XLOC_034412 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034412
Unique NameXLOC_034412
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_243:274507..286915-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034412 ID=XLOC_034412|Name=XLOC_034412|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12409bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_243:274507..286915- (Clytia hemisphaerica)
TAACACTCAAACACAATCAATACGATCGTCATTTTAATGACGTCTTGCAT GACGACGATTTTGTCATTTAGTTTAATTGTGTTTAGATGAATCATTTTAT TAAAAGATGCCATGGTCAATTTTTTTTCTCAAACACTTTTTGAAATCCTG AGTAATAAGATACTCAATCAGGATAAGTTTTGTAGAATTATTGAGTTGAG GTAATATATGAAAATAGGTTTTCGGGGATGTTGCTGGGACTGGGAGCCAG TCCAAGTTTTGCGCAAAAAATGGCATCCGTATCGTCATAGACTAGAATTT TGTTGTTTGATCTGTGTGCGTTATCATTTTATCGGTCATGGCAGAGGCAA TTTTTTGTTTACTTTAGCGCCTTTCAAAATAAAAAGGGCAGCGGAGCTTC GAAAAAGATTACTGGCTTGAAAAGTTAACTCGTTCATGGTCAGTCAGTCA GTTTTTCGTCTATGTTTATAGAGAGAAGTAATATATTTTTTGTATTTTAA ACCTTTGTCTAGATAACTTATTGAAATCTAAAGAAAATACTAAAAGTCAT GGATACCAAATTGCTTTTTGCCATTGCAACCTTTTGGTGTATTGGTAAGG ATTTTTATAAATTTTGATTATTTCTCAATGCCACACCCACTTTTTACTCA ATCATAATGTAATTTCCAATAATTGAAAACTCTAGCATTAAAAGAAAAAC ACACTAGGGAAGGCATTTACTTGAAGGGGCATTTATTTGAGGGGGTGTTT GTTGAAAAATGTTCTCATAAGAAGGACGACCCTGCCGGTTGCCGGTGCAC TCGACAGTCGGGTGCTGTCGGGTGTTTTGTTGTGTGCTGACATTTCTAAA TTTGCAAAAACACCCGACAATAGCGCACCCGACAGTCGGGTGCTAAAATT CCTAGCTTTGTTACATGTTGGGTGCTGTTAAAAGCACCTAAGATGTAGCT 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CTTTGGTCAAAATTTTGTCTTCTGTTGGAAAAATACCTTGTTACCTTTTC AGCTTCATTCGGGAGTTGATTTTGATTTCATCACCATTTGAAATGCAATG CAAAAACTTGCTCTCCTTAACCATCCCTACTGGACTTTTTAGCTGGGAAA TTCTATCCCTATTGGGATTTCGATAGATATGTTCATCCCCACTGTGGGAA AAAGTTCTAGCGGGACACTGCAACAGGCGTGTTTTAAGTCCAGATAAAAT TCTAGCCTTTCTAAGGTGCCGAAAAAGTTGTTTTTGTTGTTTTTTTTTAT CAACCAACATGCACTTCATCTTGTTAGAATCATGCACAAGACAGTCGCCA GGCTACATAATTTTGCTGGCTTTCTGTTGACGCTCTCTAATTCGACGTTC TACTGTTCGATACGTTCTATTATTCGATAGTGCTGAAAATCGCTGTCAAC AAGAAACTCTCATAAACGACGCTCTATTTATTCAATGAAAATTCAATCCT CCTAAAAAATCGACATAGAGAGCATCAACTATTTCATCTCAAACAATTTT CTCGATAGAACGCAAAAGTTGAAGAAACTTGGGTCTGTTTATTTTGCAAA GATCCTAAAACAGGGCAACAACATCGTAAGAAATCAAAATGGATCGATTC CCAAGATATTTGTTTGGAAAATGAATGCACTGGTGTAAGTTTTTTTTGTT TTTTATCTCCTAAGATTTCTTTAAAAAGCAAAACACGCTTTTTTTTGTAA GAATAGACTATAGAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAAATTTAGAA TAATGCTAAGAATATCACCATCGTGGAAATTGGCTACTCAAGTTAAAAAT