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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_97:361162..381811+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045739 ID=XLOC_045739|Name=XLOC_045739|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20650bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_97:361162..381811+ (Clytia hemisphaerica)
GGGTAACTAACGGAAAAAGCCGTTTCTGACTTTGGTAGTGAAATGGATGA
GGAACAGTCTGACAGTGGAGAGAAAACTGACAGACTTCGGAACGGGAACA
GGGAGACAGAACAGATTCAGAGGACTCGAAAAggcttttgaaagattttt
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tctaacatactcatagttttggacaagtatttttgGAGTGgcagttgaag
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tttcgaaaaatccggctttttcgtgtgcttccgtgcaaagttggatcttt
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aactttataaagatcaaCCATGTAAATGTCACCTGATTTTGTAATATTTG
GATGATATTAAAACCTTTTTGCATATAtttggttcttcaaaaccatttcc
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tggtttaaaaaagtcaaaacatcacGTGATCAGAATCATGATCGGAGTGA
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tttttgaccgcccgtccgcccgcatttttttgatgaccgcctaaaaaggg
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GTAGGTAGCTTCGTCAGTGCATCACAAAGTGGGATATAGACAAAACTCAA
CATccttacaaaagttgtctttttgatttcccaaacatttttttcaagcg
ttcacttccacaataatttatgtaatagCTGTTTTGGTCAGTCGAATTCA
ACATATACACGGTTTTTAGTCACCTTGTGactgaagtgcctactaaaaaa
caatccgggggtaagtgttgaagcaacacagcaggttattctttaaaaga
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ttaattcaaaaatacaaaaattcactttgcacttaatattacatactaaa
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ccctttgactttcaaaaaatagtatttaaaaaatatgaatttataataag
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tcaaatttggttctccattgttcTTACTGTCAAGTCAGAATCGACATAGT
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ttcattatttttaaaatgaagcacaacctaaaaaaaaattaaaacttccg
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ATGATGATTATAAGCCAAATGTCTCGtaattgggggttctagtcttgagg
CTTAAACTCGAAAAAAGCTGGTCTTTTGAAGCGTTTCGGTGTGGTCGCAA
TATTGCACTTTGTGACGCACTGTTCTTGTAATGACGACCCTGCTGATGCA
CCAAACAGTCTGGTGTTTTTGCTGTAAAAGTATCCCTCAGTCACACTGGA
AACCTTTTTTCTGGTGTTAGTCCgatgttaatttttcaaacttctggACA
CTTGACACGTGTGTCAAGAATAATAATGCGCACGGACCGGACTCAAGTTG
AGATTGTCTGGTGTTAAAAAGTATACTCATCTGATATACACCAGATTTTG
CATGTCCAGTGTTCGTAAAGTCCAGGGTGTGGACAGGGTCATGTGTCATG
TTGACacgtaccgtaacttggtctaatgtcgacacccctcctctaattct
