XLOC_029738 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_029738
Unique NameXLOC_029738
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_114:150030..158080-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029738 ID=XLOC_029738|Name=XLOC_029738|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8051bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_114:150030..158080- (Clytia hemisphaerica)
ACAAAGTCCAAATGAGTGAAAAATGAGTGAAAATGGCTAAGTCCAGAAGT
CAGAATGCCTGAGGTCAAGTAGACCATGAATACAATATGAAAATCTGAAT
ATAAGAGCTATGAGTATATAAATATATAATGTCTATGTCTAACTTAACCT
TAACCTAAATGTGAAAAGAAAAGCAAAAACAAGATGGCTGACTTACCAGT
TAGGCCATGAATGAAAACTGTGAAGGTGTGGCCATACAGGTAAGTGTGAG
AGACAAAACAAAACTAAGACTATGACTTGTCTTCAGTTGTTGAATGAATT
GAGTTTATGTTTATTTGAATTGACTTGTGAGTGACTCAAGTCTGGAGCTG
AGGTCCTTACTCCATGGCTGTCATGAGTCAAGTGAGAAGCTGAATGCCTT
TAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATTTTCTTTTTATAATTTTTATAATTTTGGTTTTATAATCAATAACTTTA
CACTCCCCACAAAGAAAATTGAGTTGAAATTTATTAAATCACTTGGCATT
TGACTTTAAGTCAATGTCTTTTGCGAGAGCACCAAGCTCGGCAATCAAGT
CATTTTCATCAATACCACATATTTTCACAAGACCACGAACTGATCGATAC
GTTTCACGACAAACTGCCTCGTTGGCATTACGATATCGAACTTTTGCCCT
TCGTGGCAATGAATCATTTCCGTACTCAAGTGCGCTGATGATCCCGTATG
TGTATCGATTTTGAATCACTGAATCGACTTTTGTGAATATGACGATGTCA
CCTTCGGATAACGAATCATCGTGGAACCACTTCTGTTGCTTCATGAGTTT
GGGAACATGTACGAGAAGCCANATTGGCATTACGATAGCGGACTTTTGCC
CTACGTGGCAATGAATCATTTCCGTACTCAAGTGCGCTGATGATCCCGTA
TGTGTATCGATTTTGAATCACTGAATCGACTTTGGTGAATATGACGATAT
CTCCTTCGGATAACGAATCATCGTGGAACCACTTCTGTTGCTTCATGAGT
TTGGGAACATGTACGAGAAGCCATGTCTCGAACCAGGCGTTGAAGCACTT
TTCGTTTTCTTTGATGATCTTGGTGGGAGAATCACATGTGATCAAGCCAT
CGATGCTTCTATCGTTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTGTTTGATCCAGATGGGTCGAAGTTCAGTTGGAATTGTGTCGTCCCAAT
CTAGTTGTCTTGTTGAAAGATCGTGTAAGTCAAGCTTCATAGCAGCAACT
ATTGGTGTCATCATTCCTGTGATGTCAAAAATTTCTGCAACTTTGGAAGC
ACAGTGCCTTCTAGTGAGATTGGTTGGAATGATGTTTGATGCATTGGTTG
GTTTCTTGCCTCTTTGCTTCTTTGCGAAATTCAAATCTGAGATGCAGAGT
GAGAGTCGATCGGCTTTGGGATACCACTTCATACCACCAACTGAAATGCT
AACACCATCGTCTGTGAGGTCTGGTGATGGATCAATGCCAGAGAATGTCA
CACCTTTGAGGTTGAATCCTCCACGATTGATGACAACTTCTAACTGATCA
GCTCTGTTGAAAGCTTCGTCAATGTCTTTCTCGCCTGTTATGCAATCGTC
AACGTATACATCTTCATTGATGATTAGCTTCACTTCTGGATATTCATCTC
CAAATAGGTTTGCGATTGCACGGAGACCACATTCTGCTTGGTTTCCACTT
GATCGTATCCCATAAATGAGTGTCTTGATTACCTTTTCCTTTGGAATCTT
TGATGGGTTGAGGTTATTCTGCCAGATGTAACGCTGGTAACACCAATCTT
TGCAGTTGAGTCTGATCGTGTTATACATTTTTCGTATATCCGTGTGTATG
NCTTGGTTTCCACTTGATCGTATCCCGTAAATGAGTGTCTTGATTACCTT
TTCCTTTGGAATCTTTGATGGGTCGAGGTTATTCTGCCAGATATAACGCT
GGTAACACCAGTCTTTGCATTTGAGTCTGATCGTGTTATGCATTTTTCGT
ATATCCGTGTGTATGCTAACTTGATGTATGGACCATCTGATAAGAACTTC
