XLOC_033873 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033873
Unique NameXLOC_033873
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_233:1418984..1462943-

Legend: gene
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>XLOC_033873 ID=XLOC_033873|Name=XLOC_033873|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=43960bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:1418984..1462943- (Clytia hemisphaerica)
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ACCAACGACCTTGCGCACCGTAGCTGAATGCTCTACCTTTTGGTGGCAAA ACATCACCAACAGTGTGGATGGCACAGTCAAAATTCTCTTGCTGGATACT GAATCTGATGGATGGTGGGTAAATTTAATGGATTTTTTAAATACAATGGT AAAGGTTATTGTTTCTGTTGTTGTCATCGATTCATCAGATGACTTTGATG GTCATATTGATTTCCTTGTGGTTTAGAAACTGGAGGATTGAATGAATCTA ATGACCAAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAAAGATGGGTCTGATAGTCCC AATGAATCTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAA TGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTGGTGAATCTAATGGTAGAGTTG ATAAATTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATTGTCCCAATGATTCTTGT GAATTTAATGGTTGAGTTGATAAATTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGA TAGTCCCAATGAATCTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTG ATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTAT CGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGA TTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAG GGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGAC TTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACC TTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTC CCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCC AATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGT TGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTT GTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCT GATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGG TGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATT ATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAAT GATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGA AGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATG ACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAA CCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAG TCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATT CCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGA GTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTC TTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGT CTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTT GGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTA TTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCA ATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAAT GAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGA TGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTG AACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGAT AGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGA TTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATC GAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGAT TCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGG GTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACT TTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCT TATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCC CAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCA ATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTT GATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTG TGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTG ATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGT GATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTA TCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATG ATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAA GGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGA CTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAAC CTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGT CCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTC CAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAG TTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCT TGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTC TGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTG GTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTAT TATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAA TGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATG AAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGAT GACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGA ACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATA GTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGAT TCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAACCTTATTATCG AGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGGTCTGATAGTCCCAATGATT CTTGTGAACCTTATTATCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGAAGGG TCTGATAGTCCCAATGATTCTGGTGAATTTAATGGTCGAGTTGATGACTT TGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAATCTA ATTGTCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCC AACGATTCTGGTGAATCTAATTGTCGAGTTGATAAATTTGGTGATTCCAA TGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAATTTAATGGTTGAGTTG ATGACTTTGGTGATCCCAATGATGGGTCTCATAGTCCCAATGATTCTGGT GAATCTAATGGTAGAGTTGATAAATTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGA TAGTCCCAATGATTCTTGTGAATTTAATGGTTGAGTTGATAAATTTGGTG ATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAATTTAATGGT CGAGTTGTTGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGA TTCTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTGTTGACTTTGGTGATTCCAATGATG GGTCTGATAGTCCCAATAATGATTCTTGTGAATTTAATGGTTGAGTTGGT GACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGA ATTTAATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATA GTTCCAATGATTCTGGTGAATTTAATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTGAT TCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAATTTAATGGTCG AGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGATT CTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTGACGACTTTGGTGATTCTGATGATGGG TCTGATAGTCCCAATGATTCTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTTGTGACTC TGGTGATTCCAATAATGGGCCCGATAGTCCCAATGAATCTTGTGAATTTA ATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCC AATGATTCTTGTGAATTTAATGGTCGAGTTGATGACTTTGGTGATTCCAA TGATGGGTCTGATAGTCCCAATGAATCTGGTGAATTTAATGGTCGAGTTG ATGACTTTGGTGATTCCAATGATGGGTCTGATAGTCCCAATGAATCTGGT GAATTTAAAGGGAAATTTAAGGATAAATGATTGGTGAGTTGATGGTTCAA TTTTTAAATTTATTCGTATTTCTTTCTTATCTTGACTACATTTGGCTTGA AACTTGATATTTATTTTCCCTTTTTATAGCATGTAGAAGAAAAGCTAAGA AATTCAGGGTATAATTGAATCAAATATTAGTTGTGAATTTTATGTTATTA AAATTAGATATAAATACAAATCTTTGAAAATTCATACAACATTTATGAAA ATATATTCTATAAGGTTTCACTTCACTGAGTCTATCAAATGTTCTTGTGA GCTTTGAGTTCATCAGCAGGTCTAAATAACTCCTTATCTTAATTTCAATG AGTTTTATTCCAGCTTTCAACTTTTGCAATTACGTCATCCAGAAGAGGCT TATAACCATGAGTCCTTTTTGGGACCGCCATTTCACTTTTCCCAAGGATC AAGGATGTGGTTTAAGACTAATTTACTATTTTCGATCTGCCCATCCATGA GTCCAATCTCAACTCAAATGCTCATCACTTGCTNGGTTTAAGGCTAATTT ACTAATTTCGATCTGCCCATCCACGACTCCAATCTCAACTGAAATGCTCA TCACTTGCCAATTGATTTCTTTGTCTGATTATTTTTAGGGAACGAAGGTT CTATCTCGAACGCACATGGTTGTTGGACAGTAACAAAGTGGGCGAAAAGT GTAAACATATCGTGCAATAGCTCTCACAAGACCCTGTCTACATGTTGTTG GTCTCATTCGTGGACATAATGGCATACATGTGATGATTTGAAATTTACGG GTACGTCTACACTGGCACATTCTTTCACAGTTTCTAGCAATGAAGATTTC ACCACTGTGATAGCGTTTGCCGCCGATTGTACAAGCTGAAAATAAAATAA AGATTTCTGGTTAGGTGAAAATAAAAAAATGTAGTTTTTCCGGAAAAAAA AAAATTTTCTGACCCGGACGTAGACAATGGGTTCATCTATATGGTTCATC ATAAAGAAACTCAAGTTGACCGTTCAAGCTATCAAACATCGTTTGGTTAG ATATTCCCGCTTGTAAATCAAGTTTTGTTCGTTAGTAGTTGATACATTGA TATTCAGGGCTTACTCCATACTGTTTGTACATAAAAGTTATCTTTAAAGT TCTATTTCAATGATCTTAAGTTATAAAAAATAGCAACCAAAAAATTATTA AAAAGGCTGTTTTTCCTTCACCTGCATTCTGGAAACACTACATTTTTCTT ATTTTCGCCTTAGCAGCCTAAAGTAATTAATCTAAAAACAGGCATAAAAA GGTTAAAATTCAGGTTTTTAATAAACTAAATTTTTCTGGTCTATCTTTGC CATCATTTCTTGAATATTTCGATCTTTTATTGAATATATTTCTGAACCGT GGAACAATCGAATTAGAGAAAGATTCCAATAAGAGAAGTTAAATTAAAAC AGTATCTAATGTGTTGAGATTACGTTCCTAAAGATCTTTAAATGTCTATA TTTTTTCAAGCGCAGTACTAGTTCTTATGAGTTGGGTTTCACTTATTGTG AAAACATCGGGTTGTTTTTATTTTTAGAGGACACCCGTTTAAGGGCTAAA CTAGATTTAGAATTTTCTTCGACAAATCTGATTAGAAACAAAAATATTTT TTGACAGTTTACATTCAACTTTGTAATGAGAGTAGACCGAAGGAGAATGG GATTTTTGAAGGAATTGCTAGACGATGTTGTCGTCCGTTTCATTGATAGT AAAGGCGGGAAAATGGCGGTATGGCGTTATGGCGGTATACGGAAAAAAAA TCGGCGGGAGAGTTTCGAAGACTGGTAAACTCTACCGGCTGTAAACCCTT TTCAGCAAAAAGCCCGTTTGAGAATTTTCTTCGGCTTTGGGCTTATTTCT TAGTTAGTGATTTGTCTTAGACTATAACTGAGGGTGATTCAGCCTGCAAT TGGCCCCAAGGGGAATAGAATTTGCTTCGAACAATTGAAAATTCTAATAA ATGAAGTTCGAATAACCGAGAGTTAGGTAAGCAGATCCAAGGAGGAACAA CCGAACTTTTCGAATAAGTGCAGTTTCGAATAACCGCGAGACTACTGTAA TTCAATATTTAAGTAATTCAATACTTTTCAGCTGAACGCCCTTCATTTAT GAACTTTTCTTTCGGCTACCGTTGAATTTGATTGAGCGCGTAATTTACAA AATGTAGATCGTGAAAATAGCTTTTCAGTGAACGCAAAGATGACCTACTT TGATTAAGCCAAAGTCGAAAAATTTGTATTTGAAGCTGAATAAATTTCAG TTTCCCACAGTATTGAAGTAATTAAGAGTCCCTAATAACGAGCAGGATTA AATAAGAGCTGAGTCATTTCTTTGAGGTTGAACAGATATTGTAAGTAAAA AGATACTTGCATTACTTATTTCGCCTTCAACTGAGACGTTTGTAAATTCA ATTTTCGCTCTCATGAATACTTAAGTCAGAAGTCTTCAAGTCTACAGTGT GTCCCAAAAAAGCGGACAAATTTCTATGTAAATTACAATCCTCAAACTTT ATTATGTAAACTTGGCTTAAAATAATTAAAATACTGTAAGATTAGAATTC TCTGTCCAATCAATAGATATTCAATCACCAATATGATTGAATAAGTTTTC GAGATTGAAATACCAAGTATATAAGTCAGAAATTTGGCATAAATGAAGAT TTTACTTTACATAAAAATGTGTCCACTTTTTTGGGACACACTGTATAGTG TGAAAAGTTCAATTACAAAACCTATGAATATTGTGCTCCAACTTTAATTA TACTTATGTATTTTCACAGTTTTAGAACAAAGCAGTTCAAGAACATAGAC AACATTGTACCCACCTGTGAACAATGCACTACTTCTTGCCGTCCGAAGAC CAAGATCTTGCACACGTTGTCTGTAAACCGTCACCTCTGACACTTCTACA AAAAAAAAGATGAGGTATTTTATGATTTTATTTTAAATTGTAATTCAAAA ATACCTAGAAACCCTTGCATCAACGAGGGAAAAGAGAAGGGTGTTGGCCC AAAGTTTGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053710TCONS_00053710Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053709TCONS_00053709Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053708TCONS_00053708Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053709-proteinTCONS_00053709-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:1418984..1462943 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
31.14 26.68 39.61 36.59 28.6 21.94 18.12 18.49 14.36 15.09 11.45 10.54 9.5 7.71 9 16.08 14.09 14.54 2.12 1.59 6.77 7.44 14.59 11.25 21.16 24.37 5.64 3.29 5.39 4.96