XLOC_042146 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042146
Unique NameXLOC_042146
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_47:289378..297955-

Legend: gene
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>XLOC_042146 ID=XLOC_042146|Name=XLOC_042146|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8578bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_47:289378..297955- (Clytia hemisphaerica)
CCTCACAAGTGTTCACTCACAGGCTGAAAACAATTTCCTAAAACAAGAAT
TTCATAACAGGTTTATTATATTTTCTTGGAAATGTTGAATTATTTCAGGC
GTTTGCTTTTCCCGGGCCATAATATTATATAATCGAAACAATCAAACTTG
ATCAAATGGTTAAAGTTTAATTTTAATGAATCAAAATTTTCCGAAAGACT
TATTACTAAAGACTAATTAGGCCTAGAATTAGTCAAACTTTAATTGAACT
GATATATTTGTCCAACTTATCAACCAGATGATTAATTGTAATTTGTCAAT
CTTGAAACAAATAATCAAACAATTCAACCAATTTTTTTTTACAATTTCAA
AAAAAAGTTCAATTAATCAACAAAATTGAGCTTTTGTCTTTTAATCAAGT
CTGATAGAGCAGATTTAAATGTGGCCTAGTTTTCCATAACTGCTGATTTT
AATTTTTGATTTTACCACAGCTCTTTCATTCAATCAGGCAGATTACAAAG
ATGGCATTCAATAGATCTTTTCTCAAGTAATCAGATGAGAACTGGAGAAA
AAATAACTGTTTTATTCCCACACTGCGCCGAAAAAATTTGAAAAACTCAA
TCTCCCAAAAATACTTGAAAGGTTTTTTTACCGTTCTTACTTTGACAGAG
TTAATTAATATATTAAATAAGTTTTTTTTTCAGGACTGGAAGGCGAATCG
CTTGGTATGGTGGAGAGAAAAAGAATGGTGTATTTATCTGGTCTGATGGA
ACCAGTTTTACAAAAACTTTTTGGAAAAGTGGCGAACCAAATAACTTAAA
CGGAAATGAAAATTGTCTTTTAACAAATGATGGTGCGTGGAATGATGAGG
ACTGTTCAGTTACCAAGTACTACGTGTGCAAACTTGATTCTGGTGAGTTT
CTCATCATTTGTTGTTTGGTATTAATAAATTAGTTCATTATCCAGCGCGT
GTTTAAATAGCGTAAAATGATAAAAAATGGGTATTGCTCCACAACAGAAT
TTAAAATAATTCCCGCCCAACAACATTTAATTTGCTTTCCTGTCCAATAT
TTTCTGATTAATAGCTTCTGTAGAGGCTATATATTTCCAATACTGTATTG
ATGTCACATAAAGAAATGGAACATTTGAACATTCTACTCTTTTCCTTTGA
TTAATTGTTAATTTTATTTAATGACTTAAGTGATTAAATAGTTCACAAAT
CCCCCCCCTTTTATCAACTATCTTTAATAACAACAAAATGAAAATGACAG
TTTTCAAATTCAGAAAGCAAAATTTGAAAAATAAATTCTGCAGTGGTATA
ACAGTGGTTGTATATCATAAGGAAAATTATTCAATGCTATTTTTGCCTAC
GGGCATATAATAATTAATTGAAATATGCTTGAAAATGAGAATGATTATTT
AGTGATGAACGAATAATACACCAATTATATTGACGCAGTCTCAGCCAACA
TGAAAATTATTGGGCTGTGACGAGAACATATATTTTTGTATATCGGATTC