gacaccctctttattagctgaaatttatagaaaggctGAAACTGTGTTTC
TTTGCTAaatggtcagagaggaataatcctttttcaatcagtgattcaaa
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AGGATCAATaaacaatatttgaaaatttgcttataaaaagttataacggt
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CTAtatcaaattttgagaatttttgaatGGTGgtattaccttattggaac
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caattttttccaattttatcaaaaaatttgaaaaatccctaagaaaatga
aagaaatttgtccaaaaaagggcaaaaccgcgaaaataaAAACGCGCAAA
AAACtccagaatgaaaaaaaaaacgcaaaaatttaaacctgcgaaatgca
attttttggatattttttttcgactgcgaaaattagttccaataaggtga
ttttcattttgaagagattgaattttaaattctttttcctctCGGACCAG
GTAAAAAAGTGACATTGTGGGCATTAAAGAAACCTTTGTAACCTTCTTAT
ATAGAGAAATTTTCAGCTATGGTTGTTATGTACTTATTCAAGTTGATTTA
GACAGATTAAGTTGAGACAGTAATAAGCTATTCAGCTTTATGTCGCCATC
TTGAATAAGCAAGACTAGAGAACAAAGTACTAtttatttatagaagtgta
tttctcaggtctattgacctctatgaaacaatcttacatctttacaattt
atagatcttctCGTTCCATTcgtttttcaattctgttataGAGTTTTACA
GTTAGGCACCTGGGCCTCTAACCCACTCTTCTTATAATCATTTTGTTTCc
gtcgtaaatttctttaaatagagtttagtcctaggactacctctcacttt
ccatatatgactcttgtcttttttttttcgatgttttttcttttgcttta
taaTGCCATTGTTTTATTATCTCGCGTTCTTTCCTTAAAAAACCAACGGT
ATATCAGGAAATATTAATGTAACTCACGAAAAAATCTATCAGTGATCAAG
AAACAAATCAGAAAGTCAAAATAGTCCATTGTGGCTTGTAGAAATTATTA
TcttctaattccaacacccagttttagagatacgaaTAATAGTAAGGTCA
GAtttcactgatagacaaaagatttttcctctctggTTGCtaagcaaaaa
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aagaatggtgtctggattagaagagggatgtcgacattagaccaagttac
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TCCCTACTACTGTTCATCAAGAATATAaccttatatactttgttcaaTGG
ATTTCATTAATATTTCCTAACATGTTTATTGAGCAACTTATTTGAAAGAG
TTACTTGTGTGTACTtatccttgggtgaatatctgggggtgttattttca
ttttttcaaaatttcgatttttagggcctggtcacgagttttagcctcaa
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atttggctgaaattcttcacacttgttccttgggtgaatatccgggggta
gtttttcattttttgaaagttatgATTTTCAGGGGCATGGTCATGAGTTT
TATGCcaaaaacgaggctaaagctttggggCAGGCTGAAGACTTCataaa
tggtccgatttggctgaaattttgcacactttgtTCCTTGGCtgaatttc
tgtttttttttcttcattttttcgaaattttcatttaaagggCGTGGTCA
GACATAAGGTTTAGACCCaaatgaggctaaaacttttgttttaccAAATA
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ACGAGTAATTTAAAAGATAGTTAAATTGAGCCAGTGCAactagcacgttc
gacagtaaTTTCTaataccataaatttacataaagagatacaattttgaa
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GCAACAAATGACttttaaaagtaaattttttaattttttgttttcagaac
