XLOC_037273 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_037273
Unique NameXLOC_037273
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_319:116514..174579-

Legend: gene
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>XLOC_037273 ID=XLOC_037273|Name=XLOC_037273|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=58066bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_319:116514..174579- (Clytia hemisphaerica)
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TCCCAACACAAAAAGTGTATTTTTTGGGTCACCGATAAACCAGTTATCAG ACATTTGCTCGTACAATATGGAAATATTTTACTCGTTCCGGATTTTCCGT ATATTTTCCTCGCCTAAAGGCTCGGAAAATATTGTACAGAAAAATCTCGG AACTCGTAAAATATTTCTCATATTGTACTCGTAACTTTCCGATAACTATT ACATATTGCACGATGAAAAGGATCTTAGTCTAGATCTAGTTGCTTGTATA AGCTTGTTGCCTGTCAAAGATAAACGGCAGGGAACTACCACTGTTAACCT CGTGTGTTGTCTTTTTGATGGTGTTTTTTCTTTGTTTGATAGATTTACAA TAGAAAATTGAGTGCTCAGACTCATATCGAAACACGATTTTTTTTCTTTT AGTTGTCCGAAGAGATTTGCCGGCGACAAATGCGAAGAGAAATGTATTTC CGATTGTAAGAATGGTCGTTGCAAACTGAACCCTGCACTCAATGGAAACC GCCATTGCCAGTAAGTCACAGTCACAGTGCTTGGCTGTTTTCAAACTTCT TAAACTTCCCTTCGATGGAACTTCTCAAACCCTATATTGATGTAATTCGA ACTTATTTGTGATTAAGTGTGTTTCGAGAAAGATCTTAATGATTTTTAGC CTTAATTTTGTAGATGCGAAAAAGGTTTCAATGGAGCTGCATGTGACAAT GCGACGTGTGACGGATTCAAATGTGAAAATCCGTTACATAATTGCTTCGT GGAAAATAATAAACATGTTTGCAGGTATGAATGCTGGTCATCCGATTTTA TAATTCGCACGGTCCTCTTAAAAGTGCGTGCATCTATTAAGCATCAGACT TCGTTTGCTAAAGCTCAAAAAAAAATTCATGAATTATGTCACGGAGCAAC TGTTACCTCGTTTCAGAATATTACTAAGCTGTGCTAAGGTGTTGATTCTC AAAGGAGTTCATAACAAGACTACTCTATTTATAAAGCAACACTTGAAGAC TCGAGGGATTCAATCACCTTGACAATGACTTCAAAACGAGACAGTCGTTG CACTCAAAATAATATACGAAAATGTTTATTGAAATTATTCTATGATGTGC CCCTTCTCCTGAAATAATTCATGAAAACGGGCATTTCACTACCCAGGTAC TACTACATTAGATACTTAAATGGACTATAATCTTAAACTAAGATATGAAA ATGTTGAAACTTCATCTTTTTAGATGTCTAGCTGATGGTTGTTCACAAGC CACTACTGACGGTGGTAGCAGTAATCGTAAGTCGATTCTTCTCTGTTTAT TCTGTTTTGTTTTATTTGTAAAAAATTCTAAATAAATAAATCTCCCATTT CGCATTTTCAAAGCATTTTGGAATACATTTCAAGAATTTTTGAAATTTGT CTTCTACGTACTCGTTTTTATAAGAACAAACTACAGCACCTGACCCCGAG AATGTAGTAAACTCTCATTTTTTAGCATAGTAGCCCTAACGATAGCTCAA CTTCATAAAAATTTGTTTCAGAGCATACTGTTACATCTTACTGATTATTT CTGGACAGAAAGTTTTAACTTGAATTAATTTTTTCCAACGAAAATCTGAA TGGAAGTTGATTGGATATTACCCGAACTGAGACATTTTTTTAATAAATCC TCTCTAAATCAAAATCTATTGGAATTAAGTTATGATGATAGGGTATTTTC TTAGTCCTAATGAACTAAGGAAATAGGGAAAATAGTCCATTTCAATATTT ACTGTTCTGAGTTAGATATTTGGACGAAAATGTTTGACCTAACTTTTGGG GTTAGTTGACCTACAATTTGGGGGCCTTTATAACCCGACATAAAAAGTCT GTCAAATTATATAAAACTTGTTCGTTGTACTTTTATAACATGAAAGTACT 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TTTTTAGAAAAATTTCAGAAAAATGCTCACAAAATGGTGAAAATTAAGAA CATTTTAAGAACATATTGACTCAAAAAGTTAAAAACATGCGAAATTTTGG ATTTTCACACCTTCAGTGAGCCCACTGGACTCTATATTTTGTTTATAATA TCTTCTTTTGTTGTAGAAACGATCATCATTGCCATTGTGGTGATCATCTT AGTTCTGGTACTCATTGTCGTCGGTGTTTACATTTATATCAAACGCAGGA GAGAGTAAGTGAATTCAAAATTTGCTAATAACGTTTTTCTTTATAAGAAT AAACTAAAATATTAAAGATATCTTTCATCACAACAAAAAGTACACTCTGT TACACTGTTGTTATGATGAAAGATATCTTTTGATATTTTGGTTGGCTCTG GTTTCATTGAGCACTCTGCAACATCGATTGCAAACAGATTTAAGAATAAA CTATATAAGAACGTAAGGTTTCGATGGCTTAAATATTAAGAGCAAGTTAA GAAGCTTTTAAGGCTTCGCGGACTCGCAAAATTGCAAACACCCAATTTCT