XLOC_031394 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_031394
Unique Name	XLOC_031394
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_16:187250..194913+

gene from alignment at scaffold_16:187250..194913+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_031394 ID=XLOC_031394|Name=XLOC_031394|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7664bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_16:187250..194913+ (Clytia hemisphaerica)
GTATTGATGAAAACAAATGTCGAGAATGGATGAAAATTGCCAGATCTGTT
CAAGTGTGTCTCAAACAAAACTTAATTGATATTCTAGACGATCCTGAGAT
AGATGGTCTTCCAAAGAATTCAAAGGAACGAGACGACATTCTAAACAAat
attagtagggggaaatttgtaaaatcgtNAATATCGTCaagtaaatgaaa
atgaattaAAAGAGATGATTATGTTTGGGCAACTAGATTTCATTTCATAG
GATGGACAATCTCAAATCAGGAGATTATGTATTCCAAATCTGGTTTACTT
AATCAATCAGCTAACCAATATTGATAAGATGCATTCTGGTAAATTGGCTG
GTCTTTCCAGTGCATTGGAAATCTATCAAGATATTTATAAAGGGTCGATT
AGTTCCATGGAGTTTGGCTGCTTCACAATCTCAAGATTAAAGTGGTTCTG
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TCTTGACGGGTattaactacttgtggtattgCTAGAAATCGTTTGGGAAA
TACCCTTTTTCGTTATTACTATACTTTAGAAATTGACAATGAAATCGTCA
TCACACTATCGTGTTACAACAGGGTTTGAACCCACACCGATTATAGACCT
TCAGATTTGAATGCACGCGTACTAACTGTTTGTGAGTTAAGGTAAAGCAA
GCTAGCGTTATTTTCTAGGAAGTCTCGATCAATCAACCTTCAATTTAAGT
AATGGGCTGTTTTTCGCGTATAAAACAACTGACTCAGGGTTTGAACCAGC
ACGCTATTCAACTCTTAGATTGGTAAGATTACACTCTTGCTAACTGCGCT
ACTTAAACAtgacatttccataatcatCTGACGTAAGTAATGTAATAATC
AAACGAAAAGTATTTCCTTGCTTGGACTCAAGTGAGTGCAATGCAGAACG
ATTGGCTAACGACCTACCGttgagaaaatatcttaaaaGATGTTATACCT
ATGTGTTCTGAAACATGAAAAATAGTATCAACcctgtatttttgttttta
acacCCGCTTGTGGGCAACGAGGGAAGGTTCAGGCTTCTAGGTTTTCTAT
NGTTGATTATTTTATCTACGGCTGAGCAAGAACATTCAAATGAAGGCTCC
GTTCCCAGGAAAATAGAGGTTTCCGTGCTGCAGTCCATACCAGTCTGTAT
GCGCCCTAACCATGATTATTCATGGTTTAACTTGCGGCAGCCGGTTCCTG
GGAATGTCACGATGCGTGAATTTGAGAGTGATTCTTGTTATTGAAGCAAA
GGTGCTCCAAGGATATTCATCAACCTTAGCTAGTAATTCGGTTATGTATT
CATAATCAATGCTACTAACGTTCGGTGGATAGAAAGCCTTTGCCCTTGCT
AAGCTCTATGACCCGGACACTCTATTACATATTGATCAGTTGATTCCCGG
ACACTCTATTTCATGAAAAACCAAAATAATGGAAATCCAATACCTTGTAT
TCAACAAATATAATCTTTTTCAATGGTCTTCTAAtccaaaatcattttct
ttaagTGACTCGgatatttttagaatttctatTTACCATCCCATCCCCGA
CCACCGTCCCACCGAATTTCCTTTTACGTATATCTTGACGGGTattaact
acttgtggtattgCTAGAAGTCGTTTGGGAAATACCCTTTTTCGTTATTA
CTATACTTTAGAAATTGACAATGAAATCGTCATCACACTATTGTGTTACA
ACAGGGTTTGAACCCACACCGATTATAGACCTTCAGATTAGAATGCACGC
GTACTAACTATTTGTGAGTTAAGGTAAAGCAAGCTAGCGTTATTTTCTAG
GAAGTCTCGATCAATCAACCTTCAATTTAAGTAATGGGCTGTTTTTCGCG
TATAAAACAACTGACTCAGGGTTTGAACCAGCACGCTATTCAACTCTTAG
ATTGGTAAGATTACACTCTTGCTAACTGCGCTACTTAAACAtgacatttc
cataatcatCTGACGTAAGTAATGTAATAATCAAACGAAAAGTATTTCCT
TGCTTGGACTCAAGTGAGTGCAATGCAGAACGATTGGCTAACGACCTACC
GttgagaaaatatcttaaaaGATGTTATACCTATGTGTTCTGAAACATGA
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TATGACTAGATATCCTGTTGCTAGGGAAATGCATAGTgaccaaatcaaaa
aatcaagtcGAGCATAATTTCCTAGTTTGTTTGAAGTAACACAGCTTGCT
TAGAATGGTCGAATGATTAGTTTGCTTCAAGACTTTAACGAGTCAGGTAA
GTCGACTAAAAACTGAATTAATGAATTTTGACGACATTTAATTTAAGTTT
TGGTGGACTTTGTGTCATACTGGTCTGTACCACTCGTCGCACAGGCAatt
ctttatcttttgaaaaatgtttctccTGTAGGTACATGTGTAATTTGGCT
ATGAAAGAAGGCTATCATAACTATTGGCGAGCATTTGCGTAAGAAATGAA
TGGTTATGCTatcttgatattttttgatttttagaggGAAAACTATACAT
CATCAGTGAGCTCCTTCCATTAGTTAGAAACAAATAATGGTTGACAATCT
AAATAGTCAGCAAAATGTTGGTATTGATAAAAACAAATGTCGAGAATGGA
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ATTCTACACGATCCTGAGATAGATGGTCTTCCAAAGAATTCAAAGGACCG
AGACGACATTCTAAACAAATATCGTCaagtaaatgaaaatgaattaAAAG
AGATGATTATGTTTGGGCAACTAGATTTCATTTCAAAGGATGGACAATCT
CAAATCAGGAGATTATGCATTCCAAATCTGGTTTACTTAATCAATCGGTT
AACCAATATTGATAAGATAGATTCTGGTAAGTTGGCTGGTCTTTCCAGTG
CGTTGGAAATCCATCAAGATATTTATAATGGGTCAATTACTTCCATGGGA
GAAGAGAATTTCCAGAACCTTTGGAAACGAATCTATGATGTATTGATTGT
TCTGGGATACTCTGAGATACCAGTTTTCCACTATCTGAAAGAGAAAGCAT
CGCTAGATGAGATAGATACTGAACAAATTGAGGTTCTAGATGAACGTTGC
AGATCTTTAAAGGCCCTGGATAACGATATCGAAATAAAACAAAGAGAAAT
GAGCTTTTTAATGG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00049480	TCONS_00049480	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00049481	TCONS_00049481	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00049481-protein	TCONS_00049481-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_16	supercontig	scaffold_16:187250..194913 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1.38	1.29	0	0.08	0	0.26	10.75	8.84	0.86	0.73	0.08	0.07	0	0	0	0	0	0

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XLOC_031394 (gene) - C. hemisphaerica