XLOC_039009 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039009
Unique NameXLOC_039009
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_362:204304..216264-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039009 ID=XLOC_039009|Name=XLOC_039009|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11961bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_362:204304..216264- (Clytia hemisphaerica)
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AGTGGCTCTTAGACCCGATTTTCAACACACCCATTCAAGTAAAAAAAGTT TTCCTTAGGGCTGGACTTAAAAAAATGTTGATTTGCCGTCACCCAAACCT AGATTTTGGAGGTGGGTCGGTCGGTTCCCCCTCCCTCCAGAATTCAGCAA CTAATGAAACTTTTCGCTAGAATTTTCCATTATTGATAGATAGTAAACAT CTTAAACAGTCAAAAATTTCAGTTTGATTACTTGCATGGTTGGTATTTTA CAGAACGGTACTATTTTAATCGAAATGATAACTTTACGCATAGCCGCTGC AATCCGATTACGATTAAATTTTGTAGCCTTTTCCAAATAAATTATGAGAT ATGGAAACCTAGGGCTGATCTAAGTAAAAAGGGCAATTTGAGGCCGGTAT GTAAAATACATGATACCAACAAGTGGCAAAATTTGACCATGCATTCCAAA AATATATATGAGTATGAGTAAGAAAATGAAAATAAATGTCTGTGGCCACT TGAAACATTTTTCATCAAAATGAAACATGAACAAATTACAATATAATTTA AAAACACCCGGTAGTATACCATAAAAATCTCCTAAATGTTTTAGTATCAT GGGGTACATATCTTATCGGAGTAAAAATGTCGGGGAGAGAGACGAAAGTT TTGAGACGATTACAGAATTTTGTTCATTTTTAATCACATGACAACTTTGT TCGCTGACTTTTTTTTTCATACAAGACTAAAAATTTTTACCTGAAAATTT AAACCTAAAATTCAAGTCCATTTTGTGTACGCCTTTATTAACCGAACATA ACTTTTTAAACGTCCAATTATATTTGAGATTTATTTTCGGGCTAGTGAAG CTATTTGACAATTTAGTCGATTGAATTGACTTAATTGTAAATTTGGTCTG GGAAAAGCAAAAAGTAATAAATTTGAAATTTTGGTCGAGGAAATCAGTGT CAAATTATCGCCAAGAGGTGGTATCCAGAAGATAATTATTTAGGAATTGG TACCTAATTCTTTTCAGAATTAAAAATCTAAAAAAATTAAAATTTCCTCC TTTCAAATAAATTTAAAAGTCCAGCCATTTTCCAATCCGGTCAAATGTCT AAAATGTTTGCTCAATTCAATAAGTAGTACCATTAGAAAGTCTTTGTGTA AAAAATTAATTTTATGTCGCAAAATTGTGCACCTTTGGAGCCCTGAAGGG GAGGGGGCTACTTTAATTAATTTCAGATTTAGTTCGTTTCTTATAAAGTG TGTTCGGAAAAAAACGTCCCTTTCCATCATAATGCACCTCTTATTGTTTT CAAGGGTTACTAGGGCTGAAAAAAGTTTTTACCAAAAAGGTAAGTAAATT TTTGTTGAGGTGTACACTTTTTTATAAGAACAAGTAAAATTTTTCTGAAG CTCGGTTATTCTTATTTTTTTAGCCTCAAATTGTTCTCATCATGTTCCTA TTATAGGGTGTAATTGTAATTGATTACCCTATTTTTACTACTTTAACCCC CAAATTGCTTGAAATTGAGAAAATGCAGATAAAAAAGGTGTTGCTGTTCT TATTGTTTTGGCACTTTGAGCCCCAAATTGTTCTTATACAGTTCTTATTG ATAGAGAGAATGATTGAGGTTTTTATAGCTTTATACCAATTTTTCACCAT