XLOC_043738 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043738
Unique NameXLOC_043738
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_516:302255..351143-

Legend: gene
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GCAAATTCAGTATATATAACTCTTGTGGAGTTGCTAAATTGATAGTCCCC CTACTCTGGGGGTTTTTGAATTGTACCTTGAACACTTACTATGTAGTTTA CAGACTATCTGGAAATCTCAATTTATGTCAATAACGTTAAAAAAGAGAAG CAAGGTTCCATCTTCAGTCCTCCATCGAGAATCTGAAGACTAGGGAAATT GGATTAGAGTACAGATGGCAAAAAATTTTCTACGTGATATATTTTAAGTT CTAGAATAGAGTATTGCAAATACTTCTCCTAAAGTGATTTGCCCAAACAA ATAGATTGTATTGGTTTTTGTTTTGACCTTTTCGCCTTTCTATATTTAAT AGATAGTTTTGACAATCACTATCCAAGCTTCAAGAGGCTATCATCATAAA TAGAAGAAGCTTATAAAGTTATTGCGATTTTCTGTCAAAATACTAAGGAA GCAATTTGACAAGCATTTAAAATACACAGTCACGAGTGTCATATAGAAAA TCACCCAATTAACAAATCATTCATTTTTCTACGTGTTATCCTTATTTGCG TGAACAAAGAGAGATTTGATGAGTAAATCTTGTCTCCAGAAACCTATAGT TAGCTGGCAGCGGGTACTTGGTAGTTTACTTTTGATATATGACTTGAGAT TTGTTGGAAAATGGTATCCAATGCAATTTATGAAATGGTAAGCGCTGTGT GTTGTATTAGATGCTATGCATTATAAGTGTATATGTCCAAGTACTCAAGC CCATTCACAATAACAGATCATTGTCATTGAGTTTAAAAAGCCCAAAAGGC TAGAGAAGGATCTCTTGGGTGGTAAATGAAGCCAAATAGGACCAGTATTA TTTACAATCTGAGTAAAAACGGTCTTTTGTCTCTGATGAAAATTTCCTGT CGAAATGTTTACAACTTTCATTCACTGACAGGGCCATATTAAGATTCAAG 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GCTTCCCTTTTGTGAGTTATTTATGATTTCTAAAAATTGACTTTTCAAAG TTCTATTACACGCTTTTTTTATAAGAATGGTGTGAACCCATTTCATCATG GATATTCTTAACTTTTTTGGGAAAATCATCCTAAAATATTCTTACTGCAT TCTTAGGTTAGGATCCTAATTCAGACTAGATTTAACAATTAGTACATACG TCTCAAGCATAAAATTACATTTTTGTGAAAGGAGTGAGCTTTACTTGGGG GTAATTAACAATTTCTAATTGAAAATGCTCTAAAAATGTCATTTTTAGCT TGCTTAGCAAAAATCCATGATGGTAATATTCTTAGCATATTCTTAATTTT TGGCCATTTTCATCATGGACAATCTTATAAAGTGTATTCTTATAAAAAAG CGTGTAGCTAACAAAAGTAAAGGGTTGTGTTCTTCTATTCAACTCGAATG TTTCTTTCTCCTTTCAACAGGGAGCAGATGATGAAGAAATGAAACGAGCT CGACGAAGGATGAAGAATAAGGTATGGATGCCATTGATTGAGATAGGCTA TGAAAATATCTATCCGTCCTTCTTTCTGTGTGTTTTCCTGTCCGCTAAAA GATATGGTACTTTGGTCCTTGGTTAAGCTCTTCAGCTTTTTTTAAATTTT TGGTTCTTTAGATTTGCACCAAAACGTACCATGAGTATCATTTTCGGGAT TTAACCTGTGGAGACGGACTATAAGACTTTTATTGCGCATGTCTCAATCA CGTTACTATTCAAATAATCGAAGATTTAAAGCAAATATACTTCTGTTATG TTTTAAGCTGGCTCCCCTTTCATCGAATGTTTTTTACGTTTCTTAATAGT GGTTTTGATTGGTACGGCCTTCATCCGTGTTCCTGGATGATTGCTTTGGT ATTTTTTGTACTCACTGAGTGCGCGCTGAATAGAATCCTTATTTTTCGTC ACAGTGTAATATTCATGACGGTAGCACCGTAGCCAAAACGAGGTTAAAAA CTTAAGCCAGCCTGGGGACTTCAAAATGAACATACGAGTAAAGCCGATAT CAACTTTGGGTTTGTGAGGTTCAACATTTCTTGTAAGACCTGTGGTCAGG CTGGAGCTAAGGTTATTTTTGTTCCTTTTCCCTCCTTTAGATCTCGGCAC AAGAAAGTCGCCGTCGCAAGAAAGAATATGTTGACGCCCTTGAATTAAAG TAAAGATAATTTTTTTAACTTTTTTTGATAATCTTTCTTTCACTTCTTCA TCAATAAACATAGACGATGCTATCGTCCGTAAACTATATTATATTATCAT TATATAACAATAGTTTGTATATTATAAAACGTAATATGTTGCGCGGCGGA AAATAGAGTCTGTGTTTACGACAACAGCTACCCCCCCCCCCCAAAAAAAA AAAACTCCTTTTTTCGCGCGTTTTCCTCTTAGATGAAATTCGTCTTAGAC TATAGCATAGNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAACT CCTGTCTTCGCGTTTGTTCCTCTTAGATGAAATTCGTCTTAGATTATAGC ATAGTCTACAATAAACATAATTTTTGTCACATACTATGAGGCCTAGAGGT ATAATTTACTACATTTTTGAAACAATGAATATGATCGAATGTACCACTTT ATGATTTTTATCTTCTGCGTTTCTTCTTTTGCAGAATGAAACAACGAGAC CAAGAAAAACGCTTATTGACAGAAAAAGTGACCGAACTTGAAGATCGAGT CAGGTATAGTTTACGCATGTGTTGTTTTCCTTTTTTGAATTTCTATATAG TCAAAATAAAATGTAGCGAGAAAGACTACTGTTAATAATTAGGATAATTT GATAACTAAAAAACACTTTCCTCAAATTTTGTGAAATTAAGGCAAATTTT TCCAACGGTCACATAGGTCACCTTTTATATATAGTTTGACAAAGTAACAA TAAAATCCATTTTCTCTCCTTAGACAACTTGTCGACCAACTCTTCCATGC AAAACAAAACAATCGCGAGAATACTTCCTCTACAATGACCGACACTGAAC CTTTCGTCAGACGAAGAACCACCGATGCTGGTACACAAACTGGTATATGT TTGGAATGGTAAGATTTTTGTGATTTCTTCCGGGCTTTTTCGTGGCCCGA TTCCGTCATTTTCACTAACGGTCAGTCATTTTTTTAAGAATTGTCACATC ATTTTAGGGTGAAATTTATGTCAATTAGGAATAGCAGATTGAGGTTTTGT TTGAAGATAGTTCCTGTCTTTTTTTAATAGTAAAAATATGTCCCTTTATT ACTAATAACTGAAATTCTACCCGAAACCCAATACCACTGAAGTAATCATT CCTTGAAAAGTTTTTTGGAAAAAACTTAGAATTCTTTAATTTATTATAGC TATCTACAGACACCGTCAAAAGTTTTGCTCACTGAAAGACAAATCAAGCA CGAAACTGAGGAAGAATTCCCTTCAAACGAGCTGACCAACGAAAAAGAAC TCGACCCCACTGATTGTTTGAATCATCAAACCTCAACACAAACCTCACCG TATAAAAAAACTTTTATTGATGATTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCA TCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCTGAAAATGAACGTTTTCATCCATACC GTATAAACAGAGAACATTATCGAGAAATCTCTGAAAATCGGGATCGATTC CGAGAAATTGCTGATTTTCAGGAAAACCGAGAACATGTTCGTTATTCGTC GTCTTTATCTTACCAACCCAGCGAAAGTCACCGACGATCTTCGGTCAGTT ATCCTAAATCACCGGAAAGATACTCATCACCTCACATGGCAAGATATTCA CCAACTACAAACAGGTCGGCCTCTCCGAGCCACGTCAGTGATCGAGCGCC CACTAATCCAAATTTAGACCGTGATCTGCGTCAAAACTCAATGGTTCTCC CTCCACAGGCTACTTTCCGTCGCATATCAAACGCCTCACCGCCTTCAGCT GAGAAAATGATCCCTTACTCGAAATATTAGATTATTTAACTCCCTTATGA AAGCTTCTGTTTTAAGAAGTTACAAACCATTACCATAATCAACCATTTCG ATGATCTATAGATTTTTATTCAAATTTTATATGTAGATAGTTTATTTGAA ATTGAAAAAAATGAAATTCTGAATATAAAAAAATAGATTGAGACTTATNA AAAAAGCAAAAAGTCTTGGAATTCTATTCCTATCACCTTGAGTTAATAGT TTATAACAAAAAATTAACATTACATATAAAAATTTTCGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070245TCONS_00070245Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070244TCONS_00070244Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070243TCONS_00070243Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070242TCONS_00070242Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070241TCONS_00070241Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070245-proteinTCONS_00070245-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_516supercontigscaffold_516:302255..351143 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.5 4.72 1.66 0.59 7.22 5.89 14.46 15.48 4.18 4.37 7.61 8.6 10.57 8.14 10.51 16.55 8.43 11.17 1.13 2.15 4.34 4.37 8.69 7.92 8.53 11.29 2.29 1.31 6.11 7.04