GCCATCTGATCTTTAGAGCATTTTCTACTATAAATTGTCAATTACCCCCA AGTAAGGCTCCTAACCTAAGAATGCTGTAAGAATATTTTAGGATGATTTT CCTAAAAATGTTAAGAATATCGATGATGAAATGGATTTACACCATTCTTA TTAAAAAGCGTGTATTGATAAAAATTTGTTAAAAGTTATACTTTTACATA TATGATCCCGTTTCATATCAGACACATGTTTTATATCAGGCCAGTGTCTC CTGTGTCCGATTTTGTGCTGAATAATAAACAAAAAGTTGCCTTTCTTTCC ATCTTTCTAACCAATATTTCTCCACATCCGTGTCAATTCAATGGGCCTCC ATAAACCGCTCGTACTTTTCACAATGATGTATGGTTTTAGCATTCATTTG TTCGGTTTCCTTACACCATTCTTTGATTATTCGTCTTTCATTTTTGGTTA AATCCTCTGTCACTCGGTTAAGAAAGCCATTTTCTTTTGTTATTGCTTGC AACACTTTGTTCTTGTCTTCTTCATTCGTAAACGTGACTTTGATTGGTCG ATATGTCCCTTGATCTTCCCTTTCTTTCGTAAATTTCCCGATCCGTTGCA TTTGGTAATCTTTATATTTTCAGACGGAGCCGCCAACCAATAATTTTGTC ATGGATGAAATGACTTTGAACTATGTCTCTCGATTGAATAATATTTTTAG AAAATTAAGATCAGATACCCAAAAATTTGAAAGATTGCACTCTATGCCTC ACTCACTATTTTTATAGGGTTTCAGACCAATCAAGTCTCGCACCATTACT TGTCGTGATCCACCGCTGACAAAAGATGATTGTGGAGGACTGGAACCTGT TAAATTGGCAAACGAGTGCTGTGCCAAATGTGGAAGTAAGATTTTTGTCT TTGGGAAAGTTTTTTGTTGCTAAATTTTAAAACCTGCGTCAATTTCAGTT TCTTTAAAGTGAAAGTCAATAAGTGAAAAAAAACAAACGCATATTTAAAT ATTATCTTGTTAGAATGTTAAGCTTGAAAAATCACAAAACGATTAAGCCT TAGCTGAAATTTATAAGGTTTATTATATTCACAATAAATTGAAGTTGAGA TTGAAATTGTTTGATACTCAAAGTTTCACGTAATTTTTCGTTACGATCTT CAGTCAAAAATTCTATACTAAAAATTCGTTTCAAGTTTACAAAAATATAT TATTTGTTTTTTTCCCCATTTAGTATTTGTATTTTTGAGCGATAAGAAAA CTATTCGAATGTTTAAATTAAAGATTTTATATTCCCGTGCTATATTTTAG ATGAAACCTGTTCATCAGACAGAAAATATTATTTGGGTTGTAAGAGAACG TGCAGTGACGGACCTGATTTCGTCTGTCCGACAAAAAAACCTGGTTGTCA TTGTCCGGAGGGTTATGCTGAAAATGAGGAAGGACTTTGCATCAAACTTG GAAATTGTCCATGCAGATCTGGAAGAGTTGTTTACAAGGTTTGTTTCATG AGTCTCCATTGTTCACAGCTCTACTGTCTCAAACGGATTTCCGTCTATGT CAAGTATAAAAAGAAGCTTTTCCGCCTAGTTTCGAATTTATAGAGAAAAT GCAGCGAAATATCGAAAATCTATATGTGTCCATTTTCCTTCTCAGACCAT TTGATACCCTCGTATTTCGCCTTTTTTTTACTTTTTTGAAAAGTAATGTT TTATAGCATTTAGGACATAGCTTTTGTGATATGATAATATACGAGTTGCG GGTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTAGAACCACGAGTTGCGAGT TACTTTTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTAGAACCACGAGTTGC GAGTTACTTTTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAACAAAATAA AATCGCGAGTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAACAAAATAAA ATCGCGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAAATCACAAAATTCGCGAG TTGCAAATTGAAAGTGCGAGTTGCAAATTAAAAGTGCGAGTTGCAAATTA AAAGTGCAAGTTGCATATTAAAAGTGCGATTTGCAAATTAAAAGTGCGTG