XLOC_034908 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034908
Unique NameXLOC_034908
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_253:256370..298796-

Legend: gene
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>XLOC_034908 ID=XLOC_034908|Name=XLOC_034908|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42427bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_253:256370..298796- (Clytia hemisphaerica)
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AAGAAACAAAGATTTTATTTTGGGGTTTCAGTGACAGTGTTTCAATAATA GAAACGACATAGACGAAAGTATGTTTCAGTGAGATTCTTGTTTGAGATGT AAACAAGGTCTTATCCTCTCATGCGGTTCGTCCAGACGAACTTTATCCTT CTGGCTTAAAATTTCAAGCACGCAATAGTTTTGATTTGTCCTAGAAAGAC ATTCCGACAGTGACGTTGCGAAGGGCACTGAATTTTAACACGTCCTTCTC AGACTTCTCACACAAGTACAATAACTCCTCGTGCGATTATATTGTTACAA GGACATTTGGCAATATTTAGAAACAGATCCTGAGTATACCGTCTATAAAT AGTTCTTTCAGGGGAAGTCATTTTTCCTGTTTGGCAATGAAAACCACCCA TCTTTGCCTGTAGCGAAAAGTACAAAAAATATTGAATTTGATATTAGATT CGCTCGAACGTATATAGCTCTTCGAATTTACATTTACATCAGCTAAAGTT GTTTTGTGAAGATGATACGTTTTCTTTCAAATCTTGTTACAAATAAAGAG GTGGGTGGTAAAAACCCTTATCTTATTTGCTCCGCCTTGACCAACATCAT CCCTACCTCTTGAAACTCAACCTCAAACAAATGTAATACCATACCAGCTA CTTTAAATGACTTTTTCCATCTAATCTCGTGTTTTCCTTATATTCACCAT AGTACTTGATACTGTTTTCAATACATTATTTACTCTGGGTTGTACGCGCA CTGTTAAATCTCTTTGCTGAGCGGCACCTGATGTTTTTCTTGTTACCTTT GAACAAATAAAAACCTTCTCTCATGGTAAACATCACAACACAACTGAGAT TTTTTATGTTTGTTGACTTCTTCTAATGTGTCAGCAAAAACAGTGGATTA GGGTCTAAATCCAAATGTTTTGGTCCAGTCTGCTCATTTCGTCTTCACAA CTAACTATGTCACCCTTCCTTCATTCAAACGCAAATCGAAACAAGTCTAT GACGCTTTTCTAGATTTTCAAGCTTTAACTTCAAGAATGACCGGCTAATC TTGTTGCCCCTTTCACCAAGTACCAAGTCACCCATAAGTATGTACAGATG TGTACGTGATAGGTGAACATGCTTAGGTTGGCAAGTCTCGCCTCCAATAT CTGAATCAACTGAACGAGGAATTACTTTAAGACTACTACTTCATGAAACA CACATCATGAAAAGATTACTAGGCACTCTAAGCCGATAAATTACGATTCC CTTCAACTGACAAATTATCTTTGGAATTCCTTCTCTCAAAATTATAATCA GCCTTTTCAAAATGATGACCAAGAGAGAAAACACGATAAGGTCACTCCTA AATTAATTAAGGTATTTTTTCTTTTACCACAACCGGTGGGTTATTTGCAT GTGACAGGCAAATAACCCACCGGTAGTGATAAAAGAACAAGTGACTATCA GCTAGCCATAGTTCGAATTGCAGACCTCTACAAGAGGACAGGCATAAGTA TGCAAGATACACGGATTCGTTCGAAAATGTCAACATCCTAAACTAAATAA CAATAAACGAATAAGATAAAGTTACATTGTTTTAATAAGTATGCCAATTA AGTCCTGCAAAAAAACATACAACAGTCAGGAACTATATTTATTTGCCAAT