XLOC_045379 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045379
Unique NameXLOC_045379
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_87:6316..33962-

Legend: gene
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>XLOC_045379 ID=XLOC_045379|Name=XLOC_045379|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27647bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_87:6316..33962- (Clytia hemisphaerica)
CAAAACAAAAACAACATGGCGGAAGCTCACGTGAGAGAAAGAGGTGAGGA ATTGGCTAAATCTTTCAACTTTATAAACAAAAAATTATGATGAAAAATGT GAATATCAACACTTTCTGAACAGTCTAAAGTCTACTTTTTTCAAGGCTCG CAGTTGGCAGTAAACTTGTGAAATAAAATCCCTCAAAATTTTTCTATTTT TTTTGCTCCTGCTCTGTGGTGGTGCTCTATATATGTCTCAAACTGTCAAA GTTTTGTTAAATAAAATACAAATGCTCTGTTTTCCGAAGAATCTGTAGCT AAGTGGGTAAGTGGCCAAGTAAAAAAAACAAGGCTACTGTGTATAAGTCT AGTAAAAGTAAGTCTAAAGAGCTGACTAATATTTCTTTTTAAAATTCATT TTTCAACTATCCAGAGTTTATACTGGTCTTTTTCTGCTCAAGACCAAGAG TGGTGTGTTTCTCCTGGTTTCTCTGGGAATGAGGGAGATGTATACCCTAA TTTTTTCCTCCATCAGAATTATTAAAAGGCAAAAAGAAGTTGAGCAACAG CTTCTGGACTATGATTATTTATTCTCTAAAAACCATGAAGCGTATAATTT TTTTAAAGATTTTGCCAATTATATATATAATAACCATTTCTTTTTCATGC GTAGAGTTAAAATAAAAAAATATAACTTCGAACTTTCAAAAGAAACTTTG ATATAAATTATATAATGAACTTTTTTAAACCGTCACCGTGCATGATAACT AAAGCAAGCATACTGTGTGTCAAAAGATCTTTAACTCACCTATTTTTAAA TGACAAATTGATTTAAAATTTGATTGAACGAATGTTATAAAAGTACAGCC CTATTTTTTCACTTTGCTGCCAAACTATTTTCCCTCTGCTTTTTTCCTCT AAAATTCTGGTCCTCAATTTGTTTAAAGTTGTCATTTCATTTGTTTTGTT 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TACGAGACAGTTTCTCTTTCGAAATAAAATTTGCAATACCCCTCTCCATA GACATGTCCTCTCCTAGCCCTCGGCTTGAATTCAAGAAATTTACGAAATG AATACCAAATCTTGGAAAATCTTCTTTGTCAAACTTTCTGCAACTATTTT TTTCTTTTGAATCGGATGTATTTTTTGTGTCATTATTTTATCCATTGGTC TGACCCTAATGAAATATTTCGATTCAAGATTTTTCTTTTGGCAATTTGGA ATCACACCCTGACCTTAACTGGTAATGACCCAATAACGACAAAAAACGAG AAAAAACGACAATTAAGAACGACATTTGCATAACGTAGATCAGTACACGT TTTTTTTTTTATAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTT AGTTTTTTGGATTTGAAGNATAAAAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCG GATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTT CTTATTTTCAGCATTTTTTCAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAATG CATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTAGAATGTTCTTAAA CATTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAA AAAAACGTGTACTGACGTAGATGTAGTAATTTTTGCCTTGGATAACAAAA TATTTTTATTGTCCTGGGAATTCGAAAAAACGATCATGTTTTTTGCCGAG TTTTTTTTTTGCAACTTAGTAAACATCTTTTTAAATTCAAAATTATACTA TTAGCGAACTTTTGACATCGATTTTTTCAAAATCGAGCGGGACGGCACAG TCAATGTTGGCCGCTGCCAGACAAAATATGGAACTCGTAAATAATAAAAG AGCTCCAATCAATCGATCAAGCGACTTTTTTAGGACAAAAGAATTCGGAC 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TTTCCTCCAGACACTTCAGTAAAAATATTGAAGCAGTTCCAGAAGTTTAA CGTTAAAAAAGCTTTCTGCTAGGTTTTTCCCTGGGCTATTATTACATCAA GAACATGGAAAATGTCCTTGAATTTGCTGAAACTTATTACTGCCATGTAT ATAACATAAACTGTAGCATAAAGATTTGACGTCAAATTTTTTTCTGGCTG GTTGTGCTCGTCGAAATGCATCAAAATGGCGAAAACTAAAGAAATACCAA AAAAAATCGAAATTCAACAAAATAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNATCAGTCCACAAGCTAAAGAAAATTATAACTGATTTACGAG TAACCGATGATTTTTCTAAAAAAGAACGCGAAACCATCAAAGAATGGCAT AGGAACGCAAAAAAGAAGACAAAGTTACAAAAGGATGGCAGTCAAATAAA 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ATGTCTAGGTTTGAGCATAGTATAAGAAAGCCGCGGCTGGAATGATGACG CTATTGTTTTTGTCGTAAATGGATGTTCTATCTGTGTCTCCGTGGTTTTA TAAGAACTAAGTCGAAGGTAACAAAATCCTTAACCTGAAAAGTGTTTATA ATATTCAATTGAAGAACAACTACTTTTCAAGTCTCAAATTTTTCCCACTA TCCTCTCTTATTACCTTATGTGAAGTATATTTTTATAAATTCCAAATAAA TTTTTATAAATTGAGGACCAAATAACACACATTTTATTAAAATAACTATT TTCCAAATGTTAAACTTTGAATGCTTGCTGTCACCTCAATACTGTTTTTC GAATGGAATTTTCACAGAATGCAGCTTGAATATTTATTTACTAATACCAG TGATAATTTTTCAGAATAATCAGGAAGGCATTTCAAGGCACTCAATTTTC TTCAAGTTCTTAAAGCATTGACATTCTGAAGTTCTAGTACTTTTAAACCA AGAGTCTTTTCTTTTACTTTGATGTTATGAATGCTTGAATTATCAAGAGA TTTGCGTTTATGAGCAAAATTACGTTTAACTAGGTAGTCTGTTAAAAGTG AAATTAAATTGACAATAGAAATTGTCACCGAACCATCAAAAAATTCGTTC TTACGACATAGATAGAACAAGAGAAATTCAGCCGTACTCATTCCAGCCGC GGCTTTCTTATACTATGGTTTGAGGTCAAAAAATTTTTTAGCCCATGTGA CGAAAGAAAATTTTGAATCCGCCATTATGGATTTTGAACTTCCTGTAGAT TTAATTATGTAATTGTTTTTTTCTTTTTGCATTTTATTACTTAGCTGGCA GTCATTACCCTCGAAAATTTCACGTCAACCAAGCAAACTAATGAAAAGTT ATTTCATCCTTTAAGATATTTCAACTTCTAAACAGCGGAAAGTAACGTGG AAAGAATTGGTTGACATGACACTTTATGTTACATGTACATCTTTATTTCA GAGAAACAGATGAAATGCTCTCGCTTCAATGACAAACTTCAATTACA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073167TCONS_00073167Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00073166TCONS_00073166Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00073165TCONS_00073165Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_87supercontigscaffold_87:6316..33962 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0.08 0.12 4.48 5.87 7.81 3.32 2.37 1.75 10.18 4.52 1.9 4.58 0.31 0.09 0.11 0.25 0 0 0.07 0.1 0 0.08 39.04 22.17 0 0.11 0.08 0.04