TCONS_00000038 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00000038
Unique Name	TCONS_00000038
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2103

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000001:1005161..1016571+

transcript sequence

>TCONS_00000038 ID=TCONS_00000038|Name=TCONS_00000038|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2103bp
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GTTTACTTGGTCGCATGCCTCCATATCAATTTTCTCTTCACTTTCAAACT
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CTATAGGCGGGATTTGAAGAGACTTGCTCAAactgaaaaaacaacaacaa
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GAAAATTGACTATGGGAAGTTTATTGAGTCTTATCGGCATTGGTTCAGCT
GCAAGCTGTTTGCCCTCTATTGGAGGTTGTGCAGCAAGTCAGaTTGCTTG
TTGTTGTGGGTCTGCTGCTTGCAGTTTATGTTGTAAAGCATGTCCATCTT
GTCAAAATTCAACTGCTTCAAGGATTGGTTACACACTGGTACTCCTGCTT
GGATTTATTCTATCATGTGTCATGTTGTCACCAAACATCCGTCAGAAATT
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GTTATGTGGCGGTTTATCGTGTTTGCTTTGCAATGTTTGCTTTTTTCTTC
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GGAGGGTTGTATGCAATCGCGTTGGCCATCACTATTTGTGGTTTCATTTT
CTATACTAAGACTTCAGGATGTGGATTGAACAAattctttttgagtttca
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ATACAGCATGTATTTGACATTGTCCGCCATGTCTAATGAACCTGGCACAG
ATTGCAATCCAGGTAGTTCCTTCTTGCAAAGTGATTCTTTCGCACCTGGT
TTCGACACACAAACAGTGTTGGCAGCCATCTTTCTTTTTTGCACGGTCGT
CTATTCGTGTGTGAGAACCAGTGCCAAAAGTTCTTCACTTTCCATCCAAT
CAGATGATGCAGACATCGAAGAAGTTTTGCTAATCGAAAATAATGGACAG
GGTGATGACGATGTGGAATACAAAGGACAAAAAGTTTACGATAACGAGAG
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AGGACAAAAAGTTTACGATAACGAGAGTACAGAAGTTGCATACAATtatt
cattctttcatttcactTATGCATTGGCCTCACTCTATATCATGATGATG
TTGACCAACTGGTACAGCCCTGAAGGTGCAAACTTCAAAACCTTAACCAG
CAGCATGGCTACAGTTTGGGTCAAGATGGCGTCAAGTTGGGCGTGTTTCG
TCCTCTTTGGGTGGACTCTTGTCGCGCCTATGCTTTTTCCCGATCGAGAG
TTCCACTAAAGTTCGCTTTCCAGTACAAAAACCTTGTTTGTATATAAGTG
TACTTTTGAATTTTGTATTTAGATCCTTCTATTTAGGATCAATTCTGTAA
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agttttggtttcttttgtaAAATCTTTGTTGTAAGatatattgttttgtt
ttgtttaaaaagaaacttcCGATATGTTCGATTAAGACCAGAATATACCT
TTTCGTTTTTTTACATGGTAGCCAACTCTTGCCAGGGACGGTTGGGATCA
CAGATTTCTGTGTCCAAAGGGCCAAGCAAACGAACTTTATGCTGAATTGA
ACT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000001:1005161..1016571+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00000038 ID=TCONS_00000038|Name=TCONS_00000038|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11411bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:1005161..1016571+ (Clytia hemisphaerica)
CAAACGGTTGATAATTATTTTAGTGTCAATATCTCACATGTCCCTTTCAT