TTACAAATCGAAAAGTCAGTAAGAGTGAAAATTTCTATTGATAAAAGGAA AGATATTTTTTAAATGATTAAATAATTATTGCTGCTCACTATTATACATA AGAAGAGCAAATATTTGGTGGAGAAAGAAAAAAATGTACAAAAAGTATTT ACATTGCATGAGTGTAAAGAACTGTAGAGAAAAGTGCTCCCGGGCGGGGG TAATAGGTTTGGATGCGTTGTTACTAAAAAGGGTAACATGGGGTAACAAG GTAACAGGCTGAGAATGATGGCTCTAAAAGGTTGTTTCACCTACAGTAAT TATAAGATCACATGCAAAACGTGTACAATCATGGTCGTAATATTTTAGAA AAAAAGGAAATTACCACGAATTTTCAAAACTAAAAACGATTTTGAAGTGC TCTAAGTTAAGTTGGAAGGATAGAGTTTTAATTCTGAGTTTTAACGCTAG ATTTAAGACTTTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTTAAAAAATGGTCCAATA CGGCTCAGAATATAGCCTTGAAATCTATAAACCCGTGCCAAATTGAAATA TCCGATTAAATTTAAGAGATGGCCCAAAATCTCGCCCGAACTTTGAAAAA TTTTGAAAAACAAGGAAGTAAGCTAAATTCTCAATAGATTTTTAACATGA TTGTAGAACAGCCATTTGAAAGCTATTGAAGCTTGAATAGATTGTCGATT TCTATCCTTTTGTGTTATCAGCATCAAATTTATAAGTGACAAAACCCCAA ATCAGTCCTTCGTAGAGTGCCTTTTTCGAAAAATTTGGGGGAAAAGTAGA AAATCTTAGAAAATTTTGGATTTTCAGTTCCAATCAGGGAAAATTCGGCA AAATTTTTGAAAAAACGAGTCCCATGTAGAGTCATATTTTGGAACCTCAG CGGAGTATCCCCGTCGGTCGGCAAGGGTAGTACCCCCCACCCCCGGGGAC AAAACCTTTGCTGGGATTGCTTAAAAAAGCTTTATATTTGACCATCAGGT CATTATTTTATAAAAATAAGTGATTTTATCAACATAAGGACAATAGAATA ATTGATTAGAATTGTATCTCTAAAACTGCCCTTCCCAAAGTTTGTCTCTT GACAATACACGTTTTTTTTTTTATAAGAACGTCAAAAAATTTTGAAGCCT TCGGATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAAT GTTCTTATTTTCAGCATTTTTTAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAA TGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTAGAATGTTCTTA AATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTCTTCTTATAAA AAAAAAACGTGTACTTATCTATTTATATCAAAGGCATCTCATTCTGTACA ATTAAAATATTTGGTGTAATAAAGCTTGCAGGTATCACACTTAAGTAGCC TGTCAATAATTTTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGTCAAAAAGTGTCACTTTGTCTTGAAAA TGACAGGTAACGTCCACGTTATTAAAAGCAACATTAAAGATGTTTCTCGA TAGGAAGAAACACGCGCATTTCCTCTCAAAACTTAAAGTTATGTAATGCT CTGTTTTGTTTTTATACAAAAATGAGCGAAAAAATGTGTGATTTAAGTGG TTTCACAACTTTAGTCACAAAACGTAAACAGTTTGGCTGAGTTTTCCATG CTTTGCTTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCATGTAATACTAATAATAAAC ACAAATAATGATACGGGATTCAGTTTGTATAAACTAAAATTTACTTTTTT GCTTTATTTCTAATATGTCTGAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTATGC TTTGCTTTGGGTTTAGCTTTTTTTGTGCTGTTATTATTTAAGATAACAAT CTCAGACTTGATTTTAATTCNTCCCGTGCTATATTTTAGATGAAACCTGT TCATCAGACAGAAAATATTATTTGGGTTGTAAGAGAACGTGCAGTGACGG ACCTGATTTCGTCTGTCCGACAAAAAAACCTGGTTGTCATTGTCCGGAGG GTTATGCTGAAAATGAGGAAGGACTTTGCATCAAACTTGGAAATTGTCCA