TAGGAAAATAGACAAAAATACTTCGAAAAATAGTTGAAAATAAGAACATT TTTTGGCTTAAAACTCAAAAGCTTAGATGTTCTAATAAAAGAAATGTGCA TCAACATTAAAAAAATTTCTTTGGTTGTCTACACCATTATTTTCTACCTC CTGACCAGCCTGAATCACTTTGCTTAATGATTAGTTGATCGACACTGCTA TCAAATTCTGGATAAAAATCTCCTTTTTGAAAAGATAACAATACTCCCGG GACGGAGGGTGCATTGTTTTTGGAGGGGTCAATTCTTATGCCATTTTATT CCCTATAGATTCCTGCGAATAAATTTACTTTTAACGTTATCCACCCAGGT CAGTATTATTTCTATTGAATACTTTTAACATTTGTTTTTCACCACAGGTA TAACCAATTTGCACCANTTCTATTGAATACTTTTAACATTTGTTTTTCAC CACAGGTACAACCAATTTGCACCGAAGCGTATCAATATAGAAATGGAAAA CCCAGCTTATGCAAACGAAGGAGATTTTTACAATGATTACGAAAATACTC AAATATTATCATCAGTGAGTCTTTTCTCTCGTTGGCAGAGAAATTCTTAT AAGCGCTCCTTTTTTCTTCGATGCCGACCCCCAATGGTTTGCGTGATGGT GTTATTCCAAAATCTTTTTGGTGTACTCTCGGGTACCTAATAGCCCCCCC CCGCTAATTAATTTTTCGAAAATGTTTCTGAAAGTTCCTTCTTTTGTACT AATTCTGCTGTATTAGCCTCCTTTTCAAAAGTTTTACACCCAGGACATTT TTATTCCAAAGGTTTAACGTGATTAAAGGTTTAGCGTGATGCGTGGTGCG AGCTATGGAAAGTTTCGAGACATGATGCGCGCTTTGGGCTTCTTAGCCAG TTTTGAATAATTAGCAAATTTTAACCATTTTTGTGACCTTGGTGAAATAT TTGGTAATGGCGTGATCAGGGGTGCCGCTGGGGATGGGGCTCTTTAATTG AAGGTTGGCTGGTAGGGGAAAATGTTTAAAACTTTGTAGGCAGTAACTTT AGCTGTTTTTGCATTCACTCTTATACATGTTATTATTTTCAATAAATTTT GTTCTTTGAATTTTATTGTTTTTGAAGAACTTGTGTCAAATGTGTAAATG TTGATAAAGTAAAGCTAAAGTACTTTTTTTTGAGAAAATCTTCAATTTTA TTTTTTAGAAAACGCGCTTACCAGACATCTACCAAAAGACTTCAATGTAC GACGATAATGAACACTATAGTGAAGATGATGATGATTACATGGATAGACA GGGTGCCGGTGGTGGTTTCGAAGATGACTTCTCCGAGAAAGCGAAATTGG TCGATTTCTAAGCTACCTACGTTCAAAACGAAAACGACTTTTATTAATAA TTTAAGCTGGCTACTTATGGCGCTTTCAGAACTGTACATTAATGAATAAT GAGGAGTGTCGCCTATGATGGGCTCGAGTTAGCTGAGTTGAAACGAGTTG AACTGGAATAGTTCTACGTCGGGTTCAAGGGAAACAGCGTTTTTAGGAGA GACCCAGCGCTGTCTCATTGGTGGGCAGCTTTTTTATCAGGAAAAGCATA TACATAGTACTACTCAAGTTGAGTACATAACTCTTTATTTAAAATATTGA AAGAGATTTTTTTTCTACTTTCAATATAATATTTGTTCGTGTTTGTAGTT TTTCATTTCTATAATTTTCTGTTTTTTCGTATCTATCAATTTATAAAATT CATTTTTTAATCAGTTTATTAAAATTCGTACTAAATTCTAATTTTCAGGC TTCTTTTCAATTTTTTATTATTTTTCACTTATTTTATTTGTGTCGTGTCG TGATGTAGTTTTTGAAAGCCATGCAGCGCGTATCCTTGCAAAATTTTCAT ATAAGCAATTAATTTCCCAAAAAACGGAAGTTTCGTCAGCTCATTTTTAA TCGGTAAAAAAAGGTTGTGAAGTAAGCTTTTGTGACGAACATAACTCGGA TAATTTCTAAAATTAAAACTCTCTGAACGCTCAGAACGTTCGGTAGTCTA TTGTCTGTACACAGACCCAGTATCTACAGCTATTTTCGCTATTGCCGTAG AGGTAAACGTGAGATACAATCTGGTACAGAGTAGGTGGTAGTGTATTGCA ATGGTGTTTCATTATTTTAATGACAATTGATGACTTATTTATTTGTTAAT CTTTTTTAAGAAATATTTTGTTTTGACCTCGGATGTAACAAAGTTATAAA TTTTTCGTTAATGGTTGACAATATTATTGTATAATTTTTAATTCTAATTA TTTTTTGGTATATTTTGTTTTTCGTTACTCATTATTTACTATATAAACTA AGAAAGATATTGTTCGTTTCACTTTTTTAAAATAAATATCAATACCAAAT ATGTAACATTTATGCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059185TCONS_00059185Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059184TCONS_00059184Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059183TCONS_00059183Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059183-proteinTCONS_00059183-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_319supercontigscaffold_319:116514..174579 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.64 10.26 6.6 6.11 42.45 29.85 18.24 25.86 14.26 14.28 12.17 15.15 14.4 15.7 5.55 6.59 10.69 10.16 13.29 17.35 18.39 13.96 7.61 11.44 25.62 24.25 37.16 30.51 6.26 5.35