GTTTACTTGGTCGCATGCCTCCATATCAATTTTCTCTTCACTTTCAAACT
TCCCGTTAAACCGCCCCGCGTGCTGTTACGCCCTCTTTGACATGCTCAAA
CTATAGGCGGGATTTGAAGAGACTTGCTCAAactgaaaaaacaacaacaa
caaagatggccgCCAAGAGAAGTGAAAATTTTTGAGTGAAaactaaaata
ataatttttttgtatcaTATTATACAGTCATCAAACAGATAGAAGAGGTT
GAAAATTGACTATGGGAAGTTTATTGAGTCTTATCGGCATTGGTTCAGCT
GCAAGCTGTTTGCCCTCTATTGGAGGTTGTGCAGCAAGTCAGGTTATAAT
TGATAATTCTTTTCTTACTTGAAAATAATACAGTACAGAAGGGAGTAAAG
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aatcgaacacaattgaatattacccaggaatcggccgttcgattaagata
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cgtctggctattgcaaaaaattttatttttccaatagCTGCACCTTTCCc
ataattcaaacttctcagaaatggcccgggaaaatgtgcactccaccgtt
gtgtataaaattgtttgggaggtagtAAACGAACGTGTTTTTGCCTGCAA
GGggaagggaaagtgggttttcgtgcagcttctaacttttgataacaatc
ttcttttggcaaaagattttcagggtggtataatatcatgaatagattga
gcATACCATAGCTGTCAACGGAgcgggagagctccaagtcggaaaaattt
tctcgataatccaatttttccgaatcggaaaatcaggaaatcgaGGTAAT
TTTCCTGCGAAATCcgattttatcagatttttttttccggAAATAGGGAA
ATTTTACGCATGAATTTTCCAAATTCaggaaattttgccattccGCTCTT
TCAAATTCTGAATTTTNCTTTTCCCGGAAATGGGGGAAATAGGGAAATTT
TACGTCTCAATTTTCCAAATTCaggaaattttgccattccgctctttcaa
attctgaatttttttcaagaaatcgGAAACAttttggaaatgcgggagat
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CGGGAGAAAGCGCCGTTGGCATGCGGGAGTCTCCCGCCcaatgcgggaga
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ttaagaaaagctcaaaaaaccaattttccctaaggaaacgcaggcaaaaa
cgggtttgtttacctccaaaGCCCAAATGCACAAGTGTTACGCATAAGCC
AAATTGCGTaatacgaacaacctctaaattgccgagtacaagagaaaaaa
aaatcgaaattcaaaatggcggctaAGCCCACCCTGATAACTACCGTgaa
aggaccctgccgacgcactggacttaacgaacaccggacacgcaaaagtc
tggtgtaaaaatgcagtccggtgcgtccggtgcttcttaattttttgttt
tataaatgTCTGGCGTTCAAAATTCcatgtatgcaacaccggactgacac
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gtccggtgcgtcggcagggtcctaccGTGAATGGttctaaatccgacagc
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tacaaacattccctctccaagttgaacaataaactattgcaaggactctt
gaaacaaaacatctgaTCTAAaaagatgactataatgtcaagatgtcaat
caatgtgataaaaaaagtgtgagttgtaaaaataattacctctattattc
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ttagaACCACTCACGGTAATTTTTCAAGCGTAACAAGAATGATTTGAGCA
GGGGGTCTGGTGGAATCCCCTTAGAAAATTTTGTCTGAAAAATGACCTTT
AGAGATTGGCTAAACAGTTATGTTGATTCAAAATCTATTCCTCATTTTAT
CAGATGCGATATCAAGTATTTATCTAAGCCTTCTagtcatcaaattttga
tggGATAAACTAAAAAACTTAGCTCCTTATTACTATAGGAGAATTTTCCT
AATTAGGTTTTCTTATTTAGATATTTCTCCAAAAAACTCTCTACATGTAA
TAACCAGAAATGTCATCCTTGGGATATAACTCTTCAGGAAAATTTATATA
AGTTTAATCATAAAAAGCATCAATTATATAGTATATCCCTCCCAAATTgt
ttgttttactttattctacTACATATATCATATTTTTTGGGAGAAAacca
atattttttaattttgtagaTTGCTTGTTGTTGTGGGTCTGCTGCTTGCA
GTTTATGTTGTAAAGCATGTCCATCTTGTCAAAATTCAACTGCTTCAAGG
