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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00000719 ID=TCONS_00000719|Name=TCONS_00000719|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3071bp CAAAAAATCTGGTggggatagttttggagtgcaattatttaaattgaatt ttgaacggggatgaaatcaaagtcaatcttCCAGGggatgaaattgtagg gtatttttcccttCGGGGACGAGAATTTGGCcgaatttttcagtggggct gaggtcccagcgggtctgtgatacAGTGGTGTAAGAGATTACCGTCTATT GGCTAGAGGTTATTGTCGTGTATGTTATGGCAATTGTTGTGGGGTTGATT ATCATAGATTATCGCTCCTGTATTTTAGTTCTTCTtcctattttcatttt aaatcaTTGCTATGATCAAGACACTTAAATAAGAGAGTTTTTTTTGCTTG TCATGTCTTTTAAAACTCCGCTGTATCAGTGCCCTGGTATACGCAGTTGG GTTTCAAACGCGACCGGTGATCAATGCAcaggttaaaaatattattttga ggaTTTTCTAGGAGAAGAAAGAGGATAATGAAAAAACTTGAATAGATTAG TCAATTCATCCCCTCAATCTTAACCGTTTGACATTATCGAATGCAATGGC TAACAATAAGGTACTATTCAATATTGTCAAGACGATAAAAGTTAGCACAA ACGTCAGaattttaaattaaagaaatggaagaaaatatttaaaaataact aaaaagaAATGACAAACTTGAATAATTTTGTcctggaaaaaaaagaaatc gcAGTCAAACAaagcgttcaattgattcgatttctacgttttttttatat agaaTTAATAAGATttcgattttgtgctcgttcaTAACGTTAGTGGGGTT AAAATTTATTacttaaattatataaatatatattttaccaagaaagtttt attttacCAGTTAGAATAGCCTATGTCGACGGTGAGTTATCGATGAAGAT AAGGAGTATGAATCTGTTCTTCGGGATATTTCTACGTATTTCATTGGTGA TTCTGCCAAGCTGTTGTCGTTGTCAACAAATTAAGAGGCTTAGTACGGTG CAGACAAATAGCAGTGTACAATATGGATTTGCAAATATGGTGGCCCATGT CAATCACATCCTTGATGTAACACCAATACAAGTTATTACAAGTAACATAA CATCAAACTCGAATTGCATTGCACATTGTATCAATTTTGACACGTGCACC AGTACCAATGTTGTAGTACAGAACGCACTAGCCAGTGCTGGCCACCTTGA ATGTCAACTACTGGGCACTGACCGTTTCAGAAATTCTACAAGTTTTGTTG AACAAATTGGATCGACACATTATGCTATCAGTCATGATTGTGAATGGGAA GATACGTGTATCAATCCATACCATAAATGTATACCACATTATGACAATGA CACTTATGAATGTCTATGTCCGTTTCAAACCTACGATGAACATTGCATGA ATGAGCTAACAGaaaacatggCAATTCACAAACCTGTACTGATGTCAACA ACGTATGGAAACCAATACAGTTCGTATTGTACTGATGGCGAATTCGGCCC AGGCTCCTCAATCTGTCACACAGATAGTAGTAAAAATGGATGGATACAAA TCGATCTTGGATCACGAAAAATCATCACATTCTTAATTTTACATAACCGA CAtacagaaaatttgaatttattaaGGCGCCTATCACAAACTGATATCAA CGTCTTCGATAGTCCAGGCAACAATCAACGATTTTGTACACACATTGGGG ATACTGTTGCTTTGGTTTATTTTGCTCGATGCACTAAGCCTCTTTTAGCA CGGTACGTAAAGTTGTCACAACTTGATATTGGATCGTCAAGATACATGAG TCTTGCTGAAATCATGGTTTATTAATTCcataagaaaaaaaggaaggagG ATAATACGGAAAATACGGAACTTTTCAAatagattttccaaaaaattgag gggttagaataagaatgtcctgggtggatcattttcaaaaaattaattag cagagGGGcacttattaggtacccgagaataTTTGGCACTTTTAAAGTTG TAAAAGATGAGGTACATGAATATGGAATTCAACCCAAAACCTTGGTTGAA GCACTTTAGCTTGAACATTGATGTATCTAATATCTCACTACTATGACAtg gcgcagtagtgtagtgtGGTTGTTTTCAATCTTGACCACCGTTAAGGAGC TCGAGGTTCGAAAGTGTGTTGGCAGGTAGTCTAAACTACACTACGTAAGA TTCTAGCGAGACTATTTTGCTCCTCCCCTATTAAAAGAAACAGGAAAGGG GACACTTGATACACATACTTGTGACGCGCAGTTTTTCGGATCAAGTGCGA TAATcaaagagtctgctaaatcacgCGCCCATATTCTTTACGCGCCCATA TTTTTTACGCGTCTTAGTTTCTACTTATTTATAAgcaatattatttattt tgttatttaattatttaatttaaaaaggAATCTAAAGTCGTAGCCAACAT ATATGTCTAGTTCTTCAGCAGTCACGAGCTGAAGCAGTAAAATCTCAATA CTATCATAACGAATAGTCCATCAACCTTAAGCATGCCATTTAGTCTTGCT CGTTTTTGCTTTTCTTCTAATTACCAGTTTACACTTATTTATAAGCAATA