TCONS_00001971 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001971
Unique Name	TCONS_00001971
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2936

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000012:1027087..1045747-

transcript sequence

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tttgatggcGTTTTACTGGCGTTCATTTCACAAGATTCGAAAAGTATGAT
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TAAAAAGccTGGTTTCCGTGAATGCCGCAAAATTTGTAACTATTTCATCA
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GGCGGTTTTAGGGGTTTAAAAATGTAGAATTTTCTATGGCATTGAAATTT
TGCTcgaaaatttgttcaaaattttaccTTAAAATACTAATAATTATtga
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transcript from alignment at sc0000012:1027087..1045747-

Legend: exon

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>TCONS_00001971 ID=TCONS_00001971|Name=TCONS_00001971|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18661bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:1027087..1045747- (Clytia hemisphaerica)
ATTATTTTCAACTTGATATAAATATTTTGCAGAAAAATATCAAAAATCTT
TTTGATGGCGTTTTACTGGCGTTCATTTCACAAGATTCGAAAAGTATGAT
TCGTGTCGTCTCGATCATCAATTTGAAAACAAGTTGCGGCAAATCAAAAT
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GTATCCTTTCACTACACCGGACGCAATAAGTCCGGTGTCAGTCAGGGAAT
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AAAAATGACCCATTGAAAAAAAATTTCATCTATCCAGTTTTCTTTAATTT
TAGATTTAATTTCATTTAGTTGAAGCGTTCGTTCTCAGATCGCGCGTATA
TAAAGATGGCCGGAACATGGGCGATAATATTACGGAGGTACCCGAGCTCC
ATCTTTCGTATTTCTCACTATCGACGATATGAAGTATATTTCTAGAAAAC
CCGTACGAAAAAATAAGTGTAGGAAATATATAAACACTTTTTTCTAGAAG
CAATTAAATCTCAACAAAGGAGTTTTAACACAAATTTCAGCCTCGTTAAA
TTTAATGATCTACTTCACTTTCTTTATCAGTGAAATAACTAAGTAACAGG
TAATAATGACGATTAAAATAAGAGGAGGCAATAGAAATCTAGGTTATATG
CACACGACCTATGTATTTAGTTCTAGAAAAAGGCCACTGTCCCAGTGGAC
TAAAAAGATATAGACCAATACTCCAATGTCCCTAACCCCGTAAAAGACGG
AATAAGTGAGGGTGGTTAGAAAAAGTCACAAAACTTAATACCGTAAATCC
TGATGATTTTGGCGACTTCGTGATGACTTCGTGATGACTTCGGACGACTT
TACAGGGCTGTAATTTTTTCATAGATCAAATGAATTACTTTCATATGTTT
TGCAGACACACCTGTCTCACAGCCCCGGTGGAACTTTTTCCCACAAGCGG
GGAAAAGAAACTCTACTGAAATTCCAATTGGGATCGAAATTCTATTGTGC
CAAGGTTAAAAAATCCAGCGGGAATGCTTTCGGAGTGCAATTTTTAAACA
TTGAATTTTGAAAGGCAATGAAATCAAATTAATTTTCTCAGTGGGACTAA
AATTATAGGATATTTTCCCACCGGTGACAAAATTTTTGTCGAATTTTCCA
GTGGGGTTGGGATCCCAGCGAGAGGGAGGGAAAAATACACATAATACATC
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TAAAACTCAATTAAAAGAATCAACTGCAGCTGTGATAACTGAATAACTTT
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CTTTTATGAAAATTTTCTTTCAAATTGAGTTTCTGAAACTCAATGTGAAT
TGAGTTTAATGCCTCCGTCTAACGGAGGCATTTGAGTGCTTGGAAAAACC
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AGAGGGTTTTTGGCTCTCTACCTATCAGTCGGTGGTCTTCCAGATACGGG
ACCTGATTTTGGTAATTTTATCCTCTAAACGTTCGACGAATTCCGCCATA