TTTCACATTCATGTCAATGGGGTGTTTCATTGCAAGTTGCGCTATTCTCA
ATTAGACAAATTCTATGAACAGGTAATATAATATAGAAAGCAATATTATT
TACTCCTCACCTATTGTCAAAAGAAGTTGCTTTCTTGTGAGTGATGGACA
ACATTTCTGCTTTCCTTTTCAGTCTCCCTTATTAAGAGTATCACCCCTCT
TTAAGTGCCTTTCAAAATTAAAGCTGGTACCCTTAAAAAAGACTTCGAAG
GTTCACAGGACCCTTCTTATAGAAACTCAGCTGTAATTTGTATATTCCGt
ttttaatggcgttttttATATTCTCTTGATTAACCAAATATTATAAatga
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cagttttttttagaacaatagaatgctaagcataatgcaagCCTGGaata
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gcTCAAGAATGATTTCCCTGGAAGGATTCAATCGAGGTTATTTCCAGGGA
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TTAGAGAAATTCATTCAACACATCAGCCAGGATCCTGTGATTGGTGTCAG
TGATCAATTCAATGATTTCTTTGTTAAAGCTCAACAGGTAATGTTTTAAA
TGCAGATTTATTGACTGTATAATAAAAAGTCTGTCATCTCTTTGAAAACA
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TTGTGATGTATTCTTTTTAAGAATTACACATTACTGACCATTAGAACTCT
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aattagtaGCAGAAGTCTGCTGCTGGCCGTTTTAATTATCGAGAGATAAA
GAACTAACGTACAACAATTGCTACACCGTGTTTCATGTTGGCGCAATCTA
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AATACAATTGATTTCCCTGAAGGTTGTTGCATCAAGTTTTATTAAGAGCA
TTTGTGACGTAAATTTCGCAATTTtgcgacctcgcgaaagttttaCGTCT
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TGAGAACGTATCACTTGATGTCTTTTTAATGAATGGAAATAAAGTGACGC
TAGAGATTAGTACCACGGACCAGACAGACGACGTCCTTGAAGCAGCCATG
ACCAAGATTGGACTACAAGAGAAGTTCTATTACTATTTTGCATTGTTCTT
TGTGAGAAAGGAGGATAATGGTGGTGGTATTAGAAGTAAGTTTTGAACAC
TATTGATACTTCAGGTCCTCACCGGTAACTCACCCAGGCACGACGCACTG
GGTACGGCATCCGCCGTACCAGATCAGATTTACAcaaaaaatcccaaaat
tttcctcttcgtcggtaaaatcccttaaatttcctcattctcCGTACCAG
ATTTAAAAGGTTTCCGTCGTATCATTCACCTGACAATAATTGTCGTACTT
ATCTAATATACAGATGGcagattggcggccgcccacggcAACTTCCCATC
GGGAGGAATGATTGTCGGCCTTTGATAAACCACATCCCCAGCCGGACTCA
ACAACTCTTGTGGGGGTATGCAAGGGGCTTGAGTTCAGGCCTCCCACTGC
AATATCCTTGACAAGGTCTGGCGAAATTctgtaatctaaaccttccagat
gttggaCATATTCCCggccttcagagctttagcgtatcggaagaaaattt
tctaCATCGAGAGCCAGATATGGTGTGTACAGAACGGACCTCCGAAAACT
GAGAGACTATTTCTGAATAACTTGCtacccatagatttataaagcccgaa
gggccagatggcgtacttttgctgacaagtgtgccgtggttagataggaa
atcctacctaggtcacgtgacattacaagtagaatttcagcgcttgacca
tcaagcgatattcacttttttgcctgtgatggcttaaagcacgacatcta
gcccttcgggctttataaatctatgtttCTACCCTTAAAAAgactttttt
caaagcaaaaaacaAAGGCTTTACTAAAAATAATATCTTGTTTTTACAGT
TGTTCGAAAATTACAAGACTTCGAATCTCCATACTTATCTTTGAAAGCTG
TAACCAAACCGCATCGCATTATCATCAGGAAAAAGTAAGTACATTGTTCA