ATCAAATCAGATCATGGCTTTAGTAAGAAAAGCTCTTTACTTCAGCTCCC CATGGGAACTGTTCTCATTAAATTTCTAGTTTCCATATCCTTTTATATCG TAGCCAGCAGAAAATTTTGTCCAGTGGGTTGGCAGACATTACACAAAAAA TGGAAGAGAACTAAAATATTTTGAAAGCGTTCCAAATGAGTTATTCACTT AAATTCGAAACATAGATATCAAAAAACTGTGTGTACTGTACTAAAGGATT GTAAAAGTAGTTCGTTGGTTTATGTAATTCGTTATTGACCCATCGGTCGT GATGACGTTTTCAAAACCTCTGACGTCATCAACAAATCGAGATTTATATA ATTTCAGAGTCACCCTAGCTCTGGAATGTCAGATATTGTCAATAGAAGTA CTGTTTATCTACTGTGGTATACAGTGAATTCCGGATGAAGAAAGGTGGTA CACAAACTAATGATATCACAAACCAAGAACAGGCACTTGCTCATACCAAC TTCCATGAAACATATGTTTAGAGCTCCTGCTTGCTATGTTCAATCTACTT CAGTAATGAATGAACAAAGGCTTAGGAGGCTCTTGTCTTAGAAGATTTGT GAGCTCGGCAAAATACTATCAATGCTCATGGACCAATTTTGTTATAAAGG AAACTTTCAAAAACTTACTCCTTTCATTATGTATTAAATTTCTTAAAAAT CAGCTTTATCGTCCCAGCGACTCTATGTACAGCAAACCATTCGTCTTTCA ACTATCTCTTCTAGTTTGAAGCACCAACTTTGCGATACACTTTTGAATTT TTTTGTTATTTGTATCAAAAGTAGCAAGGAATTTCACTAATTTGTCGCAG AGGAAAGTATTAATTTTTTAAATAACGAAATTCCTAGCGAACTTTTAGTA GACTTGTTAAATACGCGCTTCTTTATAAGAACAATTCTTTAACAAAACAA GGCTTGCTTTTGACTAAAGCCTAAAATAAAGGAATAAAATCAGATTTCAG TAACTGCTAAGAAAATGCAGATATTAGGCCTCTTTTAATTCAATAAGTGG CTTCAAATATCAAGATCATAAGAAATAAGAACGTGGCTATAGTATCGGCC AAAGTTTACTGGTTCTTATAATATGAGCGTCTATCCTTCGAACGAAGAGN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAACTTACTCCATTC ATTATGTATTAAATTTCTTAAAAATCAGCTTTATCGTCGCAGCGACTCTA TGTACAGCAAACCATTCGTCTTTCAACTATCTCTTCTAGTTTGAAGCACC AACTTTGCGATACACTTTTGAATTTTTTTGTTATTTGTATCAAAAGTAGC AAGGAATTTCACTAATTTGTCGCAGAGGAAAGTATTAATTTTTTAAATAA CGAAATTCCTAGCGAACTTTTAGTAGACTTGTTAAATACGCGCTTCTTTA TAAGAACAATTCTTTAACAAAACAAGGCTTGCTTTTGACTAAAGCCTAAA ATAAAGGAATAAAATCAGATTTCAGTAACTGCTAAGAAAATGCAGATATT AGGCCTCTTTTAATTCAATAAGTGGCTTCAAATATCAAGATCATAAGAAA TAAGAACGTGGCTATAGTATCGGCCAAAGTTTACTGGTTCTTATAATATG AGCGTCTATCCTTCGAACGAAGAGTAGTAACCTACCCTTGGGAGATGGAG ACGAGAATTGTGAAGGAGGGTGTAGCCACTTTTCTCTATGTATTATCTTA TATGGAATTCAGTGATTCTTCCCCCATAGATGTCGAACCTTGTCTCTGTA TCCGGCAATGAGGAGACTGGAAAATTTATTTCAATAGCAATGAATCGACC ATGCTGTCCTGTTATGAAACACATGTGCGATTTCACTATGGTAACTGTAT TGGGTTTCATAACAAGCAGACTTAACTCAAATTCTATGCCACACTGCCAA ATCAAAACTTAAAACCCTCTTAGGAATTCTTCAACTCTAGTGCCAAGAAC TGCGAGGTCTTTTTGTCCGTACTTGTACTTTTACAATTAGCGCATTCTGA ATAAAGAATGGATTCTTCCATAGATATATACAAAACTGTTTCCAGCCAAA