XLOC_040503 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040503
Unique NameXLOC_040503
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_419:507690..522182-

Legend: gene
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>XLOC_040503 ID=XLOC_040503|Name=XLOC_040503|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14493bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_419:507690..522182- (Clytia hemisphaerica)
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AAAGTTCATTTTAACATATTGTAAAAAGGTTAAGCTAAGCTTAAAGTCAA TGGTCCGATGCTGACATTGGGAAATAAATATTATTATCCATATATCCATA TTAAGTAAGCCATTAAAGATTCAATCGGCGGGTGGTTTTGTTTTGTGACT CAAATTTTCATACCCGCGCTGAGGAAACTAAAGCGCCAGGCCTCAGAGTG CTGAAATACATAACAATATCGTTCAGTTTTCGTTCGTTGTTGTCGTTAAT TCTGCCCTTGCAGTTTGATTATTAGCCCCCTATTGTCGGGCGAATAATCA AACTGCGCGGGCCGAAAATAACAACAATGACCTCAAACTGAACGCTATTG TTATATTATAAAGTTTCACCTTGAATTAAATTTTTTTTTGGTTATCTCTA ATATAATGTAAATAAAGTAACTGAATATTTTAAACAAAAGTTCAAGTAAT GTTAATCAACTCATACAATTTAAACTCTAAATGATTAAAAATAACTTTAA CCCAATAGCTCACCCAGAGGTCATTTCCAGCAGTCCACAAAATCAGCAAG CAGCCGTTGGTTCACAGTCCGAACTTTTCTGTCAAGTACGGGCGGACCCG GAAGCAACGGTTGAATGGATTTTCCCGCAAGTCGACGTCATCGGGAAAGG TTTCTCACTGATCGAGACGTTACTTTCGAACGAGAACGGCTTGGTGACGA AAACGTCGACGTTACGGACTCACGTTTTGACGTTGAATGATACTGGAGAA TATGTTTGTCTTGTGAACAATACGCATGCGCAAGACAATAGAACTTTCTC ACTTCAAGTACAATGTAAGCCATTGTTGTCATGGAAACGAAAAAAACTTC ATTCTCTAAATGTTAAAATCTCACCGTTAAACTGTAAATCATAAAATTAT AAATCTTTACAAATTCTTGAATCAGTTGATTTTTAATCCTTAAACACGAT TATTGATCTTTGTTAACCGGTTATTTTTTCGAAGCGGGCTACACGGCTTT TTGCGCAATGTAATTAGTTCATTTTGCATGATGACGGGCCTACACCGCAC AGAGTTGCCGCAAGTTCGGTCGTTACTTGACCTCGGGCAATATTTCTCAG TACAGCCCTCACTAACTGGTCACTATTGTATTAATATTGATCTTCAGAAT ATTTCCATTTACACTCAACTTAACTTCACTTTTAGACGGGCCAAACATCG TATCTTTTCCGGCCGACCCATACGGAACAGTGGAAGGAGCTCAAAACGTT CGATTCGAATGTGTAGTACACTCCAACCCAGTCTCCACCATTGATTGGTT TATCAACGAGAAATTGTACAACCAATCCTCCCCAGACCTCTATGACGTCA GTAACGAGACGACAATAAACTCTCAAACAAACGATGCTGTCGTTAGTAGT TCGTTCCACGTGAAGAACGTTCGTAAAGAAGACATTGCAAGGTACACGTG TCAAGCTACCAACAATGTGATTGGACGAGGTGAATTGAAAAACAACCAAT CCGCAATGCTGATTATATCACGTGAGTATTTCTACTTTTGAAAGAATTTT CTTTTGAAGAGACCGCCTAGAGTTTTGAGTTTTATCATCATTGTTTCAAA AAAGAACAGTATCCCTTCTTGCTCAAAACTTTAATTTCTTCGACCAAAGG AATCTCATTTTTGTAATACTCAAGACATTTCAGAAAATCGATTCTCAAAC TTTTTTTGTCGTCCTATCTAGATAAACCATACTTTCTATCCAACCCACCG CCGTTGTTGGCCGTTCGTAATGGAACACAGGCTGTATTGAATTGCTCAGT TCAAGGCTTCCCTTCACCGTTAGCCTGGTGGTCGAGCAACATCACCCTGG ATGAAGAGCGTGTCACAAACACCACAGTGGTGGAGAAAGCGACAGGGAAG