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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001966 ID=TCONS_00001966|Name=TCONS_00001966|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2376bp
GGTCGTTTGATTCGCCGTTCGCTtctttcgattgacatcgtctggaatta
actacacctttttttttaaacaatcaatcaaattttatgtaaaaaagaaa
agaaatatcaagaaaaattttaacaaggacgaaaataaaaaacattgatG
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TTAACCCTAAATTTGTCAGAGAAAAGACTTTTTTTGATGGTTTTCGCTgc
caaaaattgatttatttatgTTTCAAATCTACCATTTTGGATTACCTAAT
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GGCGGTCATAACTTGCAACCATTTTGTGCATATCATTcgatccactgacc
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TCATTGGTTAAAGCAGGTTACCAGTTACACTCCCATCCCACAAAGACATA
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aatattaaaggCAATACGAGCCAGTACATTTGTAAGGTTTCTAAAACACT
CCATGTCAGGataaacaTAATGCCACTTGGAGATGTGCGTTTGAATCCTG
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TTTTCATACTGGTTTAGTTTATGGTAAAGAACTTGGTAAGGAAATTGGAT
TTTATAAAGGATTTGTGTCTTGTTATTGTGAACTTTTAACTGAACAAACT
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CAAAAATCAGAACCAAATTCAAACAATTGTCATCAATCCTTAAAGTGCCT
GTCAATGTCAATAAAGATCCAGCTTTGTTGAGTTTTTGAAGATAAATTGG
CAAAGAAAGGTATATACTTCTATACTTTGgataaattttgcaaattttca
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TTAACAGTCTAACAGTATAAAAAGTTTTAACCATACAATGAGTGTATCAG
AATCAGTTAATTGCACAAGACTAAACTTGTGTAAATTAATCATTATCTTT
TACTTGTATGCACAATTACAAGTTGATGTTTCTGTATCGTTGCTCTGCTA
ACAATTATGAAAATTGTATGGTAACAGTAGCATACCATAGTTTTTGATTG
GTTTATATCATAAGCTCATGTGGTTCATGCTGTCTGTGGCCTGTTTGTTG
CCTTAATTTGTCattacaaaaattttgttttgtttataaaagaGGGAACT
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ATCTTGAATTAGTTGGTATTTGCCTTGGCTTTGTCCCTTTTGTCTTTCCC
TCCATTGTCACTTTGAAGTCATTCAGGTGGTGCATGTCAGTGAAAATCTT
TTCAAGTTGAGGTGCCACCTGACCTGGCAGTTTTCTCCCCAAGGTAACAA
ACCAATGGAACCGACTAAGTGAATATATCCATCAAGGATTTATTTTATTC
TGTCCACACAAACCACCTGGCAGGTTTTTACAATAGATAATTAGATCTTC
TAATTAAGATCCTGTTCTGCGGTGAGATTTTGAATATCCTTGTTCTTTGT
ATACTAGTCACTTTTTTTTGTACCATCGCTCTGCTAATAATCCCTTTGTG
GAAATTGTCTTCTTTGTTCCATTTAGACTGAAaggcttttttgaaaatat
gccTATACACCATAGTTGTCATTGGTTTCTTTCTATTACTTATGTGTAAC
TAAGATATTGTTAATGCTGGGTAATGGCCTATTCGTTGCCACAAATTTAT
ATAAGTTGCCATTTCGAGAAATAAAATTGCTACACGGTGTTTTTATACTG
