XLOC_037156 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_037156
Unique NameXLOC_037156
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_315:201243..215116-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037156 ID=XLOC_037156|Name=XLOC_037156|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13874bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_315:201243..215116- (Clytia hemisphaerica)
ATATAAATCAAATAAATTTTCAAAAAGTATCAAATTGTCATGGCCCGCAC GTAAACAAATACTTAAAAAAAAATACAGTGAACTTTTCTCATTGTTTCAG ATGTCAACAAGATTAGCAAGCAAAATTATTGAGTGCTGTGATTTATTGTA GATTTCAGGTTTTTCATGATTGTTACATACATATTATTATTGTGTTGGGA AGGAAATGGGAAGAGTTGTTACTGTATGCTTTACACACACTTTTGGAAGT ATTTCGAGTATCATGACTTTTTTTTCTAATTAAAAACAGTAAGTCAACCT GATGCTGATATCTGAGATGGCGTGGTTTAGAAATTAAGCAACCCTCTCAG CTTATTATGTGGGTTTAGCAAGAAAGATGATCACTTGGTTTTTTATGAAT AAAAACTCTCTCAGTCATCACCATCAATCATGAAGTGCTAAATACTGATA CTCAACTGCATTGAAAGATTAATCCTTTTATTATAATCCAAGTAGTATAT ATCTGTATATAGTTGTAGTAGAAACCAGCTATTGGGCTATTGCAGAGTAA TTTTTTTAAGTTTGTCAATCTAGTCAAAAGCCATTGCAATTATTGGTAAG TTTAGTGGTATATAGAAATTTTCTTGAAAGACCTGGGTACGGGTACGGGA CATGCCGCTGGTCAGGGTCCATTTTTTAGGCTCTGAAGATATCTGACAGC TTCCCAAATCTACTAATTTTCAAGATATGTATCTGACACGGTCCACTATG GTTATTTGGACAAAATTTTTTAGTTTTACATCTACTTTTAGTTATTTTTG CCACTTGTTAGGGTGGAAATTGGAAAAAATTTCAAATTTTTGTTCTGACA GGGTCACCATTTTACCAAAAATTCACATCTGACAGGGTCAACTTTTTGAA CTCCAGTGGGGCACGTCCCCGTCGGCAGTCAAGGTTGGTGCCCCCTGGGG 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GAGGAATCATTAATATTCTCGGATGCAGAGGAAGATCCTTTTGATGAAAT GGAAATGGAAACTTTATCAAACACTAAATGGTGCGGCAAACGTTCTCAGA TGAACCGCCCAATAACTGCTCGGATACGTAGCAAATCAGCCCAAAATACA AATTTTTCTAATTCACCCATTGATGTTCAAACATTTGATCTACACACGCA GCACCAACACCAAAATTCACCACATAAACACAATAACAACAATATTCATC TAATCCAACATTCTATAGAACAAAACAAATCTAGCAAGTCTGGTGATCTT GAAAGCATAAAGGCCAAGCATTCTTGTAATACCAAAGGATTGCCGAATGC TATAAATAGTGAAAATACCGCAGAATTAAAACTTCAAACTCCTAAAACAG GCTTTACTCAACTTGATTTAAAAACATTGGACAAACAGGATAATGAAGAA CCTCTTTTCCAAAGAGTAAACACCATTAATGTAAGTTCAAAATAAAACAG ATTATCTTAAGGGACAACTAATTTTCGCGGAACTTATTTTCGCTGTTTGA AGGTACTAAATTGGCGCATTTTGTGGAACTAATTTTTGTGGTTAGCACTG GTTAGCACCCACTTTTTGCCCGGAAATTCTTTCATATTCCTAGAGTTTTT TGACTAATTTTCGTGGTAGACACCCGAAACGCGAAAATTAGTTCCCGCGG AAATTAGTTCCCTTTTGGTACGATATAAAAGGTTTTTTGTTGCTCAGTGA