XLOC_035536 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035536
Unique NameXLOC_035536
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_275:55440..67593-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035536 ID=XLOC_035536|Name=XLOC_035536|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12154bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_275:55440..67593- (Clytia hemisphaerica)
ATAAATTATAGATTAAATGAATAGTTATCCAATAAAATTGTCACTTTGAC TTTTATTTATTCAAATTTACTAAATTAAGGTAAGAAAATTCACTTTGAAG GGCTAATTTTTAGTCTTTTGTCATTATTACGACGGTCTGTAAAATACACG TCGCGACCAAAACAAAACATTCCAAGCAGATGTTCCTGTTCGCAAACTTT TTTCGAACACAACAAATTTTTTTTGAAGGAGCGAAAGGTCGAAAACTTTG ATTTATATTCCCAAAGTTTTACAGTATAATTCAAAGGGTTTCACTTATCT TTTTTTAGACGACAAATTTCAAAAATGGATATCTAAGGAAGGCATGAATT CTCAGCTTACAAAATGGGTGACAAGAACAAGGATTTTAACTATGGATACC AGCCATTGGATGGTAAGAGCAACACAAATTTTATCATAGTTTGACTCTAT TTTAGTATTAGGTCAACACTAATTAATATTGCTTGGCCTGGGTGACGTTG ACAAATAGTTGTTTAGGAGAATGCGACGGCCTATTAAATAACTAATTAAT CTACAACAGTTATATACCTAGTAAATATATTCTAATAATTTATCACGTTT TTATTGGCTGAGAGAAAGTAATGTATATGGACAACCCTGGACACCGCCGT ACATTGCGCGGTGGAGTTCGGTGGTATTTTAGGTTAGATCGAAAACACCG TACAACACCACCATACAGAATCCCACCTTACACGGAATTGCCACCTTACG ATTGTCCGGTGGATGTATGCATGGATGTACGCACTTCCCACCGTACAATG CACGGCGGTATTTTTCGTGTACAGTGGGACATGAGCGGTGGTAAAAATAG GTCAGTCAGGACCTCTTTGGACTTTTTTAACATTAGTTCGGATAGAATAA AAACATACCTGATCAACACAACCAAACCTTTTGTCTTGCGTTTACTCTTT 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ACACTTCCAAGCAGGGTGTTAGGGAAATATGGCGATAGACTCTCTACCTT CACTCGTGTAACAACTGCAGGCTTTAGACTACATTGAAATCATCTTTATA CTAGACCAAGGTTTTAAGTAAATACCAGATTTCAAACTTCAAACACGTTG TTGGTTAAAAGGTTTTCAACGCCTGTTGATTTATTCGTTTTTTCAGAATT CGCACAAGAAGGCGATGGTAGTGGTGTACATGACAAACTGACCGAATCTT ATGAACTGGAAAATATCGATAAAAATAAATCAAACGATGGCTTGGGAGCT TTGGAAGAAAAGCCGGCTTCAGAGTACGTTATATTTTGTTTCTTCATTAC CGCCACAGATATCATATTCCTTACACGCTGGATAGGCCGACTACTCACAG ATTTCCCGTCGAAGAGTAGATTGACCAATATTAAAGTGGATTAGTCCGCT GTGTTGTTCTTTCATAATTTAGCTTAGACTTTCGAACATTCGACTTTTAA AGTATTAGAATTGCGGCTGTTGACGACTAGATTTGAACAAGATGGTGGGC AAGTGAGCTCTAAAACTGGGCACGCTTTCTTTAATAAGGAAGCCTAAACC TGAGTTTGAGATCAGTGGTCCGTATAAAGAAATGGTTCGGTCATTTCTTA GATAAGCCAACAAATATTTTTTTGTGGGAGATTGATGTTAGACTTTTTTC TCAATTACTCCAACGGGATGAAATTCTTACATTAAATTTTTCTTTTAAAA TTTTCGCAGTTGTTGCCCGATTCTACGAAATCCTCTAAATCCGCGCAGTA TCCCACTAAGGGCAAGTCAATTATTTTGTACCATCCATAAAACAAGTAAG CTCTATCGTTTACTTTTTGTTTCAAAATTGTATATTTTTTTCTTTACAGG ACCAATGCAAATGGTTTGGGTGTTATGACAGCCGCCATCTTTATTGTTGG 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AACGTTAGGCTCCTTTGCGTCAGCGTTTGGAACGTTTGTGTTTGGTTTTA CCGGAGCGTCCTTGTTCCCGACCATCCAATCAGACATGCGGAACCCTGGC GAGTTCAGTAAAGCAGCTTACCTAGGTTACCTCGGAATCTTTTTATTATA CGTACCAACCGCTCTGGGGGGTTACTTCGTACTCGGTAAAGACATCCGAT CAAGCATCCTAAGGACCTTATCACATTACGATAAAGTCCATCATAGCAGC CGATCGATCGTAAGCATAGCGGAGTGTTTATTTGCCGCGCATTTTGTGAC TGGATTTGTATTGATGTTAAACCCTTGTCTACAACAACTTGGCGAATTCT TCAAAGTACCCCATAGTAAGTTTTGTTATTTCATTTGCTTATTTACTCTG AAGAGCTCTGAAACTACTGAACCTCGATTGTAAAAACTGATATGGAAATT TTCATATTTTAAAAGATTTTAATTCTAAACAAAACATTCTATGCCTCATT CTTTTCAAATTTTAAAATATTTTTTATTCCAAACAAGCCATTTTGTGTCT