GCGCAATCATCAGCAAAGTGAATTCTACAATCTCaaactaagaaaaaaaa
atatatttgaatttatcataacaata Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000012:978516..987805- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001966 ID=TCONS_00001966|Name=TCONS_00001966|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9290bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:978516..987805- (Clytia hemisphaerica)
GGTCGTTTGATTCGCCGTTCGCTTCTTTCGATTGACATCGTCTGGAATTA
ACTACACCTTTTTTTTTAAACAATCAATCAAATTTTATGTAAAAAAGAAA
AGAAATATCAAGAAAAATTTTAACAAGGACGAAAATAAAAAACATTGATG
ACTAATACCTGGTTGCTGTTGGAAGTGTCCATACATCTTGAAGAGCTTGA
TTAACCCTAAATTTGTCAGAGAAAAGACTTTTTTTGATGGTTTTCGCTGC
CAAAAATTGATTTATTTATGTTTCAAATCTACCATTTTGGATTACCTAAT
GTTTGTTAAACGCCGTAAATATGATAGGCGGCCGCACGCCCCACGCGCCG
GGCGGTCATAACTTGCAACCATTTTGTGCATATCATTCGATCCACTGACC
TTTATATAATAAGGTTATAAAAGGTCAGTGATTCGATCACACGTGGTGGT
TCATTGGTTAAAGCAGGTTACCAGTTACACTCCCATCCCACAAAGACATA
TGTACATGACATATACATAACAACATAATATATATTCAGCATATAAGAAA
AATATTAAAGGCAATACGAGCCAGTACATTTGTAAGGTTTCTAAAACACT
CCATGTCAGGGTAAGCAGTTCAATTTGATTTTTATACTTTTCCCTTGGTT
CCTTCCTTTCTTTCTACTGTACTGTCTGATGACGACAGCGATAGCAGAGT
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ATACATTCAACATACCTGATTGTAAAGGATTCTTCTTTGCGGCTCATTTT
ATTACTTACAATCAGATTCTATATTTTCTCTCGCAATCAACCAAAACAAC
AATACACCTTTCCTGTAATTTGTAAAACTAATGCATGCGAATTATTTTGA
TGCTCTCTATCCTTTGGTCTCTGGAGGTAAACAAACCCGTCTTTGCCTGT
GCCTGCTGCGTTCTTAGGGAAAGTTGCAGTTGGTTTTTGAGCTTTTCTTA
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TGATATTATACCACTCTATCAGAATTAGACCAGGGTTATCGGCGTTAGGC
CAACCAAAATTTTGAAATATTTAGGGGAGCCATCCAAACCTGCCACCAAA
AACTAACTTTGATACACCTTTCCCGTAATTCGTAAAACAGATGCGCGCGC
ATTATTTTGATGCTCTCCACAGTTTGGTCTCTGGAAGTAAACAAACCCGT
TTTTGCCTGCGCTTCCTTTTAGGGAAAGTTTTTTTTTTTTTAGCTTTTCT
CAAGTTCTGTCAAACAAAGTCCCCTCAAATTTTAGTATGTTCAATCTATT
CATGGTATTATACCACCCTGGAAATCTTTTGCCAAAAGAAGATCGCTATT
AAAAGTTAAAAGCTGAAAACCCACTTTCCCTAAGGCAATGGCATGGGAAT
TTGATGTTCTGTTTACCGTCGCATTGTAAAAAATATTTGATGCGGCAAAA
TTTCATTATTCATTATTCATTATTCCTACCTGGTGCTTCCCATCTCCAAC
GAAGTTGAATTTCACGATTCCACCGTGAAATCGAGCTGCTTTCACTTTCG
GAATCAAAATGACATGACAAGACGCATCTAAAACGCGAATTTTTAAAACG
CCCTTGTAGCCGCCCACTGCTTAATAAAATGCCTGTCCCATTTGCGGACG
TGATTGGAACCATGTCTTTTACTCGAGGCGTACATTTTGTTAGCGAAGAT