TTTAACGCTTAGATTGCTTGATCAATTCCAGGTTCAGTTTTGTGCGTAAA TTGTTTAAACAATGTTATGTGAATGAGGTATTTTTTTTTAAATTGTATAT ACGTTTGTTTTTGTTTCATTTGTTTGTTTAAACTTTTCTTTTTGATGACA GACTTTGAAGGAATAAGTCAATGGTGACATATCTTCTCGTTCTTTTATTC TTGTGCTCGAACATTTTGCCTTGTTTGTTTATTTGTTTGTTTGTTAATTT GTTTTTTGACAACCTGATTTTCGAAAGTTGCAGTATTATAAACAGCAGGT GCTATTTCGCAATAAAGTTTATTCACGAGAATTATAACAAAACTTTTTGA TAATTAGTATTATTAATTGGTTGTTTATCAAAATAGAAAGGAAGTGTTAA AAGATAATAAGATTGACTTGAAAGAAATAGCGTTTTTTGAGCGGTAGAAA GCCGCACAACTATTAATTTCAAATTAAGTAAATGACGCTTTTAGAAATGA ATTAATTATTCATGGTATTCGGGATGATCTAAATCGCTTGTTAGCACACT TTCTGTATGATAATTGAATATACTATAGACACTCAGTTTGAATCAACAAA GAGTTTCACAATAAACAAGTTTGCTAAATTGATTTTGTGAAAACAGCTGT TTTGAATAGATAGATGCGACCTCAAAGTTTTGTAGTTGTGATTTCGAAAA AAATTATAACTGCTTGTCGAGTAGCAGTCAATATAAAAATTTACAAGCCT CAAGTAAGGCCGGCTTGGTACAAAAAACTTAATCATTATTTTAATGTTTT CATCATAATACAGGGAGATGAGGTTACTACCTTCGATCGTTATAGTCACA CTGGGGATAATCCTGATAGCTGATTATACGGTAATTAAATTTTTATTGTT GTTTAATTAATTTTTGTTTTGTTTTGTTCGTTTGTGTTTTATGTTTACTT GTTTTGAAAACACTTTTTTCTGGTTAACCAACCTTGATGTTCCTATTAAA TGGCAATTAATTTCTTTAGCAATAAAATAAAACTGAATTTTTTTTTTTTT TGAAAAGTTAAGAAAAAATATACATATTTTCTCGATAATCTTTTTCCAAA TCCTACGATCATATTCTAATAAGATTCCTAAAGGAACACAATATCGTTTT TTTAGCTAAGAAGGATTTAAATACATTTTAAAGAGGTGTTCCCGAGAACA GAACACAAAACAAGTGTTTGCTCAAAACAAATAGGTGGATACAATGAATA AACTACACGCACTTATAACTAAATCACTCATGCATGATTTATATCATGCT GAATTTTAAACTGAAAATTTCAAGCAGAAATTTTGAAAAAAAATCTTCTC TCAAGGGGGAAATTTTACACCAAAAAAAGTTAAGGCTAAATTTGAACAAA ATTGGTGGTTTTAGCCTTAATTGAATTTTTTGTAAATGGCCAATTTTTGA AGAATGGAACAGGATGACTTAAAGTCGCATCACTGGTTGATCGATTGTTA AGAAAGAAGAGTTATTCAAGTCTTTTACTGTTGACAGTAGAAGGATAATA AAATATCGCCATCGAGAGAAAAAGATTTATAGTGACTTATTGTTTTTTGG CTATTTTGATAAATGTTCCAAACNTACCGACATCGAGAGAAAAAGATTTA TAGTGACTTATTGTTTTTTTTGCTATTTTGATAAATGTTCCAAATAGAGG GCACAGCCTCTTAGGAGATGGGAACATATAAATCAATGTTTTTATGGATA TTGCCAATAGCCTTTATTATTGTAACCTTGCCATATAATACGGTACGTAA GGTTGGTTTGCTAAATTAACGCCAATCATGTAGATTTGGAAGGATCTTTA TCTTATACGATACTGCGAAGCATGTATTTGAAGTAGCAATTTCCTTTCAT TGACGAGAGCTTTTCTTTAGAAAAATATTTATGTCCAAGTTAACACAAAT TTGTTAATTAAAAGTTCATTTTGAATGAATTAGTTGAAAAGAATCATGTT TGATATCCGTTTCTGTTCTCCTATTTCAGCTGTCACTACCAGTTTCACCC GTCCCACCGCTATTGAACAAATTGTTAAAAGATCAGAATGTAACACTTGG