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ACCCGACTTTTTCTTTCCCGATAAGGTATGATGCAACAGAATTTTATCAC
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CCCCCGCTTGTTAATTCTCAATTTTTTTTCAACCTCCGGACCTTATTAAA
TTCATTAATTTTTGAAAAGAAGAGTTATTTTCTCTAAATAGCTAGGTTTT
TTCACTCTATGGTATAGTTAACTTATTTTGGGGACATTTAGAAGAACAGT
TTCCAACCTCCCCTTCCCCGATAATTAGGTCCCCCCCGTTTATTTAAAAT
TTGAAGATTCTCCAATCATCTCGTTTGTTTATTCTACGACCACCCGACCA
CCTGACAGTAGAGCAGATCATTAAGTTCTTCTATTGCTAGTTTATCCTTT
TGAGATGATCGTCACATGATGGTGGTAAAACAATACAAAGTAAGTGCTTG
TAGTGTTTGTTTGTTCTTATAAAAAAGTCTTCATGTCTTCTTTTGCTCCA
TAACTTGATTCCAAAGAAGGCAGGGCCTAAAAATGAGATCAGAAAAACGA
TTAATTAATATCTTTCTTTTAGTAAGAACTTTTCCATAATATGCTATCAA
TCAATGAGAAGATCAAATATAAACAATTAAAGATGTTAAAGTTGAAAGCC
AGAGTGTCCAGTATTCCCAAATGGACTTTCAGAGAAATTAATTACAGTAA
TTAAAAATGAAAAACTCGAAAATGACATAGCAGTAACAGGAAAATTGTAA
ATTCCAATACGCGATGTAGATTTTCAAGATAACATAAATTTTTTTTNAAC
AGGAAAATTGTAAATTCCAATACGCGATGTAGATTTTCAAGATAACATAA
TTTTTATTTCCAATCTCGCAAAAAAAATTTTCTTCACTTAAGTCCGGCTT
ACGTTTTGTAGTATTTTCGCCGCGCGGTTTAATCTACTCATTACAAAGGC
CTTGACAGGAAAAGGGTTCTTTTGATTCCAAGAATAGATATATAAAGCAT
TTTTCCTTTTGGTATCCCTCATCTCCTTGTTTCTTCACCGGAGCAATACA
AAAAATTATTTAAGAATAAGATTAATCCCCTGAAATCTTCATTTTTCGAA
TTCTTCAATATCTTCACCCCTTGCAACTACAACTGGTTTTATTTACCCGA
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GACTGACTGGACATCCGACTTCCTTAAGTCCGGTGTAGAAATTGTCCGGT
GGTAAAAAAAATTCTCATTTTACACCGGACTTTCGTGTGTCCGGTGTTCG
TTAAGTCCGGTGCGTCGGCAGGGTCCTGATCTTTCAAATTCCAGTATGTG
AATAAAGCAGTAAAAAATACAACTTTTCCATTTTTCCTTTTTTTTGCAAA
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GATGATCCGCGGCACTATCGTAAAGCTAGAATCGCTTTGCGTCTTTTGTG
CTTGAGAATGTGATTGACAGATTAAAGTTTTTCACCCGCGCGGGAGCTGG
CGGGCGTTCTGCGAGTGTTCTCGGCTCAATCCTTGGACCGAGCGCTAAAA
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ACAAGGCTCTTGGCAGAGTATCGTTTGTTTGATTGTCAATGATGACAGTG
CCGTTATTAATTTTGTTAGATCTGACAAATTGATGTTTGTAAGTGCATTT
TATAGTTTTGATTCCCATCGAAAAACCATATTTTGGTTTTCATGTTATTA
GATGCTGTTTTAGAGCTTTAGAACTAGCCTGTTTTTCGCTTTTAATTCGC
CATGTTGAATGGGCCGGTTTTTGTTATAGTCAACCCCCCTCCCCCTGTGG
ACGACATGGATTTTCCATAACAATTTAGTTCTGAAAAACTTCAAGATTTC
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GAGAAATTAGAGCAAATTTTATGTGGATTTCTGAGAAAAAAATAGAACAG
ATCATAAAATCAGATTTCCTGTAAAAATATCTGTTCTTATTTGCCAGCTG
GAAATATTTCAATCCTAGAACAGATCATAAAAATTAGTTTTCTTGAAAAT
ATCTGTTCTTACTTACCCGCTGGAAATATTTTCAATGTTAGAACAGATCC
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GAACAGATAGTATTTTCCAAGCTGGACCAAAATTGGGAAGCATATATTTT
AGGGAAAAGATCAGCCATAATTTTTGCTTAGAACTGATCAAAAATTTCCA
GGTGGCAGATTTTTATGTAAGAGCAGATAAATAATTTCCAGTTAGACAAC
TTTCCCGCTTTCTTAGAACAGATTGCTATTTCTAGCTGGAACATGCCTTT
AGAACAGATATTTTGAAGAAACCCTTTGGTGGCTGCTTTCGATTCTAGTT
CTATCTTAGTTATAACTAAGGGAAACTCAAACATAAAATCCCAAACAACA
CCCCGGGAAAGGTGTATTTGAATGACTTCACAAGCGAAGTAGTGCATTCC
