XLOC_036883 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036883
Unique NameXLOC_036883
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_311:916741..927198-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036883 ID=XLOC_036883|Name=XLOC_036883|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10458bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_311:916741..927198- (Clytia hemisphaerica)
ATTGAATCGAAGCACGCCTTCGAATTCGAATTTAAAAGCGTCCCCAAGTT TAAAAACAAGACCTTTTAGCTGTTATGCGCTACCATTTTGAAGCCGTCTC TCGACCGTAAGACGTCATCCAGCGAACTGGGAGGGTAACGACAGAAGTTG GTGGAAAAAAATGCCTGCAGCCGCAGAGGGGTAAAAGTTCAACTCAAAAA AATCAAAACCAACAATCTGCCACTGACAATTGGAAGTAAAGTAAGTTATT TCATCACAAAGTTTAAGGAGTTCCACCTTTCTTTTTGACTTTGTCCAGGT GATGTCATTAATTGAATAGAGAGATACCGTCAACTGCTCATAATCAACTG CTCTATAACTTGTTGTGTGTGTGTGGGACGATTTTAGTCGAAACATGGGA CTGTTGCATATCTGGTCTGTATTTTCATGGAGAAAATTATATCGGATCGC CCAAAGTTACCTTCATTTTTTTATTTTATTTTTTTATCCACGGATCGCTG ATAGTCACCTTTCTGGGGGTTTTGTTGTTTGGAATTGATTAACTAACACT AACAGTTAGTCAGGTAGGGTCAGGGTTGCTAGTAACGGTTTGTCACTGTG CCGGGTGCATACTCGACGCCTTGGGCCCTGCAGGGTTGCTAGTAACGGCT CGAATTTCAGTCAGTTTTAAAAGAGGGGTACTTTTACCCATATTATAATA ACATTACCCCCCGTCTTTTGCTAGTTCGGTATAATATGTTATGAATTGCG TAATTTTGTTGTGCGGCGATGGCTCAACGGATAGAGCGCTGGCTTCCGAA TCTGAAGGTCTTTCTTTGGTGGTGGTTCGAATCCCACTCGGTGCGAAAAT TAGATTGGTCGAAATTGATGGACAAATGATTGACAGGTATGAAAACTCAG TCAGAAATAAGAAACTAAGTCTCAGAAACTCAGACAGTCAGAAAAGACTA GGCTAGTCTTACCTCTTTTATCTTTCCCTTTACAACAATACAATGCTGAC AAGTTGAAACAACACATTTTGGCAAGTAATCCCTGAGAGAAGTTTATGAT TTTTATTGATTATCTATCCATCAATTGATATTGATTAATTACTCTCTATA GTGTGGTTTCTCGCTATTTTAGTGCATAGTGGTAACGCTGAGTTTCATAT ACATATTTTCTTGTTGTGTTTAACTTTAAGCCATTCAGTTGATAAATTAC CGGGTGCGCCACAAGAAAGTTTCTCTCTTTGAAACAAATTTTCTCAAAAA CTTTTAAAAGAGCCATTCCTATTTCATTGGAAAGAAGAAAGATAAACTTA AATTTTGATGGGTCATTTATTAAAATTCAATTCATTAGATCAAAAGCTCT GCTCAATTGAATGAAAAACTTATATACTTTCGGAAAGTGCTCAAAAACGT TAAAAATCGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATTACATGATACATCA GTACTTTTGTTTCAGTCATTAAAAATGATAATTAGCTGTTTAAATGACCT