TTTCATCCTCAAAGGTCTTCAAGGTCCACCTGGACATGATGGTAACCCAG GTATGGCTGGAAACCCTGGTTCACCTGGTATGCCTGGTGAGCCAGGTCTT CAAGGTGCACCTGGTATCCCAGGGGGTGCTGGATTCTTAGGACCTCCAGG TTCTCCTGGTTTACCTGGTATGGATGGTCTCCCTGGTCCTGGTGGTCTCC CTGGATCCCCTGGATGGCCAGGAGGTAGTGGTGAACCTGGTATTCCTGGT CCACCTGGTCCCCCTGGTAGAGATGGAAATGCTGGTGCAACACCTATCAG ATATGTAAGTATATTTCACACTTCTTAAATCATCACATCATTATTGAATT TCCTTGATCACATTGAATGAAGTCTAACAATGTGTCTTGCCATATGATCA AATATTATTTGGTATAGATCTGTGCGCGTCTATAAAATAAAAAAATATTG TTCTAGACTTACATGGATCATCATAAGCAAATAATAACAAATTTCTTGAT TTGTTTTTTTGCAGAACGGTACAGTCAAATGCGAAGAAGACACTGCATGG TTACGTTGCAACGAATATAAACATATTTCCATCATCTCAGCTTTCTGGGG TCGACGAAACTTCGGTTTATGTACAGAACACACAGGAAACTTGGTGGCCA ACAAATACTGCCCAACAACTCCATTGTTTTTGACCAAAGTCAAGGATGCT TGTGAAGGAACGACCATGTGTGAGATCAGATGCACCAAATTCTTTTTCCA CGATCAAACGTGTTTGGATGTATACAAATATCTAGAGGTGTATTATAAAT GTATTGAAATTATCAATGGTCACGAGGTCGTGAATGAGGACAATCTATTG AACGCCAATTTCCTTGGATAAATAAATAGACTATGGGGGATGTTTGTTTA CCACTTACATAAACTTCCAATTCGAAAATGTTCTTTTTATTTTCTTTAAA GGAGCATGGAGGGATATGGGGGTGGGCGATTCTCCCCTGAATTGTACAGT AACACACAGAAGTAAAAAGAAACTATTTTTGACACTTGTTAGATGAGTGG TTTTTATTTTGCGAAAATATTACTATTTTTAACAAAATGGGTTTATAATC GACTTGTATGAGATACAATTATATATTATTTTTGTAGACAATACCTTATT TTTATACACAACCGTCATCAAGTCCCACCATGAGACCTTTATATCCAAAC AAGACTAGTTTTGGGGCTAAAGCCAAAGGAAGGATTCCCAAATTCGTTAA CCAGAAAGGCTTTTGTATAGTAATACCATGAATTACAGTCATGGGTATAA AGGTCTGTTCCCACTATTCATATTGTATTATCAGCAATAAAATATTTGTA GTAAATGTAGTTATAGTTTTATCAAGCAAAATTATATATAGTACCTTAAC AGCCCATTGAAGCCCATTTTTCATCGTGGACCAGGTCAATAATGTCACCT AATGTCCTGTTGTCCGCCACCTATAAATTACCAGGAAAATTTATTTTTCA TTGTTATTTTTATATTATAATTTTTCCTCTTTTTGACGTCACTCTTCATC TAGAGAGTGTN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062228TCONS_00062228Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062227TCONS_00062227Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062227-proteinTCONS_00062227-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_362supercontigscaffold_362:204304..216264 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.11 0.21 0.53 0.89 2.52 3.38 218.2 237.04 130.4 81.62 177.12 175.29 325.57 266.36 201.11 471.43 345.41 314.84 0.73 0.56 245.04 245.72 168.32 189.32 213.81 268.37 36.08 10.88 0.5 0.98