AACTTTTTCCAATAACTGATATGCTAACTTATATTAGGAAACTAATTCTT
GGTTATAACAACAATTGCTTTTTAATTCTGTATTTTTTATTTGCTCTTTC
AACAGAATTTACTCTGCGATTCCTCACAAAGCCATCAGTTAGAAAAAGTG
AGAGTGGCAACGAGGTAATCATTTCTGGTTGCAGTTATTCTTCGTCAACT
CATTCCAGTTGGATGGCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACAATGATGACTT
GATTGCAATTTTCAATGCAACCCAAGTTACTGATGAAACAAAAGATGAAA
ATGTTTTCACTCTACCTTCTGTCAAATTGTCCAATGTTGAGGGTGGTGAT
TTCAGTTGTGTGGTTGTTATTGACAACATGACGTTTTTTTCAAATACAAC
AAAATTCATTCCTGGTAAGTAAATTTACCATTTTAATGATGCTGATCCTT
AGTTCAGCTATTTTACATTGCAGTCAATACACACCAGATACACACCATGC
TTTCCATCAGAATTTTTATCACTTTGCACACAGACCAAGTGACAAGTAAA
GGTTTTATTATTGTAACCTGAGTTCTTTTTTGTGATTTTTTAGAGAACCA
AGTCACAAGTTTCAATGAAGCTCAATATTACTTTAGCATTTCCAAGAAGA
ATTGGCAGTCTGCAGAAAATGATTGTATTTACCTTGGAGGTCACCTAACA
AGTGTCCACTCTCAGGCTGAAAATGAGTTTATTAACCAAGAAATCAAGAG
GTTTGTATCATCAAGTTTCATTTCATGGTGAAATTTGCTTAAATACATAT
TGACTAGATTATAGTCCTTCTATAATGATATTACCCTCTGAGAAGTCACC
GGGTTCTTTGGAAAACTAACAATTTTACTTTTACTTTATTATCAATTCAG
AGTTTTTGGGACAGCCAGCCATATGAATAAGATTTAAATTTTAAATTTTT
TGATTATACTAAAGATTTTTTATTTACTATTCTCTGATAGGACAACAGGG
AATGTTATTGTTTGGTACGGTGGTGAAAGAAAAAACAATGTTTTTGTTTG
GACTGATGGTACAATTTTTACCAAAACTTTCTGGAATACTGGTGAACCAA
ATAACTTGGGTGGAAATGAAAATTGTCTTAACGTATATGCAACTGGAATG
TGGAATGACATCAGCTGTCATAACTTGTTTTATTACGTATGCAAACTTCG
CTCATCAGGTAAAAGAAATTATTGGGTGGGGGGGGTTCGGTAATTCTTCC
ATCAGCTCACTATAGCTAACTGTAATCTGATTACTCATCTGTTAAAGATA
TTCTATTATTCGAGCAATNGGGGGGGGGGGGGGGTTGATAACTCTTCCAT
CAGCTGACTATAGCTAACAGTAGTTTGATCGCTCATCTGTTAAAGATATT
CTATCATTCGAGCAATACTTTCTTTAGTGAGTTAATTTGCGTCCACAGTA
CAACCTTATTACATACTATTAACCCAAAACTAGGGGAGGTACCCGCCCTT
TCTCCCTAAATTACTCCGTTTAATTTTTCCTGATAGTTATTGTGTAGAGA
CATCAAATAAAAGTTTAGGTTCTTAGAAACATCCTTGGACAATTTAGATG
AATCAAATTCAAATTAATCACCTTTACGCTACCTCCAAGTCTGGGCCGTG
ATAACATTTCCACTTGGAAACATTTTCGATCTTCTTTTAAAAACCCACAA
TTTATGTTATTTAATTTGTATTTTTGAAATTCTTATATAGATTTTACATT
GCAATTCCTCACAAAGCCATCATTAAGAAGAAGTGAGAGCAGAAAAGAAA
CAATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTCTTCGTCAACTCACTCCAGTTGGATG
