XLOC_042915 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042915
Unique NameXLOC_042915
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_49:282082..295422-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042915 ID=XLOC_042915|Name=XLOC_042915|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13341bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:282082..295422- (Clytia hemisphaerica)
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TCATAAAGAATTTCTCCCGGACTTAATTGCTACTATAAAATCTTTCTCAT GAAAACAAGAAATTAGTTGATATTTTTCTTCATTTATTTCTCTGCAGGAT TTGGTTACAGAGATCAACGGACGTTTGGCTCCTGATAGAGCATCGCCTTA TACTGCTGCTAAACTGACTGAAAGGTACCAATCGTTTAGTATCAATCGTC AGACTATAGATTAAGGTTGACCATTCTTTTCTACCAATAGACGATATCGG ATTTAGATAAATGCAATGCATTCTGGTTTCTAGGGACTCTCAAAGGAATT ATAATAGATCAATTATAATAGATTATAATTCCTTTGAGAGTCCCTAGAAA CCAGAATGCATTGCATTTATCTAAATCCGATATCGTCTATTGTTACACAT TATAAATTTGTTGATAAAAGAACTTTCACTTTTTGTTTAGAATTCTTCGA AAACAACCAAGAGTAGCACCCTGGAAAAAACACGTGGCCTTAATGTCTTC AATTCTTCAAGGTGCTCAACGATGTGGGACACCTTTCGTAAGATAAACGC TTTGATGGTGTTTTATTCTTCGTTTTATTCTTAAAGTATTTATTCAGTAT AGTCCATGTTAGCAAACAACTCATTCGGCTACTCAGCGGTTGCAAAGAAT TCCGAGGCAATGTTTATTATGTGGGTTTCTCAAATCCCCAGCTGTGACAA AATTAGCGAATAGATCCTGGGAATAAGTTTGGTTTTTTGATCTCACTATC ATGTAATCGGGACCCATTGACTTAGTGTTGAAGGAGGTAAAAGAACAGAC TACGTCTGTCCCGACTTCCTTCATATCCGACTCTGCTGACAGCTAGCAAA CGCACGCGCTCACATATACTGTTAACTCCTTTTAAGGATGGAGTAAGTCT TCAAAGAAGCGAAGGACCTGTGGAACGGCTTACGGAAACTCAATCTGCTT CTTATGTTTTGCACAAAGATGGTCAAACTTTGGTAAGATTGTTTTAGCAC AGTTGACGCTCTCTAATTTGATTTTCAAGGTGATTGGATTTTCATCGAAT AAGGGAGCGTATCGCTTATTGGTAGACAGTCTTATGGTAGACAGTCGTTC ATTGGAGCTTCTTGTTGACGGTGACTTTCAATACTATCGAATAATGAAGC GTATCGAATGGTAGAACGTCGTCAACTGTAATTTCTTTTCGATACAAATA AATCAACCGAATGCAACGCGTGAGGTGGTGAATGTAGCCAATCATAATTG TTGTGGTCTATTTATCTTCATTGTATTTGTGTTTTAGGATGAGATCGCAA AAAGACGCGCCTTGGTCCATGACACGATTTACGGACATATATGTTCTGCC CTTTTGGCTGGATTTCCTGTTCATTTGAAATTAGGTTTGTTTAAACTGAG CTCATTTTATTGTTGCATTAGAAAAGATAATTTTCGAAAATTGAGCCAAA ATCAATTTTATCTTTTTCCTTCAAAAACTATAGAAATCCATGTTTTTAAT GGCGACTGATGAAAAGAATTTTCCCTTCTTCTCTTAGTGGACTTGACTTT TGACGATGTTGCTCTTGTGGTGAAAACAATGAGTTCAGAAAATATCTCAT ACAGTAAGTTGTGTTTTGATATTTGAATGTTAATGTGCTCTTCATAAAAA ATGTGGCACATGGGGGGTGGAGGATATATGGATATATTATTCAGAGGGTT GTGAAAAAACAACAAACTTTGCCTTGTCCGGGGGTAAACTTACTCTGTTT GGGGGTAATTTTGCTATGTTTGAAAAGGTTTGCTGTCTAGGTGGAGGTTC AAAAGTTACAATATTCGGGGAGTCAATTTCCAAAAAATGTTATATCCTCC ACACCCCATATTCAAGTTTTTTGTGGAAAAGCCCAATATCTCGATGTGAC CATTCCCCATGACAACCTTATTCATTCTCGAAAATTCTTTTAAAAGACTA