GTTATTTTTGATTCACGTTGAGTGTTTTGGATAGCTTGGCACAGGAAAAT
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CAAGAGCATGCGGGCGGTCAACGGTAAACAGAACATCAAATTCCCATTGC
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TACACAACGGTGGAGCGCACATTTTTCCAGGCCATTTCTGAGAAGTTTGA
ATCACGGGGAAGGTGTAATGGTTGTTTGTGGATATGGGTGTAGGTTGTTG
ATGCTACTCGTGGATGTTTACTCATGGCAAAGAAAATTTTACCAGAAATA
CCGTCAAAAGTAGTTTAATTCTCGTGTGGACAAATTTTTGCAAATCAACC
TCAGTTTCACCAAATTTCTTACATTTTCCTAAAGGTTTTGGCCAAAATTT
GGATGATAAATTTCATGAGGACTAATTTTTCACGAAAATGGCCAAAAATC
TCAAAGATTTAAAATTCAAGCAAAATTTAATCCAGTTATGGCCAGACGAT
CTCAATCGAACGGAATCAACGATCGAACGCAATCGACTGATTGAATTTCG
ATTGTCGAATGCAATTGAATCTCAATCGAATGTCAAAATTCTGGGTAATA
TTCAATTGGTTCGATTGTTGTTCGACTGGTTCGATCGTCGATTCCGTTCA
ATTGAGATCGTCTGGCTTTATTCTTGCAGCTTCCCAACATTCGATTGAGA
TTCGATTGCGTTCGACAATCGTATTTCAATCGGTCGATTGCGTTCAATTT
GGTTCGATTGGTTTGATCGTCGATCGTCTGGTTATGGTATCAATATTAGA
CAAGTTAATTCCATGCCAATTGTTACTTTGTCATGTATTTTATTTCTTTG
ACTGCTTTGAAAACCAAAATAAACAGCCCCAATGCTGAAGTCTTGGGTTT
TTTGTTTTCCGGCTTACACGCACGGCCCTCAAATTTTAGCATAGGGATGA
TAAAGTTTCTTAGGGGGAGGCAGCTTGGAGACTTCAAAAATTGTTGGGAT
GGGGGGTCATGCAGTTGGTTCCAGACATCATGACGGTTAGTACCGTGGTA
CTGTAGGTCATATTTGATTTTTGGAATTTGCGGTTAGTACCTTGTGGGTA
CACTTGGCTAAAATTGGTTCACGTGCACGACTTTGTAAAAATTTTGCATG
CTTCACATGCATTGTCTTTGTTACGTTAGTGATTCGTCGCTCTCCTACTT
ATTTCTTCCTTGAAAGCTTGCATGTCAAAGATTGCTTGTTTCAAAATTAT
GTGCAGTTGGGTGTCCCATCCGCAACAAAAGCTCCATTTATGCTTACAAG
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AAATGGTTTCTTGCGTTAAAGACATTTATTGCCTTTAAATAATCTTTTTT
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CAACAGGGCTCTAAATAACGGTCGCCCAAATAGCTTCATGTCCGACCCAA
AAATCATAATTTTCAAGCTAAAGCAACCCTGATCAGACATTATGTCGGAC
CCACTGGAAATCGTTATTTCGAGCCTTGCACAAAAGTCTTAATTTCTCTT
TTTTTGAGACAACTTTAATGTTCTAACTGTATCAAGCCAATGAACTAGAG
GGAACCACATGCTTTTTGCAGCAGTATCATTTTTCTTGAGATTACATGTA
CTAGCTATGAGCGAAAAAATTTTTGTCCTGTCCGCAACAAAGTGTCCCGT
CTGCAACATTTTTCTCAGGATTGGGGCTGTAACAAACAAATTCTATAACA
ATCCAAGGAAGGCTATTTAGTAGAGTTCACAAAAATGTGAAGTTCTTAGA
AATTGCATTTGCCAAAGTTGAGTTATGGGTCCTCAAAAAGTGCCGATGCG
GACGGGACATTGTACTATTTTTCTGCAATTCACCCAGTTAAATTGCCAGC
TTTCTGTTTTTATTAAGTTGTGCATTACTCACTACAATGTCTTCTTAAGC
TTTTTTCCCAGTCTTTTGTCAAAAAATGCAAAAGTGATATTTTTTATTTC
TGGGGTTTTAGACCTAAATAATGTTGGCTTGGGCAGACTTGACTTTAAAT
