XLOC_045590 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045590
Unique NameXLOC_045590
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_92:12021..20823-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045590 ID=XLOC_045590|Name=XLOC_045590|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8803bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_92:12021..20823- (Clytia hemisphaerica)
ATTTCACAAATAAAAGATATAAGTTACTGCGAATTCCAATATAATCGAAT ATTTTTGCATGATTTTTGAAGAAAAAGTAGTTTTTGTAAGAAAATTTTAG AATTTTTGCCTGTTCGGTAAATTCCGATATTATATGTTGCGCTCACATGG CGTAACATTTTCGAATAAGAGACATGGTTCTGTTACCCAGGCTCCTTTCA GTCAAATAGTCAAGCGATAGCACAGAAGCAGCAATATGCCTGTATGTAAT TTATTTGGTATTTTGGTTGTTATTGTTTTATTCTGGATTATTTTTGGAAT ATTTTGGAGTTTGATGTTGGTATCATGTGTTGAGTTTGTTATTTCTTTCT TTTTAGCTGTTCAAAGACTTGCTAAACCCATCCCTTGAGGAAGAACGAAG AAAACACAAGTTTTCAAGGCTAGTGCCCTCTCCCAACTCATATTTTATGG ATGTTAAGTGTCCAGGTAATAAAACTTTACAACATTAAATCACATTTAAA AGTAATGGAGTTAAGACCTACTGAACTTGTTACATAAAATATCTTTGATT TGCTGAGTTAGCACTTTTCTCTGCTGACTTACAAATTCAGTATTCAAACT AGCCACTTAAATCACTCACTCATTATTTGATTCTGGTACAATTGAATAAT GAAATAGAGGAAGGCTAGTAATTTTTACATCATCATTAGCCTCATTTGGG TGTGCGACGAATGTACGATAAGTATAAGACAATCCAACCTAATTAACCAT TTGTGGATAAAGGACCTTGATGCTTTCCTTAGTGCTGTGGAAAGAATGGC AGAATTCAATCTAACATTCTATGTCTGGTGGTAAAATTTGCAATTTATTA ATTATGTTGGCGCGTGCGCCTCTTTTCCCATCTTGCACCCTTATTGAAAA ATTGAATGTTGGTACAAAAGAAATTTTGCTTGGCGCGAGGCTTGCTGCAC GGAAAAATATCTTCGGCGCGAGATTTCGTGGAATCCATACTGGACAGTAT GTATTGTTTGGTTGTGTATAATATTCTCAACTTCAGTTGAGCTACAATCT GACAATGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCACAAAAA CTTTAGGGCAGCCTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGTCAG AGCCTTTGACGCTAAGAAATTTCAACAGAATATTGATTTTCAAACCTGTA ACATTTTGTATTCCGTCCTTCGCTACACCTGCCATCTTATAATTCAAATG CATAAAATATAACAGAGATGATATCCAATACTCTTCCGTTACGTTTGTAG GAAAATGTTATTATCTCCCTAACCATAAAAACAGAGATACCGCAATAAAA AATAGATGGGCCGTATTTTGATATACAAGGGCCGCGCTGATGGACCGTCT ACATAAATATGACAAAATAAGGACCCGTTTGTCTGGGGACAAACAAATGT GAAAGTCATAAGTCAAAACCACTGTTTTAAAACCAAGCGAAACGAAGCAC AAAAATTAATGTGGCTGGAATATCAATATCTGTAATAATATAGAAGAAAA ATTACTTTCATCGATTTTTGCTATAATTAATGTAAATGACGCTAAGAAAG AGGGGTGGGGGGTTCTTCAGATAGTGTCACAATGACGTTAGTTGCAGGAA AAATCAATATGCGAGTGACCCCTAACTGTTATTTGGCAAAGTTTTAAGTC AATTTTGTAGGGTATTTTAGTTTGAAAACCAGACCCCCGCGCTCGATAGG ATCGGTCATCAGAACGGCTCGATGACTGATCGATAGATTACTTAGCGATC CGGATAGGAGATCGATAGAGGATCGATACTCAAGATTTTTTAAGCTTATG ATTAGTTATCGATCTATCATCGATCTTTTATCGATATTATCGACCCTATC GACTCTTTCTAAAAATTGTGCTTTAATATTAATTGATCTTTCTTTCTATC GATTACCTATCGATTTACGATCGATAAAAAATCAATTAACGATCAATGAT GAATCGATATACTCGATTGAAATACTAGCTCGATAATGGATCAACAAAGG ATCGATACTCAAGATTTTTTAATGGCTGAATCTTCCATCGATCTCCTATC TGGATCGTTAAGTTAAGTAATCCATCCATCACATATCGAGCCGTTCCGAT GATCGATCTTATCGAGCGCGGGGGTCTGGTAAAAAGTACAACTGTTCCCC