XLOC_010888 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_010888
Unique NameXLOC_010888
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000326:71930..82624+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_010888 ID=XLOC_010888|Name=XLOC_010888|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10695bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000326:71930..82624+ (Clytia hemisphaerica)
tagaaatttactcTTAaaagaatggaaaattttcatatttctctTATTGC ACTTGTCCTGACGACTCTATCAATTAACACAGGTTTGTAATTTTTGGTTT GTCAAAGAATTTAAATTTAAGTCTTAGTGGTGCCTTAAGAAAACTAATTT TGATGATCAGAAAAAAAGCAAAGTCTAAAAGAaagcaaactttttttttt tggaggaAAATCTAATTTTGGTAAATAGCAGGGTCAGTTGGTTTCTTTTA TCCTAGATAtgagggggggggtttcagggggtacccgattccgcaattcc gccaattttttctccaatttccgtcaaaccgtcttaaattgaaccaaaat tccgtcaccgaaaattcctttgaaattcaatatttttgtcgaaaattccg caaatttagaatatcttttaccaattccaaaattgcgcagttttttttgc taaattccgtttttccgcactaaaattgtctaattttccgtctccgtccg agaacccaatttccgtaattccgtctaaattttcgccaaattccgccact ccgtccgaaaaaagggccgattccgctcctccgccaaacgTGAACCCCCC CAATATGAGTGTTAAAAACAACGACTGGGGGTTAGTTTAGAAAAGCATAG AAAAGGTTGATTTCGGTGGGGACTAATTTTACGATTAGacttaataaaaa ttttagtaAGAGTCGAAAATGTACTGATTGGATATTGAATAAATTTGATC CTAGCTCTTTAGATACTAAATGGCCGTTGGTACAGGACCTTATTTCTata acccccggggggggggcactcgatctgaaaacgaccatacgttcggccca aaatttggcttctaaaatcggacccttacagtgcagtgaatttgcatgaa aaatcatacccttacagtgcactttttcaaattttttcgcccgtaagggc gacagtttttacaattttgcaagaaaatgtggaatttttcctccaaaatt gaccaattttgtgccaattttaccaaaaaatcggccttttatcacaattt gctacccttacagtgcagtttagtgcagttttgtaatttcctacccttac agtgcactagctgaactatgaaaaatctacccttaagggccgaacgtctg gtaggtcatttaccttgagtgccccccccccgggccatAACCTTGACATT AAACGGAAAGGGTCTATTTTCTCACACTCAGAAGTAAGAAAATAGAGGAA AGAGCGGTAGTGGAGtctccccagctggcacacaacgtttttttcgacgt ttatataacgttcataacgtccatataacgttagataaacgttgaaacaa cgtcgtgtgccagctgggtccaTATCTGAAACATCTCTGAAAAGTGCGTA ATGCAGTAATATTACAATACATGTAATGTAATAGAGNttaaagagaatgc aaatcgctctagggagaccaggctgtaaaccagaacataaaatataaaaa actagactgtgaaatagtttacagcctgcaTATCCAGGCTATCCTTCATC aagatcaacattttcttcaaggtgaactctattgcttaatactttcctcc aaaattctccagcgactttatgtctacaaattgggtctgaaattgtgtgt gcttatacataactttttattttctggctggagaaaatatcttttcaaaa caaaatttaatggatgacaaaattaaacgcaaacttatttcgtggagcta aattttattttattctcgtatatcagaaggctagaaatcttcgatgctga tagtaagaatgttcagagcaaacttgagttctactaaaaagtcgtatttc atcgggcgagcctagaatttcttttNNNNNNNNNtagaatttcttttgat ttattacataaaagaaatcaaaagactttaacgaccaattaccgacaaat tcatctcctgtctttctttatacctctatgcctCAAGGTAATTCAAATTC CCTCAAATGCTGAATTGTGATAAATAGGAAGAAAAATAGAAGAATAACGA