATGCCTGCATCAGTATC
GTGCAATTATCTTGGAGTTTTCACGATGTCCATACTCGGTTCAATTATGT
GCGGATCAGGACTCATAATATCGTCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00002318-exon-sc0000019-1575043694:542337..542450 | TCONS_00002318-exon-sc0000019-1575043694:542337..542450 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00002318-exon-sc0000019-1510915933:542337..542450 | TCONS_00002318-exon-sc0000019-1510915933:542337..542450 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002318-exon-sc0000019-1510915933:531575..531711 | TCONS_00002318-exon-sc0000019-1510915933:531575..531711 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002318-exon-sc0000019-1491911889:542337..542450 | TCONS_00002318-exon-sc0000019-1491911889:542337..542450 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002318-exon-sc0000019-1491911889:531575..531711 | TCONS_00002318-exon-sc0000019-1491911889:531575..531711 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000019 | supercontig | sc0000019:531575..542450 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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