XLOC_038146 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038146
Unique NameXLOC_038146
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_348:514783..557701+

Legend: gene
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>XLOC_038146 ID=XLOC_038146|Name=XLOC_038146|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42919bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_348:514783..557701+ (Clytia hemisphaerica)
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ttaaatttaaaatgatAATACTGTAAGAATCATGAATGAAATTAATCTAT ACCCGATCATGAATCCTTGTAAATTTTTCTCGTTTGTAATTCATgatttt gattcaattttttaaatctcaaagcaaaaataaattttgttaaGTATTTT ACGGACCCAATGCTTTAAATTAAAATCAtacaccgttgaaaagataattc agagcactataattttaagaaaaagatgtcaaatcttttaaaaatgaaaa agaaaaaagtcttcattttctaaatttttaactAATTTGTCATCTAACCT ACATAACTATTGTTGCCCATCCCACTGATTCACTGGACCTTACCCCCCTC CCCGAACTAAAGTTTTAATGAAGTTTCTAAGTTCTTAAACAACACTGCTA CTTTAAAAGTAGTCTAAGTACTTCCCATTGTAAATAGATAATGGTATTTT AATTGTTctaatccaaaaaaattaaatcaaatttattatTTATAACATGT tagatttaaatattttaaatatttttttctcctccTCGAATTTTGAGGAT TGAGTTTTAAAAACGATTCATAATTCCAGATAAAAATTGGTTAGCCATTA TGGATAGCAAGCATATTATTAGGTGATCTTtttttaatccttaaaaaccT TTCTATATTCATCGATGTGAGACCATGAGGTATAACTATTAATCtctgtt aaaggttttgtttttaaataaaagtgaaatcgtttgcttactcatcaatt ttaattcacaagctttttcacattggattggtACGGATGTGGAGATtggt aaaaaaaaggaaaagtaaaacttttttttgcttatatcagtacaataggg agacactgtcctgatatgaaatatgtctCTGATATGAAACGCGAAAACTT ATGGAAATGAAACCTTTAACTCTTATCATAAGCAACTATAACTCTTAAAT TCTTATGACCCCTCCCGTTAACAATACCTCATAAACCATATGATTTCCAG ACTAGTTTCGTcgcgaaatatttcaatttataGACCCTAGGCTAAATGTT TTCCATTTCTTTCATTGCATGTTattacttcaaattttcaattattcTTT AATTTTAGTGTGAGTTCATACCCTAACTAAGAAAGAAAAGCCATTCTCGA TTTAGTTTTTAATCGGGTGTGGTCATACAACAGGGCGGTGCTACTAGGTC CAGATCTACCGGTACAGGACGGAGTAAGTCGGTCAATCTCATATGATGAT AGTCTCAActttaaggttttatttttacaagtGTCCCCacttcatatcag acacatatttaaTATCAGgtcaggacagtgtctccctattgttatattgt gctgatctaagcaaaaaatagttttttctccctctttctgaccaatcttg ctccacatccgtgtcaaccCAATGTGAAAatgcttgtgaattaaaattga tgaataagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacctttaacttc aaattttcaattattcTTCGATTTTAATGTGATTTCACACCCTAACTATA AGAAAGAAAAGCCATTCTCGATTTAGTTTTTAATCGGATGTGGTCAAAAA AAGAGCGGGACTTCTAGGTCCAGATGCACCGGTACTGGACCAGAAAATTG AGTGATCTCCTATGATTGCAGTGCCACTTAATGGGTTAACATCACAtcga aatttttagatttctctgTCATTGGCGATCGGATGCATGTTCTGTTTCAC GCTTTCTATACATAAACGTAACAAGACATCCACAAACCCCATTTTTTTTT CTAGGACGTCTTTTCCTGAGATTTCCTGAAGATTTGTTGTACCTTGaaca aaaacattatcttagcaaagtttttttagttttttttttacttttctttt taagTACTTAGTCTTTTTGtgttctttttatattttttagtgGAAGTATC TAGTGAAgatgtttttaaattattttaaactattttagtattttagcatt ttataTTACATAATCACAgaataaattttcattaaaaaagggcacgtcat ggcgttctaaatctctCTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060660TCONS_00060660Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060661TCONS_00060661Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060662TCONS_00060662Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060663TCONS_00060663Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00060663-proteinTCONS_00060663-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_348supercontigscaffold_348:514783..557701 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.51 1.25 2.37 3.42 7.23 5.93 8.6 8.2 7.04 7.28 9.48 7.09 7.78 7.58 6.23 8.78 6.08 8.99 4.58 5.49 5.66 6.27 4.74 5.57 11.54 12.56 4.4 2.67 4.48 5.94