CTTCCCATCCAGAGCCCTATAGCAAACTCTAATTTCACACATATTTTTCA AAATTTGTACATTCACACATATTTTCATGCTCACGCAAACCTGTGTCACA CAAAATTGGTAAACTTTTTGGGAAAATCAGATAAGTTGGATGTGATAAGA CAGTCACAAGCAGATTTGTTTGCGATCAGGCGTCTGTATAACTGTATTAA AAACTTGTTGAATGGAGGTTACACACCTTGCCTGACTCTCTGGTTACCAA AGCACAAGACTTAATATATTCATCCATTTTCAGGATTATTTAAAATGCTG TAAAATGTATGAAATTGTGATGAGAAGATTAAAATTGCCTTACAGGATAA CTCAAACTTGATTTATTTTTTTTACAGGATGTTATAAAATCACCACCGTT TTCAGTCACGCACAAACTGTAGTCTTATGTGTCAGCTGCTCAACTGTTTT ATGTCAACCAACTGGTGGAAGAGCCAGATTAACAGAAGGTATTAAATAAC TTTATTAAAAAAAAAAGGGTTATTCAAAACAAAGGGGTAACCCATTTTTT TAACCTTGCTTTCCCAATGTAGACTTTATACGTATAGAAAGAAAAAATTT TAACTAGAGATTTGTCAAAGTCAGATTGACAGTCATGGAAGGTCTGAATC ACTTTACCAATCTTGCAAAAAAGAGTGAGCAAGAATAGAAAAAAATTTTC TAAACATTTTTCATTTCTTTTGGGATATCAGCACAACTTTGAGGTTAAGA AGCTGTATAATAGTAATAAAAAACAAATATATTTTAAAAATATCTTTAAT ACTGCTTCTTTTGGTGATTTTGGTCAAGCTGTCACTTTTTATGGGTTGCA GGAAACCCAAACAATCATAAGATGACTGCATTGAATCTGCAAGAAATATT TCTATTGAACTAATCTTAAGGACTGTCTTTACACTTGATGCAGCTTGATG TATGGTGTTTGTTTTTTCGATTTAACTTTTTTTCCTGAAATTTTTTCATG ATAAAGGTATATATTTCTGAAAGCCAATAAAATTATCTATCAAATGTAAT CAATTAGGATTATTATGCACAAAGTGAGTAGAAATTACAATGCTTTGAAA AATATAACGTTTGTTAACTTCAAAGAGTTCAACTTGCCCAACCACTTACT TTTTGGACCTACCCTAAGGTAGTCCTTTAAATTAACCCTTGTCCGTCCGT CCGTTCGTCTGTTGCCAGCTTTTCTCGGGATCGGCTCATCATTAGTTTTT TCTAATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATACCCAAAATGTGACGG AGCCCGATTTTCGAAAAAAAATTATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATAT GCCGGAAAACCCGTTTTTTTGGCATTTTCTCAAGATTTCATCATTANNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTGTGCTAACAGA CCTCACATATAAATGAATTTGTGTTGCAATTTTGATTACTTTTAATCCTG AAGAGCTTTCCTAGGAAAGAAACAAATTTAAGGTAGCTTCAATAAGAATA TTTTTTGACTGTCCACGTGAGCAACTTGCAACAGTCTTAGTTTCGTATGA TTACCTGGCGTTAAAACTATAAATTTGACTAGGCTTAATAAGATTTTCAT TATTTTTCAATCAGGGTTAATTTTTATAATTTCATTATTAATTTTTCACC GGACTGGCGGCTACTTGCCCTGCCATATTTCTCACCAAATTTGTTTTCTT TTTTTTTACTAGGGTGTTCATTCAGGAAGAAGCCACAATAAATTCGATCA ATGAAATGAGGGGATGTCAAGCGTAAACCGTTTGCCAACTTATCACCTGA AGGATTATATACACCTACTGATGGATATCACTCGAAATATATCATTTAAA ATAATATTTTGTACATTGTAAAATTCAATCCTTAATGAGTTGGGAAAAGA TTTGTGCTTGAGATTACTTTTCAAAATATTTCGTTTCAATTCTTTTAAAA GTTCTGAAAATGCATGTAGTTAACCATCGTCAGATCACAAGCAAAATCAT TGAATCAGATGCATCTGGAAACTTTCTTCACTATTTTGACTGCACAGAAT CAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073455TCONS_00073455Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_92supercontigscaffold_92:12021..20823 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1176.03 1223.59 1303.79 1429.9 983.26 821.8 1276.14 1372.21 2437.19 2000.14 2670.26 3136.54 3044.93 3230.41 2949.83 2791.35 3148.85 3218.86 1832.89 1951.6 3073.81 2963.55 2005.37 1947.96 1798.49 1783.06 2985.19 3066.1 1738.52 1784.4