ATTGGTTACACACTGGTACTCCTGCTTGGATTTATTCTATCATGTGTCAT
GTTGTCACCAAACATCCGTCAGAAATTGAATAAAGTACCTCACTTATGTC
CAACATTTGATTGTGACCAGGTTGTTGGTTATGTGGCGGTTTATCGTGTT
TGCTTTGCAATGTTTGCTTTTTTCTTCATAATGGCTTTGATCACGTTTAA
AATTCGTAACAGCAAAGATCCAAGAGCTAGTATACACAATGGGTAAGACG
ATTAACTAACATATTTAGGATTGGATATTTTCTGTAATGAAAACGTGTCT
TGTTTTATTGGCAACTAATCTGCCATGTTGTTTCCATTCACTTTTAGATT
GACAGCCTTAGCATTTGAGTATTTAAACAATTCATTGAGAATCAACAGAA
AACAACATTTGCAGAATTTACTTGTTTAGTTGTCAAAATTGGCTATACTT
CCACAAGAACTTTACAATAGATTAGTCTATCAGAGCGTGTGTAGGAATTT
TATTTGTATTATTCTATAAAATGGTAGAATAATTCCCCTGTTCTCAATAG
CATAGCCAAGAGGGGCGtgaaatttgtgtaggagagcagattttatgcca
ttataattatcttttaatactatgaatagataattacagtgtcattaaag
tctgctctcctacacaaattttgcgcccctcttagCTATGCTACTGGTTC
TTAATAATGGCTTTTTAGAACTGATAAAGGATCAGCATTCAACAAATAGA
TAAATGTAAATCAACACATTGCATAATATTTTagattaaaagtttttttc
ctaCTATGTTtcgttttttcaatttcaggttTTGGGCAATCAAACTACTC
GTTTTCATTGCACTACTGGTCGGTGCTTTTTACATTCCAAAAGGTGACTT
CTCTAGGGGTAAGAATCTTTTGTGAAGTTAACAACAAAGATATCATGGCA
ATTACACCGATATTTTGAGTCTACACATACTTTTGTGCTTTTAACCTCTA
ACCAGCGTCTCAACGAAGAAAATTTTGCTCCCTTttagatcgaattagag
agagagagttaATCGTatcatttctttcttaaaaaattataaatgtaATA
TACATATCTTTAAAACATTGTTTATTATGCAAGTTCAGTTTCCATTAGAA
AAAGAATATATTAGAATGTTACAAGAACTTATTGTAAACTTATCCGGAGT
TACATAAGTTTTCTACTTACTTTCATTATAAttgttaatttttaaaattc
tagTTTGGATGTATATTGGTATGATTGGTGGCTTCTTGTTTATCTTGATC
CAATTGGTTCTGTTGATTGATTTCGCTTATAGCTGGTCACAGAAATGGTA
TGtactcattgagtttaaagcccgaagggctagagttcaatctctaacct
ttctcaggcaagaaaaagtgaagccttaaaaaatgcgccgcttttttgac
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GAGCTGAACATTTGACCTTGTTTCGCTTGGATCTTATTGTTATCGAGACT
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TCCGCAAAGATTCTAAGAATTTGCGGGAACTTGATTTCGCGGTTGGCACT
ATAGGGAAATAATATTTTTACGATATTGTGCCTTTTTACCACAATTTATG
CGTGTTTGTTGTCGAGATACGTATTACTAGCGCTTTTTTCATGCCAGTAA
AGTATTAAATATAAAAGGCTTCAGAAGCTGAACTTTTGAATTTaccatga
aaaaaatattgtgtTTCATTAAGGATTGGCAAGTATGAGGAAACTGACAA
CAAGATTTGGTTCATTGGTACGTAATTTCATTTTATTGTTGAGCCTTTAA
AAAAGTTGGATAAAGTATTTAAAAGTAGAAGCATATAACTATGCCATCAT
GATTTAACAAGGTTTTGTTCGAATTTTCTTGAGATTAGCAATtatatttg
tatattttttaaacatcCATCACTATCCGATTATGTACCGACTGTCTGAC
TGTATTTTCCTTCCTGTGATGTATTGTAAAGGATAAACTCCGACGTCAAA
TTAGAATTGTTACTATGTCGTCAAGAAATAAGCTTCGTGCTGAGGAAGTT
TCCTTCCCGCAGTAATATGAAACTGAACTTGATTCattaaaagaatatat
tttttggatACATAACGATCGGGTCAGAGAATATCTTCTTTTCAGGAGAA
GCTTTAAGAATTCCacttttcactttcatttcGTTATTTTAGGACTGGCT
GTATGTACTGGAGGGTTGTATGCAATCGCGTTGGCCATCACTATTTGTGG
TTTCATTTTCTATACTAAGGTAGGAAGTTTatacttttctttaaaaacgT
GGTCAGTTTTAACTTTGTACCTTTTTCGGCCCTTTTTAGGTCGGCCCATA
TTTGCGGCAGTTAAAGGAAAAGGAGTCTTAGAACAACTCGTTGAGATGTC