TCTGAAAACTGTTATAAATCTTAAGCAGTTTCCTTTAGCTTTTTACAATT CGGACTTAGTATGTTTTCCCTTTCTCCGTCATCTATTTACTTTTACTTTC ATTTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTAAGTCTGCGACCGCAGTCAGAGGCGA CCCTAAGGCTCGTCTTTCGATAGCTATCTACCCGAGGTAGGGGAGGGCGC CACTCTTTCTCCCTGGATTGCTCCCCTAACCCTTGACCCTTCTCTTAATT GCTAAGGATCAAGCGGAGAGACATCAAGTACCATTTTGTGAATCTTTAGT ATGACCCGGCTGGGGGTTGAACTCGTAATCTTGCGCACCGTAGCCGGATG CTCTACCACTGCACTACGGTCGCTTTACTTTCATTTACCTGTTTTTACTT ACACAGAAAAACGGACATCTATCACCAACCAATGTCACAAGCCTCCAACA TTTCCAGAAGATGAATATTCATGATACAAAGAGTCGTTTGATAGACATTG ACGTACAAAGAGAAAACACAACACCAAAAGAAAAGAAGGAAAAATCGATC ATAAGAGCTAAATCAGCTCATACCATAACCAAAGCAACCAAATCTGAAGA AACTAACGCTAGAAAGAAAGCTACTTCAACTGGAAGGCCTAGAAGCAGAT CTCATCTTTCCATAGAGGAACGTGATTCGACCGTCCAACGAAAATCGAAA TCAGCGAGTAGTGTACGTTCACCAAGGTCCAAATCTAAAGGCCCAAAGAA ATTAACAAAAGATGAAAAAGACAGGAAAAAGGAAAGAAGTGCTGACATCA AGAAATTGAAGTAATTTTTCATTCCATCCGCTTTCTTATTTTCTACACGT TTTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAAGCCTTCGAATGTTCTTAACT TTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTTTTAACATGTTCTTATTTTGACCA TTTTGTGAGTATTTTTGACCATTTTCCTAAGAAATAGGGTGTTTTGAGTC TTAAAAGCCTTAAAATGTTGGTCATTGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTT TGTTCTTATAAAAAAAACGTGTATTGGACATTTTCTAACCAAGAAGTGTA TTAATTTTTACATTTCACCCTGCTACGACACGCTTTGCTCTGAAGGTTGG GTATATTTTAAATTGGTCCACTTCTTTAGAGCTTTAGCGTGGGCGTGTGC CAATACGCCATCAGAATACATATCAGATAAATTTCACCCAGGTTAAATGA TTTAATAATTTACTGAGGATAACCGTCTCGATGGAATAGGTATTTTGAAT TATATCAAAATAATATGGCTTTTTTCCTACACAGCGCATTCAACAATGAA TGTCATATTTTGTCACTTTATTTTATATTTAATTTGACTAATAGGCAATT GGAAAAAGCAGAAGAAAAACGAAAAGAGAAGAATAAACTTTTGGAGGAGA AAAAAGAAAAGTTGGAAGAGAGAAAGAAAGAGTTTGAGGATACACAAGCT GACTTGCTTCGACAAGAGGAGGAGATGAAGAAGACATTGAATGATCAACG TGCTTTGTTAGCTCAAGAACGAAAACAAAAACGCAAAGATGAAGCAGAGA AAAGAAGACAAGAAGTAAGATTTCATTCCATTATTCAAATACACGCTTTT TTTATAAGAATATACTTTATAAGAATATTTATGATGAAATTGGCCAAAAA TTTAAGAATATGGTAAGAAAACAACCATCGTGGAGTTTGCTAACTGTGAA CCTAACAATGCCATTTTTAGAGCATTTTACCGTTAAATTGCCACTTATTA CCCAGCAATCTAAAAGATCCAATAAAGATGCCAAAGTTTTTCTTAAAGTA TGTATTGCATGCTAGATTTTGACTGGGATTGGATCCAAATATAAGAATAC CGTAAGAATATTTTAGGATGATTTTCCTCAAAAAGTTAAGAATATTTATG ATGAAATGAAAAACACCATTTTTATAAAAAAAGCGTGTAGTGAAGAATTT