GCAAAATCTTTTATTCAAAGAAATAATGATGACTTGATTGCGATTTCTAC
TGCAGTGCAAGTTACTAATGAAACAAGTCGTGACAATGTTTTCACTCTAC
CTTCTGTTAAATTGTCGTATATTGAACATGGAGATTTCAGATGCGTGATA
ATCCATGACAGTATAACGTATTACTCTTTTGCATCCAAATTGTATAAATC
TCCAGGTATATATTTCTTTTTCAGCTAATAATCACACAAATGTTATTACT
TTAGTAGTAGTAAGTCTGCGGCCCGAAGGCTTGTCTTTCAATAGCTATCT
ACCCGAAGGTAGGAGAGGGCGCCATTCTCTCCCTGGATTGCTCCACTTAC
CCTTAATCCTTCTCTTAATTGCTAAGCATCAAGCAGAGAGACATCAAGTA
CCATTTCGGGAATCTTTGGTATGACCCGGCTGGAAATTTACCTCCACAAC
CTTGCGAAAACTAGCCGGATGCTCTACCACTGCACTACGATTGCTTTACC
CTACGGTAGTTACTTTAAGGCGCCTGATAAGTGCATTCCTGTTGTCAGTT
TTTTTCATTTTGCTTCCAGCTCTCGTTCATTGCACCCTCTGTTTATGAAG
ACACATTAGAGTAATTGTTTCAAATGAAAATTGTCAGAAATTAACCACCT
TTCAAGTTTACCGTGAGTGGAAATTCATGTAACTAATCAAATTATTGTTC
AACGTTTCAGATTTTATCGATGTTCCAACATTTGCGAGAGAATCACAACA
TTTGCTGTCTGGATGTAATTTCTTGTATCACGAGGCACCACAAACTGACA
ACGTTTTCTTCAATCTCTACAACGATGCAAAACAATTGACAAACAGAAGA
CGCACAACCTTCAAAAACTCCACAATTCCAAACCAGTATCATTTCAACCN
ATGCAAAACAATTGACAAACAGAAGACGCACAACCATCAAAAACTCCACA
ATTCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGTTACCAATTATACAGA
TGTGGGAAATTACATTCGATGTCAAATTGATATCGAAACAAACACTACCA
TGTCCAATTTCTCAGATATCATCAATGTTCATTGTAAGTTTTCGGTAACA
TCTAAGTCAGAATATTATAATCTTACACTGTTATCTGGATTCCATGTATT
TTTAGATAAACATCCAGTATAATAATTTAATGTTTTTTTTCGACAAATGA
CCAGATCCTCCTTGGATAATTTTGTATTCTGCAGACCTTGATTTATATTT
GCTATTGTTATGTTTTTAGACCCATCAGTTATAGACCACCCTACATCAAA
TTCCACCATCTATTTTGTTGGTGATCCAATTCAAATTGGTGGTTGCGCAT
TTAAGTCCACGTTTCGTCAAGGTGTCCAAGGTTACTGGTTAAAAAATGGT
GCCGTGTACAATGAGAACGTAAACTTGGTGTACGAGTTAGCAACAGATGG
GCTGATAGTGTTGAAACTACCTGCCCTTATCATTGACGAGGCAATTGAGA
GTGCTAATTATTCTTGCCAACTTGATGCTATAGTTAATGGTGATGGTGAT
ATTAGAATCACTCGTTCAAACCCTGTTCAGGCACTTGTGTATGGTAAGTT
CATCTTTGATTTATAGTTGATTGTCCTCAAGTCTCTGTAACCTTATAAAC
TGCTCGAAGTACCAAAGTTCTGTACTGTTGCAATGTTTTTCGTTGTATGA
TCTTTAAAACTCTAAAATTAGTTCACATCGATACTTTGTCATAGATCCGT
ATGCTACTTTCAATGGAGTTCGATACTACTTTAGTATAACAAAAAAAGAC
TGGCAATCTGCAGAAAATGATTGTGTAGATCTTGGAGGACATTTAACAAG
TGTTCACTCGCAAGCTGAAAATGATTTCCTTCATCAGCAACTTCTGAACA