GTTGGGCCTTGTAGCTTTGTATCATATATGTTAGGCTTTGTGTTTATCTA
TATATTAATATATGTAGTCTGTATGTCTGTTTTCTGTGTGTCACTTGTTT
TCGCAAGCAATGTTTTTGTTCTTTTAAAAGATGACTTTGAGTTGTTCGAT
AAGTTTTTTTTGATTGATTGATTATAATTCTTGACTTGCTTTCTTTTTTT
CTCTCTTTTCTTTTGTTTTATGTTTTTGAACTTAATTAGCGACCTCTTGA
TTTATTAAGACATTTGAATTCTTTTCAAAACAAAGCAAAATCTTTTAACA
AAATCTGTTTACTTAAGTCGTTATAGAAAAAAACAAAACTAAAATAAAAC
AACAAGACAGTTTGTCAGAAGAACAGCAACTTTTTAAAAAATTTTACCGC
CAAAAACAAAGGAGTTCTTTATTCTTAACCCTATTCTACCTAGGGGGGGG
GGCTTTTTCTGTTCGGAGGTCAAATTATTGGTAATAAATAGCTCCTGAAA
TAAAAGAGCTTTTGCCATGAAATTTTCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTA
GCTTCAAAATAAAAAAAAATTTGACACCTAAAAATTTTCACACCTTGAGC
ATTTCTGACAGTAAATGTCACAAAAATTGACACTTTTCCAATACAAATTT
ATTTTTTAAACCGTAATTTAATGAATATTTAGGATAAATTAATCATTTTA
AAACTCAGGAAACTTTTTTCTAAAGCCTTTGTTAGAATACAATAGCAATT
TTCGGTCTTAGGTCACTTTGGGCATAATGAGTGACGTCATCAAAAAAAAA
TTCCGTCAAAAGTTACCTTATGCGACAAGGATCTTGTGTGCCAAATTTCA
TCCAAAAAGACCCACTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGATCAGCC
CCCCCCCCTAGTTCTGAACAGCCCCTAAAGGCCTAGGTTGAATAAGGTTA
AGAACATCCTGGAACATCTAAGAATTACGGCAAAATAATTATCGAGTCAT
TCATTGTTGAATTCGAAAAAGGTATGACAAAGGTTTAATAAAAAGCAACC
AGGACATATTTTAGAAAGGCATGGTAGCGTCCGTTGGTGACCAAAAAGGG
CACTTTTTGTAGTATTTTACTACAAAAAAGGCTGATTTTACCAAAATTTT
AGTGATTTTAGAAGGGGTAGCGTCCGATAAGCGGACACTAAAAGGGCATT
AAAAATGGTCTGGCAACATAGAATCGCACTATTACGTTATTTTGTCTGCG
TGTCTTTCTTTCCTGAACTTGTGTCGTGTCTATAATTTCACCCTCCTTTT
AAACAAATTCATTCAAAATGAAGCATAAACAAGTTGCATTTCAATCGCTA
AACTTTTTTTTAGTGGTGGGCCATTCACCTCAGAGAAACCTACCTTATTG
AAACTAATTTTTGCGGGAATTAATTTTAGCTTTTTTCGTGGTTTTTCGTC
AATCGCAAAAATTTGAGCCTGCGAATTTTTTCCAATGAAAATCCAAGGAA
AATGAAAGAAATTGTCAAAAAAAGGGCAAAACCGTGAAAATTAAAACCTG
CAAAAATTTCAGAATGAAAAAAACGCTAAATTAATTAAAACCCGCGAAAT
GCAATTTTTAGGATATTTTTTTTCAACCGTGAAAATTAGTTCCCGCGAAA
ATTAGTTCCAATAAGGTAAACAAAAGGGATGAGCTGGAGTTTTTATAAGA
TACTTCACTAATTGGTCATTTGAAGTGATAGAGATGACGCATTCTTTAGA
AAAAGTAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAACGACGAACAAAATGAAAT
AAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGTCCCAAATAAAACAATTTCTGTCAC
AACCATCACGTAACTACAATGAAAAGTTTCAAAAGTTTTCTGCAACTGTT
TCCATCTAGACAAACTGCTAATGAATTTTTTGAATCATTTTTTGTTTCTG
AAACCGATTTGTATATGTTTTCTTTTCGTTATTAACCCCACGGTCAATAG
CAACTTTTTGCGTATTTCATTTTTCAAATGTTTATATTTGATGAAAAATG