TTTACATACGGAAAAACAGCCAATGAGGTAGCCAATTGCTGATTATAGGT
GATTATGGGTGGTAATGGGTTATTATGGATGATTATGGATGATTATGTAA
ATAGATATACCCTCAAGGGTGATAAAAGAGAAAGATCATATATTATTATT
ATTATAATAATAAATCATATTCCGCGGAATAGCTATTCCGGCCTATTCCG
GCTGGAACAGCTATTCCGGTTCCGGCATTCCGTCATTCAGCATTTTGTCT
ATGGCCATTTTTTGTAACCTTTTCCAAAATTTCTTAGGATTTCAAAGTGA
AAAAAAATTCCAAAAAACCCTGTTGTCCACAGGGGGTAATAGACCTTTTC
TCTTTTCCATCCATCCGCCATACCGTAACTAACTCTGACACCCTTTTTAT
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AATATGCTGAACTGAGTCAATAGGTTATAGCGTTCTCCCACTCAAGATTT
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AATCCTGAACTAAAAGACTGATAAGTTTATTAAATAATCAATTGTTGAAA
TTAATAATGCAAACATGTTATACTTTAGATCCTCTACAACTAGAGAAGAC
AGCGTATGAAGCAGGCTTCCGCAATGATGATGATTCGGACAAAGAAAATT
ATCCGTCCAGAATTCCTTTTGAACAAAATGAGCAAAAACAATCACCAAGA
AATGTTACAAGAAGGAAAGACAAACCCAAACCAAAACCAGCCCAAACAGT
GAATCTAGGCGAATTCATTAAAAAGGTATCTAATAAAATTAGTTTGCACA
TTCTTCCCGCCCATGCTTTTTTATCAATTTTCTTTAATATAATGTTACAC
ATCCATTTGAAAACTTTCCCTCCTGTATTATTGCTGGCACCTCCCGTTTA
AACGTTATACAAGGCCGTTATACAACCTTATATAAGGCCCTTTTAACTTA
CGCTCTTCTACCAAAATGATTTAACTGATATGTTTAAAACAGGAATGTTT
ATTTTATTTTGTCATTATAGTATTAAAGTTTACCTCGGTTTCTTTTGATT
TTAGGTTGACATTGATGGCCTCAAACTCACCATTCAATCCATTCAAGAAA
AATTCAATAATCATCCTTTGGTAAAGTTTTTAACAATAAGTGAAAATTAT
CATTCTTAATCTAAAGCAAAATCATTTTAAAGTTTACCAATTGCGTTCTG
ATAGTTTTATCTTTGATAAAAAATTCAGTTGAAAGCAATCAAACTATAAA
ACTTCATTCAAAACCAACACACTCTAGTAAAATAAAAAAATACAAATTTT
AATAAACAATAATTTTTCTTGTTTGGTTTAGATTTGGTTGAAGGAAGTTG
CAGCTTGGCTCAAATCTCAAATCAAGGGACCTGCTGAGAAAACTGACCTA
GCTTTTTTGAAACACGAAACAGGTTAATTTGTATTGTGGTTTCCTCTTAT
TTAATTTGACTTTTATAAAGTCAGGTCCATTTAGTTGTGATAAACAGGGA
TTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTTTCTGTTTACCCAGCATTGCCCTTTTCAA
ATACCTATCAATGCTTTTAAAAGCACGTTGAGGCTGATTTTATCAGTTAG
GAATGCAGCATTTGCTGAAATTGTTGAATTGATCCCCCATTACACAGATA
CAGTTATTTTGATGTCTTTCCTTCCTGGTAGTCTTTTCAGGCTTTATTTA
TACTCTTTGGGTCCAAACTGATTTGGGGAAATTCAAGTGTCAGGCCATCA
TGATATTGGCCCTGGAAGATTTTGTGCTTTAATTAAATTGTAAGACTGTT
TTTACTGTTTTTGTTCTGATGTTTTTATATAATAACACTTATTTCTTCTC
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TCATACTATTGATTTTATACACTAGATCATTATCTGGTATTTTCAAAACA
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GAAAATTGTAATGAAATTGTTGCCGCTAAATCAAAAACAGCTGAAACCTA
CATTGCTGTCATGTGGGCTCTTGGCCAACCTGTAGGCACACTTGAAAATC
GACTATCTGGTACTTTGTTTTATCACCTTCTATTTATTCTTTAAAGATAT
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GGACCAAATATTATTCAGGTTTTGATATTATCGATTATGTGTCTTTAACA
AAGCTAGTTTGGTTGAAATGAAAAAAGCTTCCTTTGCTCCTCAATTGCAA
ATGAGAAAGATACATTTTGTGTAATGCTCGTTTTCTTAGTTGAAATATGA
TTTTACCATAATTTTGTTCTCTATAGTCTGGTGGTCGTCTATGTTTGCTG
TGTTAGACAAGAAGAGACATGCTGTGGCGGCTGTCCACTATTTGAAAGAA
ATACTAAGGTATTCCATGTACTTGTTTTTTGTTAAGATTATTCATTTCAA
ATAAGTGGTCAAGTGNAATGTTCTTGTTTTTTGTTAAGATTATTCATTTC