AGACTAAAAAAAGTGCTTTGCAATCGGTTAAAGCTGTGCCAAAGACTCTT CGGCCTCTTTGTGGCTTTCAAAGTGGACGTCCACTTGACTATACGACTGT 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCCCCCCC CCCCCCCGAACAGGGTGACTTTTGGCCCCCGGACAATAGGTTTTACCACA AATTTTGATGATTTTTTGCTACCCCCCGGACAAAATATCCTCCACCCCCC ATGTACAGTTTTTTTCTGGAAGAGCCCAAATGTTACTAAAAGAAAAATAG GGTGGAGACACGACCATACGAGAAAGCGTTTCAGGTCGGTGGGATGGAGT ATGTTGCATTGCACCAACGCGAAAGAACTTCTTGTGTTCCAAAGCCTTTA CACTCCTGTATCAGTGGTACTTGATTTCTTCACCAGGTACAATGGAGAAT TGATGCTATCTGAAAGATACAGTAGTGGAACCTTTTCTATTATTTTTTTA TTAGAATGAACTTTGTAAGAACTACGAGGTTCTTAATTTTCGACAAGAAC AATTATAAGAAAAATGTCGANGAACTACGAGGTTCTTAATTTTCGACAAG AACAATTTTAAGAAAAATGTCGAGCTTCAAGCAATTTAATGTTCAAAGTT TGAATTTGGTAGAGACCTGAATTAAGCTCAATTTCGCCTTAAAAGTAAGA ATATTCCGATAAGAAATATTGAGGCTGAGCTCAACTACAACAAAATTGAT GAAAAATAGTGTAAGTGAAAAAATTGATCAAATTTCAATTAAAGTTAGTC TTTCTGCTTTCGTATACGTTTTTTTATAGAAATACGTCATGACTATGCCC CCTATGTATGTGTAATCTTTCTAGTTTCTACGACATGCTTATGCTTATTG TGTTGGCGTTTACATGAACACGTGCTCCCAAAAGAACATTAAGCAATTAA TGTGAATTGTTTGCTTTTTGGTATGAAATTGCCACCATAGTAACATCCTA TAACCTGATAATTTATCTAAAACTGAGAAGTAATTATCGTGTTTAAGTTT 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ATTTTTAGTCTCGTTTCTTCGTTTCAATTTAATCTCATTTCAACGTAATT TGAGCTATTGGTTGATGATATTGATAAACTTTTAATATAAAAAAAAAGAT TCTCAAGACTTTTGTTGACTGTTTGAAATCATTTATCTAAAAATCACTTT CTTGGATGGGATGAATTTGCTTTTCTTCCAGTTTTGACATACTGATGTCA AATTGGACTTACAAAATGTCACATAGGACTAACATTAAAAAATCTTTAAC AGTTATTAAAATTCTGTCAACATATTTCTTGACTTGTCAACAACAATCAA TACAGTAAATGTTATAAGAAATTTACGATATTTAATAATTTGGACCTTGG AAAAATTTCTTTGTAATTCCTGTCATCAAAAACAATTTCTAAAAAAAAAT CACTAGAATGCTCTTAAAAAGCTAAAAATAAGAATATTTTTAGTCTTACA ACCAATAGGATTTTTGGCTTTCTTTAAAAAAAAAATGTGACAAGCCTTAA ATAAAGCCCAACACAATGAAATGCTAGAATCAAAGCTCCTTCAAGTAGGA ATCGGTTTTTATAAGGATATTTTATTTTGATTCCAAATTAATTTTTTTTC AGCTGAATTAAAACGACTTGAAGAGGAGAAGCGAGCAAAACTTTTAGAAG AACAGAGACTGGAAGAAGAAAGACAACGAAAAAGAGAAGAGGAGGAAAGA TTGGAACAGGAACGATTGAAAGAATTGGAAAAGGTGAAACTTTCTAAGCA TGCTGTCTGACTGTCTGTCATGAACTTCTTAGTCTAACGAGGAATCCAAA TCAAATTGAATTGTGAGAAAATACAAATCCTATTTTCTTCAACATTTTAA AATATTGCGAAACTTTTGAACGAAATCGGCGATACAATGATAATTTTGTC CCTTTCAGTCTCATGATGTGCAATTTTCTTCTTCCTCTATTTTTAATTGA AATGAAACTGAGGATAGAGGTTTCCTGCTGCGAGTTTTTTTCTATGAAAT TTCTATTATTCAAAGAGTTTTCTTGGTAATCCAAAAAAAAAAGGAATCTC