TGCAGATCTGGAAGAGTTGTTTACAAGGTTTGTTTCATGAGTCTCCATTG TTCACAGCTCTACTGTCTCAAACGGATTTCCGTCTATGTCAAGTATAAAA AGAAGCTTTTCCGCCTAGTTTCGAATTTATAGAGAAAATGCAGCGAAATA TCGAAAATCTATATGTGTCCATTTTCCTTCTCAGACCATTTGATACCCTC GTATTTTTTTACTTTTTTGAAAAGTAATGTTTTATAGCATTTAGGACCTA GCTTTTTATCTAGTTGACCAAATTTAATAAATGACCAAAATTTAAGTTTA TCCTTCCTCTTTCTAATGCAAAAAGATTCATTCTTCAACGGTTCATAGAA CGCGAGAAAATTCACTTTAAATAAGGGGACTTTTTTCTGGGACAACTGGT ATTTCTTATTTTTTGGACCAGACCAGACCCCCTGGATGTTTTATACAGAT CGGGATACAAACTATTTCTGGAATAGCCCATTAACTGCGCCGTACGAGAT TAAATTTTGAGAAGTTGTTTTGTTAATTCTGCTTTCTCAGCGTAAAAAGC ACATCTTTATTCTATCTTTATCATAAAAAAGAAAATATCTTTTCCATTTC AGCCTGGACAAACAGCGGTACGAAGCTCATGTACCACATGTGTGTGCAGT AATGCTGAAATGAAATGTTTCAGTCGATGTTAATAAGTGTATAATAAGCG ATGTTTTACGCATCACGTGACCAGGGAATGTACTTCATTCAAGATCCTGT CAAAATTGATAGGCTGGCGACTTTCGATGTCGTTTTGTGTGTTAAAACTA TTTTTTTAAAGCAGTCAAAGTATTTCAAAGAACTGAAACTTTTTTTAACT TCATTTTAACCTTTTTATGAAACATTTTGTTTTATATCTTTTTTTTCACA GTTTTTGTGTACATAGCATTAATTTTTAAGTTTACCTCTTTTCTAAACAT TACCTAACCAATCTGATTATTACTTTCACTCATTGGGCATTAGAGATTTC ACTATTACTTCGGATTGTTTTGTTTGATGTATATAAAAAGAGTCTTTCAT AAGTTTTAAGAAATCTTTAAAAGAGCGAACAAAGTAATTAGTGCTGAGAT TTAATCTCCACATAAAATATCCACATAATTTCGAGGTCGGAGGATTACTT TCGCCTATTGATGACTTGTTTCTTAACATTTGCGAATAGTATTATGTAAA ATTACATTATTACACATTTTTGACCTAAATTAGGCTAATAGAGATTTTTA GGATTTCATCCTAACAGCAATTTTCTAAATACCTAATTAAAACCTTTCAA TAATACTACTTTTCAGTCATTTTTAGGTCTCAAACTGCTTAAGCCTTGGC AATTACTGCTTCTACAAAATGTGTAGTATTATTTGTATTAATGTAATATA TGATTACGAATATTTTATGATATGTTGATATATGATTATAGATTAGCTAT TTTTCCTCTTATTTCTCATTTAGAATAAAGACACCAGCAACTTTGAATTT TTTTCACTCTTTATGCTTTTTTTAACTCTTGGTATTTAAGGTAAATAAAG ATTAGTACT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054608TCONS_00054608Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054607TCONS_00054607Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054606TCONS_00054606Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054605TCONS_00054605Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054607-proteinTCONS_00054607-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_243supercontigscaffold_243:274507..286915 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.68 11.51 22.05 24.83 175.82 136.69 87.67 94 104.2 113.9 114.11 71.88 68.81 55.77 50.7 59.29 83.57 99.91 96.54 111.01 69.48 71.12 46.54 51.87 46.8 56.03 363.6 312.61 483.32 529.55