AAATAAGTGGTCAAGTGCCTGAAATCAATGTAAAAAAAAAATTTGACGAT
GTTTGTTACACTTATTTGACTATTATTAATAAGCTACTAGAAATTCTGTC
CTTTGAGGATTTAAGGTAAAGAATTGGAATTTTTAGACAACGACTTTTAG
ACAACCTAATTTTATGAAAACAGTAGTAAAAATATTACCTTTACATCGTG
TTTTTTTTACATATTGGTTATATTTCGCAAGGCTAGCTTAACGTTAACTA
AAATGTCAACCAAATTGATTTTTTTAGCGAACTGGAAGATAAACCTATAC
AAAAACCAATGTTAGATACAGAATCGTTTCTTCAATTATATAATGTTATC
TTTGGCAAGTCACCTTTACAACACACATCAAGGTAAACTCTATATTCGTT
TTGAAGTTGACTAAAGAATTCCCTTTTTATCAAAAAGTTGATTCTTTTAA
AATCTGATTGTTTAACTTATGATATCTTTTCCCTGCAAATTTGTACATAA
CACTGCTTAACCTTATTTTTATTGTCCATGGACAGTGGGAGACTAATTTA
TGTATATGCGTCCTTTGCAGGACGTTCCACAATTGGTCATCCTTTTTAAA
CTAGTTAAACATCTCTCGACATCTTATACACCTTTTCGATCGTAGTCTCC
AATTGTGCGGTGCGGGCATTTTTTTGTCCGTTTTTACCACCTTAAAACCG
TCCCAATGTTTTTTTTCGCACCTATAGACAATAGAAAAAGGTGTAAAGAA
GGATTGGATCGAGTTTAGGGGGGGGGGTAATTAAATGATAAAGTGGCAAG
CGCGACTATGGTCGAAAAGGTGTATTAGTTATCGCTCAAGTAACTTTTGT
GTTCTTTTCCAATTTAGTTTGATTGACGAGTTGAAACCATTTGCTTCTTT
GATGAAGGTGAGTTGGTTTATCACATTTCAAGACTTTCGTGAAGTCTTAA
TTACCTTAGTTACCTCTTCATGTTTCAAAGTGGATGTCCTGGGTAAGAAC
CTGGTAGTATTGATTATTACCCACATACATTTTAATTCAATGACTGCCAG
AACATATAAATCGAACGGAATTGACTGAATGATTTATTTTTATTTATTTT
ACATATATATCTGTCTTCAATTTATACAAATTATTTTTCCGCCTAAACTT
AACCTTTCCACCCCGCTGTTTTTTATATTTTTACGCTGTCCCCCGCAACA
TTTTTTGACAAAATGGATATGTTCGGTTATTTTGTCATAACTCAAGAACT
AGAAATCTTTTGATAAAAAATTAGCTATCCCTGAAAAGCTAATTAAATTC
CGCAGCTTTTAGGTTGGGTATCAATCCAAATAAAATACTCTAGCTAAAAT
GGTAGCTCCACATTTACCAAAGTTTTTTTTTTTTGAGACAACTCACTTCT
CTAAAATTTCTCTCTGAATTTCTTTTTACATTCTTTCAGAGGATGCTATT
AGCCGATAAACCTTGCAAAGAAAGGAAGAACATTTTCATGCAACTTCTTG
ATGAACTTAAAAATATGGAAGAAGGACGAGAGAGAAATATGGTAAGATTG
TATTCCTTTTTTCACCCTCTTTGCCAAAGAAAACAAAGTATCCAATCTGG
CAGCAANTATGGTAAGATTGTATTCCTTTTTCACCCTCTTTGCCAAAGAA
AACAAAGTATCCAATCTGGCAGCAATGAAATTATAACCTGGTAGCCTTTC
TTTCTTCAACTTTCATCGGGCTGACAGCAAATTTATACCCAGTCTTTTTT
TTTTCCATTGAAAAACAAACAAAAAATCATGAAGAAGAAAGTGAGGGATT
TATTTCAAAACTTGGACGTATTTTACGATTTGTGGATTGTTAATAATTTT
ATTGTTTAGTGTTTTCACTTGACTAGTATTTTGTGATCAAATTATGAACC
CATTTTCCTTTTCTATTTCAAAATTCAACCAAAAAATAAACTTTTCGTGA
ATCAAAATTCTGCACCAGACATTATATGTAAGGCGAAAATAAAAAATGTA
GTGTTTCTGAAGTGCGGGTGAAGGAAAAAAGCTCTCATGAAGCCGGCNAA
CCAAAAAATGAACTTTTCGTGAATCAAAATTCTGCACCAGACATTATATG
TAAGGCGAAAATAAAAAATGTAGTGTTTCTGAAGTGCGGGTGAAGGAAAA
AAGCTCTCATGAAGCCGGCCGGAAAAAAAACATTTTTTTGCTACTTTTGA
TAACTTACTCATTGAAATAGAGCTTTGAAGATAACTTTTGTGTACAACCA
GTATGAAGTAAGCCCTGAATACTAATGTATCAACTACTAACGAACAAAAC
TTGATTTACAAGCGGTCAAAGACGTTTGATAGCTGGAACGGTCAACTTAA
TTTTCTTTATGATGAACCATACGATGAACCCATAGTCTGCGGCCAGGTCA
GAAAAAAAAATATTTTCACCCGGCCGGTTTCCGGAAACACTACATTTTTT
ATTGTCGCCTAATCGTGAAATAAATGAAATTAGATACCGGGTGCGCTACA
AAAAAGTTTCTCTTTAAAACAAATTTTCCCGAAATCTAAAAATTAAAAAA
AAAAAAATTCTATTTCATTGGAAAGAAGAAAGATAAACTTAAATTTTGAT
GGTGGGTCATTTATTATATTCGGTTCATTAGATCGAAAGTTATGCACTAT