AGTATTTTCATTTTTTTTGTCATGTGTACGAGGAGCGAAACTGAATTTTA TTAGATGATGGTACGTAGATTTCTGAAAAAAGCAGGGATGAGCTGGAGTT TTTACAAGATACTTGACTAATTGGTCATTTGAAGTGATAGAGATGACGCG TTCTTTAGAAAAAGTAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAACGACCAACC AAATCAAATAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGTCCCAAAAGCAGGCTG AAACATTGCTTATATAGGCTATCTTGATGAGCAAAATTATATTTCAATAC ATGATTTTCTTTGTAGGTTGAATTACTGAAGATTGAAGAAGAACGACGGA AACGAGAACAAGTGCTGATGGCAGCAGAAATGAAATTGAGGTTGTTAGAA GAAGAACAAGCGAAACAGAGAGATAAACAACTGCTTGAACAACAAAGAAT CGAAGAAGAAAAAGAATACCTCATCAAAAGAGAGCATGAAAGGTAATCAT AAAACCCAAAAAGTAAAAAATCAACATTGTTTGGGATCTCATTTGATATG CGTGCGATTTATGCTTTGTTTTCTTTGAGATTGGGGAAACTTTTTAACTA CTTTAGAAGCTTCCCGGAGGATACTAGGTTTACGAGATGACTGGTATGTC CGAGCCAAAGTTTGAAAATCGACCTTTAGAGAGACTGAATTTCGAAAAGT TTGTCAATTTTTTGACAATTTTGCCACCCTTAAAGAGACTATTTTTTATT TTCGTAATTTTAGAACCCTTACAGACTCAATTGCTTCTTAATGATTTTTG TACCCCTTTGAACTTTCGATTACTCATCTTTATACCTAAATCTTTCAAAA AAGTGTTGACAAAAAGGATAGAAATGTATCAAGAATAATAAACAACCCAC TACCTCCTTCTTTCTATAGGTTAATAAAGGAAAAGCAATACTCAGAAGAA CAACAAAGATTAGCTGAAGAAAAAACTCGTAAAGCAAAACAAGAAGCCGA ACGTAAACGTCTCGCTCTTCTTGAACGTCAACGTGTGAACCTTGATAAAA GGAAAGAATTTGCGTTTACTAAATACAATCAAAAGACTTCAAAATCTAAT GAGTTCTCTTATTTTGTTCAAGTACCTCGAGAGGTTTGGGAACTACCTAT TGGTTGGCATGATAAACCTAAATACAAAGCTGGTGGAAGTCGAAAAAAGT GACTGTGGAATTGATACTTTGGTGTGGATCCAGGAAAGTTTTGATTTTTG TCAAATGTAGGGAGAACTTTTTTTAATTTTCATGACAACAATGCTTTTTT AGAAGAATTAGAATTCTTTAATTTATAAATAGAAATTTGTAATTATTTAA TTAATAATTTTAAGATGTATATTTTTTGTTAGCTCAAAATCGAAAGGAGA AAAAGGTACCGTTTTTTTTTTGAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059003TCONS_00059003Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059002TCONS_00059002Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059001TCONS_00059001Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00059000TCONS_00059000Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00059002-proteinTCONS_00059002-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_315supercontigscaffold_315:201243..215116 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
17.11 13.35 4.67 3.64 132.89 88.56 36.45 33.96 19.72 29.79 22.45 18.93 4.73 4.04 3.13 3.36 6.55 5.37 5.49 7.71 11.14 10.67 19.3 17.83 7.35 12.05 3.26 2.76 10.08 8.53