TCTCGAAacatacacacttttttaataTGAAACCCCAATTTTCAGCTCAG
GGCTGAGGTtacttagcattctagctcattttctaaaagaattttctttg
accacccctgatgTTATACAATACTTCTGCTTATTGGGCCAATGTGCTAT
TGTTATAATTGAACATTCTCAGagtatctaaaaagcttttacttaaGAAG
Atattaaaaaaggtttttttacccctgaaagaatgaaaaacacttcttta
gaccccttttaccccctggaaatgttcttcCAACCCctatgtatggatat
aaaatggaatgacccaTTAGGCGTCTtgctaacgtccatataatgttaAC
TAACTCTTTTTACTCTCTATTCCCTCAGACTTCAGGATGTGGATTGAACA
AattctttttgagtttcaactTCATCATTGCCGTTCTTCTGTCACTCATT
TCCATTCATCCTCGTGTCCAAGAATCACAACCAACGTCAGGGCTGCTTCA
AGCGTCCATCATTTCTGCATACAGCATGTATTTGACATTGTCCGCCATGT
CTAATGAACCTGGCACAGATTGCAATCCAGGTAACAATTagttctagttt
agacggcccacatttcgccctgcctattctaatggTGAATTAAGGTaagc
ataaagtgggctgtctgaAGTCAATGCATtaccctcttttgacgtcaatg
caatgtcttctttcaacctttttgAAACAAATAATTAAACTGCCCACTTT
GTGCCCGCTTTGTGCCTACTCTTACAATTAGAATATGCAGGGCGAAAGTT
GAGCCGTCAATACTAGAGCTTACCGCTGTTTAAAAACCTTTCCCGGTGTC
ACGTGATGTATGCCCAATTCAAACAAGATTTATTTCTAGTTTAGTGCGAA
AATGAGACGGTtgcgaaaatttcaaatttaaagtatTTTGTTTGACAGTA
AAGTTTCTTGAACATAAAAACGAGGCATTGTGTAGAAAACGATCGAAAAT
TTATGGAAAATAAAAGTGGAATATCTTTTGATCTAAGTAGACCAAATTAT
ATAATTTCAAATCCCAGAGGGGGGTTGCACTCAATGTAAGCGACCTACTG
TCGTCCGGCCCTTAAAAGAGAGAAAGTTGTACTGTAAGAtggaaaaatta
ataaaatacgAAATCTTTGGGTGAAATTGGGGAAACTTCAAGAAAATTTA
GCGGAGAATTTGAATAGCACTTTAAGGGCACgttttttgccaaatatttt
ctttactGTAAGGGTCCAACAAAAGGTCAAAGGTCCTCCTCCCCGGGTTT
CGAATGTCTCTCGAGTCGTCATTGTCGCCATGTTCACATATCATACATAG
GCATTCGACGTCCTTCAACTCTGGTAAACTCGAATCCTTTCCCTTGTAAT
GTTTCAAGGTCATGAAGTGGATTTTGTTCTACAGTTCGAGATTCTTTTTC
TAGTGGCTTCCAACATCcttcaaattttatttaatgCCACCTTTAGCCGG
GTGGTTATGTAATTATACTTTCTAGCATTTAAAAACGTTATACAAAATTT
TGGTGTTAGGGTTTTATGTTACCCCGAGGGAAGATTTTCTCTGTGGTGTT
AGCCTCGCTGTATTAAATGAGAACCAGTTTTTACTAATTCAAACTCTCTT
TTCTACATGTGGTTTCTTCTTGCAAGTCATTCCCCTTCGCACCTGGTTTC
GACACGAAAAACAGTGTTGGCAGCTATCTTTCTCTTTTCCCCGGCTTAAT
CGTGTGTGACAACCAGTCCTTACTAATTCAAACTCCTTTTCTACAGGTAG
TTCCTTCTTGCAAAGTGATTCTTTCGCACCTGGTTTCGACACACAAACAG
TGTTGGCAGCCATCTTTCTTTTTTGCACGGTCGTCTATTCGTGTGTGAGA
ACCAGTGCCAAAAGTTCTTCACTTTCCATCCAATCAGATGATGCAGACAT
CGAAGAAGTTTTGCTAATCGAAAATAATGGACAGGGTGATGACGTAAGTT
TAATAATTAAAGGAACAAAGTTCgggaatgggcttttccagaaaaaaaac
cgtatTCCCCTGTTAAGGAAGTCCATCCCTGTGGCTggaaccccctggaa
ttccagtcaatttcaggtttaaacccctctggaattctgaattttagtag
gatttaaaaagctaccctacatggaattccagttatttttgacaaatttt
tgtatctccctatggaattccgccacatatcaaaccttacccccttggaa
cggaaatggacctgcTCAACagggtatacgttttttttctggaaaagtcc
aattGCGTTTTATATTTTTAACCAACTGAATTAAAGTATCGCGAGTCTCG
TTTTCAAAGTACCACGTATTGTTGCCAAGATATTTAACCGTCATTAAACA
TGATTAATCTTTTTTGAGGGATTGTGATTTTGTAGCAGAATCTAGAATAT
CTTTCGGAATACTTATCTAATAGTTGTCTAAATTACCGTAGCTACCTTTA
ACAATCCAAAATTCCGCTTAACAATCGAATCACTTTCTATGCCACTGATT