GGTTCGTAAGGTACCTAATTTAAGTTGGTTTGCTGGTCTGTTAATAAGGG
GGACATGACACATCTTTTTCACTGGATATTGACACTTGGTTTATTAAATT
GGGTTATCCCAAAAAATAAAATATAAAAATTGAACCCCCTCCCTCATATC
GAGGAAAATCCAGGGTTCCCTGAAATTTTCGGAAACTCCATTGAGTTTTT
AAAATAACTTAATTTATTCATCGTCATTACAAGAAGACGATAAATCAAGG
GACATTTAAAAATTTGTTATAAGACTTGTCCCAAAGGTGATCACCTCGAC
AAGGGGCAATCAATTTCTATTATGGCCCATCTTTTTATTAAACTGTACTT
AATTTATTAATTTTGAATCAAATTTCACAATTATTCTCTTAATATACAGA
ACAGGGAGTGGAGATGCTTGGTATGGTGGTCTTAGAAGTGAAAATGTTTT
TTTTCTTTGGTCAGATGGCTCAGGATTTCTCACAACATTTTGGAATCCTG
GAGAGCCCAATGACAGTGGAGGGGCTGAGGATTGTTTACAAGGTTGGGCT
GCTAATGATCATTGGAACGATGCATGGTGTGGAAAGAAATTTCATTTTGT
GTGCAAAATTTATTCAGGTTAGTTATCAGTTTACTAAGTTTTCCATTTTT
CGTTTATTTGTGACAGAGAAATTGACCCTTCCCTTCTCCGAAAGATTTCC
CTTGGAAAACTTTATTAGTCAAATTTGATCGACATTCACTATTCGTATTA
CAAATGCTTGAAAAATAACTCTTGAAAAACTTCTGCTTGAAAATCAAAGC
GAAGATCAACCCTAAAAAAGTACGGTAGTTGTCTTTGCCTTGGAGGGAGC
ACGAGCAAAGCTCTGTTTCGTTACAATAGATTTGGTACAATAGATTTCTT
ATTTTTACGCCTAAAATGGTCAATCAAGGAACGATTTCGGGGGTTTCGGG
GCTGAAGGGAAAATATCGGGGGGTATATTCTCCACACAGTTCGAATAAAC
TTAAAGTTACGGTTAGAGTTTCTCTGGGACATTTTTCCAAAGGCGAAGTG
CCAGGGGGTAGATTTCAAACTTCAATTCTAGTTTCACCTGGTTTCACTAG
TTTTGATACCAATTAATGTTTTAATATTTTAATGTGAAAATGATTTATGT
ATCAAATATTATTGTCAAATACATAATAATTTTATAATATTCCGGTTTGA
AGGATGCGATGAATAGCAGCAGCCTTTGTGTTCTTCTCCTATCTAGCTTT
TCTTTATTATTTTTCTAAATATTCTTAACTTCAGTTGAGCTAGAATCTGT
GAATGTCTGTGTGTGTGTCTGTCCAGGTCTGTATGTGTGTATGTTCCAAA
ACTTTGGGGCAACCTGAAGACTTCAAAAATTGTTCGATTTGGCTGAAATT
TTGCACACCTGTTTTTTGGGTGAATATTTGTTTTTTTTTTTCATTTTTTG
AAAACTTTGATTTTCAAGGCCTGGACTCTAATCTTTTGGTTTGTTTTGCT
ACAATCGGGCCTATGAATAATTTGAAGCATCTGAAGTTGAGTCCAGTGCG
TTGCGCACGTTCGACTATTTAATTATCATCTTGAACCTCTAAAAGTTAAA
CGACTCTTATTTCTGAATTGTGAAAACTTTGAAAGTTATTTTAACTGAAC
TCTCTTTTATTTTAGATTTTACACTGCAATTCCTCACAAAGCCATCATTA
AGAAGAAGTGAGAGCAGAAAAGAAACAATTGTTTCTGGCTGCAGTTATTC
TTCGTCAACTCACTCAAGTTGGACACCAAAATCTTTTATTCAAAGAAACA
ATGATGACTTGATTGCGATTTCTACTGCAGTACAAGTTACTAATGAAACA
AGTTATGACAATGTTTTCTCTCTACCCTCTGTTAAATTGCCGTATATTGA
AAATGGAGATTTCAGATGCGTGATTATTGTTGCGGACAAAACATTTTATT
