TCONS_00001668 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00001668
Unique NameTCONS_00001668
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4298

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00001668 ID=TCONS_00001668|Name=TCONS_00001668|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4298bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000011:416724..446950-

Legend: exon
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>TCONS_00001668 ID=TCONS_00001668|Name=TCONS_00001668|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=30227bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011:416724..446950- (Clytia hemisphaerica)
TTGACTTTTATTGTCGCATTATTGATTTTCACCTACTTCGTGTATTTCCC AAAAGTTAGCGACGAGGAAAAAATATTGGTACGTTTTTGTTTTTATTCAT GTTCACAAACTTAGGTTCTATTTAAAAGGGTTTCTAAAAAGGTCTTGCTT CAATTGGGGATTTCCCATCTTTCAATTTGACTTTTTAAAGCAATTAATTG ACCAATAGCCCTAAACTAGCAGCTTTTTGGCACAAAATATTTTAGAGCGT TCGTATTAGATGACGTGACTATAAGATGGACATTTTTAACGTTTTTTTTT TGCCCAACGGTTGATCAATTGCGGAATATTTTGAACGCATGGCGTTCTAA TGGATTTAGAACGCAATGTTTGAACGTCATTCCTATCGTCCTCAAAACAC GGAAGATTGAATTTTGATGTGATTCTAACATGAACGCTCACTAATTCGAT TTTCCAGGAGGATTAGATTTTCCTCGAACAAGGGAGAGTATCGAATAGAA GAATGTTTCTAACCAGTAATCCATTGATTTGACATCTTCACCATTTCAAA CACAAATCAATAACCACTCATCACCAGACCTCTAAACAAACATTACAACC CTATCATAACATTTGGAACAATAATTATTCGTTCTCAAGGCGTCAAACGA TTGAAACATTAAATTTTAGGTTTCATCTCATAACAATAACATCAACAACG TTCTTTGACCAGAGAGAGAGACTCTTCAAGATATCTTAAAAGGTCATGAG AAAAGAAAACAAATCCATAATCATAGCTGAGAGTGATTGATAACTTCGAT CTGTTTTGACTTGCAAAGAACTGAAAACTTCCAATGTCTTTCGTTCCCTT CCTTCAAAAGTCCTCAGAAAAATCAACCCTAACCACGAAAACTTTATGAA ATTTCTTCTTTTTAATGTTATACTATAACAGTATACGGCCAAACATTGTA 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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000011supercontigsc0000011:416724..446950 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 3.15879 1.0401 0.000319244 0.0158432 4.32189e-05 0.101605 1.93449e-06 1.46285e-05 1.50542 2.18166 1.49476 0.622507 2.92802 0.439289 0 5.93365e-07 1.83937 0.000183165 0 0 5.04366e-05 6.61447e-10 2.02834e-09 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00001668 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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