AACACCTATAAACCATGAGTTTTTTAAAGCCCCGAAGAGACGAGAATTTA
ACCTGTTGGGACCCTTGGATAGGAAATAAATAGAGTCTCTTATTTCCTAT
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AAGCGTCAGATTAAACCGGCCATTAAAAAGTGTCCCAAATTATAGGGCTT
CACTTTTTCCTTCCTTGGGAATTGTTGAAGATTTCTATCTAGTACCTCAG
GCTTAAAAGTGAGAAAACCTTAGGAAACCGTCATTTCCCTaacataaaaa
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ATTGGAAGATAGGATAGCAATGAACCTTCTATATGTTCAGgttacatatt
tttaaaaactagGCCAATTTGTCGTATTGATTCCATTTTCCGTCTGGGat
taaaaattttgctttgaccactaatacactcattttgtgttataagcata
cggtaaatttcggctgaagctcactatgcttaagtaaagctcaattttga
gcctcgactatacttaaccctatgcttggtaaaaaaattatgaaggggTG
GTAAAAATTCTCGCGCATTTTCCCCTATCTTTAATCTTGagagaaatgaa
gacattctattgttttcgaatgtttaccatatgatttcttctgttatttt
cagaagtttttgaaattatgattCTGAAAGTTTCTTTGGCTGtgcctcaa
ggtatgcttagcatatgcttaatttttcttgaaatttgagcttcagtatg
cttataaaacaaaatgagtgcATGCAATTATTTTCTCTATGCATCAATTA
TCTTGATTTTACTTTAGTGCGAAAGTTTTTGCGGAGAACCAGGGATGTGA
GCATTTTGCTCATGTAGATCTAGTTTGCTATGATTTTAATGATGGAGTGT
TTGACTTTGTAGATCACAGATGACTTAGACCGTGGATGGATGTTATGTTC
AGATGAacagaaaaaaagaatgaagaaattacaaaatcaaGGATCAAGAA
AAGATGTAAGAACTTGATTGCAATGAAGATCTATAATGCTAGTATAGAAA
AGTCTTAGTTTCTAAGAGACTTAAATTTGAAAAGCTGANCGCTAGTATAG
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TTCTTCAACGAATCATTAGAGATTTTTGccgaaattttggaaaataatga
ttttttgggaaattgtCGTAAAATGTTCAAAGAGATGTCAAAATTGTCGG
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TGAAATAATCATAATGTATTTTTTAAAGTCTATTCGTTTTAAAGGAAcat
aaaaatagtaaaatgtaaacattgtgcgaaccacgtttcattaaagagaa
caattaaaatcatgtgtcctaaacaaacttgtaaaacaatttaaaaacaa
tcaaaatcagccatatttgttttgattttttattgtgacatttgcatacg
gtttgtttacaaatttcgtcagtacttttatgtccctttaagtgtACGCT
GTATTTCGCTACCATATGATAACAATTCTCAAGGAAATTACTCAAATTAC
GCTGATATGGTTTCTACatggtaccgtcaactgctctaacttgggacgat
tggtcgaaacatgggactggttgatatctggccagtatttttacttactg
AACAGGACagtaaatttgttttgataactcccccaagtttatcaatctta
ctgtcataacatgtcacgataccTTTCATTGATAGTGCGCCCTTTTTAGc
tgttttgttttcattgaaaatgaccggacgccgattggagaattagagaa
aaCCCACCgtctaaccgcctatcgcctgGTGGGATTAACAATTAACGAGT
GTGGAACTTGCAGCGCGAGTGACGTCTCCAtcattttgccactaatttgt
tcttcttcgtcCCAGACATTTACGTGTTCCACTACgaattttttacatat
tttgatttaaaagcctactcggtgcgaaagagaaatcgtgtatttatTAA
TACACCGTTCATTGACTCAAATCAggtgactttggaggttcggtgaaatg
gtggccgaaatgccgtcccatgttttgtcagatagtcccaagttagagca
gttgacggtaacaaAGAAGAATGTACACTTAAAGCGAATATGTACTTTAA
