XLOC_031425 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031425
Unique NameXLOC_031425
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_160:176217..202686-

Legend: gene
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TATTGGTTCTTTTAAAAAGCGTACAATTTAACTCAATCGAGGGCGATTTT CGGCCGATTTCGTTTAGTTCTTATTGATTCGCTTGACTGTCTTTTGACAT TATCGGAGTTTTTGATTTTTCTAAAAAAGCGATGCATTGTGGGATTGTTT CGAGTGTATTACAATAGAGTTTTCTCGACGAATTCTTAAGAGATTTCTAT TGTAATACACTCAAAACAACCCACAATGCATCGCTTTTTTAGAAAAATAA AAAACTCCGATAAGGTCAATTGTACAGTAGTTTTTTCGTTGAAATGAAGA AGATTTTTTACATTCTTCTTTAAAAGGTAAATTGTATATAATTCATTTTT AAAATGATGTATTTTTAAAGCTATTCGAAAATGTAAAAAAAAAAACAACA TAGAATTAGCCAAATAACACATCAAAAAATGTTGAATTTTCAGTCACATT AAATAGAAAATAGAGTCCTTAAGTTTTCCTCGCCGACTAGAAAGGAACCC GGCACCGGGATAGTATTGACGTAACATTTTATGGCTATTGTGCCAGACCA GCGAATAACACACAGTTTTTATTCAAACTCCTTATTTGTACTATCTTCTC ACAGACCCAGTGGGACCCCCACCCACGAGAAAAATTCGCCAAAATATCAT CCTGAGTGAAGAAAAATTATAATCTAATCTTTTCTCCCGCAGAAAATAAT CAAATAAACAAATTCTCACTGCTAAATATTGTTCTGTTTTAATTTTTTTT ATGCCCATCGAATTTACTTACTTGAAAACAATGGAATTCAAATCCTCATG GAAATATCGATCTCGTCGACTTTCAGTCCACTAATTTTACCCCCACTGGC TGAAAAAATCTAACCGGGTCTGTGAGAAGAGGAATATGAATTTCAGAAGC TCGTTTTAATCTGTGATTGAGGAAAATTGGATTACTGGACCGTTCCTTAT 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TCTGAATCAGTGGGATGACGTTCGATGATTCGAAAAGGATCATTTTTTTA GACTCTCGATCGCGTCGTCAATTCCATTTTGCCGAATTTTCGACTTCTAG TGCTTAGAATTTTATGGGGAAAACAGCGGGACCGGTATTTTCAAAAATTT TGGACGGGATAACGGTAATTTTCAAAAAAATGGCCGGGATGGCGGTAATT CAAAACCCCTTTTGTGGATCTTTCATTTACAATGATTTTATGATGCAAAT GTATTATCAAGGGCATATAATTAATGTCTAAAACCCTCTGAGGAGTAAGT ATTAACGACAAACCAATAAAATTTTCCATTAAAGATGCTACATTACTGAT TTCTTGATCAACAAATAGTCATCAAATACGACAGAGATAGAACAACAGAA ATTCAGATGTTATCATTCCAGCCGCGGCTTTCTTATACTATGATTCGACT AAAGTACTCTTCTTTGATTACAAAAATCATTGCGTACCTCGTTTTTAAAC TATTATTTCTAAGATACTTGTCTAATTACAGAGAGTAGTTTGAGTCATTT TCCAGGTGAGAGGACCAATATTTTAGTTCGAATTACAGAAAGATTCGAAA AATGGAAGGTCGTTTTTGGGAGTATCTGACACTGTAATTGTTCTAGTTGA AAACTGTTGAGCAAAGCTTATAAAATTATCATCGACCGACACTCTCTTTT TGCAGATATTTGATATGCTTTTTGGCGAAACTTGCTGAAAATTCAGAAGT GAATAAAATGACGCCCAGCAATATTGCGATTGTTGTTGGACCTAACATGC TGTGGAACGACAACGATGGAGGGTGAGTGTTCTTTCTAGGTGTGCTCTCC TTCGTTATGGCTTTGGAATGGTTTTGTAAAAAGCTCAAAGGTTTTTGAAT ACCTTATCGGCCCTTTTTACGCCGGCCCTTTTAACGTCGGCCCTTATTAC 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ATCGAGGAGGGTAAAAGTCCTGATTTACCGTCATCCTCAGCCAGTTAGGA TCTAGACAACTTAGAAACTTAGCGTCTCTGTCGCAGAAAAACACACATAC ATAAGCTTGGTAATATTCAAACATTACTTCAACTTTCTACTAAAGCGTAC AATTACTGACCGATCGCAAGCTTCTTGTAACTGAGCAAAAAATGAACAAA TGTTGAATTCTCCAATATAATTTGATTGTCAACTCTCTCTCTCTAATTCG AACCTCTATCATTCATGTTTCTCTGTTGAACTTGAAAATTGCCCCATTAA ATTGTTACATTAAAAGTTATCCATAATCATAATCTTGAGTTCTAAAATCA AATTAAAAAAGAGTCAACTTATATAGATTTTAAAAACACATATTTTCTTG AATAAAATACGAAGCTTTTCGTAAGACGAACTTCGTATTTTATTCAAGAA AATAACATGGCTTATTGATTGATAAAACTGTAAAACTAACTTGCCAGTTT TCAACATAATTATTCTCAATAACCAAATAATACGTTCGACTAACGAACAA TCAGTACGTAGTAGAATAACAAACGTAGTACGCCTCTCTGTTTTAATTAA GTGTAATTCTTCATTGTAGCACAAACACCGCTGGTTCGCAGGCTACTTCC TCAGCGGCCATAGGCTATTATAATCCGCTCGCTGCACAATATGATCCAGA TCTCGACGCCCTCTACGATAGCCCGCCCGTGCCGCCAAAACCACCATCTT CGAATACGGGTGGAGGCGACGACTCCATGGAATTCAGTCGAACAATGTCA ACGTCCTCTGTTGGATCGAGTAAGTATAAGATTGTTAAACCAAGGGCCAT TTAACGGTCGCGGCGAGTCATGGGGATCAGGACCAATATTTCTATTGGTT CAATCTTTCTGATAGAGCGCAGTCAGACCTGTTTACCAATGGTTCTCTTC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00049548TCONS_00049548Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00049546TCONS_00049546Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049545TCONS_00049545Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049544TCONS_00049544Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049543TCONS_00049543Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049548-proteinTCONS_00049548-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_160supercontigscaffold_160:176217..202686 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SH3BP1SH3 domain-binding protein 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.41 9.19 32.33 35.95 30.47 24.75 31.42 34.36 23.18 29.03 24.07 18.89 40.45 42.4 46.65 55.22 36.07 37.44 31.66 31.03 25.21 27.03 19.51 21.05 21.59 19.94 21.28 18.8 25.7 23.64