TGAATAAAAAAGTCGCTTTCTGAAAGTGCTAAAAAACGTTAAAAAATCGA
CCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATTATTACATGATGCATAAGTAATTT
CGTTTCAGTCATTAAAAATAATAATTAGCTGTGTAAATGACCATTTGTTG
TATAAAGGAAGATTGAATTTTCAATAAAAGGCAGAAAATTCGTCGAAAAA
AGCCAAAAAATCTGGTAAAAATCATAAAAATACATCAAATATAAGTTTCG
AAGTACATCCAGCCTTACATAGACTTTATCCAGTCTAGAGCCAAAAATCT
GGAGGAAAATTTCGTTCAAAGTAAATTGAAATGATTTTGATGAACGTTTC
AAACCCTTTCGTTCCATCAGTTTCATAATTTATGTGTTTAATTACTGAAA
AATGGTCTCAATCATGCCTCTTGCAATTGCCAATTTTAGAATTAAAATTT
GATAGGTCAATTTTTATCGTTTTCGGGCACTTTCTGAAAGTAACTTTTTT
ATTCGATTGAGCATAACTTTTGATCTAATGAATCGAATTTAATAAATGAC
CCATAAAAATTTAAGTTTATCTATCTTCTTTCTGATGGAATAGGAATGGT
TGTTTCTTAATTCTTAGATTTCGAGAAAATTAGTTTCAAAGAGAGAAACT
CTTTTGTGGCGCACCCGGTAGAAAGTCAATTGGCGCGCAAGAAGCATGAA
AAGAAGGTCGATTCAAACAAAGAAAGTGTAAAAAATTACTAAGCATCGTT
CATTTTAACCCAACTTCCATTAACACATATTTTATTGGGTTTCAAGTTTG
AATAAAAAGATTCTAAATGGATTTTTGGTTTATTGGAACATCTCATTTCC
ATGCCCAAGAACATGCATTTTTTCAGTGGAAAAATATCCGCGATTCTCAA
TTCATGGTACCCTTCAGAAGGATCAATGAGCATTCCATCTCTTAAAGTGT
AATCATAGATATCGACATGCGTTCCAAATCTCATGAGACGACCCAAAGGT
TCTATAAAACTACATTGGTCTTTATGACTGATTGTTTTTTGTCCATTGCA
TAAGTACCGACCACGCCCTTCATATGGTTGTTGCCAATCACGCTGCAGAT
ATAAATGATATTTACCATCATGGTTGTTGAAGTTCATATTCTTTTCCTGG
ATTCTATCCAATTTCCAATGGTCTTTAGCACTAATCAAAACATCTAAATC
AGCATCTAGCGGTACTAGATCTCCTGTCCGCCAAGCGCCCAGTAACGTTC
CACATGTTAGCGAATAAGTGATGTTGTTCTTCTTAGCTATGCTGTCCCAT
CTCTGTAATATATTTTTCAATTTCCAACGGTATTTATTCTTAGGACAAGT
GTTATCTCCGTAATAAGAGTAGTTTTGGGACTCAAAAGTGTTTATCCACT
CATCAACTTTTAGGGAGGGAACCACATAGTTTTGAAGTAGTAAATCTTTG
TATTGGTGCTCTAAAAATTCTTTTGATAAAAGTCTACGTGCCAACGTCCT
GGGCTCTAAGATTTGTTGAAAGTCTACTGATGATATAAAGTAAATAGCTA
ATGCTCCGATGATTAAAATACAAGTTATTCTCTTGATAGTTCCCATTCGA
AATCTTGTTTTGGAAATTTTTCACCTAGAGACAAACGAAATATGTATTAT
GATAAATATGTATTTTGACATTTTTTCAAAATCAAGAATTTAAACTAAAA
ACAAACTATAAGAAAGTGTTCTAATCTCAACTCAACACATAACAATCAAA
AACCTTTTTGAACACTTAACTTTTGTTTGTAGCCCACAAAATAATAATAA
TTATTACTATGTTGAATTTCAAGTCACCACCAAAAGGAATTAAAGGCTAA
GACAATCTCACTCTTACTCAATCTTTATATACTATAACACAATATTCTGA
TGCGGCTTTTGAAAACTTTTGCTAACTCACGATTTTGTTTTGTTTGATCC
GAGATCTGTTTGTTCACTTGTTTTTCAGTGGTTGCTACGCTGAAACAAAA
TCTTCATAATTGAGCATGATTTTTGACAGAGACGCTTTCCACGCAGTACA
TATTGTGTAGAGGGGTTGAAGATCGTACACAAATTTCTAGGTCTCACTAC
TATTCATTCGAGAACCAACCTCGCCTGAAAGCTGACTAGCCTAGTAGTAG
TACAATAAGAAATTCAACTTGTTGTTCGAGCTCTTTAGAAGCAAAATGAA
AAATTAGCATAACAGAATGGAAAATTGAAACTAAGAAGCCGTAGAGAATA
CCGTGATCGCTCCTTTGAAAGATCTCCAAAAGTTTCACCTAATTTTTCAC
CCCTACTCTCAAAGTCAAAATTTAAAGTGTTCACCTAGCATTCTTTGGCT
CGAAAATCCGAACCCCTCTGCAAAATGGGGAAAATGCACAAACTAGACTA
TGTACCATGCTTTCTGTTCAAAACTTCCTGAAGTTTACCATTCTCGCCCC
TCCATTCAATGACTTACCGATCTCTCTTTTTATCTCTGGTTGATCACAGA
ATTTGATTGTTTTAAAAAATTTAAATTTTCAAAAATTTGACTCAGACTTA
AAGTAAGAACAGCGCCGAAAAACGGATTTCAGTAGTCAAGAATAATCACA