TGTTATTTTCGATTCAAACATTCCAGGTACTTAGGTTGGCACGTGACttt
aaattttatggatttctACATTACTCGCCGTGCACGTCTGATTATCCCGA
TCCCGATTCAAGTGCATTGATCGCTTCCGGTGATCGGGAACTCAACATAC
GTGTCTCCAAGGAGAATGTAAGTCAATAAATTCATATTCCCTTTTAATCT
AAGTTACATGACATATTTAGcggccgtagcatgaaggtagagcaccCAGT
TAGGgagcgcaaggttgtgggttcgacccccccccccagctgggtcatac
caaagattcccaaaatggtacctGACGCCTCtatgcttgatgctcagcaa
ctaaagagacggatcaagggtaagtggggAAACCAGGGAAAGAAGTTGCA
TCTTCCCCTACTTTTGagtagacagctagagaaatGGAATTATCACATCT
TGAAAGTTCGCATCAGTGTTGATGTTAGGAAAAGGGGCTTACCACGATTT
TAGTAATATTAGTTGTAGATCCTGTTTTTGATATTAAGATTTTTTCGGAT
TACACCCTCTTCATTAATCAAACCATTGCAATTTAAAATAACTACACCCC
CTCTTGGGTCAGAATTGATAACATACACAGCCTGCTACTTTGGCTTAGCA
CTCAATATCGAATGGTTAAAGtgattatatattatatatagaATTTCTTG
GAAAGGAGTAGACACGGGAGCCATTCTGGTCCCTTTTGACCGCCATTACA
TAGATTTCATTGGCTCCAAACAGAAAGCTACTGAAAAGGAAGCCTTTCGG
GTCTCCTTGGACTGCCATGACAAACCTCTAAGTACATATCTCCTTAGAAC
GCGAATTCATATTAAAAGTGATCGAAAATGGAACCTTTCTGNTTAAGATT
TTTTCGGATTACACCCTCTTCATTAATCAAACCATTGAAAGTTAAAATAA
CTACACCCCCTTATGGGTCAGAATTGATAACATACACAGCCTGCTACTTT
GGCTTAGCACTCAATATCGAATGGTTAAAGtgattatatattatatatag
aATTTCTTGGAAAGGAGTAGACACGGGAGCCATTCTGGTCCCTTTTGACT
GCCATTACATAGATTTCATTGGCTCCAAACAGAAAGCTACTTAAAAGAAA
GCCTTTCGGGTCTCCTTGGACTGCCATGACAAACCTCTAAGTACATATCT
CCTTAGAACGCGAATTCATATTAAAAGTGATCGAAAAGGGAACCTTTCTG
CCCCCCCTTGGACAGCCGTGCGAAGCCTTAAACTAAtttcttgttcattt
ttttttcaggatacAAAAGTAATGGAGGGTCGGTTTAAAGTTCAACGAAT
TCGAAGCTGGAGGCTTACTTCATTGGTAAGGACAATAAATAGCCGAGTCT
TTTTAATGTGACGCCATtgattgggctgttccatttaaAATCcctacagg
ggggtggacgaaccttttcaaacGAAAGAATTCGttaaaatgtgtggata
ccccccttgaaaatgtcaaaatttgcaaCAGCAaaaaaacccttggaaaa
aaaaaatattcttcataccttaaagtgagggtggacaaactaaaatcagt
ctgtTAAACTCTGGAAGTTTTGGAATAATTTGTTACCCCATGaaaggtaa
aaaaaagtttccttaGATCCTCTGGAAATACTTTCCCAGGAGAAGTTGGT
CCAGGGGGTGTATtgatataaaatgaaatggccAATTGGGCCATAAATGT
CTTGCCTTTGATCTAATTTTTAAAACCTTGAATATAGCCAAAAGGTACTC
TTTTcaagcaagtgaaaaaaatagattttacatTCTGAATTAAAATACAT
GAATTTGTATAAGTTGGATTATGTTACCCACTTTAGCTAGGTTTTATATA
CTTCTTGAAAGGcctaaaataaaagaattgacCTCTTCAATCAAAGGCTT
GAAAAGTCTTGTGCCACATTTTTGAGAGGTGGTTTCCACccaaaattttt
acttgaaaaagatgaaaagaagACATCGCCTTTGACGTCAAAAGAAAGTT
AAGTAACGCATTGACATTAGACAGTCAACTTTCTGCCCGATTTAATTCCG
AATttgaataggcagggcgaaaagagGACCGTCTCGACCAGGGCTTATTT
CATTTTAGCCCCTTTAGTGGTTTGAGATTCCACATTTTAAGTCCTAAccg
ttttcaattttctttattaCGAAGCCTGGGGACGATGATGCGAGCAAAGA
GAAACTACAATTTGCTTTCGAGTATTTGTTCGGTAAAGACGAACTTCGTT
