XLOC_029789 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029789
Unique NameXLOC_029789
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_116:797521..826299+

Legend: gene
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>XLOC_029789 ID=XLOC_029789|Name=XLOC_029789|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=28779bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_116:797521..826299+ (Clytia hemisphaerica)
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CTACATCCTGACTAACTGGGGACGACGTTTATTGAGTGCTTTCATGGTGT TCATTTTgtgggtcaaaactgcgggtttgtTTTAAATCGTCTCAATTGCT CTTCCGTCCGCTATAGCACTATTGGAATTAACATAGGATCAATCAAGAAG CAACCATCTTAACTTAATGCTTAGATGTATATATTAGACAGGGGCACGCT TTTCGTTTAGAAAGTACCAAAGGATAAAGAAGCTACCCCTAACAAGGTAC AAAAAAACAGACTCCAACTATTGGTGTCCGCTAAAACaaaaatcttataa aatttatattgctgttattgttttttttcattttatttcagtATCTCTTC TGTTCTTTCTTATCACGCGAAACTTCCTTCAAATTGTTGTCGAGAATCTG GAAGCAAGCAGTACATATGGTAAGGAAAAGACTCTGTATTACTGATAATG AGAACATGGGAGGCGTACGAGACTTCGGTAATTGTGGAAATCCATCGTTT AACTTTAGACTTTTGGTAATCTTGCAAAATCTATAagattcaaaactttg gaaaaatgGCTCTAAAACtataggaaaaataaaacaCATTTACAAGTATT TCGGAAAACCAGAACCTTCGTAAGCCCCGCTTCCTCCTACCAATTCCCAA CCGAATTTTAAAACTTAGTGGCAGGGGCTTACTTGTTTTacttaatttta atttttttatttttatattctaGGAGCCTGATGAAAATGACAACAGCCCT ACAGATCCAATCAAGATAAGACCTGGTAAGttcatttttaaaacacatCC TCGTTTAATTTTAAAAGCTTTGAGTCCTCCTTACTTTGAGCATTCAATAT TACAATACAACTTTTTTaccgtagctgccaattgccgTATGGGCattttt ttaccaccctaaaaccgtcccagtctttctTTTGTACCTAAaatcaatag 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AATTTTGTCTAGATTTTAAATATCTGGTGCAATTAGAATTTTATGAATGG TATCCTAATTaatatatttaaaagtttttaaaataggTCGAAATTCGATA TCAAACAATTATACGTggatttaaaatatattttcgaaaatattttcgaa attgtATGTCTTATTTGTTGCGTAAACTTCAATCAAAATAATTCCCTTGT TTCAGCTAAAGAAATCCTTTGCACGATATCAAGCAAGTTTAAAGAATATG GGAACATCTTATCAACTAGACTGTGGCATCTAACTTCTTTTGTAAATAGC CTGCGCACACATCATCCGTTTCTACTTCTTATTTCTATATTGTAAGTTCT TTACCGGCTTTTTATGattaatctttgttttctttgtcCACGATTACGTC CAAgattattagcgagtttatgtatgggTGTCCTTCTGAGACGGAGACGG TTAGTTTCTAATTTGTCTAAATCCTGACTGACTAAGGACGACGgcaaatc agcacttttactaGCCAATTATAGGATTAGACCAATCAgattcctttcaa ttttttatatataaaggATTAGATTTCTTGATATCATTCTGTCTGaattc acgtttttttttaagcaaactatataaaacttaggcttcgatgaccagaa tattaagaaaaagttaagaacatttaaggattttctagactctaaaacac ccaatgtcttaggaaattgcaaagatactcaaaaaatggtaaaattaaga atatcttaagaacatttttaagtttaaaactcagaaagttaagagtatct aaaggcttcaaaaattttagatgttgtAGTGTAGTTTTTTCATatattct ttctttctttttacagAGTTCTTTTGTTATCCATTTTTACATTCAATTTG TTGCTTCGAATCAACTTCATATCGGATTCGATCcaagtcaaaaatgaaaa tcaaaaagtgtAAGTTCAGTATTTTTAATGTGTCAAAATGATCACAGAAC CCTTCTAAACAAGATTTATCTCTCATCTAACAAGGTTCTCTCATTGGTTT AGTCATAGTccaaagcagccggcgaggcgatcTTTTCAAGGGTATGATAG CATGCTCTTGTTGGCTAGTAACCCTTGAAAGCTTCAAAACACATTTTTCG TAGGGGAAAAGATCTATACAAAAAGTCAATCCATCTTTCCGAAATATAAC GAAAACTTTTTCGAAACGAAGAGGGATGTTGTCGTCTGCTTCCTCTTTAT TaaagatttgaagaaaaaaaattacccaaaGACACTGTAATAATTCTCCT TCTTACTTCTACAATGTTATAAAGAGGtctattttcattttgcttttagA ACGGACAATTTACGACTGAAGAATTTGTTCGAATTCAAAGAAGGAATCCA TTCTGCAAACGTGGAAAGAATGAGATCGATATTATCTGTCAACCTGGAGA CAGTTAGTGAGGTGAGTTCAACTTTGAATTTTAAAGTCTAAGTCTtttaa agggaagaaattttggcgagaagaaAAGTTATCAAACCTTGCAGTCTCCT GgtataaaaatgatttttctttttgttcaccCTCAGGTTCAAAAGACGTT ACGAGAGTTACGCGATAAACTTAAATCCAACGATGATTGAGTTCGTAATA ACACACTAGATTATTACATGGATTTGGAACTGGttgctttttttacattt ttttgttctttttttctctattttgctCATATTGTTTTGGGAAAGAAGTT TTAGCGGTTCGTGACAATTCttgatgttcatgacgtaattttttatacgg aaacacacgAAAAACACCGGGAGTTTGCCACCAGTTTCattatttaaatt caaaactagTGGCAAACGGCTGGTGTTTTTCGTGTGTTTCcatataaaag attacgtcaatATCAAGAGTTGAACGACCGTCTTTGAGGTTGATTATAAT GCTGAAGTTTTAAAAAATATCCTTTATTTGAGCTTTGAAAGACACCGTAA AATCTCTTTCCCTAATCGTAAATCTGAATGGTCTTTCAAACCTTCAATGG AATTGATAGAATACAGGTTGGCTGGTCCAATCTGGTTGGTACattaaaaa ttagtttttccaAGAACTGTCAGTTCTCCGGATAGCTGGTCTATTTGAGT CTTAATTGAATATTAAAGTCAAATCTGTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046677TCONS_00046677Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046678TCONS_00046678Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00046679TCONS_00046679Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046677-proteinTCONS_00046677-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_116supercontigscaffold_116:797521..826299 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.12 0.97 0.68 0.2 18.92 11.99 13.82 15.92 14.58 14.84 15.02 11.83 14.51 12.21 10.62 16.01 16.53 25.33 17.03 20.1 28.32 28.89 12.01 17.64 44.49 45.7 12.47 9.34 3.23 3.54