TTAAAATCTATTTAGATATCAGTCAACTGCGACCCATCAAAGATAAACTA CCAGCATCTATCGGTTTTGGAAAACTAAAGTTCGTGTTGGCCATGTTGGA AGTACATTTCGGAGTGGAAGGTGAAGATCCGCCTCAACAACCCAACCAGG AAGCACTTCAAAATATCATTGACAGCGCTATGCAGGTGAGGGCCGTAAAC TACATCTTAGGAATGGTAGCTTTCCGACATTTTTATTCTAAAATATCTCT CTAATGCTGACCAATATCTTTTCAACTTTTAATCACAGGCCAGTCAAACA GTAAACAGCCAAAACTCTACCAGCAGCAATAACAATAATGGAGCTAAACG AAAAGTTCCTGGATGGTTAGAAGCCAAGATGGGATCATCACAAAAAGCTT CTTATAAAAGATCGAGCTCCAAAAAACAAAGAAGTGGGTTTCTATGATGG TGAAGGCGTTTATGAGATGAGATTGAGGAAATGAAAGGTGAGAGTTTTTT TTTCAACTCTAAAATTGGCGTACTAGTGTAGTGGTTATAGGTTATAAACC TTGATTTCCGTCTGTGAGGTCAGGGTTCGATTCTCACTCGGTACTATAAT TCACTTGGCAAGTGAATGTACCTTCGCCCGGGTCGACCCATGTCTTGCGA GGGAAACTCATAGGTTCACTTCTCACTTCTCTCACTTCTCTCTAAAATTT TCGAGGTTTTCCAAGGTTTTGAAGGAAGATTCTAATTATGTGTTATGATC TCCATTGAAAGATTCGAAATATGTTACCCTCTCCACCTTATTTACATTTC TAAGTGACTTCAAAAAGGATTAAGTGAGACCACTTATTAAGGAGATGTTT TCTCTATCTGGGTGGATTGCAAAATCGTAGAGTGATAATATGTTTTGAAA 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CATTTAATCGTTTGATAAAAGTCTCATTCTCTTTTAAATCAGAAGTGGGA AGTCACTTAAATACTTCCAGTTTCAACACGACAAAAAATTGGATAGAAAA TTATTTTGATAAAACATTTATATTCAATACACAGGTTGCAAAATTATATC GGTGCAGTCAAAACATGTGATTACTCGAAAAAGTTCCCGTGATTTTATTC CCATGTTGCTTGCTTTACAACTTTTAATTACAACAGTTAATTACTTTATT AGTGTCAATAAATTCGAACCAATCAGAAATAAATGTCATGTAACAAGCAC ATGGAAATTTCGAGTAAAAGCGTGATTTGTCTTCAGAATTTTAATTTTGC AACCTGTGTATTACTCCATCAAAGTCTTACCGTTCCTGATGAATCCCTTA ACACATATTCAATGACTTCATTTCCAAACTCCAGGTTTCTACGATAAGTA TGTTCCACGCTTCTCTGGTATTCGTGGATGAATCTTCGCGTCAGAAATCG AACACTGATTGCTAAAAAAGAAAATTTTCATTTTTTGACAGGGAGAAGGA ATATGCCCCGGAAATATTAATCAATGAATCCTATAAGCCTGATTTATCAG AACGGTTAGCTAGGCCTTGATGATACCCTACAACTTTAACCTTTTCTTTT ACAGTAGGTAATTCACTCCATGTTCGTTTATTATGGATTGCAAGTAACGC TGCCAAAAACTATTCGTTGCGTTGGAATTACTTGAGTGCCTTTCTTGGCT TTCCATTCAACTTGCTATGTTTCGAGAAGAGGTATTATGTTATGGCAACT AACAAGGACCCTCGATGATTCAAAAATAAAGACTTTCAATGAAAACATGG CCTTTCATGTGTTTATATTACAATACGTTGTATTTTGACGATCTTCGTAT ATGTGTACCATGTTTTTATTACGTCACCGTTAAACTTTATATTCCTACAG TGTAAGATGTTGTGAATAGTAATTTTAAAAATCTAGGGAGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068843TCONS_00068843Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068842TCONS_00068842Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068842-proteinTCONS_00068842-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_49supercontigscaffold_49:282082..295422 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.83 9.85 9.54 9.49 3.9 2.98 7.05 8.09 5.98 6.77 3.27 3.37 3.37 2.92 4.33 4.34 5.96 5.49 1.15 2.27 3.48 3.74 8.87 8.73 5.18 6.61 0.9 0.82 4.78 5.57