ACTATCGTGACGGCTGTACTGACCATCAGCGATTTGAGGGAAGATGATTT CGGTTTGTTCACTTGCCATGGTATGGAAGGCAATGAGACTGTGCAAATAC AAACTGTTCTTAAAGTTGCCTGTAAGTCGCCTTTAATTTCCTGATCCTCT TTATGGAGGGTCTTATCTGGTTTGAATTACATGCAGCACTTTATCGTATA CCTTATAATTTCTTCTGGCTGTATTCGAGTTACTTGGCATGAACTGAGAA GAAAGATTACGTCAATCATTACTATCAATCATTACGTCAATCATTACGTC AATCATTACTATCAATTTTTCCGCGTCTCTTTTTATTTTTGCAATACAAC ATTCTCATTCCATCATTATTTAATTCAAATTGCAACGTTACTATCCAAAT CTAACTTGTTACTTTTGCAAGCATCTCAGTTTTTACACTTATATTCATGA TATGCACCATTGCAATGTCTTCCATTCCACCCAATAGCTGATTGGTTCAA AGTGACGTATTGACTGATTTTACGTCACTTACAACCAATGAGCGATTGGC TCCGTGATGTAATGTCAGAAGACATTGCAGTGGTGCATATCATGAATTCT GAACAGTCGCCGAAGTTCAAATTCAAAAATACTATATCTTTCTTTTGTAG ATGTTCCAAAGATGGAGAACTTCAAATCAACCCTTGACATCGAAGAAGGT AAAATGAGATACCTCGAATGCGCCGCCATCGGTTACCCACCACCGCAAAT CAAATGGTTTTTCGCGCATGACCAAATCAACTTTGTAGAGATAACAGATA AAGCTGTAGCCACTGCACATCTCCATGATGGCTACTCATCTCACGTAAGA AGTGTTTTGGACTATGGAGATAAAAACATATCTCGCGTGGATGCGGGAAG TTATAATTGTCAAGTGTCAAACTCTGAAGCTTCCTTAGATAACATCCTCA 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TAAGCTCTCTTGTCTCTATTCCTTTTTATAAATACGCATGCGTTTTAACT TTGTTTTGAAAATGAAACAATAGATGCGAAGTAGACACTTTCTCTATGTG TTCAGCTGTGATTTTAATCTTGACTTCATTTCGTTGCCGTCCTTCAAAAA ACATGAGAGATCTTAGCGAGCAGCACACCAAAAACCCGTTTCTTAGTGAG TTTCACTTTGATGATTTTCGAAAAATAGAAACCTTTCAAGTGTTTTGACG CAAATTCTATTTTCTTTGATACTGCAGGAGCTTCAAACGTTTAAAGTGAC GTCAAAAATTGAATCTTTGGAGCCCGAAAACTTGGGCTCAAAATATTCGA AAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTAATTGCGTAAAAAAAAGTCGTGAG GTCTAGTATAGGCTAAAGAGATCTATAAATTGACTATGATACAATCTTTT GTTTATTTTCATTCAGACGCCCCTATCATCACAGCTACTCCATTAGAACA GGGAGTGGCCGCCAAAACGAAGTTAGTTTTGAGTTGTGCTGCGCATGCGT ACCCAGCCATTGAGGAGTACATGTGGAGGTATAATGGCAACGCCATCCAA GACTTCAATCAAGAAGAATACGTCATTCAGTCAGTTGATGTAAGTCAAAT TGAACGGTCTATAGAAGCCCTGAGGGCTAGACTTGAATCCCCTAGGTAGG GTTTGAAGCCATTAAATCCTACTTAAGTTGCGCAGTCAGCGTGGTCCGCG TGGATTTCACACAAATGCCGGATTGGAAGTAAGAATGTAGTAAAAATATA CCACTCGAAAATAAAGAAATCGCTGGATTCAATCCGTCGTCAAAAATACG ACGCACTTTTTAAAGGCTTAACTTTTTCTTGCCTGAGAAAGGTTAAAGAT TCAATTCATAAAATTATTCATTGAGCTCCCGCTTTCACTGGGAAAGATAA 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GGGTACAGACTATTTCTGGAATAGCCTAATAATTATCATATAAAAATCGT AGACCAGATAAGTTAACGTTGCGCTTGCAATGGACTCAACGGAATAGTTG TTGATGAAATTCAGCGGGTAATGAAGAAAGAGGCCTACTCCAAGGAGAGC TAATATTTCTATTGCATGTGTGTCACTCTGTGATTATCAGGCAGATCAGT GAAAAGATTTATTTCTTTCACTAACGAAGCTTATAGGATCACCTAAACTA TGGTCGGGTAGCTATTTAAAAAAAAGATTACCAAAAAAATTTCAAACTGG TCTTTTGGTTGAACTGTTTTTCTTTCTTCTAATAATTTGATTTTATTGGA