TTTGTTACATAAAGGAACGTTGAATTTCAATGAAAGGAAGAAAATTCGTC AAAGAAGGCAAAAAATCTGGTAAAATTCATAAATATACATCAAAAATAGG TTTTGTGGTAGATCCAGCCTTACATCAACTTTATCCAGTCGAGAACCAAA AATCGGAGGAAAATCTCAATAAAAGTAAGATAAATTGATCTTGGTGAAGA TTTTAAACCCTTTCGACCCTTCAGTTTCAAAATTTATGTGTTTAGTTACT GATAAAAAATGCTCTTAATTATGTAAAGGCTATTGCCATTACCAGATTTA AAGTAAAAAATTGATAGGTCGACTTTTAACTTTTTCGAGCACTTTCTAAA AGTAACTTTTTTATCCAATTGAGCATAACTTTTGATCTAATGAATCAAAT TTAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTCCATCTTTCTTCCTTCCAATGA AATAGGAATGGCTCTTTTAAAATTTTTAGATTTTGAGAAAATCAGTTTCA TAAAGAGAAACTTTTTTTGTGGCACACCTGTTAGTCTTCAAGGAATCATT TGAAAGAGATCATTTTCATCTCAGGGAAAACCTTGTGTGTAGATTTTACT ATTTATCTTCTTGTTGACAGTATCCTTTCCTGAAAATTTCAAATGACCAT AGTGTAGGTTGCCCACTTGAAATATTACCTTAAGGGGATTAATTTTCGCG GGAACTTATTTTCACGAGACAATTTTTTCGCGAAATAATTTAATTTTTGC GGGACTTATTTTTTTCGCGAAGACGGGAAATTTCGCAAGTTTCGCGAGAA GTGGGCTTTTTCGAAAATACAAAACTAAAAAATCGAACAGTAGACCAATA AAAAACTTCAAACAATTGTGATTTTCTCAAAAAATAGAAACTGTAGAGCT CTTTTCAAAAAACTTGATTTTCGCGAGGATTATATTTTGCGAATTTCGCG AATCCAAAGTTTTTTAAAATTTTCGCGAGATTTAATTTTCGCGAATTTTG GAAAAACTCGCAAAATTTGTGAAACATAATCCCCGCGAAAATTAATCCCC TTAAGGTAACTATTTCGCTTAACAAGAGAAGAAAAAGATAAATTCCCTAT TTTTCCTCCCCTTGCTGTTTGAAGCAATTTTTTCTCCACCTTGTTTGCCC CCCCCCTGGATTTTTAAAAAGGATTAATTCTCCACCCTTTTTCAATTTAT GGGAAATAATAATAATAATAATAATGCTATACAAGTTTACAGGCCACCGT GCGAGCACATGGGCCTCTATGAACCGCTCTTTGTTCGGTTTACAATTTTC TTAAGGTAGAGTTTTTTCCTAGGGCTCCCCCTGACTTTGAATTTGAAGTT TGCGTCCTTTATTGAAGTATTCATTTCTTGGGCTTCATGATACACCACTC TTTGATTGTCTTCCTTTCACTTTTCGTAAGATCTTCTGTCACCCGGAAGG GTAATCTTATTTTAAGGGTAATCCTCCTTTGGTAATTGCCTTTAACACTG TATTTTTGTCTTCTTCGTTTGCAAATCAGACTTTTATTGGTCAATAGCGT TTCTCATCTTCTCTTTCCTTACAAAATTTTCAGATTCTTTGAGTTTCTTC GATTTTTATATTCCTTAAGCGTAGCATCATAGGTAAGACTTTTTCATGAA GATATTCTTTGTCGTAGATTTTGGTTGACTCCTCTGAATCTACAGTGGAT TCGTCAACACCATGAAGAATCAAATTATATGCTGTGGAATGAATCAGACG TTCCTCCTGTTTTTCCTCCTGAAATGCATTTTCTATGTTCTTCTTGATTT GCCTTGACGCGACTGCTGCCTAGCTTCGTGGTCTTACTTCTTCTTCCTTT TTGAATGATGTTTTCTATCTTCTTTTTGATTGTTGCCATTCTGGGCTCAA