TTATCTATTTgttatttaattatttaatttaaaaaggAATCTAAAGTCGT AGCCAACATATATGTCTAGTTCTTCAGCAGTTACGAGCTGAAGTTGTAAA AAAATCTCAATACTATCATAACAAATAGTCCATCAACCTTAAGCATGCCA TTTAGTCTTGCTCATTTTTGCTTTTCTTCTAATTACCAGTTtacatttat ttataagcaatattatttattttgttatttaattatttaatttaaaaagg AATCTAAAGTCGTAAACAACATATATGTCTAGTTCTTCAGCAGTCACGAG CTGAAGCAGTAAAATCTCAATACTATCATAACGAATAGTCCATCAACCTT AAGCATGCCATTTAGTCTTGCTCATTTTTGCTTTTCTTCTAATTACCAGT TTACACTTATTTATAagcaatattttttatttgttatttaattatttaat ttaaaaaggAATCTAAAGTCG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00000719-protein >TCONS_00000719-protein ID=TCONS_00000719-protein|Name=TCONS_00000719-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=310bp
MKIRSMNLFFGIFLRISLVILPSCCRCQQIKRLSTVQTNSSVQYGFANMV AHVNHILDVTPIQVITSNITSNSNCIAHCINFDTCTSTNVVVQNALASAG HLECQLLGTDRFRNSTSFVEQIGSTHYAISHDCEWEDTCINPYHKCIPHY DNDTYECLCPFQTYDEHCMNELTENMAIHKPVLMSTTYGNQYSSYCTDGE FGPGSSICHTDSSKNGWIQIDLGSRKIITFLILHNRHTENLNLLRRLSQT DINVFDSPGNNQRFCTHIGDTVALVYFARCTKPLLARYVKLSQLDIGSSR YMSLAEIMVY Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000005:889900..894114+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00000719 ID=TCONS_00000719|Name=TCONS_00000719|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4215bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:889900..894114+ (Clytia hemisphaerica) CAAAAAATCTGGTggggatagttttggagtgcaattatttaaattgaatt
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aggAATCTAAAGTCG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005:889900..894114+ >TCONS_00000719 ID=TCONS_00000719|Name=TCONS_00000719|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=3732bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:889900..894114+ (Clytia hemisphaerica) ATGAAGATAAGGAGTATGAATCTGTTCTTCGGGATATTTCTACGTATTTC ATTGGTGATTCTGCCAAGCTGTTGTCGTTGTCAACAAATTAAGAGGCTTA GTACGGTGCAGACAAATAGCAGTGTACAATATGGATTTGCAAATATGGTG GCCCATGTCAATCACATCCTTGATGTAACACCAATACAAGTTATTACAAG TAACATAACATCAAACTCGAATTGCATTGCACATTGTATCAATTTTGACA CGTGCACCAGTACCAATGTTGTAGTACAGAACGCACTAGCCAGTGCTGGC CACCTTGAATGTCAACTACTGGGCACTGACCGTTTCAGAAATTCTACAAG TTTTGTTGAACAAATTGGATCGACACATTATGCTATCAGTCATGATTGTG AATGGGAAGATACGTGTATCAATCCATACCATAAATGTATACCACATTAT GACAATGACACTTATGAATGTCTATGTCCGTTTCAAACCTACGATGAACA TTGCATGAATGAGCTAACAGaaaacatggCAATTCACAAACCTGTACTGA TGTCAACAACGTATGGAAACCAATACAGTTCGTATTGTACTGATGGCGAA TTCGGCCCAGGCTCCTCAATCTGTCACACAGATAGTAGTAAAAATGGATG GATACAAATCGATCTTGGATCACGAAAAATCATCACATTCTTAATTTTAC ATAACCGACAtacagaaaatttgaatttattaaGGCGCCTATCACAAACT GATATCAACGTCTTCGATAGTCCAGGCAACAATCAACGATTTTGTACACA CATTGGGGATACTGTTGCTTTGGTTTATTTTGCTCGATGCACTAAGCCTC TTTTAGCACGGTACGTAAAGTTGTCACAACTTGATATTGGATCGTCAAGA TACATGAGTCTTGCTGAAATCATGGTTTATTAAATGAAGATAAGGAGTAT GAATCTGTTCTTCGGGATATTTCTACGTATTTCATTGGTGATTCTGCCAA GCTGTTGTCGTTGTCAACAAATTAAGAGGCTTAGTACGGTGCAGACAAAT AGCAGTGTACAATATGGATTTGCAAATATGGTGGCCCATGTCAATCACAT CCTTGATGTAACACCAATACAAGTTATTACAAGTAACATAACATCAAACT