TTGGTGGATGAGTTTACACCGAAACAAGATAAATGTTAAAAGTTTGAAAA AACAACAACTGCAAGATCAATTATCGTTTCAAATAACTTTCCTGATTTTT CGTTTTCAGTAAAGCCAGTTTTCACCACCTTTCCCACTTGCGTCCACCAC GAGCAACAAGATATCCTACAATGTCATTTCGAAGGTTCCGGAATTCCCGA CCCAACCCACCATTGGCGAGTGTTCGGCCAAAATGACGTCATCGCGAACC AATCAGCGCTCAATATTTCTTTGAGTAAAGACACAGAGGGAAATTATTCT TGTGTTTTGAGTAATTCACGCGCAACCATTGAGGAAGTTCTCAATATTGA AGATTTTGGTATGTTTTAACTTTTTGAAATACACTTCATGTACTTGATTG AAGACCCTAAGAAGGCCTGGAGGATGTTCCAAATTTATATCATTTTTCAA ATAAATTTTTCTAAAACGACCCAACTTTTTAGTCAAGTCCACTTTCGGAG GAAGGTGTCGAATATTATTTTGTTTTAAAAATATTTGATAAATAACATCT TTGAACATTAATAAAAGTTTTTAATCATCTCTAATTTAAAGTTTTGAGGG CTTACTTCGTTAAACGATATGAGCTCTCCCCGATTACAAAATTGATGACT TAGTTACGTTGTTTCACATTTTCCCATCATAGTACCAAGGAACAGTGAAT GGAGCACGTGGTCATCATGTAATGTCAATTGTGGAGAAGGGGAAAGAAAT CGGACGCGAAAATGTCTCATCAAGAATTGCCTACCTGTTTTATTGGAGAA AGAAAATTGCAATATTTCCTGTCCAACGAGTATGAGTTTGTTTTTTTATT TGTATGTACCGGGGATTCAATCTCGTGGAACTTGAACTGTAAACCGTCCG GCTCATTCGTTGTCTGTACACAACCCCGGTATCTACGGCTAATTTCAAAA TTCATTGCCGTAGAGGGTCTGTTGTCATTGTCTTTGATGACATTGATTTG AGGTTTTTCAAAACGACGGCTGCGATGGAGTGCGGGTGAGAAAGTGGAGT CGTCGAAAGAAGTATTTCTATTTATAAATCATACTTCATCGCGGAGGTTC CGTACTAGGGTTTTTTCGTCAAACAGACAATGCGTATAGAGTGTGCTACG AAACGATAAACGTGAGATAAAATCTGGTACAGAGTAGCTCATTCGATTCC TGTCCATTGTTTTGAATAGACGATATCGGCTTAACGAAATTCTCCCCGAA TGATTACCCATGATGCATTGCGCAAAAAAATTCAGTAAGTCAATATAGTC CGTGAATTTTTTTGCGCAATGCATCATGGATAATCATTCGGGGAGAATTC GTTAAGCCGATATCATCTATTGTTATTGAGTTTTGATCTACATCCGGACC TTTCTTCACATTTTCAAGTATCATTCATTTTTTGTTATTTCCATTTCAGC TGGTGCCATCAAAGCGGACTGGCATAAAGGTAAGAAACGCCCATTCCCTT TGATGTAACCACTACACGTGGGAAAGCCGTTCCCGTGAATACGCGTTGGA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064592TCONS_00064592Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064591TCONS_00064591Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064590TCONS_00064590Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064589TCONS_00064589Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064588TCONS_00064588Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00064587TCONS_00064587Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064588-proteinTCONS_00064588-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_419supercontigscaffold_419:507690..522182 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.93 2.9 1.06 0.59 1.63 1.61 1.61 1.81 3.09 1.79 1.83 1.2 30.24 23.45 2.36 2.01 20.56 19.02 38.96 57.16 18.02 16.96 5.89 10.17 13.46 17.34 14.81 8.31 1.04 0.72