AACTATCCTTTATTTCGCTGATCATAGTATTAACGTCTTTGGACTTTAAT TGAGTGATTTCTACGTCCTGAGATGTTCATTATGTTCTCACAAGCTTTTA TCTTCTTTCGGAATCCTGAAACTGTTGATGTTTCACATGAATTGACCCGT TCCAATAGATCAGGAGTGATCAAGACACAATTTTGACCAAAAAAAGCTCT CAATTTGTATGTTAGACATAACTGGAATTGATAGACCGGGAGCTTTGAAC AAATGTAGTGTACAATTCGATTGCACTTCTTACATTCAAGTGTGTCTTTG GATCTTCCTTCTTCACTTGTAACACGTTCAGATGGGCTGCAAAGGTCGTA AATTGATGCTGAATTCGGCTGTTTTCGTAGATTTTTCTGAATTTTCTCCG CCATATTTATTTCTTTTAACAACACATCCGTTCAGCTTTTATTTGACGTC AGAATGAATCCCCCTCAACGCCCTTGACTCTTAAAAGAGGGGAAAGGCCA CTATGAAATCTTGTTCATCATTTTTCTCTCTATGGTTTACTTTCATATTC TTTTATTATATATCGAACTTACACTTCAAAGATTTGTTATTAGACCAATG CCTATTTATTTGTGTTATGTGACGTCATTTTCACCAGACCTATATATTTT TGAGTTAAAATTGTAATAATAATTTAATAATAATAATGTATACAAGTTCA AGGCACACGAGGGCCTCTGAGAACCGGATCTTGATTACAATTGTCTTGTC TCGAATCTTTTCGGATGTTTTTTTCCAAGCTTCGTTGAGTCTTTCTTTGA AGATCTTGTCAGTCTTTGCCTCTGCAACATATCTTGGTAATCTATTCCAG TTTGGTATATTCCTGTAGTAAAAGAACGAGTTGGTTTGTGCGCCTCGGAA TCCATCTTTACCAAAATTTGGTATTAGCAGCTCATCATTGTGTCTCCTGT TCGGACGTGTTCGAGTCGATAATTTACTTGGAAGAGTATTTTTATTTTAG TAGTGGAGATGTTTGTATACTTGGACCATATCACAAAAGAGTCTCCTGAA TTCAAGTGTGGGGAGGCCAAGTATGCGCAAGCGTTCTTCATAGGACATAT CTTTGCAGATAGGCATGAGTCTTGTGGCGCGTCTTTGTACACCCTCGATC AAATTAACATGTTTTCGAAGTTTAGGTGACCATACCGACTGAGCATACTC CAAGTGCGGATGGACAAACGAAGTATATAGTACTAGGAAGATGGATGGAT TCAGATGTTCAAAGCTCCTGTTAATCACTCCTAGTATTGAATTTGCCTTC TTTACCTGCTTTGCAATATGCTCCTTGGATGTAAGTTCTGAGTCGATCAC AATCCCAAGATCTTTCGCTTCAAAAACATGTTCTAGCTGATTTCTTTCGA CCACTTGACTAGCGCGTCTATATCCTGTTGGATGGAAATAGAGTGTCTTC GATAGTGTTGACCTCTTGGAAGATTTTGGTGTCTTCAGCAAAGAGGAGTA TTAATGATGATATCACTCTTTCAGGAAGATCGTTGATGTAAAGAACGAAC AATAACGGTCCAAGGACATTACCCTGGTAGGAAACCACTAACCACGTGAT CCGTTGTCGTAAAATGATTTATTTACTTTCACTGATTGGGTTCGTCCATT TAAAAATGATATTACCCAAGACATTATCGGACCATCTATGCCGTATGCTA ATAGTTTCTTGTATAAACGATGATAAGGTACAGTGTCAAAGGCCTTTGCA AAATCAAAATAGATACTATCAATCACTTTTCCCTCTGATGTACTTTCACA ACACGTATCCAAGTAATACAACAGTTGCGTAACAGTGGATCGATTTTTGA TAAAACCATATTGCTTGTTCGATAAAAGATGTTGATCAAGAAGATGCTCC