XLOC_011298 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011298
Unique NameXLOC_011298
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000349:39271..67176+

Legend: gene
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>XLOC_011298 ID=XLOC_011298|Name=XLOC_011298|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000349:39271..67176+ (Clytia hemisphaerica)
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CATCCTTCAGCTTGCTCGATGatggagaagaatctctcgaaacgtaacca aacgtaaatctcgtggtCCAAACCACGATATATTTCTAATACGTCAATAT AGTAGGGGGATTCGATTTTTATGGTTTTAATTAGCCCCGCGCTTTTCGTC AGTCTACCCTGTTCAGGAAACATAGGGACATAGAAAGCCTCTAGTTTAAA GGGCATCTCACAGTTGAAATTAATCATGGGCAATAGGGAGTAGCTGCGCT CTAATAACAATCTCCTGTTGGTCCGATGGAAAGTCTTCAAAACCAATGAA AAGAGGTCATTTGCACTCGCCCCTTTAAACTGCTTGGTTTTGCGTTTTAC TAGTTAGAGAACTCGATCGTCTGCTTTCAAATTCACCATCCTTCAATTTT TAAAGGTTATCAGCGGATTCTCAATCCATACTGTTCGCGTTGATTTCGAG TTGCTTGCAAAACCAAGAAGAGAATAAGAACATGTTCTTGGGATCGCTTC AAAAACAATTGCAAGCTCTTGTGACTGCACAAAAAGAGGTATGTTTATAT GGATGAGATATCTTTGGTCGCAATAGGGGGGTCTGTACTAAGATGTAAGG ACCACTGTCGGGTGGATGTGGGTGGGTCAAGCTTAGCAAGTTAAAATCAA CTAAGTACCGGCACTGAATTGGGTGGTCAAAGCTGTAGTACCTTATGCAG ATTTGGACTAAACAGGCAGTTACGATCAAAATGTATTTTGTTTGCAAGAA AACATGTTGATGCAACAATGCTCTCTCCCGAATTGAAAATGCGTTATTAC AATTTCTTTCTGATAGTAATTTTGGTCGTAgaaatccttttttttatttc taaataTCTTAAATAAAGGCGCCTTAAATTTgaaccatttttcaaaaaca gttACTTCACATAAAGTACCGTAGAAATAATATATTTCTTAGAAAAGTTA 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AAATATGTTATGTctgcctttcctctttacaatAAAACCTACGGAAATGC ACGTTTAATCCcttatactttttcgtgggGCACCCAACATAAGGTTTGAT AGGTGTTTGGTATTATATCCTGTCTTTTAAGGTGGTCCAGCGACCCCATT GGTGGACCCCAACGTTAATTTGAGCAACATGAACAGCGATTTAGCTTTAC AACAAAAACAGAAATTCGAATTGCAACGTGCTAAACAGATGATGCAAATG AACGCTCAACAACTTCAGCAGCAACAAGCCAACAagttgaaatcaaaaca aatgcttcaacaaaataatcaacaaGATATGTCTAATCAACAACAACTCC CACAGGTGCGTGTTAGGTCATTTATCTCCGTTTCTTCTTTATGCAGATAT CAAAGATCTTCAATCTCAGTGAAGGATAGAAAGTGGCTTTAAAGAAAGTG CTCACATTATATTGAAAATATGTCTACAATATTTATTGCCAATtttattc caacaatatagggagTTGTTTACAGACAGGAAATTCTTATTGCTCGCTTC GTACATCACGGTCTGCAAACtatattgtcaaatatttttctccaatatat tgtgtagtctaagtagctcTTTTATGATGTATCACTCTCTGCTGAACACT AGTCTTTTTAAAGAAACAAAACTAGACAACAAAATCTTTGCTTCCTTAGA ACGTCGCTTTATCCATGCAGCAGCAGCTGCAAAACCAACAGAACCAGCAA CTGCAAAATAAACCCAATCCTCAACAAATTCAATCCAATCCACAACAAAT CCAAATGCAAAATCAGCAATTACAACAGAATCCACAACAACAGTTTCAAT CCAATCAACAAACACAACAGTTgcaacaaaatcaaaaccaaatGCAACAG AACGTCCAGCAGATTCAACAAAACGCGCAACAGATACAACAACAAAACAC 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tattttttcattttgaaactaTTTTATGAATTCGAttgaaatattgtttt tttttttttttcatctcaaCTACTTTTGAAGGAGTAACAGTGTTATGGCC AACAATAATCCTCAACAAACCAAGTCAGCACTACAAAACATGTTGGCTCG TAAAAGTGTTAATAACCCAGTGATAAGTGGAGGAGCCACCACAGTCAGCC AAAGTAACCCACTGATGCAACTACAGCAACAGAACTTCAATAGGGTGCCA AATATGCAACAATCAAACATTTCAGCGATGAATNACtatatccccccccc cccccccatgtacggacattttctggaagagcccattttgtAAAACGCAC GTGTTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00020097TCONS_00020097Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00020100TCONS_00020100Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00020101TCONS_00020101Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00020096-proteinTCONS_00020096-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000349supercontigsc0000349:39271..67176 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
MED12LPREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like protein isoform X4 Homo Sapiens
MED12PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12 isoform X2 Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
12.21 11.61 8.91 9.26 27.95 21.07 19.28 22.35 12.39 14.54 14.25 13.08 13.89 15.78 12.43 15.32 14.17 15.13 13.33 14.8 13.37 14.1 12.83 13.98 23.27 22.66 9.42 8.42 11.65 13.45