AAAACCACCATAACCTTGCATGGAATAATGACCCTTGAATGTTTATCCCT
TACTTGATCTCTTCTATCCCTTCAGATTTGCGATGTATTGAGTGATTGTT
TGGTGTCCAACCCAGATCTCTTGGAATGGTGGAGTGAAAACATCTTGGCT
TATCTCCGACAATCAAGGTACATTCTCGAATCCCAGAGTTTTCAATCATT
CTTTTTTGAAATTAATGAGTTATTTTACAGATATCATTTAACCTTCTTTC
ATTAAAATTTTTAATTTAAATTCAAATACAGAAAACTGCTGCTATTAACT
GTAAAATAAAATTATGAGTACCTCTGAATAGTATAATGTTAGCGGTTCTA
ACGTAATCAAACTAAATCTAAACCATGCATTTCAGAAAATACTTTGAACA
AACTACTCGAGAATTTTTGTAAAACAGGTTGCCTTTTCTTTTTTTCTTAT
CTTAGTGTTTTGCTGAAATATATCGAAGAAACAGATGTGGCTGAAAGGGT
AAGAACGAAAAAAAGTTAAATATTTCTGTATGTATCAGTATATATAGTTC
ATTTGAAACACATGTTCTGTTTGATTCGGTCTTGACTAGTCTTGACTTGA
TTCGTTTGGACCGAGAAATAGCCTAAAGGATATTCAAGTTTTTATATGTC
AAAAAAGATGTCAACTCTCTTTGTATCTTATTGTCAGGGAGGGTCCTTTT
GCAACTTGTGACCTGGAAAAGGTCCATAAGCGTTTTATGGCCCTCCACCG
CTTAATGACTTTTCGCTGTTTGTCTAAAAAGTAAAAAGGGGAAAAAAGAC
CATCATTTTTCCAATCACAAAATCTTCGAGTTAGCAGGGGATTGGGTGAA
AGTTTATCAGAGTCGAATGACGTTATGGTGTCTGAAAACATTGTATTTAC
GTGATACAGATATTGTTCGATCCTGGTAAATAAGCCAATACCTTCATGTT
GCTAGGCTACTAAGTGTTTGATTCTTTTAAGCTGAATTCAGAGATTCAAT
TTATACAGTGGAGTCCCCATAACTCGAACAAGGATGGGGAACACAAATTT
GTTCGTGTTTTTAAGGTAAACTGGTTTATAAGGCATTGTTAACTAAGGGA
CCATAAAACTTGTTCGAGTTAAGAAGACATTCGAGTTATAGAGATTCGAG
TTATAGAGATTCGAGTTAAAGAGATTCGAGTTAAAGAGACTCTACTTAAT
TTATATTTTCTAGATGAGAAAAGGCCGCCGTCACAAAACATCAAGACCCA
TGGTCACTGCTGCACAAACTATGATCGGTAAAATGTTAAAAGTGAAAGAT
CGCTCACGTTTCGATAAAAAGGTGAGTAATTAAATCGCTGAAACTAGTAT
GCTGAATTAGTCCGAAAAAGGCCATCATTTCCGCTAATTCGCATTCTCTT
GGCTCTTGTTTATCATATATTGAAATTGCTGACAATTTTTCGGAAAATAC
CTCATTTCGGAGGTCGTTTTTTTAGCATCTATTCAAAATTAGGTTCCTGC
CATTTTCAGTGTACGTTTCTATTCTAAAGTTTTTGATATGCTTACTTTTC
ATTTTTAGCCTGGTTTCCGTGAATGCCGCAAAATTTGTAACGTAAGCTAG
CTCATTTTCTTTCGTACGATCTTTCTAGAGTAGATTCTCTTAACATGTGA
TTTTTCTAGTGATGAGGGCGAAAAAGTGCCTACTTCGCAACATTAAAAAA
GAACGACAAATTTCAAAAATAACGACAAATTTCGCCAACCACAACCCCGA
CCGAAAGTGACCGTATCACCCCTTCGTATTCATTCCTCTTTGTGTTTTGC
GTATAATAACTACTAAAAGTTTATAAAATGAAAATATACGCATGTGTTTT
TACTTTGTTTTGAAAATGAAACAATAGATGCAAAGTAGACACTTTCTCTA
TGTGTAATGGCTAGTGTCAGAAATCGTTAACTTCGATAAAATCTTAAGAA
ATTATTACCTCTTAAAATCCAAATTGAAATTAATTCGCTTAGACCCGAGT
CGTTTAAAATAAGCGTTATATAGTAACACCGTTATATATTATAATTGCCA
TGGGTTAATGATTATTAGGTGGTATAATTCATACCATGCTAATGCCCTTC
AGATTCTTCATCAGTTGTTTAACCATTATATACCAATCTTCTCAACAGTA
TTTCATCAATGAAGAGATGGAACGTCGTCAACAAACATCTTCCGTCTGGA
AACTTTTGAAATACTTCTTCATTTTCACCACCATCTTCGTCGCTGTTGAT
CTTTACACCAATAAAGGATATCCAGGTAACGCAACTAAAACATGATAAAG
ACTAAAGGATTTATTAAAGATTTGCGTGATTGCGTGAATTGAAGGTCCGC
TGGGAGGGCCTCATTGGAGGTTTATTCGACTTGTTACGCCAAATTTATAT
GACAAAATAAGAATAGTTTAATCATTTAGGACAATACTATAATAATATCT
GAGTAAATTATTCAGCCAAACAACTAGATTGTCATTTTTCAATATTTCAA
TTCTCCATCCCATCCAAATGGTCTATTTTTGTGACTTTTATAGGAAGTCG
AACCAATGTATTTTTAAAGAAATATGGACTTGAAGAAAGACTAATGACTG
GTTATAATTTTGCTGATCAGAAGAGAATGCAAGCCCAAAGGTAAATCCTT