ATAATATGCTTTCTCACTATTGACTCCATCAGTTTGCATACTGCTGATGT CAAGCTTACTGCAAGATTTTGAGCACCTTTGTTCTTATATATGGGTATTA CGTGAGCTTCCTTCCAATCCTTCGGTAGAGACCCTTCCTTTAATGATGTG TTCATTATTACTGCAAGAGGTTCAGAGACGTGGTCAGATAACGACAGTAG CATCTTAGGATGTATTCCATCAGGACTGAATGATTTATTCTGATTTAGAT GTTTTATTTTGATCTGGATCACCTCTTTTGTTATATGGAATTCATCGATT ACGGACTCAGTTCTTTTCTCGGAGTCTGGTAGCTCCCCAGGAGGCTCTCT AGTGATAACACTGAAGAATTGACGCTGAAGTATATCCTTTTCATGGTCTT CATGTTTCAAAGAATTCTTGTCATTTGGTGCCTCAAGTAATGATGATACC GTACTGGAAGATTTCATTTTACTCCTGACATGTGACCAGAAAACTTTTGT TTTTGTTTTTGAATTGTTGCACTTGCAGATTTTCCGTTCGTAATTTCTAT GGGCTTGTGTCATCATTTTCGTCACTCGGTTGCGTACACGGGTGTATTTC ACGCGATTTTCGTCTTTCTCTCGCGGCGATGATTTCATCCATTTTCTATG TAGGCGCTTTTTCTTTGCTATTTCAGTTCTGAGATCTTTTGGAATAGGAA TTCTTCCTCTCTTTCTCCAACCCTCGCCTCAAATCGTTTTGAGCGGGATG AAACGGTTTTGCCATTCGTTTACTTTATTCTTGAAAAACTTGCTATAGTT CCTCGACTAATTTGTCATTAGCTGCATCTAGAAAAATCGTTTTCCAGTCA CCTCTTTCAAGATCTTGCTTCATTGTTTCAAAATTGATCAGTATTATCAT AATTGTACCTTTCAGATGTAGGCTTAACATATGCATTGCACTTTATGCTA AAGGTCAGGGCCCGGTTGTTCAAAAGTGGATTAGCGACCGATTAGCTTAA TTTTCGATTAAATCTCGATTAGCGCCGATTAACGCAGAACCGCTGGTTGT TCGAAAAAAATTAGGCTTAAATCTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGT AATACTAATAATACCAATACTAATAATAATAATACGGGATTTAATTTGTA TAAACGACTGGAAGAATCCGGTGTTCCAGCCTTATAGATACCCCGGCTAG CTACGCAGAAACTTGCGTAGCGAGAAAACTATTTATCAAGCAATAACAAA CTCTCAAAACAAAATCAACTCAAATGAAAAACTTTCAATACACAAATCCA CACACATGTTTTTCTCAAGAATTATTTTGAGCGGCANNNNNNNNNNNNNN NNNNNATACACAAATCCACACACATTTTTTTTCAAGATTTTTTTTGAGCG GGAAAAAATTATAATTGCAATATTGACACTTTTCTTTTGTTTGGAGTTAG TGCTCAAAGGTTTCTAGACGACTAAAATTGTTCCCTTCATTACTTTTTGC TTTATTTCTACTATGTTTAAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTAGCTTA AATCTGGATTAAATCCCGATTAAATTAGCTAAATTTTAATCCTGCTCTGA CCCAGGATTAACGAGGATTAAGAGACTTTTTCCTACAAAAGAAGTGAAGT CGCTGCATTGAAGTGAGAAATTTGAACAAAAAAAGATTTTCGAATGTTTT GAAAACATTCGAAAAGTGACGTCAAGATTAAATTTTTTGAAAACAGGCAA AATGTCCACGATTAGTTGATCTGACGTTCGAACAACGGAAGTTAATCGCC GGGATTAACTAATCGAAATCTAATCGCGATTAGCGCTAATCGCGAGTTAA