CAAACAGCTCCAAGTTGTATAAATCTGCAGGTAATTTTATTTGGAAACTT
GAAAAAAATTTTTGCTTTGTTAGTTTCACTTTTTTTATGTCAAAGTTGAT
TTCACATTGCTTGGTCAGGGTCTTACTTAAGTCATTTGCCTGGCAAATGT
ATCAATCATCTATTCAATCGTTTTTGTTATACATGAAAGCTTCTGTCACC
ACTCCAAGACAATCAAATTAATAATATATTTTAACACTTTAGAATTTATC
AAAGTCCCAACATTTGAAAGCGGAACACAACATTTGCTGTCTGGATGTCA
TTTTTTGTATCACGAGGCACCACAAACTTATGACGTTTTCTTCAATCTCT
TCAACAATGCGAAACAATTAACCAAAAGAAGACGCACAACCATAAAAAAC
TCCACAATTCCAAACCAGTATCATTTCAACCAAGTTACAGTTACCAATTA
TACAGATGTGGGAAATTACATTCGATGTCAAATTGATATCGAAACAACCG
CTACCATGTCCAATTTCTCAGATATCATCAATGTTCATTGTAAGTGTAGC
TCAGTTTGAGAAGTTTGTTTGATTAGTAATACTAATTCCTATCTTTTTAA
TAGCATCTAAATTTATTATAAAATTGGCTCATGAAAAATGTAGAAATTCA
CGCGATTGACTTCAATGATCCTACCTTTGACAAATATTTAGTTCCACTTT
TTTAGTGATATTGCATCGACAAGTTATTTATTGCTGAATTTCGTATCTCG
GCATAATAACAGATTTTCAACATTTCAAAAAATCTCTTCCTTTAGACCCA
TCAGTTTTAAACCAACCGACATCAAACTTCACAAATTATTTCATTGGTGA
TCCAATTCAAGTTGGTGGTTGCGCATTTAAGTCCATGTTTCATCAAGGTG
TCCAAGGTTACTGGTTAAAAAATGGTGCCGTGTACACTGAAAACGTAACC
TTGGTGTACGAGATAGCAACAGATGGACTCCTAGTGTTGAAACTACTTGA
CCTTATCATTGACGAGGCATCTGAAAGTGCTAATTATTCTTGCCAACTTG
ATGTTATAGTCAACGGGGATGGTGGTATCAGAACTGCTCGCTCAAATATA
GTGCAAACAACTGTCTTCAGTAAGTCTATCGCTTTCATGGTTTTTTGTAA
TTTTAACATTTTTACGATGCATAGGCTAATCAATTTCAGCCTAACTTCTC
CAAATGTAATCAGATTCTTAATTCAATTAATCTCAGAACCCCTAAATTCT
TACATATTGGATAATCCTTGTGCCGAACATGCTTGTCAATGAATCTCCAG
TTGATTAATTCACTCTTAAAACATTTAGGTAACGGAGTACGATTCTTAAC
AAAACCTACAATCAAGAGAACATCGAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067485TCONS_00067485Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067484TCONS_00067484Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067483TCONS_00067483Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067484-proteinTCONS_00067484-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_47supercontigscaffold_47:289378..297955 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.17	0.04	0	0.11	0	0.05	0.03	0	0	0.02	0	0	0	0.01	0.03	0	0.43	0.02	0	0.03	0.52	0.13	0	0.18	0.9	0.83	0.19	0.55	0	0