TTTCAAGTGGCCCCAGACCTTTATCTTGACATCAAAGTTTCCAAAATTAT
TGAAAACTAGGGCAAGTAGGGCTGCCTAGGGTATTAACAGGTTTTCAAAT
AGTGATTACCTTGAGCTTTGGCCGCTCAAGACCAGGTGCCAGCCTGGTAA
TAGTCAAATGTACTTAGTACTGCAGTGTACTAGGTCTAGGTGCAAAAAGG
AGTGGTGTCAACTGGTGTATGTCAACTTTGTATTTTGCTGTTGTTTTTTG
CTACAATTGGGCCTATGAATAATCTGAAGCATCTCAAGTTGAGCCCAGTG
CGTTGCGCACGTTCGACTATTTGGAACACTGAAGACAATTGAATGACAAT
TGATCCACCTAGAACTAGGTGTTTTGTGTGAATTTGATTGCTTTGACAAT
TTCAATCGGTTGACGAATTCTTTTCCAATCTAGGGTGTTTTAAATATCCC
ATCAATTCCTTTTCAAGTTAGGAAAACATTTTATAAAGTATTGAACTCCT
TCTTCTTTTTTTTTAGATAAACATAATGCCACTTGGAGATGTGCGTTTGA
ATCCTGAGGACCCCTTTGAAAAGATAGTCTTGTTGGAGCAGAGCTTACAG
CAAGAAGGATTCAACAATGGTTTTGACAGCGGTAAACAATCAGGACAGAT
TGAAGGTTTTCATACTGGTTTAGTTTATGGTAAAGAACTTGGTAAGGAAA
TTGGATTTTATAAAGGATTTGTGTCTTGTTATTGTGAACTTTTAACTGAA
CAAACTGCATCAAAGCGACAACTGAGTTTGCTGAAACAACTTTCTGGTTT
GCTTAATGAGATAGATTATGAAAATTCAGAAGATGAGGGAATGGATGATA
AGATGGCAAAAATCAGAACCAAATTCAAACAATTGTCATCAATCCTTAAA
GTGCCTGTCAATGTCAATAAAGATCCAGCTTTGTTGAGTTTTTGAAGATA
AATTGGCAAAGAAAGGTATATACTTCTATACTTTGGATAAATTTTGCAAA
TTTTCAAATATTTTAAATTCCTTGTCTATTTGTGTTTGTTTGTATGGGCA
GGTTTTGATATCATAGTTTTTTTATTCTTAACCCCTCCCCCATTCCACAT
ATTTTCATGTGCATTTAAAAATTCAAGCTCATCTCATTTAAATGGCAAAT
TTTAGTTAAATTTTGATTTTGTTGATTGAAACAAACGATGTTTTTAAAGA
TTTCNCAATAGTCAAATGTACTTAGTACTGCAGTGTACTAGGTCTAGGTG
CAAAAAGGAGTGGTGTCAACTGGTGTATATCAACTTTGTATTTTGCTGTT
GTTTTTTGCTACAATTGGGCCTATGAATAATCTGAAGCATCTCAAGTTGA
GCCCAGTGCGTTGCGCACGTTCGACTATTTGGAACACTGAAGACAATTGA
ATGACAATTGATCCACCTAGAACTAGGTGTTTTGTGTGAATTTGATTGCT
TTGACAATTTCAATCGGTTGACGAATTCTTTTCCAATCTAGGGTGTTTTA
AATATCCCATCAATTCCTTTTCAAGTTAGGAAAACATTTTATAAAGTATT
GAACTCCTTCTTCTTTTTTTTTAGATAAACATAATGCCACTTGGAGATGT
GCGTTTGAATCCTGAGGACCCCTTTGAAAAGATAGTCTTGTTGGAGCAGA
GCTTACAGCAAGAAGGATTCAACAATGGTTTTGACAGCGGTAAACAATCA
GGACAGATTGAAGGTTTTCATACTGGTTTAGTTTATGGTAAAGAACTTGG
TAAGGAAATTGGATTTTATAAAGGATTTGTGTCTTGTTATTGTGAACTTT
TAACTGAACAAACTGCATCAAAGCGACAACTGAGTTTGCTGAAACAACTT
TCTGGTTTGCTTAATGAGATAGATTATGAAAATTCAGAAGATGAGGGAAT
GGATGATAAGATGGCAAAAATCAGAACCAAATTCAAACAATTGTCATCAA
TCCTTAAAGTGCCTGTCAATGTCAATAAAGATCCAGCTTTGTTGAGTTTT
TGAAGATAAATTGGCAAAGAAAGGTATATACTTCTATACTTTGGATAAAT
TTTGCAAATTTTCAAATATTTTATATTCCTTGTCTATTTGTGTTTGTTTG
TATGGGCAGGTTTTGATATCATAGTTTTTTTATTCTTAACCCCTCCCCCA