TCTAATCGACTTTTGAACAACCAGGCCCAGGGAACTGTGATCGCTTTTAC CCAATGGACTGAGATATTCCAGGTTTTGTGCTTGGTTGGCTTCTCCTGTT AGAATGAGATTATTAAGTCTGATGTTGTTTTCATTCGACATGTTACTGCT GGTAGGGCTGTGGTACATGCATGCAAAAACCAGTAAGTCATTACCACTCA TAGGATCCACCCCCCCCCCAGAGATTTAGGGGTACCTAAAAAAAAAATGT TAAAAAAGCCTGGTACCTGGAAGTATTCTTAAATTTAGGGGCTACCTGAT ATGTTTGGGGTTACCTGCATTTCATTAGTGGGGGCGGGGGCTGTTGTTAT TGTGAGAAGTATTTTCCTTGACTAATCCTTTTCATTCAGAAGACTTTATA ATTTTGTCTGTTTTTCCCTTTTCACCCAGTTTGCTTCTCATACACTGATG TACTTTAAATCACAGTGAAAGAAACAAGCCAGTTGCGCAAGGAGAAAAAA CATATGTTTTCGCTGAACTGATGTACTGCTATGATTAATTTGAACCTCAT GCTCTACTTCCATGGAAATTCAAAGGCTTGATATTGTAAACATTGATCGA CGCAATTTTGGTTTTATGAAAGGCTGATAGTTCAGAGTAGTTTTTGTGAT ACCAGAAAATTTAACTTTTTAAAACCCTTGTTTTAAGGTTATTGGAATGC CGAAAGGCTCAACTGGTTTTACCAGGGTTTTAAGTCAAAGTGCTTTAAAG GAGGGGGTTCCCTATATACTAAAAGCTTTTATGTCTTGACCTTTAAAAAA TCTTTTCATTATAGAACAAAACTAACACCAGAACAAATAAATATCTTCCC AATGCCAATGGTAACATCAGTTCTTAGAAATGCAAGCAGTGATAAAATAT TTCGATCAGCTACACAATACATGACGAAATTTTTCAACCATGGATGGGGA GACATTGAAACATACCAACAACTCAACCGTCTACAAAAGATTGTTTTCGA TAAAAATCAGATGAAAGATGTTTATCACTTTTTACAAACTGTCGACATCA AATTGTCGAAAGGGCAGAAACTCAACTCATGCATGACGGTATACAAAGGA GAATTTAGATCACCCCTGGCATCGCTTTCTCCAAAGATGCTTCCTCTGGA AAGTGAAACTGCGCATTTTCAGCTAGTCATTCCTAACAACTGGAATACAC AAAAACCTCTAACCATCCAACTTGCTGGAACAGGCGATCATTTCTTTTGG CGTAGAAGACAATTCATGGCTGCACCACTTGCCAAAGATTACAACATAGC ATCAATCATTCTTGAAAATCCATTTTACGGATATCGCAAACCAAAAAACC AAAGTAGATCAGCTGTCAACCATGTATCAGATATCTTTGTAATGGGTGCA GCTCTTATGTTGGAATGTTGTACGTTATTATTTTGGTGTGAAGAGCAAGG TTATGGACCCCTTGGAATTACTGGTGTCTCGATGGGTGGTCACATGGCAA CTATTGCAGCTTCTGGCTGGCATAAACCGATAGCCTTGGTACCTTGTCTT TCATGGACATCTGCAGGACCAGCCTTTACTGAGGTATCTTTTGGTTGATT AATGGTAACGTTTTGTTATAACCAAGAGTATTCTTGGATCAGTTTGGATA AGAATAAGAGCAGCCTATGCGGTTTTTTTAATTTCGAATGACATTAACTA AAAAAGATACCATCCCTTACAATTTTCTTTGATTATGACTAAAATCCAAG GCATTAATTATATTGTGATTTTTATTCAACATTTTTATTTGGGTACACTT TTTTACGATTATATGGTCATCTGATCAACACTGCAACAGTGATGGATAAA AGATGTTGGATAGGGTTGATAATATTTTTTTAATTAAAATTTTAACAGGG TGTCCTTAGTCATGCTGTGTGTTGGGATGTATTAGAGAAGCAACTATCAA