GGGTAACTATCGAATCAGATCAAGCGATCATGATGTCCATGGCCTTACAA
GGAATCGTTGATGAGATATTGAGAGAGAAACGTGGTCAAGGTATTAGGCT
GGTAAGTTCTTGTTTACACGTTACGGATATCTGTTGTTTTGAAGCGGAAA
GGAGTTACGGTAcgacatagatttataaagcccgaagggctagatatcgt
gctttaagctcttccaaacAAACAAAGTTTATATCGCAGAAAATATTGCT
GTTATTGTTTTCGagaacccgcgaagcttctaaTTGGTNagcaagtgaaa
aaaatagattttacatTCTGAATTAAAAGGCATGAATTTGTATAAGTTGG
ATTATGTTACCCACTTTAGCTAGGTTTTATATACTTCTTGAAAGGCCTCA
AATAAAAGAATTGACCTCTTCAATCAAAGGCTTGAAAAGTCTTGTGCCAC
ATTTTTGAGAGGTGGTTTCCACccaaaatttttacttgaaaaagatgaaa
agaagACATCGCCTTTGACGTCAAAAGAAAGTTAAGTAACGCATTGACAT
TAGACAGTCAACTTTCTGCCCGATTTAATTCCGAATttgaataggcaggg
cgaaaagagGACCGTCTCGACCAGGGCTTATTTCATTTTAGCCCCTTTAG
TGGTTTGAGATTCCACATTTTAAGTCCTAAccgttttcaattttctttat
taCGAAGCCTGGGGACGATGATGCGAGCAAAGAGAAACTACAATTTGCTT
TCGAGTATTTGTTCGGTAAAGACGAACTTCGTTGGGTAACTATCGAATCA
GATCAAGCGATCATGATGTCCATGGCCTTACAAGGAATCGTTGATGAGAT
ATTGAGAGAGAAACGTGGTCAAGGTATTAGGCTGGTAAGTTCTTGTTTAC
ACGTTACGGATATCTGTTGTTTTGAAGCGGAAAGGAGTTACGGTAcgaca
tagatttataaagcccgaagggctagatatcgtgctttaagctcttccaa
acAAACAAAGTTTATATCGCAGAAAATATTGCTGTTATTGTTTTCGagaa
cccgcgaagcttctaaTTGGTCAAGCGccgaaattctattgtaatgttaC
GTGACCCAGGTAGAATTCCCTACCTAACTACGgtacacttttcagccaaa
gtacGACATccagcccttcaggctttataaatctatggttacGAAGACGC
TCTCTAactcgacgttctactattggATGCGCTCCATTATTAggtaatat
tgaaagtcaccgtcaataaGGGAGTGTCAACTGTATTCTTTTTGGTTTGA
AACAGTTGCACTTCCAAAAGTGACCAATAAAATGCAATTTCGTATTAAGC
GGTGATTTTCCTCTGCAACGTgtaaaatgttattttattctggaataaaa
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ttggccaaaacccccctagaaaaattaaagaaattaggTGAAATTGAGCC
TTATCGCTAATTTGGACTAAATCGAAAATTAATCAACTTATATaggtatg
tttttttatagtgacctaagattttttcttaacttgactttttgtttgtt
tagccacgaaagaaagaaaagaaagatcCGAACGATACATCGTCGTCTTC
AATATCTGGACAATCCTCAAATAGCACGGTAAGTCCATATACAGTAGAGT
CGCCATAACTCTAATGTCTCCTTAATTGGAACAAGTTTCTTGGTCCCTCC
AACAAACAAACATCTTTATAACTTGTCATTTCCAAAACTCTCGACCAAAT
TTCAATTCCCCGCgcgtgttcgaattatggagactccactctattcatga
tatgcaccactgcaacgacttcacgAAATCATgcaaattttctgtttttg
ttccaaccaatacttcactttttttattgtttaagtGAAGTatttgggtg
gaaaattttaaaagttctcagaaaactctccagtggtgcattaTCATGAA
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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_97 | supercontig | scaffold_97:361162..381811 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| SNX17 | sorting nexin-17 isoform 1 | Homo Sapiens |
|
