XLOC_030415 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030415
Unique NameXLOC_030415
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_136:245216..249124-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_030415 ID=XLOC_030415|Name=XLOC_030415|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=3909bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_136:245216..249124- (Clytia hemisphaerica)
AAGTCTATGGACACGTAGTAAAGGTACGCTAATAGATTTCAATCAACATC
AATTCTGTTTCTCCAATTAAGCAATAAATATCAAATAAGCGTAACATAAA
TAATATCAAATAACTTAGTAACTCTGGCATGTAATTAACGATAGTCTCTG
TTCAAGTCCTTCTCCTTCAAGTTCTCCTTTTTAAGTCCTTTTCATTCGAG
CTCTCCTTTCCAAGTCTTCTTCCTTCGAGCTCTTTCTCCCAAGTCCTTTT
CCTTCGAGCTCTTCCTACCAAGTCCTCGATTTCTTTCCTTTTCTCGCTCA
TGTTTGCTCGCCCTATTCAGGGGTCTGGGCTCGAGGGCCTGAGCCCCACT
CTATTGATTTCTATTCATCTTTCAGTTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAGGCATTATCATTCGTAACTTTTGT
TCGATCACCTCGGATACTTGTTCATCGAGATCTCTTTCACCGGCGTACTC
ATTTAATGACACTCGTCTTGGTGTTGCACCGGAAAATTGGACAGTATGCT
AATTTGTCGATCTTTTCGTTCAGCTCTTTGAATAGTTTGGTGGAGTTCAC
ATTATAATTCGGCTTGATTGTGTTCTCCAATCTGATGTAAGCCACTGCTT
CATTGAAGGTTTTGAATCTCTTTAAAATGACTGATATTCGTAAACCGTCA
TTCAGTCCGGCGATGAGTGAGTCCAATTTCTGCTCATTGTTATAATTTAA
TTGATGAACTAGATTTTCGAGTTTTTCAATGTAGACATTTAGTGATGAAC
ATTCCTCTTGTTTGAGTTTGGCTAGTTCCGCTTTCTTTAACATTCTGATA
TCGGACGACCAGAAGTAGTTCAGCAACATCTCTTTATCAGCTTGTATGAA
GGCTTCACGCCTGCTGGTAGCGCTCTGTAATAGTGCATCGCGTGACCTTG
TAAGCCATATGCTGTTAGAACGTTCAAACGTTCTTTGGAGCTCCACTTGC
CAATGGTTGCTATGCTCTCGAAACGTTCGAAATAGCTTTTGATATTTTTA
TTACTGGTTCCATTGAATTGTGGTATATCGTCCAAAGTCATTTGGATTAC
GTTCATCTTGAAGATGTTCGTCATTACTTGCTTGTTTTCGCTTTCATCGA
CACTGTCGTTTTAGCGAGTTGCATGTTGAATGATTTATAAGTAGTCGAAA
TGTGTTACCTCTAGATGCTGTATTCCTCTTGCCTAGTTTCCTTTACTTAT
TTATCTTTCCATTCATCACAAAATCGAAATCAAAATTTACTGCACAATGT
TAGGTATTATTTTACTTGAATCAATTGTAACCAATGCTTGGTTACGGCAA
AGGTTCACTGCGTTCAAGTTTGTTGAATAATTGATACCGAGAGTTCGACG
TTAAACTTCTCTTCTCGTTGACTTTAAATAATTGATTTTGTGTAAAACTC
TCGTTTTGATAGTTTTTAATACTTTCTGATGTAAAATCACTTTTGTCCTT
TTCAAAATAACGTGTCCTTAATCGCGAAATCAACCAAACTACCAATCAAC
AATAGTTCAGTTTCTGTGGTGTAATCTTTTATTGTTCTTGTTCCTTGGTG
TAATGTAGCTCTCTCCTTTCGGATCTTTGATTCTTGCGAAGCGAGTTCTT
CTGGTTCACCTTCAGTGTAACGAAGGGACTTTAGGTCTTTTTCCAATTAA
GTAATATTTATCAAATAAGCGTAACATAAATAACATCAAATAACTTAGTA
ACTCTGGCATGTAATTAACGATAGTCTCTGTTCAAGTCCTTCTCCTTCAA
GTTCTCCTTTTTAAGTCCTTTTTATTCGAGCTCTCCTTTCCAAGTCTTCT
TCCTTCGAGCTCTTTCTCCCAAGTCCTTTTCCTTCGAGCTCTTCCTACCA
AGTCCTCGATTTCTTTCCTTTTCTCGCTCATGTTTGCTCGCCCTATTCAG
GGGTCTGGGCTCGAGGGCCTGAGCCCCACTCTATTGATTTCTATTCATCT
TTCAGTTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047799TCONS_00047799Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_136supercontigscaffold_136:245216..249124 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.53	0.93	2.93	2.52	6.42	1.63	2.63	4.43	0.26	0.99	1.01	2.16	11.77	10.35	6.78	7.94	2.53	3.78	9.22	7.48	10.72	4.16	4.83	4.62	9.8	9.93	4.87	4.03	7.38	6.24