XLOC_045539 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045539
Unique NameXLOC_045539
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_91:82369..87649+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045539 ID=XLOC_045539|Name=XLOC_045539|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5281bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_91:82369..87649+ (Clytia hemisphaerica)
TTTTAAGTCACAAATGACTGAACAATCTTCTCTAGAAAAAATTGCAACTG
ATGCAATTAAGAAAGTTGATTCAAATTTCTCGTTGAAGAGAAAGCAGATG
GACTGCATCGATAATGTTGTTGCTGGTAAAGATACTCTTGCTATCCTTCC
TACCGCATATGGAAAAAGTATGATTTATCAGCTACTTCCTTCAATCTTCC
GGGCCCTTCCCAACAGTTCGAAGCATCCAATTGTTCTTGTGGTTTCGCCT
TTACAAAATCTGATACCGAATCAAATTGCTGAAGCTGAAGAACTTGGTTC
ATACCTCAACATCAAGGCATGCAGCCTTGACAAATGTTCAGACGTTGAAA
CACTTAAAATGAATGGGTACAACATCTTATTTGGAATTCCTGAAAAATGG
CTTTTGTCCTCAGTGAAAGATTTTCTCACCACTTCATTTCTTCGAAAGAA
CGTTGtttgtgttgttgttgatgaAGCCCATAAAATTTCGTGgtaagtaa
tttttatttctatgaAAATGCCTAAAGCAAGGCCTTTTTATTTGCTAGCA
AATTGAAACAGAAAAATCTTTCATCCTGCATATATGTTCCatgtattttt
taaatcaaaatttcaatttgtgACATTCCCAGGCTCAATCATGATATATC
ATGATATATCTTAACAGAATCAATGCcaagaaaaaagcaaaacgaATTTC
GACATTCGATTTTGCAACACTGTACACAACCCTTCCACACGATCTTCTCA
TTGAATTCTGGGTTGTACAAAATTCTTCGCCTGTTATTGGACATCTTAAC
AGAATCAATGCcaagaaaaaagcaaaacgaATTTCGACATTCGATTTTGC
AACACTGTACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAAATTTACCCTTACTGCATTGAGAagttttttactctttttttcaGGGG
TGTTCCTGCTTCATCTTCTACAGAAAGCGTATTCAGAGAAGCCTTTTCTC
GCATCGGAGAGATTCGATCATTTTGTTCAGAGAAAGTTCCCGTTCTGGCC
CTTAGCGCAACAATTGAGATGGACTTCACTGAAATTTTGCGTGGTGCATG
CAGTCTGTCTAAATATGTAAAGTATATTCATTCTTCTCCTGATAGAAAGA
ATATTAGACTATCAATCGTAGATGCTGGGAGCAAATCAATATCGTGCTTC
AATTGGCTGCTCAACATTATCAGtcaaaacagtgaaaacactccaAAAGT
GTTGATATATTGTCGATCTCAGAAACTGGTTTCTTGGTTATTTGGGCAGT
TTCTATCCAAACTTAGATTAGGAATCTACAAAAATCGGGAAAAGCATTAT
GATAATTTTCTTGTTGGCATGTTTCATGCAGACACATCACCACACAACAA
AGAGAAGTACCTTGCTTCGCTTACTTCTGTAGATGATACATTACCTCGTG
TCATAATTGCAACAAGCACAATCGGGTGTGGTATCAATGCAAAAAGATTA
AAGTATGTTTGTCATTTTGGGCCTGCTTTTTCACTGCCAGCAGATTGGGC
GGGCAGGACGGAATGATGAATCGGATTATCATGCCATATTATACCCAAAT
AAGACTCAGGGCAGCAGATGGCTCCATCTTAATACGAAAGAATGATTTTA
AAACTGTGTAGGCATATTTACTTCTTCCATAACACTTGAAATAAAGGACT
GCAACTCGATAATGCTCAAACAGCCTTTCTCCATCCCCCTCTTTGATTGC
ATCATTTATTGACCTCAACAACAAATTGTAAGTAAACAATGCTTTCTGAT
AACTCAATTTGTGATTGATAGTTTCCTTCTCTTCCTCCTCAGTAGGTTCG
TTAGTTGACTCCATAGCATTTCTAGAAATGAAGAAAttatttctatatat
tttttcaaatattattgtATTTGAGTGATATTTTCTGCTAAACATTTTCT
GTTATATCAGATTCtattgtaactttttattttagcaCATTTTCGATAGA
GCTTTCAAAGATTATTTTATACTAAACTTTAGACAGGatatctatttttt
attaccTGTCATATTGGTGCTTAGCAACTTCGTGGCTGTCTCGCCCGTTT
TTTGTCTTGTACggtttttttgttgtgtttt
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073386TCONS_00073386Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073386-proteinTCONS_00073386-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_91supercontigscaffold_91:82369..87649 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0 tpm) - - (1.94 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0.03	0.14	0.04	1.25	0.69	1.46	1.94	0.38	0.7	0.26	0.43	0.3	0.33	0.12	0.23	0	0.1	0.04	0.03	0	0	0	0	0	0.1	0	0	0	0