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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00000688 ID=TCONS_00000688|Name=TCONS_00000688|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2780bp
tttcattcctcgtCCTCGATAAATTCTATAATTCTagcaatttattttat
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ATCGAGGCTACAAAACCTACTTAGAACCAAACTACTTATaccataggcca
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atcatataATAAATCAAGATTTAAAGCAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000005:102317..110715+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00000688 ID=TCONS_00000688|Name=TCONS_00000688|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8399bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:102317..110715+ (Clytia hemisphaerica)
tttcattcctcgtCCTCGATAAATTCTATAATTCTagcaatttattttat
tttatagattgacaataaaataaatgaagaaagtaaaaaagtaaaaactc
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TTTGATTTTAAGAATCTTATTTAGGCTTTCGTTGTCAATATTTTTCAGCA
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GCTCCATTTaatttttgatcttttttagCCTAATTGTATTAATAAAAAGA
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ATCAGGTCACGTTTTAGCCTTTCCCTCATTAGCAGATAAAGAGGTTTTAG
GAGAATTACGCAAATATCCAACATTATACTGTATTTGTATACGAGAAAAG
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gTCCATTTGTTACTCTCAAAGGGTAGATGTTTTAACTTCTTGCTCGGACA
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GGTCACGTCGTTAGTTTTAAGTAGAGTCGAGCACTTAGCAATCAATAATC
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tttcaacgttaatctgatgttaaatggacgttgcGGACCCGTTAGATAAA
CGTAACGCTATGTGCCAGCTGGCGGAAAGTATTCTCTTAATCTCGCATTG
CGTACTAAAATATGATGGGCTTTGGTCTTTGAATGTGGAAAGGCCTTGGT
CAAAGTATTGACTTTCCAGGGATTTTTCTTTCTGGgaagaaaataataat
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gttttttaccacaaaggTAGAATTCACCAGAGCACCTAGGGTATGGTAAT
TAAACAACAAATGGACCGCCTTTTTATCCGATATTTATTCCGGACACCTT
GGTTACGTAACCATtcgaaataaaagaaaaactagtattcaaagaaatta
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CCATTTATTGATGCCTTGATTATGATTGCCATGGAAACAAAAACATTAAT
GGTGCATTACAGTACCTTAATTATAGATTCATAATTTAATTGGAATAAGT
TTTAATTGATCTCTCTATTGTTTGATACTTAAATTGggttcctttttttt
cttccttacTTTACTTTACAGAGATGGTCCTCTCTATCTCCTTATACATC
ATTAGTGCCCACTATTTTTAGTTCAGGATTAAGCAATCAATTCTAGTGTA
GAGTGGGAGGCAGTGGGAAGGCTGAAAATTATCTGTGTTTGATCTACAAA
ACCATACTGTGGTTCAAAAACCAATTTCTGAAGGGTTtaaaggttactga
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aaaacaaTTATACTCTACTATGGACTGCCTCTAGGTTATTGACCCAACGT
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CATCAAATGGTAAAAACGTAATATCGCCATGCTTACTCTGAGtagaaata
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ATGTATGTaattgattttttccttatttggGCATCGTCGTTACCTGGTCT
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GTTACTTAGCATTCTagttcattttctgaaaattttactttgaccacccc
tgatattataccatatttatgcttattagGCTAAGTGTTATCGTTTTCCA
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TTTTGAAGCATAAAAAGACATTTAGGAGAAATCTTCCCACTACTCTCTGT
ACTCCCGTCGTTAATGAAAACTAATTCAAATTACCCTTAATTAAGAGAGC
ATCAATTATACCATAATACCATAATATACAGTGTTTGCGACGAGGTCTAG
TCAATATTCTATTTGGTAACTTAATTTAGGCATACCTTTTTACTAACAAT
TAACAAAAGTATACCAGTTCTTTACtaaagttgacgctctctaattccaC
GTTCTACTATTTGATGTTTCCATTAATTGATAATATTAAAAGTCACCATC
AACGAAGAAGCTCTCATAAACACTCTACTATTCATgctatgcaccattgc
aatgtcttccacggacccaatagctgattggttgcaagtgtcatattgac
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ttcatcaaattataacattttctTTATTATCTCTCTTCAGCAATGTTATG
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GTAGCATCAGCTTAGAAgacattgaaaaagaattcacAAACTCTTTATTC
AAAGTTGCTAAAACGTTACCGAAACAAAAATTCTGTTTGAAACTTGGTCG
ATATATTACGAACAAGAATGATccgattttaaataaaatatggTACTCAG
GTCGCCtgaaaaaccgaaaattcaaTTGCAAGAAAGTGAATGGCGAAATC
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ATATAACCAATTACCGTTACCGTTTCAATGCCAAATTCTAACGACTACTA
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CGAGCTAACCAAGAAAACACTGTGGAATTGAAGTCTTCGCGTAAACAGTT
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AGACTGGTTGTGCTCTAGTAACGACTTccggttggctagacgcaaaaatc
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CAGTGGTCCttctcttaggtgccaaataaacgcgttaatttttaagaata
ttttcagttgttaaACAATAGTCCTCttattttttctccaaaaagccTGA
CTTTAGCcaatatttaccttatttttgggttttcagaagtacaatttcca
acccccccggcaattaggtccccccgtttattaaaatttcgaaaattttc
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tgcaactgtgaaatggcctattgtCCCGGAAAATATAGTTCTCCCAAGAC
AATTTTATAGCTTATTGAATGGTCTAATTGATATTGAGGAATTTTGAGGG
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TCTATTACGTGTGACTAGAAATGGAAATATTATAACAATAGACACTATCA
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tttttgatattctattttaatCACACTGTATATATTGTAAAACACACAAT
GgagaaattaaattaaaaaatcatataATAAATCAAGATTTAAAGCAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1491911889:102317..102537 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1491911889:102317..102537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1510915933:102317..102537 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1510915933:102317..102537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1575043694:102317..102537 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1575043694:102317..102537 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1491911889:108157..110715 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1491911889:108157..110715 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1510915933:108157..110715 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1510915933:108157..110715 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00000688-exon-sc0000005-1575043694:108157..110715 | TCONS_00000688-exon-sc0000005-1575043694:108157..110715 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005 | supercontig | sc0000005:102317..110715 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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