XLOC_037564 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_037564
Unique NameXLOC_037564
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_330:46866..56739-

Legend: gene
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>XLOC_037564 ID=XLOC_037564|Name=XLOC_037564|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9874bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_330:46866..56739- (Clytia hemisphaerica)
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TGAGTTTTGTCTGAAACCTTTCTTGGCTTTACCTCGAGTTTCAGTCTGCG ATTGGGCTTGTGTCTAGAAATTCACGGGATTTGGGTTTAGACTTAAGACT TAGGATTAATAGAAGACGGAGATTCCGGAAAACGTTTGAGAGTGTCTGGT CTGGGAATCGGCTTTAGTCTCGAAACTATCAGGAAACCAGATAATTGGTC ATAAAAACTTTGAACATCCTTATACTTGTAAAAAAATTATTGAAACCATC CTTATCATCCCTTTAATTTCCGTTCAAAATATTGTTTTCTAGATGACAAA GATCAGTGGTACTGGCAATGGAAAAGTTCACAACGCCAAGAAACACAGCA TCAAAAGGTATAGAAGTCACAACTAGCATCATTGATGTTTTGTTTCTCTT GTGATTCACTTCTTATTGACTCGTCAGTTTATTGTGATTCACAAAGTTCT TTCTGAGATGCTAGTAATCTTTGAGAAGACAAAATAATAAAAAAGGTAAC TAAAATAAATTTATCTTGTGCATNGTCTTTGAGAAGACAAAATGATAAAA AAGGTAACTAAAAGAAATTTATCTTGTGCATTAATTTTGTTGTCAAATTA TTGCGATTGTAACATCTTAAGAAAGTAGCTTTTAGATTGATTCTTTTACG TTATTTATACTATGATGAACCTTCTAGATTTTTGCAAACTTTTTATCACC CCTTCAATTTTTTAACATTTTGCCCACTTCAAGCAAAACATGTTCACAAT TAACCAGCTAAATTTTAGCTAGACTTTTTTCCGGTAACCTTTGATTGTGA TAAAGAACTGGAAAAGCATTGTTCTAAATTTCCTGATATTTGAATCTTGT CTATTCTTAGCGAGGACAACATTCCAGTTTACGACAACGGAATGGATTCA ACACTCGGCAAGAAGCGCAAAGTGAAAGAGGAATCAGACAGCGATGCAGA AGATACGAAACCCGTCATCAAAAAGAAGAAGGTCAAGAAAGAACCAGTTG ACTCTGATGAAGAGATGGAGGAAAAACCTAAGAAGAAAAAGAAAGTCAAG AAGGAGGAGCCCGAAGAAGAGGAAGAAGAAACTGGTAAACTTTCTTCTCT CTTGTCAATGACACGTGACATTTGCTCACACAGTTTCTATGAAGCCTTAT ACGAACGTTTTCCCTCCTAAAAAACTGATTTTCTTTCGATTACTGCTTGC GGTTGTTTTATTTCCAAAAATTTGAAGGTTTTATCGCAATCGGGAATTCT CATTTATAATTGAAACCAATCTATATTCACTTCTTAATAGATCTTATCGG AGGATTGTTTCGGGGGTATTACAATAGAAATCTCTTAGGAATTCCTCGAG GGAATTCTATTGTAATACCCCTGAAACAATTGCATCGCTGTTTCAGAAAA ATCAAAAACTCCGTTTGTATCGTTTCCATGTTCGTTCTAGTCAGATTCTA ATATCAAGTTTCTCTTTTCATAGAACCAGTAGAGAAAAAGAAAAAGAAGA AGAAGAAGGCTGCCGAACCTGAACCCGAAGAAGAAGAAGAGGTTTGTTGT TCATTACACCGTATTTTGACCGTGGCCGCCAATTGTCGTGCGGGCTTTTT TTGCCCGTGTTACCACCCTAAAACCGTCCCAGTCTTTTTTTCGCACCTAA AGACAATAGAAAAAAGTGTGTATTGTCATCGTCAATCTCTTTTTTCATCC CATATTAAGAACTTTACCTTCGACAAGAGAGCAGCTTAGATTGCTCTGCA TAAATGCATGCTACTATAACCGTTATATTATGTAGTAGAATGCATAGACC TGACAAAAGCTGTTATTAAGCATAACTTAAGTTCTTTTATCGCTTCGTGA AAACCATGTTATGTTAAGACGAGGTGAAGAGAGCTGTATCAAGGCGACAT TCAAAGAACCGTAAACTAATAAATTCATTGTCTTCTTTTAGGAGGTCGTC GAGAAGAAAGATAAGAAGAAAAAGAAAAAAAAGAAGAAGACCGAAGAATC CGATTCTGAATGAATTCAAATCGAAACTTCCCCAAAAATGAAACTCAAAA AGTCATAAAGCTATATTTACACTAAACATTTTTTATCTCGACATATATTG GAATTTTTTATTTTTTAAAAGTTTTATCGCTCAGGGTATATTTGGCTTAC TAATGGTTGTGTCGATTTTGTATATTTTTTGTCGTCTCATTTACGTCGCG TTATTTTGAAAATAAAGACGTCTTTAATCTTTTGTAAATTAATTTGTCCT TTCATTGTATCAAATGAGGTCTAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059718TCONS_00059718Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059717TCONS_00059717Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059718-proteinTCONS_00059718-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_330supercontigscaffold_330:46866..56739 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NOP58nucleolar protein 58 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
111.5 103.05 40.6 31.3 565.78 442.56 294.93 319.73 167.33 198.47 125.39 132.74 140.75 162.38 196.97 254.3 207.32 206.25 19.4 29.91 192.87 202.9 163.27 153.28 143.18 163.32 119.4 83.77 131.18 129.5