TTCTCCTTTTTCGTGACATCTAGGAATCCCTTTGTGCAGCCCAATTTCTT
CTACATTTTTACGTTATTTTTTGAGTTGTGAAACCAAGGACTCGGGACCA
TTAACTCTAAAATCTTACAAACCGTGATAAGTCGTTGACTTCATATATTC
TTTGACAGTTTCTTTTTTCAAAGTGAAACCAGAATTTGAACCGAATATTA
GTTTAAAAATAAATAAAGTACAAATATCGTAATTCTTTATAGCTTCATCA
CTACAAATGCACCGATTTATTACGCCAAAGTTTCTCCCTATGTTGACCCT
GTAATGGAAAAGACTGGTTACTACACTCGAATCACGTGCGAAGCCATCTA
TAAACACAGCAAACCTGTACGCGACTTTGCTAATACTCGTATCCCACCAC
TGCTCGAAAAGGTTTGTGCGGAATGGTTTGTGGCGGATTTCGTCCGTCGA
GAATCATTGTTTTGTGTACCGATTATCATTTAAAATACAGCTTTTTTGTA
ATCTCGAGCAACTTTCTGGTGCAATTCTTTTTACTTATATTATTCTGGTT
TTTCATAAATGCTTGCAACGATAATCAGTTGACTTTTACTTTTACTTATT
ACTGATTAACTCTGTTCTCCCCGTAACTCAGCTGAATGGTTTTTCTTATT
TCTACCTTGCTCTTCTCTATTCTTCTTTTTGACAGTCAACCGTCAACCAT
CTTGATTTCTCCTTACATTCGAATGATCATAATGTGTGGTTGAAACAACT
TAATGTATATTTATTCATTTTAGATCACGTATTTCTTGAAACGTCAATAC
GACATTATTTCATCTTACATATTGGGTCTGTACCAAACCTACGCACCAAT
TGTCCAAGAAAATGTCACCCANATTGAAACAACTTTATGTATATTTATTC
ATTTTAGATCACGTATTTCTTGAAACGTCAATACGACATTATTTCATCTT
ACATATTGGGTCTGTACCAAACCTACGCACCAATTGTCCAAGAAAATGTC
ACCCAATTCTACAACTGGTTACAAGTCTCCATCCCCAAAGCTTACAAGTT
TATCTTGACAAATCTCATGGAACTCAAGAAGACCATCTACAATTTAAACC
CTGCCATGTTCGATAAAGCTGCAATCGTTTTGAATGATGCAATCGATTAC
GTCATCAAAATGGTACCCATCGTTGTGGAGAGATGTATGGCCACTTTGAA
TCTGGTGTTGGAATACATTCGAACTTATTTCGCTCAAGGACAAGGATGGA
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CAGTAGATCTTGAAGAATAAAAGATGTATTGTTAGCATTTTGAAAGTAAA
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GATTTTGAAAGTGAGAGATTCTAATCATGAATAAGGTTTTGTAAGATTAA
CCTAACATAGTTGCCATTATTTTAGCGCGTATTGTTGAGGGAATTAAATA
ATGAGTTAACTCTTGTTAATTCAAATTCGAATGGGGAATTTGATTTGTTC
GATTTACAGGGAGATTCGAAACAAGTTCGAATTATGGAAAGATTAGAAAA
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AAGAGAGTTGACGACTCTTGACAGCTGACAATACCTCACAGGATAACATT
GGCAAAAGTAAACTTAACCCCCATTTAAACGGGAACAAATTAAAAATTGT
GACTTTCGACGATACGCGTGGAAAATTAGAGGGGCTGAGAATTTGAAATA
TTTTAAAGTTCTATTGTTTACAAAGGTAAAAATTAGATGAAAGTTAATCG
TTTTGAATTATTTGTATTAATAAATAGAGAATTTTCAAGTATAATTATTG
CTGACTTTTTTAATTTTTTTTGACTCGCTTCAACTATAATAGTGCGCACG
CATTAATTGGGCGCTCTATGGTCCTTCAAATATAGTAGATCAAGAGGTTT
AAAAACGACTTAAAATTAGCGTTTTTTTCTTTGGTAGTTCAAAAGAAGCC
AAGAAAACGTAAAGTTTGGCCTCCCATCCTTCCTGCGACGGTTTTGGGAA
AATGTAAGATGTTCTTTTATTCTAGTTCTTAGATATTTAGACGTAGTACA
TTAGAATATTTCAAAGAGTAAGGGGTGTTTTGTTAAAAAATGACGTAAAA
GATTATTGTTTTCTTTTTAGGGTTTCTCCTGCAGCGAAGTGAATGGTTCA
AATTGATGAAGTTTTTTAATGAATTTGATTATTCCCACATGGCATCGGCA
CCACATTGAGAAGGGATAACTTTTTAAAAATAGTTCATGTTTTTTTTTAA
TAACAATAGAGCGCACGTATTTCTAGGCGGTTTTAGGGGTTTAAAAATGT
AGAATTTTCTATGGCATTGAAATTTTGCTCGAAAATTTGTTCAAAATTTT
ACCTTAAAATACTAATAATTATTGAATCTTAAAATTTTTTGATATTTATA
AATTTTTGAAGCTGTGAAAAAAAAAGATATTTTTCAAAATAATTTGAAAT