TTGGAGCTTGTTGAGGTTGTTCTGTCCTTTTGCCAACAAATCATTCAGAC
TATAACCTGAGCTGGTTGGGTGTGATGCGTCATATACGACTCGACATGGT
GTACTTAGTGATGTGGTTTTCCATACAGCACGCCATGGGATGAAGTTGTG
CGTTGGTGAGTCAGCTAACATGGTTTGTTGGTCAGCAGTGAGATTNNNNN
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GCTTCTGATTTGATGATGTCGTCTTTGTCTTTTGGATTAGCTCCCAACTT
CTTGAGCTGTTGGTAGTAAATTTTCAGAGCAATATTCTTGTTTGGTGCTA
ATTTTGATACTTTGTCGACAAATGGAAGACGAGCTGTGATAATGTTTTGG
TTGGTGTCAATGTCAATGGATGAGTTAATGACGTCTTGCTCAACCTCCTC
TTTGATGCTAACTTCCCTTTGATGAATGGAGTTTTTGCAATCTTTGCAGT
TTCTGCACATTACACATCGATAGGTGATTTCTGTCCCAGTTGATTCAGTT
GATTCGAAGCGTTTGAGATTCTGGGATGGAAATGAGAGTTTGGAAACATC
TGGATTGACTTGGAGTCCATTCTGGTAGAGCTTGAATTGCTGACTGCAGA
AGCTGTTGAAGGTTGATTGATTGAAGAACTGTCGATGGATTGCAGTGAAG
ATGGGATGTGGACCACCAATTACACCTTTGCCACCATCTGGATTGCGGAA
CACTGATTTGTAGATTGATAATCCTGATGGCATTTGAAATACAAGTTTGG
GGCTGTATCTCAAATATTTGACCCCAATCATGAAATGTACGTCACCACCC
ACTGTTGCTGATGTCTTCGGGAGTGTTGATGGGTTGCCGGGGTAGCTCTC
TCTGATGGCTTGGTTGACCTCATGGAGCGGATATTCAGGAAAAGTTGCAG
TGAGCTGTTGCAGGCATGTACCATCAGATAGCATAGCATCTTGTCCGTTT
GCCATTGGAATCTTGACGATGTATGATCCAAGAGATGTGCAGGTTGTTGT
GTTACCTACACCACCAATCTGAGTGGCAATGGATGATTCTTTGATAGCTG
ATGTTCCAAGGTCCTTGATTGCAGAGTGTTTGATCAGGAAATCGCTGCAC
CCATTGTCAAAGAAGATTGTAAAGTGTTTGTTGTTGANNNNNNNNNNNNN
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TTTCGGAAATGATGACGTTGGTGTCCATTATGAGTTCTGACGGTTTCGAC
ATCTCGTCTAATGTCAGGTTATGGAATTGAGTTGTGATTGTGTCTTCAAC
TTCAGATGATGTCGGTTGATCAGGCTGCAGTGGTTGAGGGTTGGCTTCAG
ATAGCGGAGCTGTCTTTCTACCAACGTCGTTGTATACAGAATAATCAATC
CGGGGGAATCTCCGAGGTCTTGACATTCAATTGAAATGATTGATGATTGA
GGTGTCTCGGTCGTGTGACTTCCTGTTTGACTGTGGGGTTTACCACATAT
GGTCACGTTCAAACGATTGAAATTGTTGAATTGATATTTCAATACCGTCA
AACTAAATAAATACAATGAATGAATGCTAATAAATATCTAGTTTGTACAT
GAGTAATTGATAATTGAAAATGAAAAAATTATATATTTTCAAATTTTAAA
TATTTGTGAGAGACTAAGTCGAAAATGAGCAAAAACGACAAAGTCCAAAT
GAGTGAAAAAATGAGTGAAAATGGCTAGGTCCAGAAGTCAGAATGCCTGA
GGTCAAGTAGACCATGAATACAATATGAAAATCTGAATAAAAGAGCTATG
AGTATATAAATATATAATGTCTATGTCTAACTTAACCTTAACCTAAATGT
GAAAGGAAAAGCAAAAACAAGATGGCTGACTTACCAGTTAGGCCATGAAT
GAAAACTGTGAAGGTGTGGCCATACAGGTAAGTGTGAGAGACAAAACAAA
CTGAGACTATGACTTGTCTTCAGTTGTTGAATGAATGATTTTATGTTTAT
TTGAATTGACTTGAGTGACTCGAGTCTGGAGCTGAGGTCCTTACTCCATG
GCTGTCAAGAGTCAAGTGAGAAGCTGAATGCCTTTAGGCATTAAATACAC
TTGATGCACCAAGTTGTCAAGGCAACAAAAAACAACATGGTTTGAGAGCA
T
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00046594TCONS_00046594Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_114supercontigscaffold_114:150030..158080 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.29	0.54	0.9	0.61	0.98	0.98	0.35	0.99	0.27	0.51	0.42	0.28	2.03	2.1	1.09	0.08	0.21	0	0.88	2.11	0.4	0.19	0.16	0	1.03	1.98	0	0.4	0.17	0.16