CGAAACCACTGTAATATTTGCTTGGATCAGATAATGCAATTTATGAAAAT AGTTATCGAAGTATTGTAGAAATTGCCGGTATCGCATTTTTGTAGTAGTT CTATCGTTATTTTAAACTTTTTGAACGGATCATTTTTATCATTGATATAA TCAAATGATTTTCAACTTTCTAACATTCAAACTGCTTCATTGCACCGATA GTTCCCACACTGTAAAATTCGAGGAAACTTGAATGACAAGGTGTTAAATC TTTGAGATAAGCTATCCCCAAGAACGAATCATTTTCTTCCATTCTCATAA ACGTAATACTATTCTTTTTCTTTTTATCATTCAGAATTTTGTTTTCAACG TGTCGCTCTTCGATCATTAGCCATGTTGGCTATACTCGTGTCATGTGAAA 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GTGTGTCGTTTATCTGTTGTTGGCAGCTGAGATTGTGGGTAGCTTTGTCT CATTTCATGTTGGGCACATCCATCAGCAAGGCAACTTAAGGCTCTGGTTA ATTATATTAGCTTGCATAATTACTCCTTTAACCTGGTTGGGGACACCCAA AGATTTCTGGTTTGTCGCCGTCGCCGCTGCTGGGTCCACAACCCTTGCCC TCCTTTTGGTTTGGATTAAATATGGAATGATCGCGCCTGAAGATTTAGGG GCCGTTGAAAAAGCGCCAGTAACGTTAGGCTCCTTTGCGTCAGCGTTTGG AACGTTTGTGTTTGGTTTTACCGGAGCGTCCTTGTTCCCGACCATCCAAT CAGACATGCGGAACCCTGGCGAGTTCAGTAAAGCAGCTTACCTAGGTTAC CTCGGAATCTTTTTATTATACGTACCAACCGCTCTGGGTGGTTACTTCGT ACTCGGTAAAGACATCCGATCAAGCATCCTAAGGACCTTATCACATTACG ATAAAGTCCATCATAGCAGCCGATCGATCGTAAGCATAGCGGAGTGTTTA TTTGCCGCGCATTTTGTGACTGGATTTGTATTGATGTTAAACCCTTGTCT ACAACAACTTGGCGAATTCTTCAAAGTACCCCATAGTAAGTTTTGTTATT TCATTTGCTTATTTACTCTGAAGAGCTCTGAAACTACTGAACCTCGATTG TAAAAACTGATATGGAAATTTTCATATTTTAAAAGATTTTAATTCTAAAC AAAACATTCTATGCCTCATTCTTTTCAAATTTTAAAATATTTTTTATTCC AAACAAGCCATTTTGTGTCTCGAAACCACTGTAATATTTGCTTGGATCAG ATAATGCAATTTATGAAAATAGTTATCGAAGTATTGTAGAAATTGCCGGT ATCGCATTTTTGTAGTAGTTCTATCGTTATTTTAAACTTTTTGAACGGAT CATTTTTATCATTGATATAATCAAATGATTTTCAACTTTCTAACATTCAA ACTGCTTCATTGCACCGATAGTTCCCACACTGTAAAATTCGAGGAAACTT GAATGACAAGGTNTCGGGGAAAGCGTTTATTTACAATCTATTTTTCCCGA TAAGGTATGGAACTAATTGAGTGCAGTTTGTCTAATTCAAAAATGAACAT TTCTTGTTTTACTTGTTGCGAATTTATTTTTCGTTGAGATCAGACTTCTC GTATGTATTTAGAACTAGAAATAATAATTGTATTCATAAGTGAGGCTNTA AGCTATCCCCAAGAACGAATCATTTTCTTCCATTCTCATAAACGTAATAC TATTCTTTTTCTTTTTATCATTCAGAATTTTGTTTTCAACGTGTCGCTCT TCGATCATTAGCCATGTTGGCTATACTCGTGTCATGTGAAATCTTCCCGC AATTCGGACCAATCGTTGATCTGGTTGGTGGCTCCATCAATGTCCTGTTA TGTTTTGTATTCCCAATTACCATCTACTTAAAGTTATTCCCTGAAACCAC AACGAAAAGTAAGCTCGTAATGGCTGCTATTATTATTTTCGCCGTACTAG GAGGTACAGCATCTACTGTTTCTAATGCATGGAACATTTCTAAAGAATTT CATAAATTATATTTTGCTAAAGGAGCAACAGGTCATCCTGAAGTGTAACA AAATTCTTATTTTTTTATTTGAACTATCCTAGTTAGATAACATGGTGATC TTTTGTTCTAATTTTTATTTTCTTGGGGTGTTCTTTGGGCGTTCTTAGTG CTGAGCGGTTGTATTTGATAAATAAATAAAAGGGTAAATGGAATCCTTCC AGTTTTTTAAGGATGCAAAATTCGAATTTTCTGACGTTCTTTACCTATAA AGCTACTAAAACATATTTGTGAAAACATTCTTAGCAGTGGACGGGGTTTA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056390TCONS_00056390Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056389TCONS_00056389Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056388TCONS_00056388Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056389-proteinTCONS_00056389-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_275supercontigscaffold_275:55440..67593 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
30.22 30.09 12.87 9.89 58.18 43.27 72.8 80.89 94.69 109.64 62.83 60.7 37.84 40.32 28.56 25.95 37.34 41.01 32 42.22 45.15 49.74 34.98 40.59 30.36 34.14 32.78 29.12 39.82 44.17