GGTTTGTTTGGCtcaatgaatttgaaatttgatcaatcaattgatttgat
ttttgagctgacttttggattgttaaagGTATAAGCTACAGTAATTTAAC
GACATTTACATATATATTCCGAAAGatattcttgagaaaaaattattatt
ttccgGTTTTCCAGTCTTTTCTAGATTTTGTTCCCATTTAATTGTGTAAT
GAATTTTAATATCatctttttatgttttcacGGATTGATTATATCAGTTT
TTGAAAGGTTTAAACAGTAATTTGTTAGCCgtctttttttcatcattaCT
CAGGATGTGGAATACAAAGGACAAAAAGTTTACGATAACGAGAGTACAGA
AGTTGCATACAATTATTCANTATTACTCAGGACGTGGAATACAAAGGACA
AAAAGTTTACGATAACGAGAGTACAGAAGTTGCATACAATtattcattct
ttcatttcactTATGCATTGGCCTCACTCTATATCATGATGATGTTGACC
AACTGGTACAGGTGAGTTTGACCACTCATTGAAACATTTTATTTAACTGG
TCACTCTCAGCGTTAAGGCCAGTCTctacttgcgcgcgcttcgatcgcac
tttttcgagcaaagcttccacactattagtcaaaagaaaaatgaagcaac
tacATTGGTGCGATCTGGATCATTTCGAGCGCCcactacatttttatgac
gttatcttttttccaagcaaaaaggattgaagccaaaaagtgcgattgaa
gcgcgcgcaagtggagaccagtCTTTATAAAGAGAGGGTGGAAACATCAG
ATGTCATTCTGCAAATTACTgaataaattttcgcgaatttccatgttaaa
cattttcaaagacaCTAACTTTCACGAAAGAGGCCAAGACTGGTGGGATT
CacgaaagttttcttttcgcTAAAATTTGCACTCTTAAAGTATTTGATCC
TGTTAGATTAGGAATCCGTAAAGATTTTTGTGCTTTTTTTggacttaaag
gttttgtttttaaataagggtGATATATGTAGTTTGCTTACTCGTTAGTT
TCaacttacaagctttttcacacccctgtctcacagcctcggtggaacct
ttttcctcaatggggataaaaatttcttttgaaattccaatggggataga
aattcttttgttttaaggttaaataatccagtggggatggtttggagtgc
aatttttaacattaaatttcgaatggggatgaaatgaaagtaaatttccc
agtggggtaaTTTCCTAccggggaagaaatttttgccaaattttccagtg
gggctggggtcccagcgggtctgtgacacaggggtgttttttcacattga
ttattggtcagaaagaggaaaagaaaaatttcttgtttattcaatacaat
ataacaatagggagagaccgtcctaatatgaaatatatgtctgatatggt
gatatgaaacggaaaaacatttaaaatcgTTCCGTGCGCTGTTTTTTTCA
GTGCTTTCCGATCACAGCTTTTTAATTCCCTTAGATAATGACTCTttata
aaattcttttgtttctgtGTTTTAGCCCTGAAGGTGCAAACTTCAAAACC
TTAACCAGCAGCATGGCTACAGTTTGGGTCAAGATGGCGTCAAGTTGGGC
GTGTTTCGTCCTCTTTGGGTGGACTCTTGTCGCGCCTATGCTTTTTCCCG
ATCGAGAGTTCCACTAAAGTTCGCTTTCCAGTACAAAAACCTTGTTTGTA
TATAAGTGTACTTTTGAATTTTGTATTTAGATCCTTCTATTTAGGATCAA
TTCTGTAACTATttagtttatttgtttttggtAAAGTTTAACCCATTGta
taatttttagttttggtttcttttgtaAAATCTTTGTTGTAAGatatatt
gttttgttttgtttaaaaagaaacttcCGATATGTTCGATTAAGACCAGA
ATATACCTTTTCGTTTTTTTACATGGTAGCCAACTCTTGCCAGGGACGGT
TGGGATCACAGATTTCTGTGTCCAAAGGGCCAAGCAAACGAACTTTATGC
TGAATTGAACT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000024	XLOC_000024	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000001	supercontig	sc0000001:1005161..1016571 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
50.4023	52.0518	41.0187	42.1967	12.5957	12.2748	18.3816	14.2615	33.9361	20.5501	29.4397	28.1495	26.6937	25.9841	12.5872	8.4356	12.4398	17.9532	23.3756	21.8657	21.2475	17.6981	18.1053	16.9125	74.3315	62.9468	18.148	11.5857	8.38175	14.4652