AATCCTCTGTTTTAAAAGTCTTTATTGAAATGGCTTTGCAATGTAATACA TGTAATGTAATAGTGCGTAATACAGTAACATAATAATACatgtaatctca tggttgattgaaattcNtatatcgtgcatttttaatgagctcttttgttg ataggtgaaatcttattggctaacttaagtgttggaaataagatgagacg agattcattgtttttgacattggtgtaagaaaatatttggattaaaaaaa ggcctgtaaactttgcaatccttcatctagcctggatatccaagctcaaa atttaagaaaaaacaaaatttatctcaacatacaaagttcttaaattata gagcttggtctccctagagaatgaaagtgaaaacccatgtttcctagcca acccagggcagcaaaacagaaattaataaaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNtcagaattgttagaatttcaatccaaaccatgagattaacc aggaatcccatgcttgttttcgtgaaattctggataaattaccctcggtc aaatttcgaaatgtttcaaatttccctcgttgcactcgggaaatttcaaa aaatttcaaaattgacctcggaAAATTTATCTcgaatttccctcataacc atgagattactagtactaatttgATAATgcgtaatacagtaatataacAT GTAATGTATTCTCTAAATCGTCTCATCAACTCGAATATGTTTTTTAGTCC CTTTATTTAACAATCTTTAACCTTACTCGGAAATTCAAGATTTCCTGGAA TCGAGCCGAGTTGTGTTTTCCATGAATATTTCAGCATATAAAGACTtcac tttctatttctttaaatttaagTTGAATTTTATatgcttttttgattttt cagcaAAAGGTCAAATTACAAATGCTAACGAATTAACAGAATGTTGGAAA TGTTCTGGCAGTGAGGACTGCGGTGATCGAGATTCTTGTCTCGCTGAGCA TGATCGGTGTTTGAAACTGAAATACGAGTAAGTCTTTTTGTCTCGCTGAG CATGATCGGTGTATGAAACTGAAATACGAGTAAGTCTTTTTGTCTCGCTG AGCACGATCGGTGCTTGAAACTGAAATACGAGTAAGTCTTTTTGTCTCGC TGAGCATGATCGGTGCTTGAAACTGAAATACAAGTAAGTGTTTTTGTCTC GCTGAGCACGATCGGTGTATGAAACTGAAATACGAGTAAGTCTTTTGGTC TCGCTGAGCACGATCGGTGTATGAAACTGAAATACGAGTAAGTGTTTTTG TCTCGCTGAACAGGATCGATGCTTGAAACTAAAATACGAATAAGTCTTTT TGTCTCGCTGAGCACGATCAGTGCTTGAAACTGAAATACAAGTAAGTGTT TTTGTCTCGCTGAGCATGATCGATGCTTGAAACTGAAATACGAGTAAATC TTTTTGTCTCGTTGAGCATGATCGATGCTTGAAACTGAAATACGAGTGAG TCTTTTTGTCTCGCTGAGCATGCGCGATCAATGCTTAAAACTGAAATACG CGTAAGTCTTTCTGTCTCGCTGAGCATGATCGGTGTTTGAAACTGAACTA CGAGTAAGTCTTTTTGTCTCGCTGAGCACGATTTCCTCGTCCTTCATGGC AGCCTTCATTAAATCAATTTCTAGCTTTTCTCCTAAAAGCTGTTGAATTT TCACAGTCTTGTAGAATAATtaatacccagctggcacacaacgttgtttt aacgttcatataacgttatatggacgttgggaacattagatggacgttga aacaacgttgggtatatatatttttactgTCATATTCTTTTTCAGACATG ACGGTGGTTTCGTGAATGAAGCTAGATGCTCCAAACGAACTGAATGCGAT ACAGAAGGTGGCAAAATGGTGTTATGTGACAAGAAGAAGAAGTGCAAGGT AAGAAGGTATTAGAGGGAAAATTAcaggggggttgtacttttacggtgtg aNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN atcatactttatgcgccttaaattgcgcccaggaccaactttactgagat aattttaaaatactttcaatttttttcgctcgcttcgctcgcaatacaat ttaattggtaacttctttgcaatctagcttatttataactttttttgTGT ATAtgatagcattattaaatgaaaatctaactgcgccccaagaccaattt gctgacaacaatattgaaatcatagaacatcaattttttcgctcgcttcg ctcgcattttacattgtttctttaactttttttttcgctctagcaagtgt caaatttgtctatttttatttagtgatttagggtgtcttggcagtcgatt tttaaaatttttctagtcggccccaaccatggtgaaGCCtgcttttccat