XLOC_013468 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_013468
Unique NameXLOC_013468
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000468:211546..220060-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_013468 ID=XLOC_013468|Name=XLOC_013468|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8515bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000468:211546..220060- (Clytia hemisphaerica)
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TTGATCATCATAGGTGTTCACCTTTGGGAAAACTTCGGCATTAATCGGAT TTTTTGTCACATTGGATTTTTGACACACCACTGCTCCCCTTCCTTAACTT TTTTCTACTTAAAAATTCAATTGCATTTCCTGAAGGGAAATATCCTTGAG AATGTGCATTTTCTTTTTCAAAGGTTTTTTTCATGTACGAAAGTTGGTCT AATCTCGACATCCCTCTTCTACTTCTGACACCCTTCTTTAGAGATAGGAA TAATAGGAAGGTTGGAATCGCTGATTGAAACTAATTTCCTTCCCATAGCC ATCAGGGAGGAAAAAATCTTTTGTCAATCAGCGATTCCGACGATATTTTT CATATCTAAAGCAGGGTGTCGAAATTAGAAAGGGATGTCGACATTAGACC ATCATCTAGTACTTTACGGTACTTACGGTATTTTATAGATTTTCGCCTTC CATGTTTAATCTTCTCAATGAATAGTCATAATCTTTTAGGAACCAATTTG ATTCTTGATGAAACTCAAATGGAACCAGGAAAGCTGGACACAGATGGTAA ATACAAAGTCCCATTTATGTTTTTCCTTGAGAATTTGATGAGCTATATCA GGTTTTTCTTCTAATTATGCAGTATAGCAAACTAATAATCTGACACCTTC TCTAATACGTCTTGGTCCCTCCCTTGTAGCTCGAATTAGAGAGAGTCGAT CGTGTTTTCATGAACTGATTACAATGTATTCTCCAAATACATAATCCAAA GAAAAGCCAATAACGATTCCAAATAAACTAAAAACTCCATTATGACGAGC TTGAATAATTAATCGATAGTTTGAAACTCAAACCTTAAGAGATCAGAAAA CGAAAGAAGGATCACTTCCTTTATTCGAACTTATTTTTTTCTCTGTGATG ATTTCAGGTGTCAAGAATTTAACAGCTCTTGGCAACTTGATTCAATGGCA GAAATTAGAATACGATTTCACATTCAACAGATTAGATATTGAAACAAATG TTGTAAGTCTAATTGACTCGGTAGAAATAAAATAAGGAGCCAAATATAAA TGGAAATGGAAAAAAATCGCCTGTTTTAACGGTTTTTGCGGGAGCGGGAG TACCAGTTCTGAGACACAAGGGTGCATTACCAGCCGAAAGGTCTATAGAC CTTTCAAAAGTTCCCTAAAAAAGCGAAATGACAACATTTTAGGCACTGGG AAATTCTCTCAACTGACATCATAAGATCTCAACCAAAATCACTCAAAATA CAAAAAAACACTGAATTGGCTAAAAACTGGTTCCGAAAATTTACTTGGAC TTTTCATTAGGTTTTTACCAGGATTGCGATCAATTGTTCATAGTCATGCT ATGCTATCTTTTGGTTGTTCCTAGTTTTGTATTGTTCAATAAATTATTAA TAATTCGAAAGTTATTGATTATTGTTTTTTTCCAGAATGTTCTGGTCTTG TCAGAAGGCAAATCACTTTTGAAGGTAGGATGTCTGTAGATTTTTATGTC GTAAAGTAAGAATACATATACTTTTCAATGGTAACTGGGAAGAATTTTCA TAACAACAGGTCTTTACTTTTGTTTGAATAAGCTTAAAATTTGAAAAAAA ATTGAGTGTAGTACTTCTACCTTTCAATTCAAAACTGTTTCAGTTGAACA ATCAATTGACCTTACACGCTCTGTTTTTAAGCTCAGCATTCTTTTAATAT CAATATATACCTCGATTTAAACACAGCCAGCCTTCCTTCAATTAAAAAAT AACAGCATCATGTTTTAGTGTGATTGTCAATTACCGATCAACTTTGAAGA CACTACTAAACAAACGAATGCAACCTCAGAAAAATTACTACAAAAGTTTC GTTATTATCTTTCCAACGTTCGACAAATGAAATATGAGCTAACTGAAGAA GTACAAAAGGTATTTTAGTGTGAAATGCTGTTTTTTGTAAGACTATTAAA GTCGAGGCTTTTCTTTATATTTTGATTTTAAAGATGTCTTTGATAAGCCT CGGTTTCTTTAAAATGTGTATTAAGTGGGCATTTTCCTCAGTCGTCTATA TATTCTTAAAGCGTCCATTAGCTGAAACAGGATAATGTTTTGCATCTTTC ATGCAAAACGCAACAGTACAAAGTATCCAATTTAATACCTATGTATCCCG TTGAAATTAGTATAGAACAACTAATGACATGTTTTTCATTAATTTCATTA TAGGCGTTAGAGGATGATTTTGTAGAGATGAGAAAAGAGGATTCAAAAGC AATGAACGCGGATGCTTTTTACGTTTTATTGACCACAGCTAGGTGAGTAT GGTGTTTGAGCTAAGATTGTAAAACTGGCATCGAAAGTTAAAGTCGTTTT AAATTTAAGCCAAATCTGTGTCTCAAAAGAGTAAATATTTGACTCAACCA AAATTCACTTAGCGTAGAAAGAATTTCGTAGAATTTAGAATCGTTTTCTT AAGACTAAAGTTAATTATAGACACTGTAGTTTTCAATCTTTGTTTCAGAT ATCTTGCAATAAGTCATGGGCAATCAACACTATCGGCCGCGCTGTGGACG CGCGTTAAAGAGCTGGACGCTGATTTAAGAAAGAGATTGCGTTGAGGACG TTGATTGACAGACTACATGACCAGCAAGAATGAAAGTGATGGGGAAACGA CCTTATGACCTGAACTGTGATGGTGAATAATGAACTCTACCAAATGCTTA GAAAACCACCCCCTTGACAATCTTCTCGGACAAAGTCTTGTTTTTTTTGC TTTCAAGCGAACCTTCACAACGAACACTGACAAACAATACTTTTAAACAC ACTAATGTATTAGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023985TCONS_00023985Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023984TCONS_00023984Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023983TCONS_00023983Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00023982TCONS_00023982Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023982-proteinTCONS_00023982-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000468supercontigsc0000468:211546..220060 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
146.71 143.55 137.27 130.17 28.28 20.26 21.8 22.29 33.94 33.55 39.12 33.09 29.98 29.72 30.66 31.65 42.16 40.42 10.19 11.12 26.25 23.57 51.35 54.35 44.63 49.68 17.47 15.2 24.48 25.71