XLOC_045841 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_045841
Unique Name	XLOC_045841
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_98:93..7190-

gene from alignment at scaffold_98:93..7190-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_045841 ID=XLOC_045841|Name=XLOC_045841|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7098bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_98:93..7190- (Clytia hemisphaerica)
TTACAAGTTTGTTTCATGTAACGAACATAAAAGCATAATGGCCGGCGAAG
AGTCAGGTGGTTACGAGTTTAAAACAAAAGGGAAATTACCAACACGTTGT
CAGTGTTTAATTTGCCAAGAGTTGTTAAGACAATGTGTTGAACTTCCCTG
CCGTCATCCATTTTGTAGCAGCTGTTTGCTGAGATGGGAAGATCAAAAAC
GAAAAGAGAGGAAAGGCCTTGAGCAGTATGTTTTATCTTTTTTATTCATA
ACAATTGAAGGTTTCATGTCTTTAGGGGGGGGATGTTCTATATTAAGGAG
AGGGTGCCAAAATTATATTGACTGGTTAGGAGGGGGGCTTGAAATCTTTC
TGAGGATATCCAAAGCGTGGGAATTTTTTGACATTCTTATAAATACCCCC
CCCCCCCCCTACACGTTTTTTTTATAAGAATGGTGTTGTTTCATTTCATT
ATGGATATTCTTAACTTTTCGGCGAAAATCATCCAAGAATATTCTTACGG
TATTCTTAGGTTAAGATCGAAATTGGCAATCTACAGGTTAAAATGCATTA
GAAATGGCATTCTTAGCTTCATTTGGTAATTTCCATGATGGTGAAATTCT
TACCATATTCTTAATTTTTTGACCATTTTCATCATGGACATTCTTATAAA
GTGTATTCTTATAAAAAAAGTGTGCAGCACATACTTTCTGACCACTCCCT
AACAGTTTCCTAAAAATAAACGTTCCAATCTGCTTTTCCTTTTACAGAGA
GAGACCCTTCAGGTGTATGCTTTGTAATCAAGAATATCAAATTCAAGAAG
TAAGTCACTCTTTCGTATGGTTTCTTATTAGTTTCCATCAATGATTAAGT
AGTTTTTCCTAAGACCTTCCCAATTATCGTTATTTTGTATCGGAAATTTC
CCGCTCTGAATCCCTTACTCTAGCTAGCTCGCCTTAATTTCTTATTTTCA
GTGCAAAAATTATTTTGACACTTCTAAAACACCCACTGTGTCAGGGGCTT
GGTGGGACCCCCTACTCACTGAAAGATTTGGCTAAAACTTCGTCTCCAGT
GGGTAAAATTTTTTTTCATCCCCATTTGAAAAAAATAAATTCCCCGCTAG
ATTTTTTGACCTGGGAACAATGCAAAATTTCCATTTCCATCGGGATTTCA
GTAGAAACTTTTATCGCACTATTAAGATAAGAAGTTTCACCGGGACTGTT
AGACGGGGGGGGGTTTCAGGGGTCTTAAATACCGTCATACCGACAAAATT
TTGGGTCATATACCGTAATACCGTCGGTGAAGGAAGCCTAATACCGATAC
CGATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNATGTATTGTATTGTAGTAGCAATATAAGTGAATACGGAG
AGACGACCATATCATTTAGTGCTGACGGAGAAAATTTTATCTAGACTCAA
TGCAGAAAAATAACGAAAATATTTGTTTAGATATCGTAAAGTTTAACTTA
TTTTGAATAACCTCAGCATGACAATAAGTCAATGGGAAATCCAAGATTGT
GCGAGCGAAGCGAGCAAGAAAATTTTACTGGATAAAATAGCGGAATAGAC
TCATCTTTTTTGAAAATTTTTCTACATGAAACTCATGAAGAAACTAAAAG
GTAAATAGTTTTATACCGAAATACCGTTTTTTATTGATAAAAATATCGAA
ATACCGACAAAAAAACAGGCAATTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNATAGAAAATGAAATACCGTAATCCCGTCGTTTTTTTCTCGTAATAC
CGATTTACCGGGGGTAAAAAGGCCCAATACCGTCATACCGTAAAAGTGAA
AACCCCCCCCCCCCTTAGACAGGGAAACATGAAGATCAATCTTTCAGATG
GATTTTTGTACTTGTTTGTTATTTCAACATATTAAAACATCATATAAGAT
TTATCTTACGGTAATGAAATTTAAAGAAATATAACTTTTATTGCATCTGC
TTTATTTAACAGAAGAAAAAGAACACAGTCGTCGACAACATTATCACTGA
AGATATAGAAGTTTTGTGCAAGCACCATGAGCAAGGATGTCCGTGGACTG
GTGCTATCAACGATTTTATGGTATATGGTTCCAATGTTTTGATTTAATTC
CTTGGAATATTTTGACAGACTTAAAAAATTTAGGGAAACTGAACATATGC
TTTTTTCACATACATGTAAAGTCTTACTTAATACCTTATGGTCTGGGAAT
TTACCCAACATCACATAGATTTTTTATCGTTTGGGGAAATTCCCAAAAGA
CANGAATTTACCCAACATCACATAGATTTTTTATTGTTTGGGGAAATTCC
CAAAAGACAGCCTTTCGAACAATTTTCCGTAAGGTCTTAAAGGGACATTA
CAGTAGTAACAAGAATCGCAAAATTGCGACTAAATATTTCCTTAAAAATG
AAGGTCATTATTGACATATATAAAAAGGGATAATTAGCCTTAGTAAAAGA
AAGCAAGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTTATTGAAAG
ATATATTTTCTTCGTTTTATGTAATCAAATCCTTTTTCAACAGCAACACG
CCAACACAGATTGTCCATACGTCGAAATAACGTGTCATTTTATGGGATGT
GACGTTCGCTTCTTACGTAAAGCGAAACAACAACACGAACAAAATTGTCC
GATGAAAGAGGTGAACTGCGTGTACTGTCAAATGGCTTTTAAAGAAAG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00073804	TCONS_00073804	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00073804-protein	TCONS_00073804-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_98	supercontig	scaffold_98:93..7190 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.18	0.78	1.14	0.79	3.08	1.7	3.94	3.01	2.55	2.6	1.4	2.16	5.91	5.96	1.75	2.13	1.98	2.42	11.64	11.86	1.4	1.46	2.47	2.18	3.94	6.05	0.87	1.61	2.44	1.57

You are here

XLOC_045841 (gene) - C. hemisphaerica