tcatcaaagatatatctactcttctccactaaatatttccttcctcacaA TGcgtaggcaaatgaattagtaaaagtttagaaactggtgggtgggggca ccactttggaaaattgaagggggcgccatttaaaaaagaattgactttgg cccctccagaaaaattttcccacaacgccactgtaGAAGGTGGGAAAATG GTGTTATGTGACAAGAAGAAGAAGTGCGAGGTAAGAAGCTTTTAGAAGGA AAATTACAGTGTGTCTTAAAAAGAGTAGAGAAATTTTTATATcaagtaaa atcctcataatCTATACGAACGAAGTTTCACGACTGTATACTGAATATTT CAATCTCAAGaacctattcaatcatctttGGAATTGAATACCTATTGTTT AAGCAGGAAATTTAAATCTTATAATTCAAACATTCTAAGCCCAGTTAAAA TGATGACTTTTGATTTGACTTTGTAAAAagatttgtttgctttttttacg ctgcatataggaacacgaggctaaattttgatcaaaatctAAGAACAAAT TTTGGTCTAATCCGACCAGTCAATTTAATCAATTCAGGCCTAAAAGAATA TGAaataataagaacagccgagcttCGGCTGAATTAGAGTGTGCGGGAAA CAACTTTATTTATCATccctcccagctggcacacaacgttgtttcaacgt tcatctaacgttatatggacgttggataaacgttgaaacaacgttgtgtg ccagctggccTGTATCAAAGCCTCGCCTCTCACAAAAGCCCAACGGCAAA ATATAGTGTTTACCTTATTTGCATTAAGCTTCTTCATTTTATTCCGCTGC TAAAAAAGAGTTTGGACAGATCAATAAGACAGGGGCGTTTAATAAAATGT TTAAGAGTTtaggtaatgttctagttggtgagttggtgagttgctagttt cgagttgagaagttcgtaaaactttacggcgaccgaaattttctaattta aactaatgtagcccaaaagtacaaatttcaaattagccagccagtaccaa acatattattgactttaagatcatgaaaatggtaaggtgctggctagcaa agccaaaatactcAGTTCTGTTATGTCATTGTCATAATGCTGACAACATG acacgttcttgtaaaaatattgacaaaatctttaaataaaaTGATTGTCA AActaattccccaaaaaatattgatcatactgcaagtgatgcttattgta taaaatgatataagttgacagtcatcttagcctcaaaaaattcgtAGAGA TAGCTTGTAGAGCtggaaaaataatgacactttcttttgtcattttatca ttggaattgacactttttaataaaaattttgatcacattataaaatacaa tggttTTAAAGTCACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTTt tatatgtgttatatattactctcatattacatttactttcaaaatcgtac ttttgatgtatgttattctttttcggtagccggtaattttttaactctcc aactcgaaactagcaactccctaactcgcgaatagaatagtttccaaact cAATGTTTAACATGGTTTCTCGCAATAGATTTCCGCTTGCTGCAGAGGTG ACATGTGCAACTCACCCGCTGTCACAACCAAATTCAATGCCAGCCTTTTG GCtcttgtcgtcatggttacatTCTATGTTTTTTTTGGACGATAATTCAT CTATTTCACTATTGTCATATTTAAACACGATTTATGTCGCTAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019369TCONS_00019369Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019370TCONS_00019370Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019371TCONS_00019371Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019372TCONS_00019372Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019371-proteinTCONS_00019371-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000326supercontigsc0000326:71930..82624 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.19 0 0.4 0.21 12.95 10.07 21.79 17.02 56.1 51.12 55.7 88.82 86.83 83.29 120.08 93.74 23.68 25.3 103.78 91.97 24.95 18.79 6.5 11.25 8.64 10.04 2.99 1.31 1.02 2.3