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00000038 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SERC3 (Serine incorporator 3 OS=Homo sapiens GN=SERINC3 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 230.335 bits (586), Expect = 7.155e-67
Identity = 162/405 (40.00%), Postives = 226/405 (55.80%), Query Frame = 3

Query:  453 QNSTASRIGYTLVLLLGFILSCVMLSPNIRQKLNKVPHLC------------PTFDCDQVVGYVAVYRVCXXXXXXXXXXXLITFKIRNSKDPRASIHNGFWAIKLLVFIALLVGAFYIPKGDFSRVWMYXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAYSWSQKWIGKYEETDNKIWFIGLAVCTGGLYAIALAITICGFIFYTKTSGCGLNKFFLSFNFIIAVLLSLISIHPRVQESQPTSGLLQASIISAYSMYLTLSAMSNEPGTDCNPG-SSF---LQSDSFAPGFDTQTVLAA-------------------IFLFCTVVYSCVRTSAKSSSLSIQSDDADIEEVLLIENNGQGDDDVEYKGQ--KVYDNESTEVAYNYSXL--------------LRTWNTKDKKF 1514
            +NST +R+ Y  +LLL  ++S +M    +   L K+P  C               DCD +VGY AVYR+ FAM  FFF+ +L+ FK++ SKD RA++HNGFW  K+   I ++VG+FYIP G FS VW  +GMIG  LFILIQLVLL+DFA+SW++ W+ + EE + ++W+  L   T   Y +++      + +YTK  GC  NKFF+S N I+ V+ S+ISIHP++QE QP SGLLQ+S+I+ Y+MYLT SAMSNEP   CNP   SF   + + + APG  T  V                      +F+ C ++YS +RTS  S    +    +D   V+L +    G  D E  GQ  +  DNE   V Y+YS                L +W + D KF
Sbjct:   33 KNSTVTRLIYAFILLLSTVVSYIMQRKEMETYLKKIPGFCEGGFKIHEADINADKDCDVLVGYKAVYRISFAMAIFFFVFSLLMFKVKTSKDLRAAVHNGFWFFKIAALIGIMVGSFYIPGGYFSSVWFVVGMIGAALFILIQLVLLVDFAHSWNESWVNRMEEGNPRLWYAALLSFTSAFYILSIICVGLLYTYYTKPDGCTENKFFISINLILCVVASIISIHPKIQEHQPRSGLLQSSLITLYTMYLTWSAMSNEPDRSCNPNLMSFITRITAPTLAPGNSTAVVPTPTPPSKSGSLLDSDNFIGLFVFVLC-LLYSSIRTSTNSQVDKLTLSGSD--SVILGDTTTSGASD-EEDGQPRRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYIMMTLTSWYSPDAKF 433

HSP 2 Score: 97.4413 bits (241), Expect = 3.433e-21
Identity = 47/89 (52.81%), Postives = 61/89 (68.54%), Query Frame = 2

Query: 1493 EYKGQ--KVYDNESTEVAYNYSFFHFTYALASLYIMMMLTNWYSPEGANFKTLTSSMATVWVKMASSWACFVLFGWTLVAPMLFPDREF 1753
            E  GQ  +  DNE   V Y+YS FH    LASLYIMM LT+WYSP+ A F+++TS    VWVK++SSW C +L+ WTLVAP++   R+F
Sbjct:  385 EEDGQPRRAVDNEKEGVQYSYSLFHLMLCLASLYIMMTLTSWYSPD-AKFQSMTSKWPAVWVKISSSWVCLLLYVWTLVAPLVLTSRDF 472

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00000038 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00000038 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
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Match Name	E-value	Identity	Description
SERC3	7.155e-67	40.00	Serine incorporator 3 OS=Homo sapiens GN=SERINC3 P...	[more]

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TCONS_00000038 (transcript) - C. hemisphaerica

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