CAAACCCAAAATATAATGAAATGTTACGGAAAGACGAAGCTTTTAAACAG ATGCTACAAAATCATTACATTGAAAACGCACTTTATGGTAATGATAATCA TCCACCAGCTCCAAAAAGTGATTCCACGGCTGCTACAGAAACGTCTGCAC TGTCAGGCATGTATAACAGTGTAACATCATTATTTTCGAATGTCCAATTA GGCCAATACTTTGATTTAAAAGGTAAAAAGATCGGTCCCTCTTCTTTGGA AATGGATTTAATGAAATATCTTTACACCGTACCACAGTTGTATAATTCAA CTACGAAATATTTCAATTTTGACCATCTGAAAGAGTTGATATGGCCGTAC GAGAGTGAAAGTAAGCAACCTTCTAAAGAGACTATAGACTACATGACTGC TATCATGGATCAAGCTACTCATTTAGCGCATTACAATAGACCACATGAAG ATTCGCCAATTATCTTTGTATCTGCTGAACACGATCGTTACATACCAAGA GAATGTTATAAAGTCACACCAATGGATGTTTATGGTAACCATAAAACTGA GGTCCGAACCATTGATGCTGGACATGTTTTGGCAATCATTCAACATCATG AAGAATTTAGGGACGCTATTAGAGATGCTTTTGTTAAAATGGGTTGCACT TTCTAAATCATATCCACTCTCATAATTTCTCTTTAGTTCTTTTTGTTTGT TTTTTTCTTTTATTCTCGTATACTCATTTTTTCAAATCTATGAGATGGAT CTCTACAACTTGCAGCCTTAAACTCTAGTAAAACGAACTAATTATTTTAA AGTCAACATTACCATTTAGGTTCAAAATATTATTTGTTTGTGATTTCATT AGATTGGATGAGCGTGTTTTTTATCAAAAGAATGTTTGTTATATTGCTAA AAAGGTTTTTTATAAATATGGAATATTGTACACTAAAATTTTTATTTTTT CTTTGCTTTTATTAAATGTCTTTGTTTTGTTTTATGCTAATACTCAACAT TAGGTCATACCCCTCAGAGTTATTGACAAAGCACACTAATCTTTCAGAAG AGCCCTTTGATACAAATGTTTGCTCGTAGATTTTAAATACAAGATACTTT AAATTTTATTCGTGTTGAATTTGATGTATTTGGTGTTTTTATAGATAAAT ACTTTTGTTATTGAAAGTGTATTTGTTATTTGCAAGAATTTTTTAAAAAT CAATTTGTGATCTAAGGAGTTTCATTGTAAAACCCAGTATTTGATTTTAT TTACCACATTTTACTCTCATATTTACTGCCCAAAAAAAGCATAGAGAAAG AGATATTAGTATATTGTTGCTTACAATGTAACTATAATGATTAATCACAT CCAATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058555TCONS_00058555Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058555-proteinTCONS_00058555-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_311supercontigscaffold_311:916741..927198 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
C4orf29PREDICTED: uncharacterized protein C4orf29 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.26 7.94 5.45 6.3 35.4 29.36 34.74 34.05 23.86 27.03 25.32 15.52 15.36 16.1 18.69 16.19 24.67 21.16 10.79 10.05 20.66 18.53 23.36 24.13 97.21 63.54 12.7 8.34 16.21 16.1