CGAATTGCATTGCACATTGTATCAATTTTGACACGTGCACCAGTACCAAT GTTGTAGTACAGAACGCACTAGCCAGTGCTGGCCACCTTGAATGTCAACT ACTGGGCACTGACCGTTTCAGAAATTCTACAAGTTTTGTTGAACAAATTG GATCGACACATTATGCTATCAGTCATGATTGTGAATGGGAAGATACGTGT ATCAATCCATACCATAAATGTATACCACATTATGACAATGACACTTATGA ATGTCTATGTCCGTTTCAAACCTACGATGAACATTGCATGAATGAGCTAA CAGaaaacatggCAATTCACAAACCTGTACTGATGTCAACAACGTATGGA AACCAATACAGTTCGTATTGTACTGATGGCGAATTCGGCCCAGGCTCCTC AATCTGTCACACAGATAGTAGTAAAAATGGATGGATACAAATCGATCTTG GATCACGAAAAATCATCACATTCTTAATTTTACATAACCGACAtacagaa aatttgaatttattaaGGCGCCTATCACAAACTGATATCAACGTCTTCGA TAGTCCAGGCAACAATCAACGATTTTGTACACACATTGGGGATACTGTTG CTTTGGTTTATTTTGCTCGATGCACTAAGCCTCTTTTAGCACGGTACGTA AAGTTGTCACAACTTGATATTGGATCGTCAAGATACATGAGTCTTGCTGA AATCATGGTTTATTAAATGAAGATAAGGAGTATGAATCTGTTCTTCGGGA TATTTCTACGTATTTCATTGGTGATTCTGCCAAGCTGTTGTCGTTGTCAA CAAATTAAGAGGCTTAGTACGGTGCAGACAAATAGCAGTGTACAATATGG ATTTGCAAATATGGTGGCCCATGTCAATCACATCCTTGATGTAACACCAA TACAAGTTATTACAAGTAACATAACATCAAACTCGAATTGCATTGCACAT TGTATCAATTTTGACACGTGCACCAGTACCAATGTTGTAGTACAGAACGC ACTAGCCAGTGCTGGCCACCTTGAATGTCAACTACTGGGCACTGACCGTT TCAGAAATTCTACAAGTTTTGTTGAACAAATTGGATCGACACATTATGCT ATCAGTCATGATTGTGAATGGGAAGATACGTGTATCAATCCATACCATAA ATGTATACCACATTATGACAATGACACTTATGAATGTCTATGTCCGTTTC AAACCTACGATGAACATTGCATGAATGAGCTAACAGaaaacatggCAATT CACAAACCTGTACTGATGTCAACAACGTATGGAAACCAATACAGTTCGTA TTGTACTGATGGCGAATTCGGCCCAGGCTCCTCAATCTGTCACACAGATA GTAGTAAAAATGGATGGATACAAATCGATCTTGGATCACGAAAAATCATC ACATTCTTAATTTTACATAACCGACAtacagaaaatttgaatttattaaG GCGCCTATCACAAACTGATATCAACGTCTTCGATAGTCCAGGCAACAATC AACGATTTTGTACACACATTGGGGATACTGTTGCTTTGGTTTATTTTGCT CGATGCACTAAGCCTCTTTTAGCACGGTACGTAAAGTTGTCACAACTTGA TATTGGATCGTCAAGATACATGAGTCTTGCTGAAATCATGGTTTATTAAA TGAAGATAAGGAGTATGAATCTGTTCTTCGGGATATTTCTACGTATTTCA TTGGTGATTCTGCCAAGCTGTTGTCGTTGTCAACAAATTAAGAGGCTTAG TACGGTGCAGACAAATAGCAGTGTACAATATGGATTTGCAAATATGGTGG CCCATGTCAATCACATCCTTGATGTAACACCAATACAAGTTATTACAAGT AACATAACATCAAACTCGAATTGCATTGCACATTGTATCAATTTTGACAC GTGCACCAGTACCAATGTTGTAGTACAGAACGCACTAGCCAGTGCTGGCC ACCTTGAATGTCAACTACTGGGCACTGACCGTTTCAGAAATTCTACAAGT TTTGTTGAACAAATTGGATCGACACATTATGCTATCAGTCATGATTGTGA ATGGGAAGATACGTGTATCAATCCATACCATAAATGTATACCACATTATG ACAATGACACTTATGAATGTCTATGTCCGTTTCAAACCTACGATGAACAT TGCATGAATGAGCTAACAGaaaacatggCAATTCACAAACCTGTACTGAT GTCAACAACGTATGGAAACCAATACAGTTCGTATTGTACTGATGGCGAAT TCGGCCCAGGCTCCTCAATCTGTCACACAGATAGTAGTAAAAATGGATGG ATACAAATCGATCTTGGATCACGAAAAATCATCACATTCTTAATTTTACA TAACCGACAtacagaaaatttgaatttattaaGGCGCCTATCACAAACTG ATATCAACGTCTTCGATAGTCCAGGCAACAATCAACGATTTTGTACACAC ATTGGGGATACTGTTGCTTTGGTTTATTTTGCTCGATGCACTAAGCCTCT TTTAGCACGGTACGTAAAGTTGTCACAACTTGATATTGGATCGTCAAGAT ACATGAGTCTTGCTGAAATCATGGTTTATTAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000005 | supercontig | sc0000005:889900..894114 + |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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