ATTTTTCGATT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_001015	XLOC_001015	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000012	supercontig	sc0000012:1027087..1045747 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.794278	0	0.299774	0.586564	0	0	0	0	0.0648809	0	0.10066	0.0783341	0	0	0.150339	0.161337	0.0621737	0	0	0	0	0.109827	0.910703	0	0	0	0.726075	0	0	0.109053

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00001971 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TM214 (Transmembrane protein 214 OS=Homo sapiens GN=TMEM214 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 84.7297 bits (208), Expect = 1.140e-16
Identity = 117/548 (21.35%), Postives = 225/548 (41.06%), Query Frame = 3

Query:  378 LQLEKTAYEAGFRN--DDDSDKENYPSRIPFEQNEQKQSPRNVTRRKDKPKPKPAQTVNLGEFIKKVDIDGLKLTIQSIQEKFNNHPLIWLKEVAAWLKSQIKGPAEKTDLAFLKHETDFPVSELDKAVHKLLEDLMKKCDKKNLATFYISLIAGMVTDIQQ--GNSTLADRIMIQLLCQLEPTVIKENCN---EIVAAKSKTAETYIAVMWALGQP-VGTLENRLSVWWSSMFAVLDKKRHAVAAVHYLKEILSELEDKPIQKPMLDTESFLQLYNVIFGKSPLQH-TSSLIDELKPFASLMKRMLLADKPCKERKNIFMQLLDELKNMEEGRERNMICDVLSDCLVSNPDLLEWWSENILAYLRQSSVLLKYIEETDVAERMRKGRRHKTSRPMVTAAQTMIGKMLKVKDRSRFDKKPGFRECRKICNYFINEEMERRQQTSSVW-KLLKYFFIFTTIFVAVDLYTNKGYPGSRTNVFLKKYGL----EERLMTGYNFADQKRMQAQSFITTNAPIYYAKVSPYVDPVMEKTGYYTRITCEAIYKH 1979
            +Q   T YE GF N     + ++  P  +  ++   K+ P+ V    ++ + K  +  +L E +K +D+  L+  +   Q  F+ +P IWLK++A++L  +++ P  +  L+  +H  D+P S + + +  ++  L+ K    +L  F+   +  M+ ++ +  G S    RI IQ + Q +P +   N     E++ +        + +MWALGQ     L   L VW   M  VL  K  +  A+ YL  +L    +      M+  + F  L +  F   P    T SL ++L      +K +    KP       F   L           +  +   L++CL  +P     W +    +L QSS+           E++ K    K  + +    Q+     LK+ ++    K     +    C+      +++ Q     W +LL    +F   F+  DL ++  +  S T   L+  G     ++     Y+++    +Q  S++    P++ + +   V P ++    +T  T   +  H
Sbjct:   53 IQTTSTLYERGFENIMKRQNKEQVPPPAVEPKKPGNKKQPKKVATPPNQNQ-KQGRFRSLEEALKALDVADLQKELDKSQSVFSGNPSIWLKDLASYLNYKLQAPLSEPTLS--QHTHDYPYSLVSRELRGIIRGLLAKA-AGSLELFFDHCLFTMLQELDKTPGESLHGYRICIQAILQDKPKIATANLGKFLELLRSHQSRPAKCLTIMWALGQAGFANLTEGLKVWLGIMLPVLGIKSLSPFAITYLDRLLLMHPNLTKGFGMIGPKDFFPLLD--FAYMPNNSLTPSLQEQLCQLYPRLKVLAFGAKPDSTLHTYFPSFLSRATPSCPPEMKKELLSSLTECLTVDPLSASVWRQLYPKHLSQSSL--LLEHLLSSWEQIPK----KVQKSLQETIQS-----LKLTNQELLRKGSSNNQDVVTCDMACKGLLQQVQGPRLPWTRLLLLLLVFAVGFLCHDLRSHSSFQASLTGRLLRSSGFLPASQQACAKLYSYS----LQGYSWLGETLPLWGSHLLTVVRPSLQLAWAHTNATVSFLSAH 579

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001971 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001971 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TM214	1.140e-16	21.35	Transmembrane protein 214 OS=Homo sapiens GN=TMEM2...	[more]

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TCONS_00001971 (transcript) - C. hemisphaerica