XLOC_031908 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031908
Unique NameXLOC_031908
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_17:87885..99931-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_031908 ID=XLOC_031908|Name=XLOC_031908|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12047bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_17:87885..99931- (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNNNNNCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTC TTTCATTCTTTACGATTTTTTGAACAAAGATGCATAACTATAAACCCTCG AATGTGGCGGAGCTCAATTTTTGGAGAAAAAAATTTTGGGGTAAATTTCA GCTAAAAAACGGCTAAAAAAAGGGTTTTTTGGACTTGTTATTTTCTGACT TTTTGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGACTTTTGTAAAAAA AGATTTTTTCAAAAAACGCATATTTATTTATAAGAATCACTATTAATAAG CATACAGCAATGTTCTTAAAATTACTGAATTTTTTGATGAGATATGTTTT TTTGCTTTCGAAGTCTTGAATATCAAAGAATATTTCAAGAGCATGAAATT TTGGTTTCTAAACGTGTTTTTTATAAGAAACAAACGACTAATTTTAATAG ATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAATGATCACGCTTATGTA GATATAGCCTGGGAATCCATGCTATGATTTCTTCTTTGATAAACTGATGG CGAAATGTATAGCATGGTATAGGCTGAGAGTTTGAATTTCTCAGATCCTA ATAACGGTTGAAAACATAGCCAATCAAATTTTGTTATTCTTTTACTGGTC ACACTTTCTTAGAGAAAGCGCAACTTCCGAAATTTGGTTTTTGTCTTAGT AAGTGAGGACAGCGCTAAATTCAAATTTCCCACTGTAAAAAATGTGAGTC CAATATTGGACTCACAGCTCGAACCCGTCTTGTGTACATCAAATTATTAA AAAACACACGACGGGTCTCCTGTCTAATGTAGATATCAATTATATATGTG TTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTATTATTC TATGCTTTGCTTAGTCATAGACTTGCTGCAATGAATGGAGAAGATGAGAT 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CCTTTCATTTTGATGCAAGAAATGTTACGTGGTGAAACTGATCTCAAACT ACCACCAGGTGATTTTATTTCTTCAAATTGCCCAATTAAAAGGTTTTGTA CAAATATTTTTCACAAAAGTTTGCAAGCCTTTTTTTGTACGAAATAGTAC GAAATTGATATTAACTCGCATATGCACCGATAGAGTTAGTTGATTTTGGT TCCGTTTCTTNAAGGATTTGGTGAAAACTGTTTTCGGCGAGCCTAGATAT TCGAAATGTTTCACTTTTGGCCAGAACTCATTTAGACATGTGGGTGATTT AAAAAAATATGCATAGATTTAGCCCAGCTTTAACCCACCAATATCACGGT TGACTTCTGCNTATGCTGGGAACTCATTTTTAGTGGGACTTTAACCCACT TGCACACTTTGAATCTCGAATACGTCAATTCGATTGGTTCTTTGTCGTTT TATTTAAATTAGTATTATAACATTAACCCATAATTCACAAGGTCCATTAA TCAATCTTATTTGTTCTTTATTTAACAAAGATACGGAGGGAATGCTGTTA ACAAAATAAAGTTTGTATTGATTTCTAGATCCAAAGCAATGGAGTGTCGA GGAAGTTTCGAAATTCATGGAATGGTTGGTCAGTCAGCTTCGTGTAAGCA AACCAACCACGCCGTACCAAAAATTCCACATTGATGGAAAATTATTGTAT AAAATTCGTAAAAGAAGTCTTCAGCGTTTCTTTACCGATAGTGCGGTTGA CATCCTTTGGATACACGTGNGACCTGACAAAAGTTTTTTGACTGTCTTCT GAAATTTTTAAACGAAGAAACGATGTAAAAATTACTGCTTTCAGGATAAT TTTTCAAGAAACGCGGAATTTTTTCTTTGTTTCAAATGCAAAAATGTCTT TTGAATCAGAAAATAGGGCCAAATTCCAGTTCAAAATCGAATTTTGAATG 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CCCTTTTTAAACACACACGCACTAGTTATTTTGTATGTTTTCTGGTGATA GAATTTCAAAAAGAACCTCAATTTGAGGTGCTCATCAACTTTCCCTTTGA GGTTTTTTCTACTCTTGGGCAAAAATTGCTTCAGTAAAAACAAAAATAAC TTTTATTTTTAGGAGCAAAGATCTCCACAGATGGTTATTGTAAGTTTCCT TTGTTCTTTTATTTATATAACACCCTGTTTTGTTCGTCTTTTATCTTTAG AGTCTTTAAATTGTAATTTAATTTTTGTAAGCTATTTACAGTGATTTAAC ACGCTTTAGAAATTGTTACTCATAGTTTAGGGGTTGAAGCAAGCTCGTTG ATTTTTATTGGTTGAGCATTAGGTTGACGTTGCTCTTACCCTTTCCCCCA TTTTTGTGTTTTCTTTTTTTCTTTGATTGATCATATGAAAATCAAGTGAA