TTTCCCTGTACAAAAAATTCCATAAACATAAATGACTCGACATTTGAGAG GAACTTGGAAAATATTCCAAATTGTGTTTTTCTTTTGTCTAAAAACTGAG ATTACCACCTTTCATTTATCATTTTTATGCGTATTTATAGATGCAGAGGA AAGTATTATGTTTTCTTTAGTAGTTTTTTGGCTTTAACTGACCAATTATA TTCAAGGGAAATCCAAAAATAAAGCAAACATAGTCCCGTCCATCAGTCGG TCCGTCTGTCATTCCATAGCGAATATGATAAAGGCATTTGTAGAAATCTG TAGAAAAACAACAATTCCAATTATTTTGCAGATATTATACGCATTTGAAA ATAGTAATCTTCAATGTCAGTAACAAGGAGGAATATAACAAAATTACCCG GAACGAGAAAACAAACAAATTTGGAGAAACAGGTCATTGGAACATAAAAG ACGTTTTGAATTTCATGCCATTGATCGGTAGTTAGCGAGAAATCTTAAGA AAAGAAATGCTTTTGATTTGCCAAGTACTTTTGCATCGACGCTTTCGTAC AAGACGACAACCATCAATTAGGTCAAATCAAACCTTGTTAAAATTAACAT AATCGGTGAGATGACGGCAACATGTGTAACGAATTTGGCTTACTTAGCTG AATTCATCTTTTTTTAATCCCACTTTTGTGGGTAATTCATTTGACGATGA CTGCCAAAAGGAATGAGTTAGTTGAATTTGGAAGAATGTGGATTTTTCGA TTTTGTAGGAGGAGATAATGGTTGAGAAAGATGCCAAAAATGTTCGGATG CCAAGAAGTTGCGAACATTAAGGATACAACAAGATGCAGAGGTGTTGGAA AGCGAACGAATGTTTGAAGGGATATTATAAAGGTTGGTGGCATGATTTCC AGAAAAGTTGTTTGTTTGTTATCATCGCACGTTTCTTGTGGTGTGGCTTT GAAGCGTGATCAATAAAATGTCGGAGACCTAACGAACAAATTTCTCATTT AACCCTGATTCGTCTCTTTTGAAAAAGATTCTTCAACCAATGACATCCTT ATTCTTACGACCAACAGCCGCCCCTTCCGCTCATTTCATCCCCGCCATCG CCTATAAGGCACCCGAGAGTGTGAAATGTGGGTATGTTATGTTTATAGTA CGAAATGTACTTAGCTCGAGACTAATCAATATTAAGTACAAAATAAGCAG ATTAAAGAAATTGAAAATGAAAAAAGCAAGTGCACTCTGACCAAATTTGA CATCATAAAACTTGATGAAGATTCATCCTGTAAAGTCGAAGCATTCGTAA ACCGTTTATAGGGTTACTCAGTTCACACTGATCACTTTATCTATCTATTT GGCGTAGAATACAGTGTGTTTATTCATTATGGAGTGAAATGAAAATCTAC AATGTTTCAGTCCTATGTAAAAAAGTCAAACTCTTTGAATGTTGAGAAAG AACATCACTTTGTAGAGACACAATTGACAGCAGAATGAAGACAATTTCAG AAGCGGGAAGTAGCAAGTTGTTGTGTAATTATCATTTGGTCAACCTCTTC TATTATTCAAAGTTATGATCTCATTAAGCGGTGTATATATTTTTAATTAT CGTACAATTGACCCCTTGTTCCCTTTGTAGAAAACCGTCATCCTTTTGTC CTTTCGATTTTTCACAAAAATAGTTCTCCGTCATCATAATTTTGCTGACG TTTTCAATAAAGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTCTCATATTTTTGTATTTTT GCCACCATAGATGGTCTTCTTGTGGTGGAACATTGCATTTCATGATAGCT TTAAGCTTAATTTTGTTTCAAAGTTTTGATGATCTCTTTCTAGAGTTGGA AAACTACACCAAGATTCTTGGCCAAAAGTGGTCTTTCATTGGTCATTTAG TGATTTAAACTTTGATTTCTTGATTGATTTGTCTTTTAATGTTTAGTGTA AGTGTGGTGTGGTTATAATATGCGACAACTTTTTCATTGTTATCAATTCA GTTTAGAATTAATGAAACTGACCTCATGTCAAATTAAAGTTTTTCATGGC TCCTTTCTTATTTGCTACACAGTATACATATTTCGAAACTTTTGTCCATA