XLOC_030404 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030404
Unique NameXLOC_030404
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_136:31905..56882+

Legend: gene
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>XLOC_030404 ID=XLOC_030404|Name=XLOC_030404|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24978bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_136:31905..56882+ (Clytia hemisphaerica)
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AAGTGATAGCCAAGTAAATGACgatttgtttttcttcattatttcgGAAT TCcatctttgattttgaaaatctcTCCTGGAAACCATTTTTCCCTGCCAA CAACATACTAAAGTTGATAATCTTCATAGTCGAAAGGCTATTTTATATCT CTTTTCgcattttgtgaattttcttgATAGATGCCCAGTCAACTACTGTG GCTACTGAACAATTTTTCTGGTCCTCTGAAATAATCATATGCTATTTTAT CCCTGCTATTTTGAGTAAGAACATATTTAGCTAACCCTGGGTTTATAACT TagctagattttctttttagaAGTATGCTGAAATTTTAACCGCAGTGACC CACTAAATAGCCCTAAATATGTTTACTTGACCATTACAAAGCTGTAAAGG GGTCATTAAAGAAGACAATTTGATTAGATACATACGTATGTAATTATCTT CTAGTTCTAAAAATAGCAACCAGATTCTTTGATGTGCACTGGGCTCCCGT TAGTAATTACCTCTTCGAAGTCTCGCCTCAACATTTTTCTCAGTGACGTT TTTCTTGTCACATATTACCACACCATTAGATTTGAAGAATGAAGTCAAAG GAAATATGAACATTTCCACCACGcactttgtttgttttgtaCATAGGAGG TCGTGCACAATCAGAAAATCTAACGGTTTTTCTCTATTCTCTCACGTATG TCAATGATCTAATAGGATATGGGCGTTCGAAGTAAATAATATCAAATAGG AGGGTCTACTACTTGCTTTAATATTGTAAGATCGGTTTTCTTGGGTTCAT TGATATCTTGATGAACGAGAACTATACAGATAGTTTTTTGTCGTCTTTAA TAACTAGAGTTGATAATTTCCCATTGGAATAAATATATCTAAACTCCAGT TAATACTGGAGAGCTGTTCAAGCAAAAGCCAAAAAGAGGTACAAGAGAGG TACTCTTTTGCTATTGGATTCTTTCCAAGAAGTTTTCTTAATTCATATAA GACAAGCAGCATTTCTCCATAAATCAAAAACCATTTCGTAATGTCCGTTT TTTGGTAATAAAAAACAACAGGAAAATAATTGCCATGATTTCTCAAACTA TATTGTGAATTTTACGTCAACTCTGATGTCACCTAAAGTTGGTCAGAATG ACGACAGGAAATTGGGTTCGGTTACGCCATAATTCATGTTTAAATATTAC TGacgaatattttgaaaatgatattgTGAAATGGAtgtaaattttaaatg aaattctCATTCCAAGCATAATTTACTTTGGTCATTACCATTTTTACACT GATTCCATTGATGTCACTCGAATTCGGGCAATAGCCTTAAGACATGCTAT TTATTTGACAACCATCTTTAGCGAAAAGATACAACACCCAAATTAAAATG TTCCACCTTTTCGTCAAATTGAAACTCCTTTCATAAAATTTGGCTTGGTA AAGGGGTCATCCATATAGTGTGTACACACAGTGAAGGGTTAAGCAAAAGC GTGCGTCTATTGTTTGAATGACGTAATTTATATTATTCACTGCGTACAAG AGGGAAGTGGGTGTCGAATATTTGGAAAGTTTTGATGTGTGTACTACATA TATGTAACCTAACCGTAACCGTAACTAGTTACCATTTGAAACcctaagaa caaattgctttgtAACGTGAACATTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNtatacatcaccgagggttaataaatccaataaccaacgaaaacc tattgaatatctgcttattattcACTGCGTACAAGAGGGAAGTGGGTGTC GAATATTTGGAAAGTTTTGATGTGTGTACTACATATATGTAACCTAACCG TAACCGTAACTAGTTACCATTTGAAACcctaagaacaaattgctttgtAA CGTGAACATTATATCCTGATGAACTCTTATAATAAAAACGGTAATTCTGG TATCTTAATAGAATATCAGGTTGTCGAGCCCGTTCTAAATCGAACTCCTT TAACAAGAGAGGTCTTTTTCCACCTTAACATGATTCAAAaccactaaaat tgctttaccGTGCGTATACCATCGAGCCAAatagatttcaaattttcatt tcattttagaGCGAAAATGGAAGCCTTGTACATGTGGGCGAAAGAAGACA GCTAAAGACGATTTGTCCAATCTGAAAGACAAACAGGTATCTGGATCGTA TCAAGCCGAAGAAACGCCACGTTTGTTCTCCGTATATGTAAGGTGGAAGA CGTATCGCGATGGCACAAGTGAGTACAACTTTCGTACGTTGCGCGATACA TTCCAAACGTTCGGAGAGATCGTAAATATTGTGTTTAAGACTCGTAACAG CGCTGTTATTGTTTTTACGACGAGTGATGCTGCGTGTACGGCAGCTAAAG TGTTTATGAATGTTGGACAAGAAATGAGATTGTATGTACGCTGGTTGAAT GATATGACATAATGCAAACAAAACAGAATAGACCCTTAAAACGATAAATA GTTATTTTCTTGTTTGAGTTCTATTGAGGATCAAAGAATTTGACAGATTT TATATTCCTTATAACCGATCCAAGCAACAAATTTCGAGACATCCCTCTGG CTGCCATGACTATTAAGCATTCACGCCTATTCGATCTTGGAAATGGAAAT AGCGTTCTCGTAGAGGAAACTTAACAAGGGCTTCCTAAACAGTAGGAACC TATTCTCATAAATTAATTTTCCAAGGAACCTAATCTCATTaattaatttt ccaaattttccaggGAGTTGTTAACCCACAAACACACATTGGTTGTTTGA TGATCAGCAGACGAGTATGCGGTTCAGTATTTGATAGCATTCCCGTAAAA TTGGCTAAAACAAGGATCGATTTTTGCCTGAAATTGGCCTAGATTTTCTC TATACTGTAAGGGTCTAACTTATGAGACCCCAATGTTTTTTATGGTTTTC AAATCGCGGTAGAATTTAAATATAAGCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047748TCONS_00047748Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047749TCONS_00047749Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047750TCONS_00047750Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047749-proteinTCONS_00047749-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_136supercontigscaffold_136:31905..56882 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8 7.88 6.49 5.8 9.21 6.63 12.43 13.46 12.46 23.04 12.26 13.42 31.59 23.37 28.5 18.73 27.78 33.49 39.49 39 14.95 16.57 20.42 19.41 21.1 18.88 21.7 8.03 10.47 10.69