AAATTTATGAGAAAGAAGAAAAACCACAACGCTTTCATTCATAACACGTT TGGAAGTTTTCTTTTTTAAGTAAATGTTTTTAAAGTTTATCAGAGATTTT TCAACGATTTATCTCCTTTACGCCAAAATAGTCGATTTATGTCCATAGAT ATAAAACCCGAAGGGCTAGATGTCGCACTTTAAGCCATCACAGGCAAAAA AAGTGAATATCGCAAAAAATATTGCTGCTAACTGTTTTCGAAACCCGCGA AGCTTCTGATTGGGCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCACGTGACTT TTGGCACACTTTTCAGCACTCCATCTAGCCCTTCGGGCTTTATAAATCCA TGTTTATGCCCCTTAAAATCAAGTGGTCAAGAGCTATGGCCAAAAGTCTT GGACTTTGTCTAGAATTTCGACCTGTTATTTTGACGTGTATGCCGGGTGA CCCACGAAAAAGTATTATGGGTTGATGACAAATGTGCCCGTAATTTTACG ACATTAATTTTTCATTGTGATGATGAAGTGCAAAATTTGGTGTAGGGTAT AATTCAAATTCGGTTTAGTGGTTCAAAATATTTTAAGGTATTAAATTAAC GCTAAACAATAGAGAATAGCTCGTTTTTTAATATTTGTGTAATTTTTATG ACGCGATTAATGATCGAAGCTAATTTATAACCATATAGATGTAACAGAAT CATTCAATGAATTAGCCGTTTTCGTAACTGAGAAACTACAGTTGCGTAAT AATATTTATTTTATAGCAAGTCTTCACTTGTGGCGAGGCCATCAAAGCGC AACCAATACACCTTTTCGACCGTAGCCGCCAATTGCTGCGCGGGCATTTT TTTGTCCGCTTTATCCCACTAAAACCGTCCCAGTCCTTTTTTTGCACCTA TAGACAATAGAAAAATGTGTCAAAAAAAGGATTGGATCGAGTTTAGTGGG ATAATCAAATAATTAAGTGGCACGCGCCTGACCGCGCGACTACGGTCGAA AAGGTGTATTTGCGACCGTTATTCATTGATTGATTGTAGAAGTGCTTATA TTTACCCATCGAAATTTTATAGAGAGTTAACTCGGCTCTGGCCACGAGCT AGTATATAGTGGAAACTTTACTTTAACTCCAACCTCTATAACTCGAATGT CTCTAACTACTTGTCTTCTCAGTTAAGAGTGCGTTATAAACCTCACTCCA CGCTCCCCGTCCGCGGGTTCGAAAGAAGTTTTCCATACAACCGAATAATG TTTTGTTATGAGAAACTTTTTTCAATAAAAACTGCACTCTGTGGAGCACC TACTATGAAACTTTCATCTATCATTTTTAGCATCACCGGGCAGTGGGCAA ATACAACTGTGGCAATTCTTATTGGAGCTGTTAACAGAGAAAAACATGAA AGACATAATTATGTGGGTGGGCGAAGAAGGTGCTTTCAAATTGGTTGACC CTGAACGAGTTGCTCAGTTATGGGGTGAACGCAAAAACAAACCCTCCATG AACTACGAAAAATTGAGTCGAGCCTTGAGGTATTACTACGATGGCGACTT GATACACAAAGTGTGTGGTAAGCGCTTCGTTTATCAGTTTGTTTGTGATC TGAAGATGTTGTTGGGGTACAGTGCTGCAGAACTTAGTCAATTGGTGAGC GAGAGCAGCGATGATTGAAACTTATCTATACTTACATTACAGTATAGACA CGACGATTGTTGTGAACGCTTATCATCTTTTAGAGAATAAAGAATATTTC TTAACCCTTTAAGTGCCACGGTCATTTTTTTAAGTTTAAAAAAAATCGCT AGTTCGAACTTTAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAGAAGGAGTTAGAAGC TCGTTGGATAGCGTTGGATAGNGATAGCTTCATACCAATCCTTGGGATAT TTTGCGATATTATCCATGTATCGTTGGTTAGCTTTCCATTCTTCCTCCTA AATTCATAAAACTTGAATTTTTTTTATCCAGAAAATCCAACAATTTCCAA AATCTATTTTTATTTGAGGCTTACTTTAGGCGTACCAACTTTCGCGATTT TCGCGAATTTTGACCTTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTGAAAATTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050395TCONS_00050395Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050394TCONS_00050394Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050393TCONS_00050393Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050392TCONS_00050392Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050391TCONS_00050391Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050390TCONS_00050390Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050393-proteinTCONS_00050393-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_17supercontigscaffold_17:87885..99931 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.91 5.91 6.29 6.41 47.05 35.39 18.68 20.74 13.46 18.77 17.19 11.29 14.25 14.83 11.95 9.67 14.42 17.35 8.93 11.57 15.46 18.06 28.43 24.65 16.83 18.31 12.3 9.67 23.07 24.08