TGACGTGCGAGGGGTTAAATTCAGAGAATTAAAACCATTGAGAAGAATGC AACATTGCAAATACAACTTTCAGTTTGCCAAATAATACCACACTACTGCA TCGTTTATTTTTGATTGACAAATTTATCGCATTGTTGAAAATGAGATGAC GTGAATATATTCGGTTTGTTGGATTTGGTTTTTCCTCAGTAAGAGTGGGA AGAAAATGCGATTGTACGTTATATTTATACCACGAAATGATATTACAAGT CACGTATTTGTGTTTGTAAACAAAAAAAAAACAGCCTAATTGATAGTCTT GCAAAACAAATGAAGTCTTTCTAATTTTCTTTAAAATAAAATGATGAAGA GCTCGCTGTTAATTATGATTGACTAATGCTATGGCAAGATTTGAATCTTG AATTTACTTTTTTTTCATCTTTAGATAAACTAACAAACAACAATGGCAAA CTTGACGACCAGGCATTTATGTTTGGCTATTTTGACGACGTTTAGCATGC TGACCACAAAGTTCGAAGGATGTGAATGTCGTTCAATTTCTTCGTGGTTG AAAGATTCTGATTATCCTGAAGTTGACCAAAAAACTTTCGGTCAAGGTAA ATATTTGAAGAGTTTCAACTATGTACATTTACATACTTTCAAACTCACTT TGTCTTTTCTCATAATGGTAGATGAATTGTGATGTTGCAGCTCAAACAGT AAAGGAAAAATATGGGTAAACAACTGAAAATAATGAATTGAGTTAGAGTC AATTCAATAATGGAACAGTTTTGGTGCCATCGGGTAGAGCGTGAAATTTG GAGCAAAAAATTATGCTAAAAGTTTCATACAGCACTATCACTAGTCATTT CGAATACGATTGAATTTTAAAGTTTGTTGATAGTTTGTAGCTTTATGTAC TATTCTCTGGTTGTAAAGAACGAACGTTGAGTCCGACAACTCTATGCTGA TTTCTCTTTTTCTCTAATAATTCTTTGTTTTGTTGCAGGTTCATTTACCC TTGGTGTTCCTGCAGGCCACAGTTGTGCTGAGAAGAATTTCCAAGTTCCC GGTGGCCGGCTGATTTGCACGAAAACCAAAACTAATGACGTCATGTGTAT ACCATCATGCAAAAAAGATCTCTTCTTAAGAACTGATTATGATTCTCACA AGTCGGTCATTGCGAAATTCCCGATTTTCTTGTGCAAGAGTGGCAGCTTG TTTTGGACAGATATTCAAAACAACAGACTATCATTACCAAACCCAAGATG CGTTAAGAAAGACGACTTCTTGAATGAAATCTTGGAAGATAAAGAATAAA TCCTTTCCTCTCTCATAAATGTTCACCTGAAAAATTGTCACTTTATTACA GAATAGATATTGTCAATTTATTTTAGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055485TCONS_00055485Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055484TCONS_00055484Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055483TCONS_00055483Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055482TCONS_00055482Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00055481TCONS_00055481Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055483-proteinTCONS_00055483-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_253supercontigscaffold_253:256370..298796 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.23 2 0.96 0.85 5.97 4.65 5.91 6.33 4.19 6.3 1.89 3.13 14.8 8.15 29.98 25.42 23.84 26.04 5.63 8.01 3.43 2.42 2.86 4.25 2.16 4.79 2.74 1.74 1.66 1.37