TTCCACATATTTTCATGTGTATTTAAAAATTCAAGCTCATCTCATTTAAA
TGGCAAATTTTAGTTAAATTTTGATTTTGTTGATTGAAACAAACGATGTT
TTTAAAGATTTCCATTCATTGTAACCTTGCTCTTAGGCTATTCCTTTCTC
AAAATCTTCCATTCTTAACAGTCTAACAGTATAAAAAGTTTTAACCATAC
AATGAGTGTATCAGAATCAGTTAATTGCACAAGACTAAACTTGTGTAAAT
TAATCATTATCTTTTACTTGTATGCACAATTACAAGTTGATGTTTCTGTA
TCGTTGCTCTGCTAACAATTATGAAAATTGTATGGTAACAGTAGCATACC
ATAGTTTTTGATTGGTTTATATCATAAGCTCATGTGGTTCATGCTGTCTG
TGGCCTGTTTGTTGCCTTAATTTGTCATTACAAAAATTTTGTTTTGTTTA
TAAAAGAGGGAACTTTTTGGAAGCATTCTCCATAAAATGTTTTCTGTATG
TTTTCTGTATAGCACTTGATCGAGACTTACCTTGACTATTTACGTTGTAA
CCTAGTTTCTTGTAATCTTGAATTAGTTGGTATTTGCCTTGGCTTTGTCC
CTTTTGTCTTTCCCTCCATTGTCACTTTGAAGTCATTCAGGTGGTGCATG
TCAGTGAAAATCTTTTCAAGTTGAGGTGCCACCTGACCTGGCAGTTTTCT
CCCCAAGGTAACAAACCAATGGAACCGACTAAGTGAATATATCCATCAAG
GATTTATTTTATTCTGTCCACACAAACCACCTGGCAGGTTTTTACAATAG
ATAATTAGATCTTCTAATTAAGATCCTGTTCTGCGGTGAGATTTTGAATA
TCCTTGTTCTTTGTATACTAGTCACTTTTTTTTGTACCATCGCTCTGCTA
ATAATCCCTTTGTGGAAATTGTCTTCTTTGTTCCATTTAGACTGAAAGGC
TTTTTTGAAAATATGCCTATACACCATAGTTGTCATTGGTTTCTTTCTAT
TACTTATGTGTAACTAAGATATTGTTAATGCTGGGTAATGGCCTATTCGT
TGCCACAAATTTATATAAGTTGCCATTTCGAGAAATAAAATTGCTACACG
GTGTTTTTATACTGGCGCAATCATCAGCAAAGTGAATTCTACAATCTCAA
ACTAAGAAAAAAAAATATATTTGAATTTATCATAACAATA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00001966-exon-sc0000012-1575043694:987196..987805 | TCONS_00001966-exon-sc0000012-1575043694:987196..987805 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00001966-exon-sc0000012-1510915933:987196..987805 | TCONS_00001966-exon-sc0000012-1510915933:987196..987805 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001966-exon-sc0000012-1510915933:978516..980281 | TCONS_00001966-exon-sc0000012-1510915933:978516..980281 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001966-exon-sc0000012-1491911889:987196..987805 | TCONS_00001966-exon-sc0000012-1491911889:987196..987805 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001966-exon-sc0000012-1491911889:978516..980281 | TCONS_00001966-exon-sc0000012-1491911889:978516..980281 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000012 | supercontig | sc0000012:978516..987805 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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